Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 | | | | 1 ...A...LD....FIQRFNEGKE.F.P.PC..AIDVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GDVAAVIH 2 ikhA...LD....FIHHFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIIEKVDYPRD.....E.N.GEIAAVVH 3 ikhA...LD....FIHHFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIIEKVDYPRD.....E.N.GEIAAVIH 4 ikhA...LD....FIHHFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIIEKVDYPRD.....E.N.GEIAAIIH 5 ikhA...LD....FIHHFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIIEKVDYPRD.....E.N.GEIAAIIH 6 ikhA...LD....FIHHFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIIEKVDYPRD.....E.N.GEIAAVIH 7 ikhA...LD....FIQHFNEGKE.F.P.PC..SIDVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GDMAAVIH 8 ikhA...LD....FIQHFNEGKE.F.P.PC..SIDVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GDMAAVIH 9 ikhA...LD....FIQHFNEGKE.F.P.PC..SIDVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GDMAAVIH 10 ikhA...LD....FIQHFNEGKE.F.P.PC..SIDVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GDMAAVIH 11 ikyA...LD....FIHNFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIMEKVDYPRN.....E.N.GDIAALIH 12 lkhA...LD....FIQRFNEGKE.F.P.PC..AIDVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GDVAAVIH 13 iqhA...LD....FIHNFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GEISAIIH 14 iqhA...LD....FIHNFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIMRKVDYPRN.....E.S.GEISAIIH 15 lkhA...LD....FIQRFNEGKE.F.P.PC..AIDVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GDVAAVIH 16 ikyA...LD....FIHNFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIMEKVDYPRN.....E.N.GDIAALIH 17 lkhA...LD....FIELFNNGVE.F.P.PC..TVNVFRVQERMDYPRD.....T.N.GNITAMVH 18 lkhA...LD....FIELFNEGVE.F.P.AC..TVEVFRVLERVDYPRD.....T.N.GNIIAMVH 19 ikhA...LD....FINYFNDGKE.F.L.PC..ILEVFKVLDNVAYPRN.....A.N.GDCTAIIH 20 vatV...LD....FIELFNQGTA.F.P.AF..EMEAYRPVGVVDFPRT.....E.A.GNLAGTVH 21 vatV...LD....FIELFNQGTA.F.P.AF..EMEAYRPVGVVDFPRT.....E.A.GHLAGTVH 22 vasI...LD....FIELFNQGMD.L.P.AF..EMDIYRNLGSVDFPRT.....A.D.GDLAGTVH 23 vasI...LD....FIELFNQGMD.L.P.AF..EMDIYRNLGSVDFPRT.....A.D.GDLAGTVH 24 kh.G...LD....FVHLFNEGKE.F.P.PC..TIEVYKITEKVDYPRN.....K.N.DEVIAIIH 25 iytI...LD....YLEQYNRGNI.PkI.NN..LLALYKFTGTVDYPRN.....E.N.GDIQGMIH 26 iytI...LD....YVEKYNQGNI.PkI.NN..LLSLYKFTGTIDYPRN.....G.N.GDIQAMIH 27 vasI...LD....FIELFNQGME.F.P.AF..EMEVYKNLGSVDFPRT.....T.D.GHLTGTVH 28 q..Is..LD....FIEHFNEGKLdH.I.NR..DIVIYKHLKVVDYPKT.....K.D.GEIVAMIH 29 iqhA...LD....FIHNFNEGKE.F.P.PC..AIEVYKIMEKVDYPRN.....E.S.GEISAIIH 30 ...VdltID....WIHKFNSGTV.F.E.GG..DVEAFKIIKSVDYPRD.....PvT.RSLNAAVH 31 ...VdltID....WIHKFNSGTV.F.E.GG..DVEAFKFIKSVDYPRDp....E.T.RNLTAAVH 32 vyaV...LD....YLEQFNQGKI.AsT.NE..TLILYDHLSVVDYPKQ.....Q.D.GKIFAMIH 33 lvnCs..LD....FLDLFNQGTE.F.P.SF..ETDVHQVLYRADFPRN.....E.D.GEIEAVIH 34 vqhV...LD....WVRSFNSGTI.F.E.GG..CVDVFTMVKHIDYPRE.....R.DtGNIIAAVH 35 iyaI...LD....YFEGCNQGNI.PhT.SS..QLTFYQYIETIDYPRSda6glQ.S.GEIQAMIH 36 issL...RD....EINKLKNNQI.R.L.PK..DLFVHVHQGSIDYPRD.....K.N.GNINALIH 37 ldsC...LK....EISNVINSKT.V.Y.PE..QLIVHRHLKNIDFPRD.....S.S.GVPSSLVH 38 leaV...LA....AITSVRDGSA.R.Y.PD..QVVIHLHLGSLDVPRR.....S.S.GDPDALVH 39 tkhI...LD....FVHLNNTNEV.PeL.PA..SYDAYCYEETLKLPED.....E.Q.GERIGMVH 40 leaA...LA....VLASARRGDL.A.L.PR..GLTVHRHLGSLDLPRH.....P.D.GRPAACLH 41 lqaA...LH....LIAAAWNGRM.L.T.PE..RLVVHRHLGSLDLPRD.....P.Q.GRADALIH 42 tkhI...LD....FVHLNNTNEV.PeL.PA..SYDAYCYEETLKLPVD.....E.Q.GERIGMVH 43 vesL...LD....YLDKKNQDQI.P.EkSH..KLGFYEVFERLDYPR-.....I.N.EEIAAMIH 44 vqaC...LE....ALSSVASGSP.T.Y.PD..EFVVHSHLGSLDLPRD.....A.L.GQPAACVH 45 ldsC...LK....EISNVINSKT.V.Y.PE..QLIVHRHLKNIDFPRD.....S.S.GVPSSLVH 46 vmhA...LD....YLELKNTGQT.PdL.PM..QMGGYRFTKKIRLPEN.....E.E.GDITAMIH 47 ...LqtfID....EIALAKSGKA.K.F.PK..NILVHRHLKSIDFPRD.....E.S.GNQCGFIH 48 ieaC...FE....ALASVRSGVV.R.L.PR..QVVVHRHLGSCDVPRG.....E.S.DQPQALVH 49 letL...ME....QIHEVKNLNL.F.F.PN..KLIIHRHIKSIDFPRD.....E.E.GNIDGYVH 50 trhI...LD....YVDLHNTNAL.PeL.PS..SYEAFEYKETLKLPEN.....E.N.GERIGMVH 51 letC...CQ....ELAAARAGTG.R.D.PH..NLVVHRHLGSVDLPRD.....Q.R.DCAAAMVH 52 issL...RD....EIDKLKKNLI.E.L.PK..DLVVHVHQGSVDYPRD.....E.K.GDIDGLIH 53 trhI...LD....YVDLHNTNAL.PeL.SS..SYEAFEYTETLKLPEN.....E.N.GERIGMVH 54 ...-...LDltfeFVQEFNAGHT.F.E.GG..QVEAYMMEDPVDYPRD.....PtT.GEITASVH 55 vqhC...LD....FLELWNQKAV.PeL.PS..EREGYRFLEKVQLPEN.....E.A.GELTAMLH 56 ltmV...LD....YLEQHNLGQV.G.E.LN..DYDAYFYTEEVMIPVD.....H.D.GMRVATVH 57 lesC...LR....ALYQVRQELA.R.L.PD..ALVVHRHLGSRDLPKA.....E.N.GEPQALVH 58 aevI...LD....FCMAYNNGSI.S.T.DNlpQCEAFRLGENVGFPLD.....E.N.GQRTAMIH 59 ltaV...LD....YVEKHNLNQI.G.L.LS..DYEAFFYTEEIRVPLD.....Q.E.GMRQALVH 60 larI...LA....YLQASTSGNV.P.A.AD..NCTVYQQIDTIDYPRD.....E.Q.GQIVAEIA 61 ...-...--....--------MD.L.P.AF..EMDIYRNLGSVDFPRT.....A.D.GDLAGTVH 62 ...-...--....----------.-.-.--..-----------QAVRA.....E.V.GPSNPGLR 50 60 70 80 90 | | | | | 1 PNLQ..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGK.V...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 2 PNLQ..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGK.T...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 3 PNLQ..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGK.T...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 4 PNLQ..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGK.T...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 5 PNLQ..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGK.T...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 6 PNLQ..DQDWKPLHPGDPMFLTLDGK.T...MPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 7 PNLQ..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGK.V...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 8 PNLQ..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGK.V...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 9 PNLQ..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGK.V...IPLG..G..DYT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 10 PNLQ..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGK.V...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 11 PNLQ..DQDWKPLHPGDPVFLTLEGK.S...IPLG..G..DST...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 12 PNLQ..DQDWKPLHPGDPVFVSLDGK.V...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 13 PKLQ..DQDWKPLHPEDPVFLTLDGK.T...ISLG..G..DQT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 14 PKLQ..DQDWKPLHPEDPVFLTLDGK.T...IPLG..G..DQT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 15 PNLQlqDQDWKPLHPGDPVFVSLDGK.V...IPLG..G..DCT...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 16 PNLQlsDQDWKPLHPGDPVFLTLEGK.S...IPLG..G..DST...VYPVFVNEAAYYEKKEAFA 17 PHLQ..DCDWEPLNRGDPMFLTFDGR.T...ILYE..G..ANT...VYPTFINEAAYYEKQQAFV 18 PNLQ..DCDWEPLTPGDPMFQTFDGK.T...IYYQ..G..PGT...VYPTFINEAAYYEKQQAFV 19 NNLQ..DQDWNELKPGDPMFLTLDGR.M...IAYE..G..DCI...VYPTFINEAAYYEKNQAFT 20 PQLQ..DRDFQPLQPGAPIFQMFSGE.D...LLYE..G..EST...VYPVFINEAAYYEKGVAFV 21 PQLQ..DRDFQPLQPGAPIFQMFSGE.D...LLYE..G..EST...VYPVFINEAAYYEKGVAFV 22 PQLQ..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGE.D...VLYE..G..DSI...VYPVFINEAAYYEKHVAFL 23 PQLQ..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGE.D...VLYE..G..DSI...VYPVFINEAAYYEKHVAFL 24 PNLQ..DQDWQPLNNGDPLFLTLDGE.V...IAYK..G..DCT...AYPTFINEAAYYEKKQAFV 25 PDIQ..FRDYEPLNPGDPLFLTLDGK.A...IAYE..G..TST...VYPIFINEAAYYEKGIAML 26 PDIQ..FRDYAPLNPGDPLFLTLDGK.A...IAYE..G..TSI...VYPIFINEAAYYEKGIAML 27 SRLQ..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGE.D...VLYE..G..DSV...VYPLFVNEAAYYEKRVAFL 28 PQLQ..GRDYQKLSPGEPMFLTFDNQ.T...IYYQ..E..ESP...VWPVFINEAAYYEKGIAMC 29 PKLQ..DQDWKPLHPEDPVFLTLDGK.T...ISLG..G..DQT...VYPVFVNEAAYYEK----- 30 PQLQ..DRDFCLLKRGDPLFLSFSGE.T...VKYE..E..EEP...LHPLFINECAYYEKGIAFH 31 PQLQ..DRDFCLLKRGDPLFLSFSGE.T...VTCE..E..EEP...LHPFFINEGAYYEKGIAFH 32 PELQ..DKDYQALNPGDPMFITFDNK.T...IVYE..G..AST...VWPIFINEAAYYEKGIAMC 33 SELQ..DKDYLPLKPGDPIFQRLNGE.D...ILYN..G..EKQ...IYPVFINEAAYYEKKVAFI 34 PQLQ..DRDFCLLHPEDPLFQTFSGE.T...LKYK..G..KEP...LYPFFINECAYYEKSIALS 35 PQLQ..FKDYEPLNPGDPMFLTFAGK.D...IFYE..G..EST...VYPIFINEAAYYEKGIAMY 36 PERI..NQDWKPIKKDAPLFMDMEGK.T...KTYA..D..EDT...IWPVFIGEVAYKEKNIAMS 37 KDIQ..GRDWYPIKNGHPLFESLSGDlT...LLLE..GglEEE...FVPVFINEAAYAEKNIAMS 38 PNLQ..GRDWQPLKAGDPLFIDAESN.T...VVFD..G..EDG...LVPVFINEAAYAEKAIALS 39 QSVQ..DNDFEPLRSGDPIFTLFDGT.E...IFWE..G..DYE...AYPHFINEAAYYDNNLAMS 40 PLRQ..HRDWQVIRPGDPLFVTAGGE.T...LRYEptD..PEP...LWPVFINEAAYGEKGIALS 41 PELQ..GRDWSPIRRGDPLFLTAAGD.T...ISYS..G..PDG...VVPVFINEAAYAEKAIALS 42 QSVQ..DNDFEPLRSGDPIFTLFDGT.E...IFWE..G..DYE...AYPHFINEAAYYDNNLAMS 43 PNLQ..FKDYKPLNPGDDLFITFDGK.T...ITYQ..G..DST...VYPVFVNEAAYYEKGIAMC 44 PSLQ..GRDWQPLQMGAPLFLWPDGE.V...FRFE..G..RDS...PIPVFINEAAYVEKHIAMS 45 GDNP..GRDWYPIKNGHPLFESLSGDlT...LLLE..GglEEE...FVPVFINEAAYAEKNIAMS 46 PNLQ..NKDYEEIRPGDPLFITLGGE.T...IPYQ..G..DKA...VYGAFINEAAYYDQHIGLS 47 SQIQ..GKDWIPINRETPLFEDTEGN.T...VKLS..A..ENFqedLIPVFINEAAYLEKGIAMS 48 QRLQ..GRDWVPFKPLDAIFEAADGS.T...VETP..Qm.EHQ...SIPVFINEAAYAEKHIAFS 49 SLRQ..SKDWQELKKNDELFCKLNGE.I...IRFE..E..DEP...YIPVFINEAAYVEKNIAMS 50 KNVQ..DGDFKQLNSGDPIFTLFDGS.E...ISWE..G..DYE...AYPHFINEAAYYDNNLAMS 51 PQLQ..GQDWRPLMDGAAMFELPRGG.T...VPLQa.D..EGE...TWPLFINEAAYAEKRIAFS 52 PKRI..NRDWKMIKKGDPLFLNSQGI.I...YKYD..G..DQF...IWPVFIGEVAYKEKQIAMS 53 KNVQ..DGDFKQLNSGDPIFTLFDGS.E...ICWE..G..DYE...AYPHFINEAAYYDNNLAMS 54 SQLQ..DKDFKLLKPGDPIFKKFSGE.T...VTYE..G..EE-...LYSFFINECAYYEKKIAFL 55 PDLQ..DQDYQEIAPGDPFFMTLSGE.T...IPYP..G..TTP...VYGAFINEAAYYDAHVGLS 56 PMIC..GRDFGVVKPGEPLLATFFGY.D...IFWE..G..KQE...IYPHFINESAYSKANIAMA 57 PELQ..GRDWQNIASTQAMFRAADGT.DrceAWVG..G..E--...-IPVFVNEAAYAEKSIAFS 58 HALQ..DSDFKPLMPGMPVFRTFDGK.D...ITWN..S..DKE...TYPHFINEAAYFKLDVAFA 59 PTIC..GRDFEAVKPGAPLLATFAGY.D...IHWN..G..KGE...IYPHFINESAYSTANIAMA 60 PHI-..-RDYQAIKPGTPLFYHRRGN.V...TPYQ..G..AAT...VYPVFIGEAAYVEKGIAMA 61 PQLQ..DHDFEPLRPGEPIFKLFSGE.D...VLYE..G..DSI...VYPVFINEASQ-------- 62 LSSQ..AQDSQPLLPGMPISQMFSDE.D...VLSE..G..EST...VYPVFINEAAYYENGMAVI 100 110 | | 1 KTTK..LT.LN.A.KS.IR..ST.LH.... 2 KTTK..LT.LN.A.KS.IR..CS.LH.... 3 KTTK..LT.LN.A.KS.IR..CS.LH.... 4 KTTK..LT.LN.A.KS.IR..CC.LH.... 5 KTTK..LT.LN.A.KS.IR..CC.LHd... 6 KTTK..LM.LN.A.KS.IR..CS.VH.... 7 KTTK..LT.LS.A.KS.IR..ST.LH.... 8 KTTK..LT.LS.A.KS.IR..ST.LH.... 9 KTTK..LT.LS.A.KS.IR..ST.LH.... 10 KTTK..LT.LS.A.KS.IR..ST.LP.... 11 KTTK..LI.LN.A.RS.IR..SS.LH.... 12 KTTK..LT.LN.A.KS.IR..ST.LH.... 13 KTTK..LT.LN.A.NS.IR..SS.LH.... 14 KTTK..LT.LN.A.NS.IR..SS.LH.... 15 KTTK..LT.LN.A.KS.IR..ST.LH.... 16 KTTK..LI.LN.A.RS.IR..SS.LH.... 17 TTCR..EI.LA.A.NA.IR..KA.F-.... 18 TTRR..EA.LV.A.ST.IR..--.--.... 19 TTQK..MT.LC.A.QS.IR..CTePK.... 20 QTEK..FT.FT.V.PA.-M..PA.LTpaps 21 QTEK..FT.FT.V.PA.-M..PA.LTpaps 22 KSEK..IR.VT.V.PA.LL..R-.LTprst 23 KSEK..IR.VT.V.PA.LL..R-.LTprst 24 KTIK..ME.LT.A.GH.IR..SS.AVgqn. 25 FTEK..QL.IN.P.SS.--..--.--.... 26 FTEK..QL.IN.F.D-.--..--.--.... 27 KSEK..IR.IS.V.PA.LP..G-.LTpsst 28 LTKK..ES.IR.V.--.--..--.--.... 29 ----..--.--.-.--.--..--.--.... 30 LAKR..MR.LT.I.PA.VQ..VQ.KD.... 31 LAKK..WI.LT.V.PS.VQ..VH.TKnsa. 32 LTQK..QQ.IN.I.--.--..--.--.... 33 ATEK..TH.CL.V.PA.L-..-K.VQ.... 34 LARK..RC.VV.V.PS.I-..--.--.... 35 LSQK..LQeI-.-.--.--..--.--.... 36 FTKK..EV.VS.V.SD.QMyeEF.FS.... 37 LTKK..EM.WD.VqKD.WI..ND.LSkll. 38 LTKR..ET.WP.LpKD.WK..EA.LAell. 39 LGKK..IV.VS.T.N-.--..--.--.... 40 LTRR..ER.WP.C.EAaWA..ED.LQqla. 41 VTSK..EE.WP.LsPE.AP..GA.LQdll. 42 LGKK..IV.VS.T.N-.--..--.--.... 43 LAKQreIV.VN.F.NN.--..--.--.... 44 LTCR..EV.CP.L.PEqWQ..GA.LQqlv. 45 LTKK..EM.WD.VqKD.WI..ND.LSkll. 46 FMEK..IN.IE.L.KQ.EG..--.--.... 47 LTVR..ES.WR.FeRN.WY..ED.LKkiv. 48 LTRR..EV.WT.MePQ.WL..DH.LSell. 49 FTKR..EL.WN.FkKE.WK..QA.LIdli. 50 LAKK..RI.VE.V.--.--..--.--.... 51 LTRR..EV.WP.IdPS.WG..QA.LEqlm. 52 YTNK..EV.IC.SkNE.WV..QE.FHrl.. 53 LAKK..RI.VE.I.--.--..--.--.... 54 LGEK..VR.LD.-.--.--..--.--.... 55 LMEK..IT.IP.Y.RR.--..--.--.... 56 LAEK..KC.VR.A.SD.--..--.--.... 57 LTRR..EV.WP.VePN.WL..LA.LKqll. 58 TAQR..II.L-.-.--.--..--.--.... 59 LAKK..RR.VSsV.--.--..--.--.... 60 LTQR..KT.IA.I.--.--..--.--.... 61 ----..--.--.-.--.--..--.--.... 62 QIEK..LP.LC.AcPA.ET..RC.LApve.