# TARGET T0289 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0289.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 46 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 P 0.006 0.002 0.001 0.002 0.060 0.931 2 P 0.063 0.036 0.006 0.009 0.146 0.739 3 C 0.156 0.010 0.017 0.009 0.246 0.563 4 A 0.609 0.007 0.029 0.010 0.131 0.213 5 I 0.904 0.004 0.003 0.003 0.023 0.063 6 D 0.966 0.002 0.001 0.002 0.007 0.022 7 V 0.980 0.001 0.001 0.002 0.004 0.012 8 Y 0.969 0.001 0.001 0.002 0.009 0.018 9 K 0.907 0.002 0.004 0.005 0.042 0.040 10 I 0.712 0.005 0.010 0.008 0.155 0.109 11 M 0.319 0.007 0.037 0.019 0.402 0.217 12 E 0.247 0.007 0.027 0.014 0.410 0.295 13 K 0.434 0.033 0.020 0.009 0.262 0.241 14 V 0.624 0.019 0.009 0.007 0.154 0.188 15 D 0.532 0.020 0.007 0.004 0.123 0.314 16 Y 0.479 0.020 0.002 0.003 0.110 0.386 17 P 0.485 0.029 0.003 0.002 0.168 0.314 18 R 0.475 0.187 0.001 0.002 0.108 0.228 19 N 0.098 0.033 0.003 0.002 0.830 0.033 20 E 0.008 0.003 0.008 0.002 0.971 0.009 21 S 0.006 0.001 0.004 0.001 0.978 0.010 22 G 0.032 0.008 0.002 0.001 0.930 0.028 23 D 0.291 0.042 0.001 0.001 0.125 0.541 24 V 0.831 0.066 0.001 0.001 0.022 0.081 25 A 0.951 0.004 0.001 0.001 0.012 0.033 26 A 0.969 0.003 0.001 0.001 0.006 0.021 27 V 0.960 0.007 0.001 0.001 0.010 0.022 28 I 0.877 0.010 0.002 0.001 0.027 0.083 29 H 0.445 0.014 0.021 0.003 0.258 0.258 30 P 0.054 0.004 0.250 0.009 0.591 0.091 31 N 0.007 0.002 0.371 0.013 0.571 0.036 32 L 0.018 0.031 0.203 0.019 0.701 0.029 33 Q 0.042 0.022 0.053 0.028 0.729 0.126 34 D 0.049 0.020 0.017 0.013 0.675 0.228 35 Q 0.097 0.056 0.046 0.022 0.663 0.116 36 D 0.132 0.032 0.068 0.033 0.439 0.296 37 W 0.145 0.043 0.247 0.046 0.309 0.209 38 K 0.142 0.036 0.180 0.056 0.241 0.344 39 P 0.174 0.045 0.099 0.079 0.189 0.414 40 L 0.079 0.062 0.025 0.064 0.213 0.557 41 H 0.036 0.058 0.013 0.012 0.781 0.099 42 P 0.028 0.009 0.011 0.004 0.897 0.051 43 G 0.011 0.003 0.009 0.001 0.931 0.045 44 D 0.080 0.020 0.006 0.001 0.840 0.054 45 P 0.324 0.017 0.016 0.002 0.312 0.329 46 V 0.566 0.050 0.043 0.002 0.212 0.127 47 F 0.705 0.037 0.038 0.002 0.136 0.082 48 V 0.779 0.040 0.013 0.001 0.069 0.097 49 S 0.468 0.018 0.016 0.003 0.359 0.136 50 L 0.100 0.012 0.063 0.010 0.715 0.100 51 D 0.068 0.013 0.038 0.004 0.789 0.088 52 G 0.046 0.006 0.042 0.006 0.824 0.076 53 K 0.244 0.009 0.015 0.007 0.321 0.403 54 V 0.758 0.044 0.005 0.006 0.065 0.121 55 I 0.826 0.013 0.005 0.006 0.059 0.091 56 P 0.793 0.013 0.006 0.006 0.069 0.113 57 L 0.490 0.030 0.028 0.015 0.240 0.198 58 G 0.151 0.008 0.054 0.017 0.491 0.280 59 G 0.067 0.006 0.055 0.016 0.638 0.218 60 D 0.110 0.019 0.046 0.014 0.555 0.256 61 C 0.244 0.027 0.014 0.007 0.303 0.406 62 T 0.438 0.032 0.007 0.004 0.180 0.339 63 V 0.479 0.031 0.005 0.004 0.133 0.348 64 Y 0.495 0.008 0.008 0.013 0.139 0.337 65 P 0.659 0.005 0.021 0.021 0.099 0.194 66 V 0.838 0.004 0.012 0.022 0.056 0.067 67 F 0.826 0.011 0.013 0.047 0.055 0.048 68 V 0.577 0.008 0.008 0.071 0.137 0.199 69 N 0.284 0.012 0.013 0.142 0.292 0.257 70 E 0.068 0.010 0.044 0.605 0.169 0.104 71 A 0.118 0.012 0.048 0.611 0.118 0.093 72 A 0.187 0.009 0.063 0.566 0.100 0.075 73 Y 0.218 0.006 0.087 0.509 0.112 0.067 74 Y 0.258 0.027 0.058 0.483 0.118 0.056 75 E 0.270 0.007 0.048 0.475 0.144 0.057 76 K 0.052 0.002 0.033 0.735 0.136 0.043 77 K 0.026 0.003 0.035 0.694 0.168 0.074 78 E 0.053 0.005 0.036 0.737 0.121 0.048 79 A 0.110 0.016 0.048 0.638 0.114 0.074 80 F 0.253 0.012 0.072 0.477 0.101 0.086 81 A 0.373 0.008 0.079 0.304 0.151 0.085 82 K 0.370 0.006 0.078 0.202 0.200 0.145 83 T 0.488 0.019 0.029 0.079 0.190 0.195 84 T 0.536 0.009 0.015 0.033 0.152 0.254 85 K 0.598 0.005 0.011 0.022 0.113 0.251 86 L 0.762 0.009 0.006 0.015 0.062 0.146 87 T 0.883 0.008 0.002 0.007 0.030 0.071 88 L 0.781 0.006 0.002 0.010 0.052 0.149 89 N 0.727 0.016 0.002 0.022 0.050 0.182 90 A 0.517 0.015 0.028 0.103 0.127 0.210 91 K 0.252 0.003 0.080 0.245 0.200 0.221 92 S 0.395 0.010 0.096 0.286 0.129 0.084 93 I 0.627 0.022 0.039 0.169 0.080 0.062 94 R 0.688 0.007 0.022 0.149 0.047 0.087 95 S 0.571 0.008 0.060 0.147 0.057 0.157 96 T 0.442 0.017 0.032 0.116 0.073 0.319 97 L 0.230 0.011 0.015 0.089 0.076 0.580 98 H 0.003 0.001 0.001 0.003 0.013 0.980