# TARGET T0283 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0283.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 12.5344 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.026 0.699 0.010 0.013 0.015 0.031 0.055 0.151 2 S 0.009 0.830 0.008 0.009 0.011 0.017 0.049 0.066 3 F 0.011 0.949 0.002 0.001 0.002 0.004 0.015 0.016 4 I 0.019 0.927 0.004 0.002 0.002 0.004 0.029 0.014 5 E 0.035 0.780 0.011 0.005 0.006 0.012 0.086 0.065 6 K 0.044 0.402 0.018 0.007 0.009 0.035 0.345 0.141 7 M 0.054 0.393 0.018 0.005 0.006 0.034 0.370 0.119 8 I 0.070 0.333 0.017 0.008 0.011 0.057 0.181 0.323 9 G 0.027 0.209 0.017 0.011 0.013 0.079 0.085 0.558 10 S 0.090 0.331 0.021 0.008 0.010 0.076 0.113 0.352 11 L 0.218 0.259 0.019 0.012 0.011 0.077 0.088 0.317 12 N 0.063 0.197 0.013 0.008 0.009 0.086 0.062 0.561 13 D 0.017 0.646 0.006 0.003 0.005 0.035 0.029 0.260 14 K 0.027 0.808 0.007 0.003 0.005 0.023 0.015 0.112 15 R 0.014 0.816 0.013 0.012 0.007 0.016 0.044 0.076 16 E 0.005 0.961 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 0.016 17 W 0.009 0.976 0.002 0.001 0.001 0.001 0.007 0.005 18 K 0.003 0.970 0.001 0.002 0.001 0.002 0.011 0.009 19 A 0.005 0.930 0.002 0.001 0.001 0.003 0.040 0.017 20 M 0.003 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.002 21 E 0.011 0.958 0.002 0.001 0.001 0.001 0.016 0.010 22 A 0.081 0.621 0.054 0.008 0.004 0.017 0.109 0.107 23 R 0.350 0.354 0.018 0.006 0.004 0.025 0.093 0.150 24 A 0.739 0.023 0.012 0.001 0.001 0.015 0.048 0.162 25 K 0.021 0.019 0.002 0.001 0.001 0.052 0.016 0.888 26 A 0.002 0.009 0.001 0.001 0.001 0.030 0.003 0.954 27 L 0.114 0.198 0.008 0.003 0.002 0.108 0.059 0.507 28 P 0.364 0.435 0.004 0.001 0.001 0.027 0.044 0.125 29 K 0.096 0.615 0.003 0.001 0.001 0.027 0.046 0.212 30 E 0.007 0.901 0.003 0.001 0.001 0.010 0.018 0.059 31 Y 0.004 0.956 0.002 0.001 0.001 0.003 0.019 0.016 32 H 0.003 0.960 0.003 0.001 0.001 0.003 0.019 0.010 33 H 0.004 0.966 0.004 0.001 0.001 0.002 0.018 0.005 34 A 0.002 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.003 35 Y 0.004 0.922 0.006 0.001 0.001 0.001 0.060 0.005 36 K 0.002 0.963 0.002 0.001 0.001 0.002 0.021 0.009 37 A 0.012 0.937 0.004 0.001 0.001 0.003 0.029 0.014 38 I 0.019 0.827 0.005 0.002 0.002 0.008 0.117 0.021 39 Q 0.017 0.685 0.005 0.003 0.004 0.017 0.160 0.109 40 K 0.022 0.245 0.012 0.007 0.010 0.040 0.480 0.184 41 Y 0.013 0.090 0.031 0.020 0.021 0.061 0.695 0.070 42 M 0.061 0.101 0.074 0.038 0.085 0.102 0.284 0.255 43 W 0.148 0.025 0.065 0.047 0.075 0.120 0.071 0.450 44 T 0.067 0.008 0.035 0.031 0.041 0.131 0.120 0.567 45 S 0.022 0.004 0.019 0.012 0.026 0.192 0.056 0.668 46 G 0.016 0.004 0.013 0.011 0.019 0.205 0.026 0.706 47 G 0.075 0.028 0.008 0.010 0.009 0.144 0.028 0.699 48 P 0.187 0.142 0.010 0.007 0.009 0.091 0.061 0.492 49 T 0.077 0.138 0.013 0.008 0.009 0.105 0.076 0.575 50 D 0.110 0.294 0.013 0.006 0.007 0.065 0.230 0.274 51 W 0.123 0.580 0.007 0.004 0.005 0.047 0.058 0.176 52 Q 0.047 0.581 0.008 0.006 0.011 0.046 0.052 0.249 53 D 0.019 0.863 0.003 0.002 0.004 0.013 0.022 0.075 54 T 0.024 0.724 0.004 0.002 0.004 0.013 0.183 0.046 55 K 0.011 0.709 0.021 0.011 0.007 0.015 0.171 0.055 56 R 0.029 0.606 0.024 0.009 0.011 0.033 0.186 0.103 57 I 0.113 0.770 0.018 0.002 0.002 0.016 0.037 0.042 58 F 0.050 0.641 0.007 0.002 0.004 0.019 0.181 0.097 59 G 0.010 0.586 0.011 0.003 0.003 0.020 0.155 0.212 60 G 0.004 0.936 0.004 0.001 0.002 0.008 0.018 0.026 61 I 0.008 0.969 0.005 0.001 0.001 0.003 0.007 0.009 62 L 0.019 0.901 0.017 0.001 0.001 0.005 0.039 0.016 63 D 0.009 0.891 0.013 0.001 0.001 0.005 0.053 0.026 64 L 0.019 0.849 0.021 0.001 0.001 0.008 0.083 0.019 65 F 0.011 0.943 0.009 0.001 0.001 0.003 0.020 0.012 66 E 0.018 0.859 0.014 0.002 0.003 0.007 0.016 0.081 67 E 0.040 0.758 0.026 0.004 0.003 0.017 0.037 0.114 68 G 0.116 0.107 0.195 0.028 0.013 0.038 0.362 0.140 69 A 0.635 0.022 0.014 0.004 0.004 0.036 0.048 0.237 70 A 0.498 0.003 0.006 0.001 0.001 0.022 0.028 0.442 71 E 0.010 0.003 0.003 0.001 0.003 0.056 0.004 0.919 72 G 0.003 0.001 0.005 0.001 0.005 0.048 0.010 0.927 73 K 0.007 0.007 0.051 0.102 0.048 0.168 0.052 0.565 74 K 0.035 0.018 0.114 0.073 0.069 0.060 0.069 0.561 75 V 0.074 0.016 0.091 0.076 0.051 0.076 0.118 0.499 76 T 0.008 0.019 0.286 0.073 0.109 0.046 0.102 0.356 77 D 0.029 0.026 0.135 0.055 0.085 0.081 0.043 0.546 78 L 0.019 0.038 0.187 0.085 0.065 0.112 0.048 0.447 79 T 0.048 0.417 0.052 0.014 0.031 0.059 0.069 0.311 80 G 0.063 0.695 0.021 0.008 0.011 0.024 0.071 0.109 81 E 0.018 0.613 0.019 0.013 0.008 0.039 0.105 0.186 82 D 0.014 0.928 0.003 0.001 0.001 0.005 0.030 0.018 83 V 0.017 0.954 0.001 0.001 0.001 0.002 0.019 0.007 84 A 0.016 0.884 0.003 0.001 0.001 0.003 0.077 0.016 85 A 0.007 0.884 0.002 0.001 0.001 0.006 0.071 0.028 86 F 0.005 0.967 0.002 0.001 0.001 0.002 0.018 0.006 87 C 0.006 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 88 D 0.017 0.930 0.008 0.001 0.001 0.003 0.021 0.020 89 E 0.047 0.804 0.019 0.001 0.001 0.011 0.059 0.058 90 L 0.158 0.197 0.065 0.001 0.001 0.019 0.494 0.065 91 M 0.205 0.235 0.020 0.001 0.001 0.043 0.138 0.356 92 K 0.043 0.050 0.010 0.001 0.001 0.048 0.075 0.774 93 D 0.017 0.092 0.009 0.002 0.001 0.089 0.090 0.700 94 T 0.101 0.323 0.012 0.003 0.004 0.090 0.053 0.413 95 K 0.109 0.276 0.014 0.006 0.006 0.083 0.041 0.466 96 T 0.059 0.452 0.018 0.005 0.006 0.071 0.033 0.356 97 W 0.054 0.580 0.026 0.008 0.009 0.057 0.039 0.227 98 M 0.062 0.438 0.018 0.006 0.009 0.054 0.075 0.338 99 D 0.071 0.321 0.015 0.008 0.007 0.033 0.429 0.116 100 K 0.018 0.570 0.011 0.009 0.011 0.040 0.136 0.205 101 Y 0.062 0.646 0.010 0.009 0.016 0.030 0.039 0.190 102 R 0.077 0.301 0.024 0.044 0.043 0.066 0.163 0.283 103 T 0.069 0.226 0.014 0.023 0.037 0.091 0.094 0.446 104 K 0.133 0.091 0.016 0.027 0.029 0.117 0.105 0.482 105 L 0.048 0.066 0.009 0.013 0.015 0.130 0.072 0.646 106 N 0.111 0.127 0.013 0.012 0.024 0.085 0.126 0.502 107 D 0.103 0.091 0.016 0.030 0.043 0.106 0.072 0.540 108 S 0.079 0.032 0.034 0.052 0.066 0.115 0.065 0.556 109 I 0.054 0.011 0.025 0.043 0.070 0.142 0.044 0.612 110 G 0.061 0.009 0.021 0.032 0.066 0.118 0.056 0.637 111 R 0.051 0.008 0.013 0.031 0.042 0.110 0.043 0.702 112 D 0.042 0.011 0.014 0.025 0.046 0.104 0.042 0.716