# TARGET T0290 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0290.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1354 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 R 0.016 0.005 0.001 0.001 0.115 0.862 2 P 0.063 0.004 0.001 0.003 0.049 0.879 3 R 0.700 0.024 0.003 0.004 0.040 0.229 4 C 0.921 0.005 0.001 0.002 0.013 0.057 5 F 0.947 0.003 0.001 0.003 0.009 0.037 6 F 0.914 0.003 0.001 0.003 0.014 0.065 7 D 0.837 0.004 0.004 0.011 0.044 0.101 8 I 0.716 0.003 0.011 0.015 0.127 0.128 9 A 0.595 0.009 0.016 0.016 0.229 0.134 10 I 0.400 0.022 0.021 0.022 0.414 0.121 11 N 0.234 0.009 0.011 0.021 0.522 0.203 12 N 0.204 0.008 0.008 0.012 0.516 0.252 13 Q 0.351 0.016 0.006 0.005 0.382 0.240 14 P 0.456 0.050 0.005 0.005 0.222 0.264 15 A 0.428 0.008 0.005 0.003 0.241 0.314 16 G 0.601 0.005 0.003 0.002 0.184 0.205 17 R 0.883 0.008 0.001 0.001 0.042 0.067 18 V 0.977 0.001 0.001 0.001 0.004 0.017 19 V 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 20 F 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 21 E 0.969 0.001 0.001 0.001 0.009 0.020 22 L 0.801 0.008 0.003 0.001 0.055 0.133 23 F 0.419 0.018 0.017 0.004 0.346 0.197 24 S 0.064 0.004 0.129 0.010 0.679 0.115 25 D 0.024 0.006 0.206 0.026 0.644 0.094 26 V 0.039 0.042 0.178 0.063 0.556 0.122 27 C 0.047 0.013 0.032 0.099 0.395 0.413 28 P 0.034 0.006 0.031 0.460 0.235 0.234 29 K 0.038 0.008 0.028 0.660 0.171 0.094 30 T 0.021 0.005 0.013 0.861 0.050 0.050 31 C 0.005 0.001 0.009 0.965 0.013 0.007 32 E 0.002 0.001 0.008 0.979 0.008 0.003 33 N 0.003 0.001 0.007 0.975 0.010 0.005 34 F 0.001 0.001 0.004 0.984 0.006 0.005 35 R 0.003 0.001 0.008 0.977 0.007 0.005 36 C 0.004 0.001 0.014 0.965 0.011 0.006 37 L 0.006 0.001 0.015 0.948 0.018 0.012 38 C 0.030 0.004 0.019 0.826 0.068 0.054 39 T 0.026 0.005 0.025 0.684 0.142 0.119 40 G 0.025 0.004 0.030 0.311 0.304 0.326 41 E 0.031 0.011 0.052 0.133 0.430 0.344 42 K 0.053 0.018 0.064 0.105 0.457 0.302 43 G 0.048 0.016 0.061 0.090 0.493 0.291 44 T 0.076 0.019 0.061 0.071 0.445 0.327 45 G 0.091 0.028 0.060 0.047 0.467 0.306 46 K 0.073 0.024 0.059 0.032 0.600 0.212 47 S 0.072 0.013 0.083 0.034 0.628 0.170 48 T 0.090 0.013 0.065 0.020 0.629 0.183 49 Q 0.170 0.029 0.037 0.010 0.507 0.247 50 K 0.250 0.031 0.020 0.007 0.271 0.421 51 P 0.320 0.030 0.016 0.006 0.182 0.445 52 L 0.285 0.047 0.013 0.009 0.183 0.461 53 H 0.283 0.038 0.014 0.010 0.230 0.426 54 Y 0.332 0.044 0.021 0.009 0.340 0.254 55 K 0.221 0.010 0.016 0.007 0.517 0.230 56 S 0.228 0.010 0.020 0.008 0.576 0.157 57 C 0.396 0.017 0.016 0.011 0.356 0.204 58 L 0.730 0.019 0.014 0.012 0.127 0.097 59 F 0.805 0.021 0.014 0.009 0.066 0.086 60 H 0.864 0.008 0.012 0.007 0.049 0.061 61 R 0.889 0.009 0.009 0.006 0.040 0.048 62 V 0.802 0.016 0.006 0.006 0.065 0.105 63 V 0.464 0.023 0.006 0.006 0.429 0.072 64 K 0.057 0.002 0.014 0.007 0.850 0.070 65 D 0.055 0.002 0.022 0.007 0.868 0.045 66 F 0.560 0.029 0.011 0.007 0.352 0.041 67 M 0.839 0.022 0.002 0.006 0.045 0.086 68 V 0.889 0.023 0.002 0.004 0.028 0.055 69 Q 0.821 0.014 0.003 0.005 0.049 0.107 70 G 0.519 0.015 0.004 0.008 0.092 0.363 71 G 0.308 0.050 0.005 0.007 0.150 0.481 72 D 0.117 0.053 0.008 0.007 0.481 0.333 73 F 0.053 0.026 0.029 0.012 0.610 0.269 74 S 0.016 0.016 0.039 0.009 0.724 0.196 75 E 0.022 0.036 0.049 0.009 0.748 0.135 76 G 0.024 0.028 0.054 0.014 0.554 0.326 77 N 0.022 0.044 0.099 0.020 0.520 0.295 78 G 0.036 0.026 0.080 0.015 0.533 0.309 79 R 0.055 0.055 0.070 0.017 0.425 0.378 80 G 0.077 0.041 0.048 0.015 0.396 0.422 81 G 0.115 0.033 0.065 0.031 0.373 0.383 82 E 0.217 0.043 0.056 0.043 0.301 0.339 83 S 0.320 0.055 0.058 0.048 0.307 0.212 84 I 0.319 0.034 0.049 0.060 0.354 0.184 85 Y 0.181 0.015 0.041 0.061 0.386 0.316 86 G 0.119 0.015 0.024 0.049 0.421 0.372 87 G 0.112 0.017 0.023 0.044 0.321 0.483 88 F 0.143 0.040 0.021 0.040 0.236 0.520 89 F 0.126 0.030 0.047 0.047 0.296 0.453 90 E 0.072 0.021 0.086 0.073 0.341 0.407 91 D 0.037 0.014 0.193 0.132 0.373 0.250 92 E 0.033 0.013 0.186 0.140 0.380 0.248 93 S 0.034 0.014 0.123 0.123 0.408 0.298 94 F 0.036 0.020 0.082 0.129 0.406 0.328 95 A 0.043 0.029 0.080 0.142 0.367 0.338 96 V 0.065 0.031 0.114 0.153 0.430 0.208 97 K 0.102 0.017 0.102 0.121 0.466 0.191 98 H 0.106 0.019 0.067 0.098 0.476 0.233 99 N 0.109 0.021 0.019 0.057 0.428 0.367 100 A 0.111 0.009 0.014 0.055 0.401 0.409 101 A 0.212 0.007 0.025 0.098 0.322 0.336 102 F 0.534 0.035 0.029 0.106 0.158 0.139 103 L 0.739 0.024 0.021 0.070 0.066 0.080 104 L 0.815 0.008 0.017 0.047 0.037 0.076 105 S 0.817 0.009 0.019 0.041 0.046 0.067 106 M 0.749 0.014 0.027 0.051 0.087 0.072 107 A 0.607 0.017 0.034 0.050 0.141 0.152 108 N 0.402 0.017 0.024 0.040 0.263 0.254 109 R 0.242 0.065 0.016 0.019 0.237 0.422 110 G 0.080 0.036 0.007 0.007 0.386 0.484 111 K 0.050 0.032 0.034 0.011 0.582 0.292 112 D 0.018 0.028 0.040 0.007 0.721 0.187 113 T 0.015 0.026 0.052 0.007 0.849 0.050 114 N 0.040 0.027 0.040 0.007 0.737 0.150 115 G 0.072 0.010 0.018 0.003 0.730 0.166 116 S 0.305 0.026 0.009 0.002 0.412 0.246 117 Q 0.682 0.029 0.004 0.002 0.110 0.172 118 F 0.895 0.004 0.002 0.001 0.038 0.059 119 F 0.953 0.003 0.001 0.001 0.015 0.027 120 I 0.945 0.003 0.001 0.001 0.017 0.033 121 T 0.914 0.005 0.001 0.002 0.028 0.050 122 T 0.777 0.007 0.002 0.002 0.070 0.141 123 K 0.408 0.014 0.005 0.005 0.249 0.319 124 P 0.195 0.020 0.018 0.007 0.296 0.463 125 T 0.130 0.027 0.044 0.012 0.420 0.368 126 P 0.131 0.018 0.134 0.018 0.442 0.257 127 H 0.175 0.027 0.167 0.019 0.471 0.141 128 L 0.124 0.025 0.108 0.021 0.586 0.135 129 D 0.065 0.010 0.033 0.010 0.772 0.110 130 G 0.032 0.011 0.037 0.012 0.814 0.093 131 H 0.095 0.004 0.014 0.010 0.645 0.232 132 H 0.706 0.011 0.005 0.006 0.157 0.114 133 V 0.934 0.007 0.001 0.002 0.018 0.039 134 V 0.968 0.006 0.001 0.002 0.009 0.015 135 F 0.926 0.002 0.002 0.002 0.028 0.039 136 G 0.880 0.002 0.005 0.003 0.054 0.056 137 Q 0.843 0.009 0.005 0.004 0.070 0.069 138 V 0.754 0.015 0.006 0.009 0.120 0.096 139 I 0.531 0.019 0.012 0.019 0.310 0.110 140 S 0.205 0.017 0.014 0.025 0.573 0.166 141 G 0.057 0.006 0.026 0.122 0.662 0.126 142 Q 0.039 0.004 0.037 0.572 0.287 0.062 143 E 0.106 0.025 0.023 0.656 0.104 0.086 144 V 0.014 0.002 0.006 0.960 0.010 0.008 145 V 0.009 0.001 0.003 0.983 0.003 0.002 146 R 0.015 0.001 0.004 0.976 0.004 0.001 147 E 0.012 0.001 0.004 0.977 0.005 0.002 148 I 0.010 0.001 0.003 0.975 0.006 0.006 149 E 0.007 0.001 0.005 0.964 0.011 0.013 150 N 0.021 0.002 0.007 0.728 0.079 0.164 151 Q 0.049 0.016 0.014 0.250 0.159 0.512 152 K 0.046 0.014 0.009 0.019 0.212 0.700 153 T 0.078 0.049 0.031 0.017 0.323 0.502 154 D 0.029 0.030 0.042 0.011 0.766 0.122 155 A 0.007 0.004 0.089 0.012 0.841 0.047 156 A 0.011 0.002 0.038 0.003 0.870 0.076 157 S 0.038 0.024 0.018 0.002 0.757 0.161 158 K 0.101 0.033 0.003 0.001 0.243 0.618 159 P 0.225 0.052 0.005 0.001 0.157 0.559 160 F 0.387 0.039 0.010 0.001 0.197 0.365 161 A 0.503 0.013 0.006 0.001 0.169 0.308 162 E 0.536 0.006 0.005 0.001 0.130 0.323 163 V 0.806 0.004 0.001 0.001 0.044 0.144 164 R 0.942 0.003 0.001 0.001 0.013 0.042 165 I 0.954 0.003 0.001 0.001 0.008 0.035 166 L 0.899 0.001 0.001 0.001 0.026 0.072 167 S 0.807 0.004 0.001 0.002 0.041 0.145 168 C 0.723 0.005 0.002 0.003 0.081 0.185 169 G 0.742 0.008 0.003 0.003 0.091 0.154 170 E 0.634 0.021 0.005 0.005 0.085 0.251 171 L 0.408 0.021 0.005 0.009 0.093 0.464 172 I 0.203 0.023 0.004 0.008 0.078 0.685 173 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.976