# TARGET T0291 # Using neural net dunbrack-30pc-1763-t2k-thin90-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-t3c1-near-backbone-11-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0291.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4685 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 T 0.096 0.075 0.056 0.115 0.113 0.116 0.131 0.102 0.092 0.064 0.040 2 Y 0.055 0.056 0.040 0.118 0.128 0.135 0.156 0.119 0.093 0.061 0.039 3 V 0.011 0.015 0.019 0.035 0.043 0.060 0.117 0.140 0.189 0.193 0.179 4 D 0.016 0.029 0.027 0.082 0.093 0.109 0.171 0.143 0.129 0.107 0.094 5 P 0.021 0.026 0.028 0.061 0.064 0.072 0.126 0.130 0.164 0.166 0.143 6 H 0.054 0.060 0.026 0.104 0.112 0.116 0.157 0.128 0.107 0.078 0.057 7 T 0.088 0.088 0.033 0.106 0.097 0.089 0.116 0.105 0.123 0.089 0.066 8 Y 0.100 0.068 0.028 0.097 0.100 0.102 0.147 0.100 0.110 0.085 0.064 9 E 0.226 0.159 0.071 0.183 0.128 0.080 0.067 0.034 0.027 0.016 0.009 10 D 0.066 0.072 0.038 0.100 0.098 0.113 0.175 0.118 0.098 0.072 0.049 11 P 0.113 0.155 0.060 0.143 0.119 0.103 0.112 0.083 0.057 0.034 0.021 12 T 0.133 0.089 0.061 0.116 0.121 0.125 0.127 0.086 0.074 0.044 0.025 13 Q 0.263 0.159 0.124 0.181 0.116 0.070 0.045 0.020 0.013 0.006 0.003 14 A 0.063 0.074 0.050 0.138 0.119 0.121 0.177 0.106 0.079 0.048 0.026 15 V 0.033 0.033 0.040 0.053 0.059 0.084 0.161 0.148 0.164 0.131 0.094 16 H 0.091 0.119 0.179 0.219 0.144 0.105 0.077 0.032 0.019 0.010 0.004 17 E 0.068 0.094 0.176 0.179 0.136 0.120 0.111 0.054 0.033 0.020 0.009 18 F 0.064 0.066 0.060 0.104 0.093 0.117 0.191 0.126 0.092 0.056 0.031 19 A 0.133 0.114 0.120 0.157 0.122 0.114 0.111 0.056 0.042 0.021 0.010 20 K 0.112 0.087 0.220 0.191 0.127 0.098 0.089 0.032 0.023 0.014 0.006 21 E 0.118 0.092 0.174 0.188 0.126 0.102 0.111 0.044 0.025 0.014 0.006 22 L 0.032 0.043 0.063 0.080 0.077 0.109 0.218 0.144 0.107 0.077 0.049 23 D 0.116 0.194 0.184 0.184 0.107 0.078 0.071 0.036 0.018 0.009 0.004 24 A 0.169 0.118 0.147 0.169 0.140 0.104 0.078 0.036 0.022 0.013 0.006 25 T 0.457 0.160 0.136 0.107 0.064 0.038 0.022 0.009 0.006 0.002 0.001 26 N 0.228 0.155 0.089 0.193 0.130 0.086 0.064 0.032 0.015 0.006 0.002 27 I 0.022 0.015 0.016 0.016 0.030 0.068 0.157 0.212 0.199 0.155 0.110 28 S 0.102 0.212 0.192 0.258 0.121 0.060 0.030 0.015 0.007 0.003 0.002 29 I 0.036 0.056 0.096 0.104 0.105 0.122 0.166 0.108 0.089 0.076 0.043 30 D 0.166 0.120 0.082 0.180 0.149 0.109 0.089 0.044 0.033 0.019 0.011 31 K 0.144 0.092 0.079 0.188 0.126 0.118 0.122 0.050 0.044 0.025 0.011 32 V 0.072 0.081 0.086 0.160 0.127 0.108 0.132 0.094 0.064 0.050 0.024 33 V 0.011 0.013 0.011 0.023 0.033 0.062 0.147 0.203 0.186 0.168 0.142 34 G 0.088 0.113 0.084 0.116 0.111 0.108 0.102 0.098 0.082 0.055 0.042 35 A 0.161 0.166 0.084 0.196 0.142 0.091 0.064 0.038 0.029 0.018 0.011 36 G 0.142 0.065 0.020 0.066 0.080 0.094 0.126 0.102 0.124 0.099 0.082 37 E 0.132 0.172 0.027 0.167 0.126 0.100 0.106 0.063 0.053 0.032 0.022 38 F 0.038 0.055 0.023 0.095 0.093 0.102 0.147 0.130 0.130 0.110 0.078 39 G 0.042 0.030 0.026 0.060 0.074 0.093 0.137 0.131 0.152 0.135 0.120 40 E 0.061 0.105 0.057 0.235 0.185 0.129 0.110 0.057 0.035 0.017 0.009 41 V 0.002 0.004 0.006 0.013 0.017 0.024 0.073 0.097 0.185 0.273 0.306 42 C 0.014 0.017 0.015 0.041 0.058 0.078 0.170 0.167 0.176 0.150 0.112 43 S 0.047 0.080 0.101 0.227 0.188 0.124 0.095 0.060 0.042 0.024 0.011 44 G 0.012 0.010 0.017 0.025 0.037 0.064 0.143 0.148 0.191 0.192 0.160 45 R 0.114 0.107 0.047 0.168 0.140 0.105 0.120 0.082 0.062 0.035 0.020 46 L 0.027 0.022 0.022 0.038 0.044 0.067 0.151 0.131 0.175 0.173 0.149 47 K 0.188 0.200 0.100 0.200 0.135 0.080 0.054 0.021 0.012 0.006 0.004 48 L 0.183 0.108 0.052 0.112 0.090 0.091 0.128 0.084 0.072 0.050 0.029 49 P 0.375 0.205 0.051 0.114 0.081 0.059 0.050 0.030 0.019 0.010 0.006 50 S 0.294 0.258 0.057 0.126 0.088 0.065 0.051 0.028 0.020 0.009 0.004 51 K 0.243 0.138 0.066 0.136 0.121 0.098 0.085 0.045 0.036 0.021 0.013 52 K 0.352 0.144 0.109 0.164 0.097 0.060 0.041 0.016 0.011 0.005 0.002 53 E 0.066 0.081 0.094 0.186 0.140 0.128 0.148 0.074 0.045 0.026 0.012 54 I 0.010 0.018 0.038 0.042 0.044 0.071 0.170 0.162 0.175 0.153 0.117 55 S 0.036 0.049 0.138 0.149 0.145 0.146 0.152 0.080 0.056 0.034 0.016 56 V 0.065 0.076 0.282 0.189 0.133 0.104 0.077 0.036 0.022 0.012 0.004 57 A 0.035 0.048 0.069 0.111 0.109 0.138 0.202 0.128 0.087 0.049 0.023 58 I 0.021 0.022 0.032 0.042 0.050 0.080 0.182 0.163 0.173 0.141 0.095 59 K 0.086 0.100 0.197 0.218 0.144 0.100 0.085 0.033 0.021 0.012 0.005 60 T 0.085 0.088 0.224 0.191 0.130 0.101 0.094 0.039 0.025 0.016 0.007 61 L 0.053 0.050 0.054 0.093 0.088 0.118 0.226 0.122 0.094 0.065 0.038 62 K 0.176 0.147 0.119 0.181 0.116 0.087 0.086 0.042 0.026 0.014 0.006 63 V 0.173 0.092 0.123 0.135 0.110 0.102 0.118 0.062 0.043 0.027 0.014 64 G 0.398 0.204 0.125 0.127 0.067 0.036 0.023 0.010 0.005 0.002 0.001 65 Y 0.167 0.144 0.051 0.096 0.088 0.103 0.138 0.093 0.065 0.035 0.021 66 T 0.316 0.295 0.088 0.118 0.078 0.047 0.029 0.015 0.008 0.003 0.002 67 E 0.440 0.171 0.095 0.132 0.080 0.043 0.023 0.009 0.004 0.002 0.001 68 K 0.500 0.146 0.131 0.108 0.057 0.031 0.015 0.007 0.004 0.001 0.001 69 Q 0.064 0.120 0.099 0.133 0.114 0.139 0.156 0.084 0.058 0.024 0.010 70 R 0.015 0.034 0.104 0.112 0.118 0.172 0.228 0.094 0.063 0.040 0.020 71 R 0.049 0.048 0.452 0.206 0.091 0.069 0.054 0.016 0.008 0.005 0.002 72 D 0.020 0.061 0.256 0.233 0.146 0.132 0.102 0.034 0.010 0.004 0.001 73 F 0.001 0.002 0.010 0.007 0.008 0.026 0.115 0.170 0.242 0.242 0.176 74 L 0.034 0.038 0.112 0.142 0.171 0.189 0.172 0.071 0.040 0.022 0.009 75 G 0.039 0.072 0.446 0.207 0.106 0.063 0.037 0.016 0.009 0.004 0.001 76 E 0.003 0.010 0.029 0.043 0.057 0.101 0.235 0.183 0.162 0.111 0.067 77 A 0.002 0.002 0.006 0.007 0.014 0.040 0.144 0.178 0.248 0.213 0.145 78 S 0.017 0.045 0.307 0.275 0.175 0.090 0.057 0.019 0.009 0.005 0.002 79 I 0.003 0.011 0.065 0.064 0.066 0.101 0.227 0.178 0.131 0.103 0.051 80 M 0.002 0.002 0.009 0.009 0.014 0.029 0.103 0.136 0.231 0.245 0.219 81 G 0.042 0.058 0.173 0.207 0.159 0.136 0.139 0.041 0.026 0.014 0.005 82 Q 0.053 0.069 0.303 0.219 0.133 0.087 0.068 0.034 0.018 0.012 0.005 83 F 0.007 0.007 0.006 0.011 0.018 0.055 0.194 0.212 0.202 0.159 0.128 84 D 0.125 0.253 0.097 0.191 0.117 0.079 0.059 0.039 0.022 0.011 0.007 85 H 0.037 0.043 0.039 0.082 0.095 0.125 0.172 0.117 0.111 0.101 0.078 86 P 0.320 0.175 0.077 0.174 0.124 0.069 0.032 0.013 0.010 0.004 0.002 87 N 0.009 0.013 0.006 0.044 0.061 0.098 0.231 0.169 0.162 0.125 0.082 88 I 0.004 0.007 0.010 0.035 0.040 0.042 0.100 0.132 0.188 0.211 0.231 89 I 0.001 0.001 0.008 0.008 0.011 0.020 0.071 0.125 0.236 0.273 0.246 90 R 0.004 0.025 0.063 0.156 0.208 0.166 0.161 0.110 0.053 0.033 0.020 91 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.012 0.048 0.090 0.225 0.297 0.317 92 E 0.023 0.023 0.020 0.092 0.137 0.151 0.206 0.136 0.105 0.067 0.039 93 G 0.081 0.067 0.101 0.171 0.134 0.116 0.127 0.077 0.068 0.040 0.018 94 V 0.010 0.012 0.013 0.041 0.055 0.081 0.192 0.166 0.165 0.140 0.124 95 V 0.015 0.013 0.012 0.020 0.026 0.041 0.128 0.155 0.215 0.193 0.182 96 T 0.089 0.127 0.149 0.208 0.134 0.090 0.089 0.043 0.031 0.022 0.017 97 K 0.174 0.193 0.106 0.163 0.128 0.097 0.075 0.033 0.018 0.009 0.005 98 S 0.364 0.181 0.040 0.115 0.081 0.063 0.063 0.040 0.029 0.016 0.008 99 K 0.383 0.201 0.040 0.130 0.093 0.066 0.044 0.021 0.014 0.006 0.003 100 P 0.125 0.126 0.075 0.147 0.152 0.134 0.097 0.054 0.051 0.026 0.013 101 V 0.010 0.015 0.021 0.076 0.099 0.154 0.249 0.135 0.110 0.074 0.057 102 M 0.002 0.006 0.017 0.051 0.066 0.095 0.215 0.191 0.149 0.121 0.088 103 I 0.001 0.001 0.005 0.008 0.014 0.021 0.076 0.150 0.205 0.259 0.262 104 V 0.001 0.001 0.003 0.003 0.006 0.010 0.038 0.103 0.237 0.290 0.308 105 T 0.001 0.002 0.016 0.021 0.050 0.074 0.159 0.170 0.224 0.170 0.115 106 E 0.004 0.009 0.051 0.080 0.097 0.114 0.223 0.140 0.133 0.090 0.059 107 Y 0.002 0.005 0.010 0.027 0.032 0.052 0.187 0.185 0.204 0.176 0.119 108 M 0.007 0.008 0.013 0.018 0.025 0.048 0.144 0.165 0.189 0.202 0.181 109 E 0.091 0.189 0.147 0.233 0.151 0.093 0.059 0.020 0.010 0.005 0.002 110 N 0.216 0.123 0.088 0.138 0.135 0.112 0.092 0.049 0.028 0.014 0.005 111 G 0.366 0.082 0.029 0.061 0.062 0.073 0.102 0.084 0.071 0.041 0.029 112 S 0.223 0.287 0.068 0.184 0.108 0.063 0.036 0.017 0.009 0.003 0.001 113 L 0.006 0.013 0.014 0.021 0.028 0.047 0.120 0.136 0.182 0.214 0.220 114 D 0.070 0.083 0.069 0.209 0.203 0.158 0.120 0.044 0.025 0.012 0.007 115 S 0.132 0.075 0.223 0.238 0.129 0.081 0.061 0.028 0.020 0.010 0.003 116 F 0.008 0.010 0.021 0.057 0.070 0.096 0.235 0.181 0.143 0.111 0.069 117 L 0.002 0.003 0.010 0.007 0.010 0.019 0.083 0.132 0.250 0.255 0.229 118 R 0.021 0.062 0.197 0.227 0.182 0.123 0.113 0.039 0.019 0.012 0.005 119 K 0.082 0.127 0.359 0.177 0.109 0.068 0.044 0.018 0.009 0.005 0.002 120 H 0.228 0.120 0.051 0.127 0.103 0.105 0.143 0.068 0.035 0.015 0.006 121 D 0.646 0.154 0.054 0.066 0.041 0.021 0.010 0.005 0.003 0.001 0.001 122 A 0.274 0.108 0.102 0.096 0.095 0.099 0.098 0.056 0.042 0.021 0.010 123 Q 0.200 0.268 0.156 0.180 0.104 0.049 0.024 0.012 0.004 0.001 0.001 124 F 0.014 0.012 0.014 0.017 0.029 0.072 0.168 0.213 0.188 0.154 0.119 125 T 0.200 0.289 0.170 0.190 0.089 0.039 0.013 0.006 0.002 0.001 0.001 126 V 0.060 0.069 0.079 0.137 0.116 0.136 0.155 0.089 0.084 0.052 0.024 127 I 0.111 0.074 0.070 0.136 0.121 0.123 0.140 0.080 0.067 0.048 0.030 128 Q 0.033 0.075 0.076 0.217 0.150 0.148 0.160 0.068 0.042 0.022 0.009 129 L 0.003 0.013 0.044 0.055 0.061 0.098 0.173 0.149 0.154 0.154 0.098 130 V 0.003 0.005 0.023 0.038 0.053 0.109 0.227 0.153 0.166 0.131 0.091 131 G 0.010 0.018 0.078 0.167 0.154 0.158 0.206 0.107 0.054 0.034 0.014 132 M 0.001 0.001 0.007 0.012 0.018 0.025 0.091 0.138 0.203 0.264 0.241 133 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.035 0.091 0.240 0.296 0.325 134 R 0.006 0.010 0.057 0.096 0.134 0.152 0.199 0.125 0.107 0.071 0.043 135 G 0.002 0.011 0.040 0.080 0.128 0.173 0.256 0.143 0.085 0.053 0.029 136 I 0.001 0.001 0.002 0.005 0.007 0.014 0.061 0.113 0.241 0.276 0.280 137 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.009 0.026 0.100 0.166 0.238 0.238 0.214 138 S 0.008 0.031 0.073 0.216 0.223 0.161 0.152 0.073 0.034 0.018 0.011 139 G 0.001 0.002 0.006 0.011 0.019 0.031 0.100 0.131 0.226 0.246 0.229 140 M 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.013 0.057 0.100 0.247 0.287 0.282 141 K 0.012 0.019 0.078 0.148 0.174 0.166 0.202 0.089 0.063 0.034 0.016 142 Y 0.001 0.003 0.017 0.034 0.050 0.089 0.242 0.184 0.151 0.128 0.101 143 L 0.001 0.002 0.007 0.006 0.007 0.011 0.054 0.104 0.218 0.274 0.316 144 S 0.016 0.026 0.036 0.072 0.088 0.116 0.219 0.164 0.114 0.088 0.061 145 D 0.078 0.136 0.178 0.171 0.154 0.115 0.075 0.039 0.029 0.016 0.009 146 M 0.085 0.062 0.030 0.102 0.118 0.159 0.196 0.093 0.083 0.045 0.028 147 G 0.228 0.117 0.050 0.144 0.111 0.093 0.097 0.060 0.054 0.031 0.016 148 Y 0.007 0.010 0.011 0.034 0.046 0.078 0.193 0.157 0.158 0.154 0.153 149 V 0.009 0.021 0.036 0.061 0.063 0.075 0.146 0.143 0.160 0.143 0.143 150 H 0.006 0.008 0.028 0.041 0.047 0.064 0.138 0.123 0.172 0.191 0.183 151 R 0.021 0.036 0.061 0.115 0.130 0.136 0.186 0.110 0.093 0.068 0.043 152 D 0.016 0.024 0.025 0.084 0.082 0.098 0.177 0.146 0.153 0.118 0.077 153 L 0.007 0.008 0.008 0.017 0.025 0.043 0.117 0.155 0.204 0.225 0.189 154 A 0.047 0.106 0.064 0.201 0.186 0.141 0.112 0.066 0.043 0.022 0.012 155 A 0.006 0.010 0.016 0.036 0.047 0.075 0.148 0.121 0.178 0.189 0.173 156 R 0.018 0.031 0.026 0.120 0.166 0.176 0.218 0.104 0.075 0.043 0.023 157 N 0.002 0.004 0.009 0.034 0.039 0.056 0.159 0.152 0.199 0.195 0.151 158 I 0.001 0.001 0.007 0.010 0.019 0.031 0.112 0.159 0.219 0.231 0.210 159 L 0.002 0.003 0.020 0.021 0.024 0.028 0.084 0.138 0.213 0.225 0.242 160 I 0.001 0.003 0.010 0.010 0.020 0.037 0.117 0.162 0.221 0.209 0.209 161 N 0.045 0.070 0.088 0.141 0.140 0.122 0.147 0.094 0.071 0.045 0.035 162 S 0.138 0.138 0.056 0.160 0.134 0.121 0.118 0.058 0.044 0.022 0.011 163 N 0.392 0.167 0.054 0.118 0.093 0.068 0.047 0.026 0.021 0.009 0.004 164 L 0.042 0.032 0.011 0.054 0.068 0.108 0.224 0.143 0.128 0.103 0.087 165 V 0.084 0.134 0.089 0.203 0.175 0.120 0.085 0.052 0.033 0.016 0.009 166 C 0.002 0.002 0.007 0.011 0.015 0.031 0.091 0.112 0.190 0.251 0.289 167 K 0.018 0.036 0.049 0.129 0.170 0.165 0.174 0.116 0.071 0.044 0.029 168 V 0.001 0.002 0.005 0.013 0.015 0.025 0.076 0.109 0.207 0.272 0.274 169 S 0.003 0.006 0.009 0.020 0.038 0.058 0.129 0.160 0.195 0.195 0.187 170 D 0.003 0.010 0.011 0.042 0.050 0.067 0.139 0.157 0.199 0.178 0.144 171 F 0.005 0.006 0.009 0.025 0.041 0.066 0.134 0.139 0.193 0.193 0.189 172 G 0.017 0.025 0.018 0.076 0.100 0.112 0.183 0.157 0.143 0.099 0.069 173 L 0.003 0.006 0.006 0.025 0.031 0.040 0.111 0.136 0.200 0.220 0.221 174 G 0.006 0.005 0.008 0.016 0.026 0.039 0.102 0.129 0.216 0.227 0.226 175 R 0.035 0.045 0.064 0.164 0.152 0.122 0.160 0.092 0.079 0.054 0.035 176 V 0.018 0.027 0.041 0.079 0.087 0.104 0.188 0.132 0.136 0.110 0.078 177 L 0.026 0.023 0.020 0.048 0.055 0.075 0.182 0.149 0.165 0.142 0.115 178 E 0.183 0.151 0.097 0.177 0.121 0.088 0.085 0.042 0.030 0.018 0.010 179 D 0.188 0.158 0.087 0.146 0.114 0.096 0.095 0.051 0.033 0.020 0.012 180 D 0.277 0.201 0.050 0.119 0.100 0.078 0.077 0.046 0.029 0.015 0.009 181 P 0.363 0.168 0.047 0.111 0.091 0.071 0.060 0.037 0.029 0.014 0.008 182 E 0.370 0.167 0.091 0.139 0.102 0.060 0.035 0.017 0.012 0.006 0.003 183 A 0.109 0.082 0.066 0.139 0.125 0.120 0.147 0.080 0.065 0.041 0.025 184 A 0.042 0.043 0.051 0.098 0.095 0.105 0.175 0.126 0.115 0.088 0.062 185 Y 0.044 0.049 0.100 0.112 0.096 0.105 0.153 0.110 0.098 0.078 0.056 186 T 0.060 0.099 0.114 0.178 0.140 0.122 0.124 0.071 0.046 0.029 0.017 187 T 0.091 0.081 0.064 0.103 0.101 0.105 0.138 0.106 0.094 0.071 0.046 188 R 0.225 0.143 0.050 0.149 0.115 0.093 0.091 0.055 0.040 0.024 0.014 189 G 0.290 0.184 0.081 0.138 0.112 0.075 0.047 0.030 0.025 0.013 0.006 190 G 0.058 0.047 0.025 0.067 0.085 0.119 0.170 0.128 0.130 0.098 0.074 191 K 0.100 0.113 0.061 0.163 0.141 0.121 0.108 0.075 0.057 0.035 0.023 192 I 0.009 0.013 0.013 0.035 0.047 0.077 0.162 0.170 0.166 0.167 0.141 193 P 0.033 0.066 0.046 0.124 0.112 0.103 0.118 0.118 0.110 0.089 0.080 194 I 0.006 0.007 0.008 0.021 0.031 0.053 0.116 0.122 0.219 0.223 0.195 195 R 0.054 0.062 0.057 0.188 0.172 0.131 0.130 0.070 0.064 0.043 0.028 196 W 0.008 0.010 0.012 0.046 0.047 0.071 0.181 0.143 0.175 0.169 0.138 197 T 0.006 0.016 0.015 0.035 0.040 0.052 0.129 0.155 0.183 0.191 0.177 198 S 0.011 0.025 0.022 0.059 0.067 0.094 0.179 0.166 0.159 0.125 0.094 199 P 0.079 0.067 0.089 0.147 0.155 0.135 0.123 0.074 0.067 0.041 0.024 200 E 0.110 0.084 0.072 0.175 0.159 0.133 0.133 0.062 0.044 0.020 0.008 201 A 0.019 0.021 0.025 0.063 0.061 0.069 0.170 0.149 0.182 0.147 0.096 202 I 0.009 0.010 0.028 0.027 0.039 0.062 0.165 0.163 0.183 0.180 0.134 203 A 0.025 0.091 0.212 0.249 0.167 0.110 0.084 0.033 0.016 0.009 0.004 204 Y 0.046 0.058 0.171 0.134 0.121 0.141 0.160 0.076 0.050 0.030 0.013 205 R 0.181 0.082 0.106 0.154 0.118 0.108 0.134 0.050 0.036 0.022 0.010 206 K 0.281 0.175 0.157 0.174 0.088 0.055 0.041 0.016 0.009 0.004 0.001 207 F 0.031 0.042 0.035 0.048 0.063 0.099 0.192 0.198 0.128 0.099 0.064 208 T 0.161 0.195 0.096 0.132 0.114 0.107 0.083 0.055 0.031 0.015 0.011 209 S 0.241 0.180 0.155 0.183 0.109 0.063 0.033 0.015 0.012 0.006 0.003 210 A 0.174 0.115 0.065 0.176 0.162 0.124 0.091 0.043 0.028 0.015 0.008 211 S 0.010 0.010 0.006 0.023 0.032 0.059 0.144 0.152 0.224 0.184 0.155 212 D 0.009 0.022 0.026 0.097 0.106 0.127 0.183 0.150 0.120 0.090 0.069 213 V 0.002 0.003 0.018 0.021 0.024 0.035 0.086 0.114 0.186 0.250 0.261 214 W 0.002 0.006 0.013 0.038 0.061 0.089 0.180 0.176 0.163 0.146 0.126 215 S 0.002 0.004 0.008 0.024 0.029 0.042 0.107 0.132 0.214 0.229 0.210 216 Y 0.001 0.003 0.004 0.017 0.037 0.067 0.154 0.158 0.204 0.191 0.163 217 G 0.002 0.005 0.006 0.037 0.060 0.093 0.184 0.171 0.198 0.138 0.105 218 I 0.001 0.001 0.002 0.009 0.017 0.031 0.118 0.155 0.215 0.223 0.229 219 V 0.001 0.001 0.001 0.005 0.014 0.021 0.089 0.177 0.223 0.236 0.234 220 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.020 0.064 0.213 0.295 0.402 221 W 0.001 0.001 0.004 0.005 0.017 0.034 0.118 0.178 0.255 0.210 0.178 222 E 0.001 0.001 0.010 0.022 0.048 0.076 0.222 0.208 0.195 0.130 0.088 223 V 0.001 0.001 0.003 0.004 0.007 0.015 0.082 0.127 0.238 0.265 0.259 224 M 0.001 0.001 0.007 0.008 0.015 0.029 0.123 0.178 0.220 0.234 0.184 225 S 0.011 0.028 0.070 0.096 0.108 0.129 0.212 0.143 0.094 0.064 0.044 226 Y 0.052 0.079 0.068 0.116 0.130 0.153 0.179 0.103 0.065 0.035 0.020 227 G 0.229 0.134 0.048 0.122 0.108 0.097 0.107 0.060 0.050 0.028 0.017 228 E 0.373 0.159 0.051 0.136 0.093 0.066 0.061 0.026 0.019 0.010 0.005 229 R 0.184 0.123 0.054 0.143 0.125 0.105 0.113 0.065 0.044 0.027 0.016 230 P 0.090 0.083 0.044 0.086 0.086 0.102 0.153 0.129 0.105 0.070 0.053 231 Y 0.143 0.148 0.091 0.172 0.125 0.097 0.088 0.055 0.039 0.024 0.017 232 W 0.157 0.112 0.085 0.146 0.123 0.105 0.109 0.058 0.050 0.034 0.021 233 E 0.310 0.171 0.078 0.170 0.102 0.062 0.051 0.024 0.017 0.009 0.004 234 M 0.185 0.122 0.044 0.119 0.096 0.099 0.130 0.084 0.062 0.038 0.022 235 S 0.196 0.241 0.086 0.136 0.102 0.078 0.065 0.044 0.030 0.015 0.008 236 N 0.174 0.169 0.086 0.169 0.130 0.104 0.082 0.042 0.026 0.013 0.006 237 Q 0.336 0.140 0.122 0.142 0.107 0.069 0.041 0.020 0.014 0.006 0.003 238 D 0.121 0.106 0.089 0.191 0.142 0.120 0.118 0.056 0.033 0.016 0.007 239 V 0.018 0.030 0.051 0.072 0.073 0.095 0.175 0.148 0.151 0.116 0.072 240 I 0.012 0.017 0.065 0.068 0.085 0.122 0.202 0.133 0.124 0.106 0.066 241 K 0.040 0.063 0.258 0.249 0.151 0.104 0.079 0.028 0.015 0.008 0.003 242 A 0.021 0.027 0.076 0.081 0.075 0.102 0.193 0.147 0.120 0.101 0.057 243 V 0.026 0.034 0.022 0.048 0.057 0.088 0.196 0.185 0.151 0.112 0.081 244 D 0.189 0.176 0.124 0.163 0.118 0.078 0.061 0.039 0.028 0.016 0.009 245 E 0.252 0.150 0.092 0.162 0.128 0.085 0.063 0.031 0.020 0.012 0.006 246 G 0.449 0.167 0.058 0.106 0.082 0.051 0.036 0.022 0.017 0.008 0.004 247 Y 0.081 0.048 0.019 0.067 0.074 0.098 0.176 0.130 0.128 0.099 0.079 248 R 0.154 0.181 0.102 0.177 0.127 0.085 0.070 0.045 0.030 0.018 0.012 249 L 0.055 0.051 0.042 0.093 0.095 0.112 0.169 0.131 0.108 0.084 0.061 250 P 0.322 0.186 0.089 0.135 0.091 0.062 0.043 0.029 0.021 0.012 0.008 251 P 0.130 0.139 0.032 0.128 0.114 0.109 0.126 0.084 0.070 0.042 0.026 252 P 0.250 0.155 0.042 0.118 0.107 0.083 0.087 0.060 0.049 0.030 0.019 253 M 0.401 0.117 0.053 0.140 0.094 0.066 0.057 0.027 0.024 0.013 0.008 254 D 0.404 0.202 0.119 0.151 0.063 0.031 0.017 0.006 0.004 0.002 0.001 255 C 0.011 0.044 0.016 0.045 0.059 0.089 0.210 0.184 0.142 0.115 0.085 256 P 0.071 0.089 0.042 0.126 0.136 0.156 0.168 0.105 0.060 0.029 0.018 257 A 0.469 0.103 0.229 0.128 0.045 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 258 A 0.046 0.083 0.059 0.185 0.236 0.195 0.127 0.048 0.015 0.005 0.001 259 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.023 0.059 0.227 0.303 0.382 260 Y 0.002 0.005 0.032 0.073 0.159 0.250 0.293 0.102 0.050 0.025 0.009 261 Q 0.005 0.015 0.592 0.194 0.096 0.052 0.027 0.012 0.004 0.002 0.001 262 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.023 0.147 0.204 0.224 0.217 0.172 263 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.022 0.085 0.256 0.337 0.294 264 L 0.001 0.006 0.143 0.095 0.168 0.190 0.211 0.081 0.054 0.036 0.015 265 D 0.009 0.028 0.374 0.182 0.151 0.135 0.082 0.026 0.009 0.004 0.001 266 C 0.001 0.001 0.004 0.007 0.009 0.023 0.136 0.164 0.242 0.238 0.175 267 W 0.012 0.012 0.018 0.025 0.034 0.066 0.220 0.196 0.175 0.142 0.100 268 Q 0.050 0.071 0.305 0.198 0.123 0.084 0.082 0.033 0.025 0.018 0.011 269 K 0.108 0.144 0.173 0.184 0.142 0.111 0.087 0.029 0.013 0.006 0.003 270 D 0.161 0.142 0.055 0.122 0.090 0.076 0.132 0.088 0.067 0.043 0.026 271 R 0.372 0.161 0.034 0.132 0.091 0.066 0.072 0.037 0.019 0.010 0.005 272 N 0.535 0.156 0.114 0.095 0.058 0.024 0.009 0.004 0.003 0.001 0.001 273 N 0.178 0.147 0.113 0.171 0.124 0.097 0.095 0.035 0.023 0.012 0.005 274 R 0.076 0.071 0.039 0.126 0.141 0.128 0.162 0.133 0.065 0.040 0.018 275 P 0.067 0.033 0.030 0.030 0.038 0.077 0.124 0.227 0.175 0.117 0.082 276 K 0.059 0.449 0.098 0.199 0.117 0.053 0.013 0.008 0.003 0.001 0.001 277 F 0.004 0.005 0.003 0.010 0.017 0.042 0.117 0.125 0.216 0.227 0.232 278 E 0.471 0.135 0.052 0.179 0.103 0.035 0.015 0.005 0.003 0.001 0.001 279 Q 0.057 0.091 0.076 0.324 0.182 0.132 0.091 0.031 0.012 0.004 0.001 280 I 0.001 0.001 0.003 0.002 0.002 0.004 0.024 0.063 0.193 0.327 0.382 281 V 0.002 0.005 0.022 0.035 0.089 0.182 0.318 0.168 0.098 0.058 0.023 282 S 0.011 0.028 0.755 0.128 0.044 0.020 0.008 0.003 0.002 0.001 0.001 283 I 0.002 0.008 0.031 0.047 0.072 0.174 0.378 0.172 0.065 0.034 0.016 284 L 0.004 0.004 0.007 0.008 0.008 0.019 0.090 0.151 0.255 0.256 0.198 285 D 0.073 0.071 0.227 0.221 0.175 0.114 0.075 0.022 0.013 0.006 0.002 286 K 0.064 0.072 0.359 0.197 0.124 0.083 0.058 0.022 0.012 0.006 0.002 287 L 0.015 0.015 0.027 0.045 0.049 0.079 0.233 0.161 0.165 0.124 0.086 288 I 0.040 0.035 0.048 0.070 0.072 0.102 0.215 0.146 0.119 0.093 0.059 289 R 0.081 0.116 0.284 0.218 0.119 0.071 0.055 0.024 0.016 0.010 0.006 290 N 0.138 0.131 0.106 0.137 0.121 0.114 0.122 0.066 0.035 0.019 0.010 291 P 0.317 0.151 0.039 0.096 0.086 0.075 0.080 0.066 0.048 0.027 0.016 292 G 0.480 0.200 0.050 0.092 0.067 0.044 0.029 0.017 0.012 0.005 0.003 293 S 0.328 0.202 0.066 0.145 0.106 0.061 0.040 0.023 0.016 0.008 0.004 294 L 0.154 0.092 0.041 0.093 0.099 0.107 0.135 0.095 0.086 0.057 0.042 295 K 0.163 0.161 0.094 0.205 0.131 0.091 0.071 0.036 0.026 0.014 0.008 296 I 0.062 0.073 0.074 0.133 0.117 0.124 0.149 0.098 0.078 0.057 0.033 297 I 0.057 0.060 0.046 0.101 0.104 0.122 0.159 0.128 0.101 0.073 0.050 298 T 0.087 0.102 0.065 0.142 0.119 0.117 0.127 0.093 0.075 0.046 0.027 299 S 0.077 0.081 0.063 0.128 0.119 0.111 0.128 0.097 0.089 0.065 0.042 300 A 0.089 0.063 0.050 0.103 0.103 0.107 0.147 0.100 0.104 0.078 0.056 301 A 0.109 0.101 0.080 0.190 0.139 0.109 0.115 0.058 0.048 0.031 0.018 302 A 0.060 0.063 0.066 0.111 0.099 0.107 0.158 0.107 0.100 0.079 0.051 303 R 0.059 0.065 0.048 0.104 0.103 0.119 0.171 0.117 0.094 0.071 0.049 304 P 0.144 0.136 0.095 0.153 0.117 0.100 0.097 0.063 0.048 0.031 0.018 305 S 0.151 0.120 0.066 0.135 0.123 0.109 0.109 0.073 0.055 0.036 0.022 306 N 0.184 0.116 0.050 0.109 0.104 0.100 0.108 0.077 0.074 0.047 0.032 307 L 0.146 0.099 0.056 0.146 0.122 0.107 0.121 0.067 0.065 0.042 0.030 308 L 0.112 0.093 0.076 0.145 0.117 0.103 0.124 0.076 0.068 0.051 0.035 309 L 0.044 0.051 0.038 0.092 0.092 0.110 0.174 0.128 0.116 0.088 0.066 310 D 0.089 0.090 0.071 0.119 0.099 0.100 0.131 0.098 0.090 0.066 0.047