Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 | | | | | 1 PPCAIDVYKIMEKVDYPRNE.....S.GDVAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGKVI 2 PPCAIEVYKIIEKVDYPRDE.....N.GEIAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTI 3 PPCAIEVYKIIEKVDYPRDE.....N.GEIAAVVHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTI 4 PPCAIEVYKIIEKVDYPRDE.....N.GEIAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTM 5 PPCSIDVYKIMEKVDYPRNE.....S.GDMAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGKVI 6 PPCAIDVYKIMEKVDYPRNE.....S.GDVAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGKVI 7 PPCAIEVYKIMEKVDYPRNE.....N.GDIAALIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPVFLTLEGKSI 8 PPCSIDVYKIMEKVDYPRNE.....S.GDMAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGKVI 9 PPCSIDVYKIMEKVDYPRNE.....S.GDMAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGKVI 10 PPCSIDVYKIMEKVDYPRNE.....S.GDMAAVIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGKVI 11 PPCAIEVYKIMRKVDYPRNE.....S.GEISAIIHPKL..Q..DQDWKPLHPEDPVFLTLDGKTI 12 PPCAIEVYKIMEKVDYPRNE.....S.GEISAIIHPKL..Q..DQDWKPLHPEDPVFLTLDGKTI 13 PPCAIEVYKIIEKVDYPRDE.....N.GEIAAIIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTI 14 PPCAIEVYKIIEKVDYPRDE.....N.GEIAAIIHPNL..Q..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTI 15 PPCTIEVYKITEKVDYPRNK.....N.DEVIAIIHPNL..Q..DQDWQPLNNGDPLFLTLDGEVI 16 PPCAIDVYKIMEKVDYPRNE.....S.GDVAAVIHPNLqlQ..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGKVI 17 PPCAIEVYKIMEKVDYPRNE.....N.GDIAALIHPNL..QlsDQDWKPLHPGDPVFLTLEGKSI 18 LPCILEVFKVLDNVAYPRNA.....N.GDCTAIIHNNL..Q..DQDWNELKPGDPMFLTLDGRMI 19 PPCTVNVFRVQERMDYPRDT.....N.GNITAMVHPHL..Q..DCDWEPLNRGDPMFLTFDGRTI 20 --CTVEVFRVLERVDYPRDT.....N.GNIIAMVHPNL..Q..DCDWEPLTPGDPMFQTFDGKTI 21 --FEMDIYRNLGSVDFPRTA.....D.GDLAGTVHPQL..Q..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGEDV 22 --FEMDIYRNLGSVDFPRTA.....D.GDLAGTVHPQL..Q..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGEDV 23 --FEMEAYRPVGVVDFPRTE.....A.GNLAGTVHPQL..Q..DRDFQPLQPGAPIFQMFSGEDL 24 ----LALYKFTGTVDYPRNE.....N.GDIQGMIHPDI..Q..FRDYEPLNPGDPLFLTLDGKAI 25 --FEMEAYRPVGVVDFPRTE.....A.GHLAGTVHPQL..Q..DRDFQPLQPGAPIFQMFSGEDL 26 --FEMEVYKNLGSVDFPRTT.....D.GHLTGTVHSRL..Q..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGEDV 27 ----LSLYKFTGTIDYPRNG.....N.GDIQAMIHPDI..Q..FRDYAPLNPGDPLFLTLDGKAI 28 --RDIVIYKHLKVVDYPKTK.....D.GEIVAMIHPQL..Q..GRDYQKLSPGEPMFLTFDNQTI 29 ---ETDVHQVLYRADFPRNE.....D.GEIEAVIHSEL..Q..DKDYLPLKPGDPIFQRLNGEDI 30 -PDEFVVHSHLGSLDLPRDA.....L.GQPAACVHPSL..Q..GRDWQPLQMGAPLFLWPDGEVF 31 PPCAIEVYKIMEKVDYPRNE.....S.GEISAIIHPKL..Q..DQDWKPLHPEDPVFLTLDGKTI 32 -PKDLFVHVHQGSIDYPRDK.....N.GNINALIHPER..I..NQDWKPIKKDAPLFMDMEGKTK 33 -PNKLIIHRHIKSIDFPRDE.....E.GNIDGYVHSLR..Q..SKDWQELKKNDELFCKLNGEII 34 -PDQVVIHLHLGSLDVPRRS.....S.GDPDALVHPNL..Q..GRDWQPLKAGDPLFIDAESNTV 35 ----LILYDHLSVVDYPKQQ.....D.GKIFAMIHPEL..Q..DKDYQALNPGDPMFITFDNKTI 36 -PASYDAYCYEETLKLPEDE.....Q.GERIGMVHQSV..Q..DNDFEPLRSGDPIFTLFDGTEI 37 -PASYDAYCYEETLKLPVDE.....Q.GERIGMVHQSV..Q..DNDFEPLRSGDPIFTLFDGTEI 38 -PERLVVHRHLGSLDLPRDP.....Q.GRADALIHPEL..Q..GRDWSPIRRGDPLFLTAAGDTI 39 -PSSYEAFEYKETLKLPENE.....N.GERIGMVHKNV..Q..DGDFKQLNSGDPIFTLFDGSEI 40 ---DVEAFKFIKSVDYPRDP.....EtRNLTAAVHPQL..Q..DRDFCLLKRGDPLFLSFSGETV 41 ---QLTFYQYIETIDYPRSDay6lqS.GEIQAMIHPQL..Q..FKDYEPLNPGDPMFLTFAGKDI 42 -PRGLTVHRHLGSLDLPRHP.....D.GRPAACLHPLR..Q..HRDWQVIRPGDPLFVTAGGETL 43 ----VDVFTMVKHIDYPRER.....DtGNIIAAVHPQL..Q..DRDFCLLHPEDPLFQTFSGETL 44 -PEQLIVHRHLKNIDFPRDS.....S.GVPSSLVHKDI..Q..GRDWYPIKNGHPLFESLSGDLT 45 ---SYEAFEYTETLKLPENE.....N.GERIGMVHKNV..Q..DGDFKQLNSGDPIFTLFDGSEI 46 ---DVEAFKIIKSVDYPRDPv....T.RSLNAAVHPQL..Q..DRDFCLLKRGDPLFLSFSGETV 47 -PMQMGGYRFTKKIRLPENE.....E.GDITAMIHPNL..Q..NKDYEEIRPGDPLFITLGGETI 48 -PSEREGYRFLEKVQLPENE.....A.GELTAMLHPDL..Q..DQDYQEIAPGDPFFMTLSGETI 49 -PEQLIVHRHLKNIDFPRDS.....S.GVPSSLVHGDN..P..GRDWYPIKNGHPLFESLSGDLT 50 -PDALVVHRHLGSRDLPKAE.....N.GEPQALVHPEL..Q..GRDWQNIASTQAMFRAADGTDR 51 -PKNILVHRHLKSIDFPRDE.....S.GNQCGFIHSQI..Q..GKDWIPINRETPLFEDTEGNTV 52 ----LGFYEVFERLDYPR-I.....N.EEIAAMIHPNL..Q..FKDYKPLNPGDDLFITFDGKTI 53 -PRQVVVHRHLGSCDVPRGE.....S.DQPQALVHQRL..Q..GRDWVPFKPLDAIFEAADGSTV 54 -PHNLVVHRHLGSVDLPRDQ.....R.DCAAAMVHPQL..Q..GQDWRPLMDGAAMFELPRGGTV 55 ---DYDAYFYTEEVMIPVDH.....D.GMRVATVHPMI..C..GRDFGVVKPGEPLLATFFGYDI 56 --SDYEAFFYTEEIRVPLDQ.....E.GMRQALVHPTI..C..GRDFEAVKPGAPLLATFAGYDI 57 -PKDLVVHVHQGSVDYPRDE.....K.GDIDGLIHPKR..I..NRDWKMIKKGDPLFLNSQGIIY 58 ---NCTVYQQIDTIDYPRDE.....Q.GQIVAEIAPHI..-..-RDYQAIKPGTPLFYHRRGNVT 59 ---QVEAYMMEDPVDYPRDPt....T.GEITASVHSQL..Q..DKDFKLLKPGDPIFKKFSGETV 60 --FEMDIYRNLGSVDFPRTA.....D.GDLAGTVHPQL..Q..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGEDV 61 ----CEAFRLGENVGFPLDE.....N.GQRTAMIHHAL..Q..DSDFKPLMPGMPVFRTFDGKDI 62 --------------------.....-.-----------..Q..AQDSQPLLPGMPISQMFSDEDV 63 PPCAIEVYKIIEKVDYPRDE.....N.GEIAAIIHPNL..Q..TGN------------------- 64 PPCAIEVYKIIEKVDYPRDE.....N.GEIAAIIHPNL..Q..---------------------- 65 --FEMDIYRNLGSVDFPRTA.....D.GDLAGTVHPQL..-..---------------------- 60 70 80 90 | | | | 1 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRSTLH 2 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRCSLH 3 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRCSLH 4 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLMLNAKSIRCSV- 5 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLSAKSIRSTL- 6 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRSTL- 7 PL...G..GDS...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLILNARSIRSSL- 8 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLSAKSIRSTL- 9 PL...G..GDY...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLSAKSIRSTL- 10 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLSAKSIRST-- 11 PL...G..GDQ...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNANSIRSSL- 12 SL...G..GDQ...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNANSIRSSL- 13 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRCCL- 14 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRCCL- 15 AY...K..GDC...TAYPTFINEAAYYEKKQAFVKTIKMELTAGHIRS--- 16 PL...G..GDC...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRSTL- 17 PL...G..GDS...TVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLILNARSIRSSL- 18 AY...E..GDC...IVYPTFINEAAYYEKNQAFTTTQKMTLCAQSIRCT-- 19 LY...E..GAN...TVYPTFINEAAYYEKQQAFVTTCREILAANA------ 20 YY...Q..GPG...TVYPTFINEAAYYEKQQAFVTTRREALV--------- 21 LY...E..GDS...IVYPVFINEAAYYEKHVAFLKSEKIRVTVP------- 22 LY...E..GDS...IVYPVFINEAAYYEKHVAFLKSEKIRVTVP------- 23 LY...E..GES...TVYPVFINEAAYYEKGVAFVQTEKFTFTVPAM----- 24 AY...E..GTS...TVYPIFINEAAYYEKGIAMLFTEKQLI---------- 25 LY...E..GES...TVYPVFINEAAYYEKGVAFVQTEKFTFTVPAM----- 26 LY...E..GDS...VVYPLFVNEAAYYEKRVAFLKSEKIRISVPA------ 27 AY...E..GTS...IVYPIFINEAAYYEKGIAMLFTEKQLI---------- 28 YY...Q..EES...PVWPVFINEAAYYEKGIAMCLTKKE------------ 29 LY...N..GEK...QIYPVFINEAAYYEKKVAFIATEKTHCLVP------- 30 RF...E..GRD...SPIPVFINEAAYVEKHIAMSLTCREVCPL-------- 31 SL...G..GDQ...TVYPVFVNEAAYYE----------------------- 32 TY...A..DED...TIWPVFIGEVAYKEKNIAMSFTKKEVVSVS------- 33 RF...E..EDE...PYIPVFINEAAYVEKNIAMSFTKRELWNFK------- 34 VF...D..GED...GLVPVFINEAAYAEKAIALSLTKRETWPL-------- 35 VY...E..GAS...TVWPIFINEAAYYEKGIAMCLTQKQ------------ 36 FW...E..GDY...EAYPHFINEAAYYDNNLAMSLGKKIVV---------- 37 FW...E..GDY...EAYPHFINEAAYYDNNLAMSLGKKIVV---------- 38 SY...S..GPD...GVVPVFINEAAYAEKAIALSVTSKEEWPL-------- 39 SW...E..GDY...EAYPHFINEAAYYDNNLAMSLAKKRI----------- 40 TC...E..EEE...PLHPFFINEGAYYEKGIAFHLAKKWILTVPSVQ---- 41 FY...E..GES...TVYPIFINEAAYYEKGIAMYLSQK------------- 42 RY...EptDPE...PLWPVFINEAAYGEKGIALSLTRRERWPC-------- 43 KY...K..GKE...PLYPFFINECAYYEKSIALSLARKRCVVV-------- 44 LLlegG..LEE...EFVPVFINEAAYAEKNIAMSLTKKEMWDVQ------- 45 CW...E..GDY...EAYPHFINEAAYYDNNLAMSLAKKRI----------- 46 KY...E..EEE...PLHPLFINECAYYEKGIAFHLAKRMRLTIPAV----- 47 PY...Q..GDK...AVYGAFINEAAYYDQHIGLSFMEKINIE--------- 48 PY...P..GTT...PVYGAFINEAAYYDAHVGLSLMEKITI---------- 49 LLlegG..LEE...EFVPVFINEAAYAEKNIAMSLTKKEMWDVQ------- 50 CE...A..WVG...GEIPVFVNEAAYAEKSIAFSLTRREVWPVE------- 51 KL...S..AENfqeDLIPVFINEAAYLEKGIAMSLTVRESWRF-------- 52 TY...Q..GDS...TVYPVFVNEAAYYEKGIAMCLAKQRE----------- 53 ETp..Q..MEH...QSIPVFINEAAYAEKHIAFSLTRREVWTME------- 54 PL...Qa.DEG...ETWPLFINEAAYAEKRIAFSLTRREVWPID------- 55 FW...E..GKQ...EIYPHFINESAYSKANIAMALAEKKCV---------- 56 HW...N..GKG...EIYPHFINESAYSTANIAMALAKKR------------ 57 KY...D..GDQ...FIWPVFIGEVAYKEKQIAMSYTNKEVIC--------- 58 PY...Q..GAA...TVYPVFIGEAAYVEKGIAMALTQRK------------ 59 TY...E..GE-...ELYSFFINECAYYEKKIAFLLGEKV------------ 60 LY...E..GDS...IVYPVFINEA--------------------------- 61 TW...N..SDK...ETYPHFINEAAYFKLDVAFATAQRI------------ 62 LS...E..GES...TVYPVFINEAAYYENGMAVIQIEKLPL---------- 63 --...-..---...------------------------------------- 64 --...-..---...------------------------------------- 65 --...-..---...-------------------------------------