# TARGET T0285 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0285.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 2 Y 0.084 0.079 0.008 0.028 0.007 0.031 0.764 3 L 0.054 0.049 0.008 0.029 0.193 0.037 0.629 4 P 0.024 0.009 0.020 0.035 0.124 0.138 0.650 5 D 0.011 0.009 0.025 0.044 0.252 0.294 0.365 6 D 0.005 0.010 0.021 0.053 0.444 0.158 0.309 7 S 0.005 0.008 0.011 0.084 0.394 0.052 0.446 8 P 0.007 0.005 0.041 0.508 0.099 0.146 0.193 9 A 0.013 0.008 0.066 0.637 0.040 0.104 0.132 10 K 0.025 0.007 0.048 0.761 0.032 0.039 0.088 11 R 0.039 0.004 0.023 0.847 0.018 0.020 0.050 12 L 0.052 0.004 0.018 0.859 0.012 0.021 0.033 13 L 0.063 0.005 0.018 0.859 0.009 0.024 0.023 14 F 0.069 0.003 0.021 0.848 0.011 0.025 0.023 15 Q 0.077 0.002 0.032 0.800 0.018 0.046 0.024 16 M 0.056 0.004 0.029 0.762 0.032 0.081 0.037 17 V 0.072 0.007 0.024 0.635 0.057 0.110 0.094 18 G 0.056 0.004 0.052 0.488 0.088 0.205 0.106 19 N 0.062 0.006 0.070 0.433 0.115 0.174 0.140 20 A 0.077 0.017 0.079 0.464 0.086 0.115 0.162 21 I 0.082 0.025 0.051 0.473 0.092 0.116 0.162 22 N 0.063 0.011 0.035 0.401 0.113 0.147 0.230 23 R 0.024 0.005 0.042 0.492 0.119 0.214 0.105 24 N 0.019 0.004 0.040 0.457 0.104 0.249 0.128 25 T 0.028 0.008 0.046 0.539 0.090 0.126 0.163 26 Q 0.033 0.008 0.042 0.579 0.079 0.101 0.158 27 Q 0.043 0.009 0.051 0.606 0.061 0.100 0.130 28 L 0.048 0.013 0.050 0.619 0.050 0.080 0.140 29 T 0.053 0.010 0.054 0.601 0.065 0.073 0.143 30 Q 0.039 0.004 0.093 0.622 0.053 0.090 0.098 31 D 0.029 0.006 0.106 0.590 0.057 0.095 0.117 32 L 0.025 0.007 0.151 0.575 0.044 0.097 0.102 33 R 0.029 0.004 0.142 0.488 0.053 0.204 0.081 34 A 0.025 0.005 0.108 0.392 0.090 0.268 0.111 35 M 0.034 0.012 0.056 0.194 0.218 0.100 0.387 36 P 0.023 0.009 0.090 0.160 0.159 0.307 0.252 37 N 0.038 0.007 0.113 0.094 0.145 0.410 0.193 38 W 0.145 0.014 0.116 0.135 0.141 0.150 0.299 39 S 0.413 0.017 0.045 0.086 0.084 0.070 0.285 40 L 0.640 0.013 0.032 0.064 0.052 0.033 0.165 41 R 0.752 0.010 0.021 0.039 0.047 0.021 0.110 42 F 0.858 0.006 0.010 0.027 0.017 0.010 0.072 43 V 0.913 0.003 0.006 0.019 0.010 0.006 0.044 44 Y 0.919 0.004 0.005 0.020 0.009 0.005 0.038 45 I 0.900 0.006 0.005 0.019 0.012 0.006 0.052 46 V 0.796 0.020 0.007 0.025 0.031 0.012 0.111 47 D 0.417 0.015 0.014 0.043 0.089 0.040 0.383 48 R 0.100 0.009 0.054 0.082 0.182 0.317 0.256 49 N 0.034 0.008 0.042 0.060 0.273 0.383 0.199 50 N 0.034 0.010 0.064 0.083 0.225 0.201 0.384 51 Q 0.031 0.011 0.132 0.190 0.173 0.198 0.266 52 D 0.044 0.024 0.203 0.210 0.127 0.182 0.210 53 L 0.061 0.028 0.259 0.226 0.102 0.143 0.181 54 L 0.096 0.028 0.139 0.222 0.089 0.203 0.223 55 K 0.097 0.029 0.100 0.143 0.136 0.246 0.249 56 R 0.066 0.012 0.021 0.039 0.360 0.076 0.427 57 P 0.059 0.024 0.011 0.013 0.170 0.065 0.657 58 L 0.083 0.093 0.008 0.018 0.169 0.028 0.601 59 P 0.038 0.015 0.011 0.009 0.103 0.030 0.794 60 P 0.025 0.007 0.059 0.027 0.208 0.486 0.187 61 G 0.092 0.011 0.072 0.036 0.209 0.418 0.162 62 I 0.431 0.036 0.042 0.046 0.060 0.038 0.347 63 M 0.769 0.020 0.011 0.025 0.021 0.017 0.137 64 V 0.795 0.014 0.010 0.021 0.029 0.018 0.114 65 L 0.701 0.023 0.012 0.028 0.045 0.023 0.168 66 A 0.381 0.015 0.023 0.044 0.088 0.035 0.414 67 P 0.199 0.009 0.087 0.065 0.137 0.164 0.337 68 R 0.192 0.019 0.146 0.089 0.114 0.208 0.231 69 L 0.196 0.034 0.121 0.099 0.138 0.109 0.304 70 T 0.176 0.027 0.098 0.109 0.123 0.111 0.356 71 A 0.135 0.018 0.071 0.094 0.163 0.197 0.323 72 K 0.076 0.020 0.047 0.086 0.278 0.162 0.331 73 H 0.053 0.016 0.019 0.058 0.304 0.041 0.509 74 P 0.037 0.010 0.046 0.118 0.116 0.158 0.516 75 Y 0.044 0.015 0.107 0.173 0.102 0.208 0.351 76 D 0.055 0.013 0.128 0.214 0.139 0.163 0.288 77 K 0.088 0.027 0.085 0.297 0.109 0.108 0.285 78 V 0.089 0.027 0.070 0.361 0.100 0.084 0.269 79 Q 0.088 0.016 0.058 0.376 0.103 0.103 0.255 80 D 0.063 0.010 0.057 0.453 0.097 0.133 0.186 81 R 0.040 0.007 0.046 0.464 0.116 0.188 0.139 82 N 0.048 0.009 0.050 0.317 0.096 0.264 0.214 83 R 0.086 0.013 0.078 0.275 0.133 0.155 0.260 84 K 0.148 0.023 0.103 0.244 0.102 0.162 0.217 85 L 0.175 0.023 0.096 0.161 0.146 0.156 0.243 86 Y 0.230 0.022 0.053 0.088 0.115 0.254 0.237 87 G 0.229 0.009 0.052 0.041 0.170 0.225 0.275 88 R 0.376 0.009 0.039 0.027 0.172 0.090 0.287 89 H 0.639 0.015 0.016 0.012 0.072 0.031 0.214 90 I 0.771 0.019 0.006 0.008 0.030 0.008 0.158 91 T 0.824 0.024 0.004 0.005 0.017 0.007 0.120 92 L 0.659 0.024 0.009 0.008 0.035 0.032 0.233 93 N 0.296 0.010 0.022 0.010 0.149 0.273 0.240 94 D 0.071 0.009 0.022 0.007 0.282 0.503 0.106 95 G 0.051 0.004 0.018 0.003 0.358 0.398 0.168 96 N 0.182 0.014 0.012 0.003 0.364 0.135 0.289 97 S 0.591 0.022 0.005 0.001 0.076 0.028 0.276 98 V 0.816 0.007 0.001 0.001 0.019 0.003 0.154 99 K 0.934 0.003 0.001 0.001 0.015 0.001 0.046 100 V 0.966 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.026 101 V 0.962 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.030 102 T 0.935 0.003 0.001 0.001 0.006 0.001 0.052 103 I 0.834 0.012 0.004 0.003 0.016 0.004 0.127 104 S 0.597 0.012 0.011 0.009 0.075 0.030 0.266 105 A 0.200 0.011 0.040 0.026 0.211 0.203 0.309 106 G 0.059 0.018 0.050 0.026 0.248 0.301 0.298 107 R 0.059 0.024 0.066 0.027 0.287 0.165 0.371 108 D 0.047 0.022 0.068 0.040 0.264 0.207 0.352 109 E 0.025 0.020 0.051 0.056 0.356 0.191 0.302 110 G 0.010 0.009 0.031 0.051 0.306 0.093 0.499 111 P 0.011 0.009 0.048 0.117 0.174 0.227 0.412 112 D 0.014 0.010 0.064 0.188 0.137 0.220 0.366 113 R 0.021 0.007 0.070 0.482 0.111 0.113 0.196 114 D 0.034 0.006 0.038 0.708 0.045 0.063 0.106 115 I 0.041 0.008 0.026 0.812 0.027 0.024 0.063 116 I 0.038 0.006 0.016 0.874 0.011 0.016 0.039 117 W 0.034 0.002 0.012 0.905 0.010 0.017 0.021 118 E 0.043 0.001 0.015 0.893 0.010 0.020 0.017 119 M 0.025 0.001 0.026 0.884 0.014 0.023 0.028 120 F 0.028 0.004 0.027 0.846 0.022 0.043 0.031 121 L 0.027 0.002 0.036 0.754 0.034 0.096 0.052 122 E 0.022 0.002 0.034 0.596 0.066 0.200 0.080 123 N 0.022 0.005 0.028 0.321 0.116 0.236 0.271 124 L 0.014 0.016 0.017 0.107 0.007 0.124 0.714 125 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998