(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
http://www.soe.ucsc.edu/research/compbio/sam.html

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0289 aspartoacyclase family, Rattus norvegicus, 313 res
    • gi|76664250|ref|XP_586387.2|_1:313 PREDICTED: similar to Aspartoacylase (Aminoacylase-2) (ACY-2) [Bos taurus]
    • gi|115893|sp|P15087|CBPE_RAT_101:447 Carboxypeptidase E precursor (CPE) (Carboxypeptidase H) (CPH) (Enkephalin convertase) (Prohormone-processing carboxypeptidase) [Taxonomy]
    • gi|203304|gb|AAA40875.1| carboxypeptidase H precursor (EC 3.4.17.10) [Taxonomy]
    • gi|50746182|ref|XP_420392.1|_94:440 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase H precursor (CPH) (Carboxypeptidase E) (CPE) (Enkephalin convertase) (Prohormone processing carboxypeptidase) [Gallus gallus]
    • gi|94390537|ref|XP_989014.1|_403:714 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase D precursor (Metallocarboxypeptidase D) (gp180) [Mus musculus]
    • gi|73978380|ref|XP_532715.2|_1:353 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase E precursor (CPH) (Carboxypeptidase H) (CPE) (Enkephalin convertase) (Prohormone processing carboxypeptidase) [Canis familiaris]
    • gi|68361632|ref|XP_685336.1|_4:311 PREDICTED: similar to Aspartoacylase (Aminoacylase-2) (ACY-2), partial [Danio rerio]
    • gi|73991988|ref|XP_542926.2|_347:669 PREDICTED: similar to Potential carboxypeptidase X precursor (Metallocarboxypeptidase CPX-1) [Canis familiaris]
    • gi|4503011|ref|NP_001299.1|_77:364 carboxypeptidase N, polypeptide 1, 50kD precursor [Homo sapiens]
    • gi|55960072|emb|CAI13078.1| carboxypeptidase N polypeptide 1 50 kD [Homo sapiens]
    • gi|30297|emb|CAA32507.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
    • gi|20379784|gb|AAH27897.1| Carboxypeptidase N, polypeptide 1, 50kD, precursor [Homo sapiens]
    • gi|115896|sp|P15169|CBPN_HUMAN Carboxypeptidase N catalytic chain precursor (CPN) (Carboxypeptidase N polypeptide 1) (Carboxypeptidase N small subunit) (Lysine carboxypeptidase) (Arginine carboxypeptidase) (Kininase-1) (Serum carboxypeptidase N) (SCPN) (Anaphylatoxin inactivator) (Plasma carboxypeptidase B) [Taxonomy]
    • gi|73998629|ref|XP_534989.2|_77:364 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase N catalytic chain precursor (Lysine carboxypeptidase) (Arginine carboxypeptidase) (Kininase 1) (Serum carboxypeptidase N) (SCPN) (Anaphylatoxin inactivator) (Plasma carboxypeptidase B) [Canis familiaris]
    • gi|68355058|ref|XP_685713.1|_136:461 PREDICTED: similar to carboxypeptidase Z isoform 2 precursor [Danio rerio]
    • gi|48425844|pdb|1UWY|A_55:317 Chain A, Crystal Structure Of Human Carboxypeptidase M [Taxonomy]
    • gi|68178239|ref|ZP_00551369.1|_42:334 Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase [Desulfuromonas acetoxidans DSM 684]
    • gi|67981722|gb|EAM71146.1| Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase [Desulfuromonas acetoxidans DSM 684]
    • gi|55636525|ref|XP_508599.1|_2:289 PREDICTED: similar to aspartoacylase (aminocyclase) 3; HCV core-binding protein; aspartoacylase-3 [Pan troglodytes]
    • gi|68364526|ref|XP_689295.1|_44:436 PREDICTED: similar to Potential carboxypeptidase X precursor (Metallocarboxypeptidase CPX-1), partial [Danio rerio]
    • gi|62738803|pdb|1YW6|B_41:326 Chain B, Crystal Structure Of Succinylglutamate Desuccinylase From Escherichia Coli, Northeast Structural Genomics Target Et72. [Taxonomy]
    • gi|62738802|pdb|1YW6|A Chain A, Crystal Structure Of Succinylglutamate Desuccinylase From Escherichia Coli, Northeast Structural Genomics Target Et72 [Taxonomy]
    • gi|94390537|ref|XP_989014.1|_826:1180 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase D precursor (Metallocarboxypeptidase D) (gp180) [Mus musculus]
    • gi|72082194|ref|XP_795134.1|_1:314 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase E precursor (CPH) (Carboxypeptidase H) (CPE) (Enkephalin convertase) (Prohormone processing carboxypeptidase) [Strongylocentrotus purpuratus]
    • gi|94390537|ref|XP_989014.1|_2:246 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase D precursor (Metallocarboxypeptidase D) (gp180) [Mus musculus]
    • gi|68440261|ref|XP_693256.1|_15:329 PREDICTED: similar to Potential carboxypeptidase X precursor (Metallocarboxypeptidase CPX-1), partial [Danio rerio]
    • gi|50749949|ref|XP_421810.1|_549:886 PREDICTED: similar to Potential carboxypeptidase-like protein X2 precursor (UNQ676/PRO1310) [Gallus gallus]
    • gi|82408088|pdb|2BCO|B_44:343 Chain B, X-Ray Structure Of Succinylglutamate Desuccinalase From Vibrio Parahaemolyticus (Rimd 2210633) At The Resolution 2.3 A, Northeast Structural Genomics Target Vpr14 [Taxonomy]
    • gi|82408087|pdb|2BCO|A Chain A, X-Ray Structure Of Succinylglutamate Desuccinalase From Vibrio Parahaemolyticus (Rimd 2210633) At The Resolution 2.3 A, Northeast Structural Genomics Target Vpr14 [Taxonomy]
    • gi|61680843|pdb|1YW4|B_36:326 Chain B, Crystal Structure Of The Succinylglutamate Desuccinylase From Chromobacterium Violaceum, Northeast Structural Genomics Target Cvr22. [Taxonomy]
    • gi|61680842|pdb|1YW4|A Chain A, Crystal Structure Of The Succinylglutamate Desuccinylase From Chromobacterium Violaceum, Northeast Structural Genomics Target Cvr22 [Taxonomy]
    • gi|76636489|ref|XP_580904.2|_220:587 PREDICTED: similar to ATP/GTP binding protein-like 2, partial [Bos taurus]
    • gi|68398110|ref|XP_683584.1|_85:334 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase D precursor (Metallocarboxypeptidase D) (gp180) [Danio rerio]
    • gi|229759|pdb|1CPB|_49:277 Carboxypeptidase B (E.C.3.4.12.3) Fraction Ii [Taxonomy]
    • gi|76638515|ref|XP_870522.1|_159:387 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase B precursor (Pancreas-specific protein) (PASP) isoform 2 [Bos taurus]
    • gi|76654750|ref|XP_616897.2|_76:308 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase N catalytic chain precursor (Lysine carboxypeptidase) (Arginine carboxypeptidase) (Kininase 1) (Serum carboxypeptidase N) (SCPN) (Anaphylatoxin inactivator) (Plasma carboxypeptidase B) [Bos taurus]
    • gi|76638517|ref|XP_606877.2|_156:408 PREDICTED: similar to Mast cell carboxypeptidase A precursor (MC-CPA) (Carboxypeptidase A3) [Bos taurus]
    • gi|73990694|ref|XP_542828.2|_159:387 PREDICTED: similar to Mast cell carboxypeptidase A precursor (MC-CPA) (Carboxypeptidase A3) [Canis familiaris]
    • gi|71042389|pdb|1ZLI|A_51:279 Chain A, Crystal Structure Of The Tick Carboxypeptidase Inhibitor In Complex With Human Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535922|pdb|1ZG9|C_49:277 Chain C, Crystal Structure Of 5-{[amino(Imino)methyl]amino}-2- (Sulfanylmethyl)pentanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535921|pdb|1ZG9|B Chain B, Crystal Structure Of 5-{[amino(Imino)methyl]amino}-2- (Sulfanylmethyl)pentanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535920|pdb|1ZG9|A Chain A, Crystal Structure Of 5-{[amino(Imino)methyl]amino}-2- (Sulfanylmethyl)pentanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535919|pdb|1ZG8|C Chain C, Crystal Structure Of (R)-2-(3-{[amino(Imino) Methyl]amino}phenyl)-3-Sulfanylpropanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535918|pdb|1ZG8|B Chain B, Crystal Structure Of (R)-2-(3-{[amino(Imino) Methyl]amino}phenyl)-3-Sulfanylpropanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535917|pdb|1ZG8|A Chain A, Crystal Structure Of (R)-2-(3-{[amino(Imino) Methyl]amino}phenyl)-3-Sulfanylpropanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535916|pdb|1ZG7|C Chain C, Crystal Structure Of 2-(5-{[amino(Imino)methyl]amino}-2- Chlorophenyl)-3-Sulfanylpropanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535915|pdb|1ZG7|B Chain B, Crystal Structure Of 2-(5-{[amino(Imino)methyl]amino}-2- Chlorophenyl)-3-Sulfanylpropanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535914|pdb|1ZG7|A Chain A, Crystal Structure Of 2-(5-{[amino(Imino)methyl]amino}-2- Chlorophenyl)-3-Sulfanylpropanoic Acid Bound To Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535817|pdb|1Z5R|C Chain C, Crystal Structure Of Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535816|pdb|1Z5R|B Chain B, Crystal Structure Of Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|73535815|pdb|1Z5R|A Chain A, Crystal Structure Of Activated Porcine Pancreatic Carboxypeptidase B [Taxonomy]
    • gi|82408204|pdb|2C1C|B_48:294 Chain B, Structural Basis Of The Resistance Of An Insect Carboxypeptidase To Plant Protease Inhibitors [Taxonomy]
    • gi|82408203|pdb|2C1C|A Chain A, Structural Basis Of The Resistance Of An Insect Carboxypeptidase To Plant Protease Inhibitors [Taxonomy]
    • gi|68364862|ref|XP_694044.1|_21:245 PREDICTED: similar to CG31019-PA [Danio rerio]
    • gi|72048470|ref|XP_788015.1|_51:299 PREDICTED: similar to carboxypeptidase activation peptide and zinc carboxypeptidase A metalloprotease and metridin-like ShK toxin precursor family member (1B249) [Strongylocentrotus purpuratus]
    • gi|76638513|ref|XP_587122.2|_3:217 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase B precursor (Pancreas-specific protein) (PASP) isoform 1 [Bos taurus]
    • gi|66361585|pdb|2BO9|C_47:278 Chain C, Human Carboxypeptidase A4 In Complex With Human Latexin. [Taxonomy]
    • gi|66361583|pdb|2BO9|A Chain A, Human Carboxypeptidase A4 In Complex With Human Latexin [Taxonomy]
    • gi|50745155|ref|XP_426217.1|_80:362 PREDICTED: similar to carbamoylphosphate synthetase 2/aspartate transcarbamylase/dihydroorotase; CAD trifunctional protein; multifunctional protein CAD [Gallus gallus]
    • gi|76690670|ref|XP_590944.2|_18:206 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase M precursor, partial [Bos taurus]
    • gi|68398108|ref|XP_683484.1|_101:380 PREDICTED: similar to Carboxypeptidase D precursor (Metallocarboxypeptidase D) (gp180) [Danio rerio] 
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