# TARGET T0283 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0283.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 7.04591 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.023 0.703 0.010 0.012 0.013 0.029 0.070 0.141 2 S 0.010 0.873 0.006 0.007 0.008 0.014 0.037 0.046 3 F 0.015 0.948 0.002 0.001 0.002 0.003 0.015 0.014 4 I 0.030 0.900 0.006 0.003 0.002 0.005 0.037 0.017 5 E 0.039 0.691 0.019 0.007 0.008 0.017 0.109 0.109 6 K 0.083 0.330 0.032 0.008 0.010 0.061 0.235 0.241 7 M 0.083 0.260 0.030 0.008 0.009 0.053 0.365 0.191 8 I 0.063 0.210 0.019 0.006 0.010 0.078 0.109 0.505 9 G 0.032 0.147 0.021 0.011 0.014 0.086 0.076 0.614 10 S 0.079 0.282 0.019 0.010 0.010 0.088 0.089 0.424 11 L 0.265 0.236 0.017 0.009 0.011 0.072 0.080 0.310 12 N 0.075 0.190 0.012 0.008 0.009 0.093 0.062 0.551 13 D 0.021 0.587 0.006 0.003 0.006 0.037 0.035 0.305 14 K 0.030 0.769 0.007 0.004 0.006 0.028 0.017 0.138 15 R 0.015 0.791 0.013 0.016 0.010 0.020 0.045 0.091 16 E 0.006 0.950 0.002 0.001 0.001 0.004 0.013 0.022 17 W 0.011 0.967 0.002 0.001 0.001 0.002 0.010 0.007 18 K 0.004 0.962 0.002 0.003 0.002 0.002 0.013 0.012 19 A 0.007 0.915 0.003 0.001 0.002 0.004 0.047 0.023 20 M 0.004 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.002 21 E 0.010 0.961 0.002 0.001 0.001 0.001 0.014 0.010 22 A 0.068 0.635 0.052 0.009 0.005 0.017 0.106 0.109 23 R 0.291 0.418 0.017 0.008 0.005 0.026 0.093 0.143 24 A 0.745 0.028 0.012 0.001 0.001 0.016 0.050 0.147 25 K 0.023 0.026 0.003 0.002 0.002 0.057 0.020 0.868 26 A 0.002 0.011 0.002 0.001 0.001 0.030 0.003 0.951 27 L 0.114 0.232 0.008 0.004 0.002 0.103 0.064 0.474 28 P 0.325 0.468 0.004 0.001 0.001 0.028 0.050 0.124 29 K 0.100 0.626 0.003 0.001 0.001 0.025 0.046 0.198 30 E 0.009 0.893 0.003 0.001 0.001 0.011 0.020 0.064 31 Y 0.004 0.949 0.002 0.001 0.001 0.004 0.023 0.018 32 H 0.004 0.959 0.003 0.001 0.001 0.003 0.018 0.011 33 H 0.004 0.959 0.004 0.001 0.001 0.002 0.022 0.007 34 A 0.002 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.003 35 Y 0.004 0.945 0.004 0.001 0.001 0.001 0.040 0.005 36 K 0.002 0.966 0.002 0.001 0.001 0.002 0.019 0.008 37 A 0.012 0.946 0.005 0.001 0.001 0.003 0.022 0.012 38 I 0.036 0.829 0.008 0.002 0.002 0.007 0.097 0.020 39 Q 0.038 0.601 0.007 0.003 0.004 0.020 0.173 0.154 40 K 0.023 0.131 0.011 0.004 0.006 0.046 0.513 0.265 41 Y 0.017 0.082 0.030 0.018 0.017 0.090 0.608 0.138 42 M 0.070 0.078 0.060 0.029 0.059 0.134 0.202 0.368 43 W 0.109 0.019 0.046 0.029 0.044 0.137 0.070 0.545 44 T 0.113 0.012 0.026 0.017 0.024 0.133 0.093 0.582 45 S 0.034 0.005 0.016 0.010 0.018 0.184 0.056 0.677 46 G 0.021 0.007 0.017 0.008 0.017 0.212 0.036 0.682 47 G 0.063 0.033 0.017 0.014 0.017 0.169 0.041 0.645 48 P 0.079 0.083 0.020 0.012 0.016 0.113 0.057 0.620 49 T 0.093 0.138 0.028 0.014 0.018 0.103 0.133 0.474 50 D 0.095 0.243 0.024 0.014 0.016 0.082 0.224 0.302 51 W 0.113 0.398 0.016 0.008 0.013 0.071 0.082 0.299 52 Q 0.065 0.454 0.016 0.014 0.023 0.065 0.068 0.297 53 D 0.029 0.774 0.005 0.004 0.011 0.023 0.025 0.129 54 T 0.032 0.677 0.008 0.005 0.010 0.022 0.152 0.095 55 K 0.015 0.606 0.039 0.025 0.017 0.029 0.176 0.093 56 R 0.040 0.472 0.037 0.018 0.021 0.046 0.223 0.143 57 I 0.159 0.658 0.028 0.005 0.005 0.024 0.053 0.066 58 F 0.066 0.559 0.010 0.003 0.007 0.030 0.168 0.156 59 G 0.012 0.483 0.015 0.004 0.006 0.029 0.143 0.308 60 G 0.006 0.901 0.008 0.003 0.004 0.013 0.026 0.040 61 I 0.010 0.943 0.009 0.002 0.001 0.006 0.012 0.018 62 L 0.022 0.886 0.022 0.003 0.003 0.007 0.035 0.023 63 D 0.013 0.870 0.016 0.002 0.003 0.008 0.056 0.032 64 L 0.016 0.846 0.022 0.002 0.003 0.009 0.079 0.024 65 F 0.012 0.926 0.010 0.004 0.003 0.004 0.023 0.017 66 E 0.023 0.805 0.025 0.007 0.008 0.012 0.026 0.095 67 E 0.056 0.711 0.031 0.010 0.009 0.021 0.041 0.122 68 G 0.117 0.098 0.192 0.042 0.024 0.044 0.299 0.184 69 A 0.499 0.024 0.016 0.007 0.007 0.052 0.047 0.346 70 A 0.544 0.004 0.005 0.002 0.001 0.022 0.028 0.394 71 E 0.012 0.003 0.002 0.002 0.003 0.055 0.004 0.919 72 G 0.005 0.002 0.004 0.002 0.007 0.049 0.012 0.919 73 K 0.009 0.009 0.037 0.111 0.054 0.157 0.053 0.570 74 K 0.036 0.018 0.072 0.076 0.074 0.059 0.061 0.604 75 V 0.089 0.016 0.066 0.077 0.057 0.075 0.115 0.505 76 T 0.011 0.021 0.189 0.080 0.122 0.052 0.104 0.421 77 D 0.029 0.026 0.092 0.050 0.082 0.085 0.037 0.601 78 L 0.020 0.038 0.129 0.083 0.065 0.123 0.045 0.496 79 T 0.048 0.401 0.039 0.015 0.031 0.060 0.068 0.339 80 G 0.059 0.708 0.015 0.007 0.011 0.020 0.079 0.100 81 E 0.019 0.662 0.016 0.014 0.009 0.033 0.086 0.162 82 D 0.014 0.918 0.004 0.002 0.002 0.006 0.030 0.025 83 V 0.014 0.961 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 0.008 84 A 0.016 0.896 0.004 0.001 0.001 0.003 0.063 0.015 85 A 0.007 0.905 0.003 0.001 0.001 0.006 0.050 0.027 86 F 0.009 0.954 0.004 0.001 0.001 0.002 0.021 0.008 87 C 0.015 0.968 0.002 0.001 0.001 0.001 0.007 0.006 88 D 0.046 0.843 0.017 0.001 0.001 0.006 0.031 0.056 89 E 0.091 0.592 0.032 0.002 0.001 0.025 0.083 0.174 90 L 0.201 0.162 0.066 0.003 0.002 0.040 0.355 0.171 91 M 0.177 0.085 0.017 0.002 0.002 0.060 0.110 0.547 92 K 0.045 0.024 0.007 0.001 0.001 0.056 0.050 0.816 93 D 0.022 0.070 0.007 0.002 0.002 0.093 0.058 0.745 94 T 0.062 0.254 0.012 0.004 0.006 0.118 0.033 0.510 95 K 0.045 0.293 0.022 0.010 0.011 0.092 0.038 0.490 96 T 0.035 0.682 0.014 0.006 0.005 0.042 0.025 0.193 97 W 0.024 0.892 0.008 0.003 0.003 0.010 0.018 0.042 98 M 0.025 0.821 0.005 0.002 0.003 0.014 0.043 0.085 99 D 0.019 0.381 0.007 0.004 0.003 0.009 0.546 0.031 100 K 0.005 0.835 0.004 0.004 0.004 0.010 0.102 0.037 101 Y 0.046 0.848 0.006 0.004 0.007 0.009 0.031 0.050 102 R 0.090 0.471 0.019 0.028 0.022 0.037 0.193 0.139 103 T 0.073 0.376 0.009 0.010 0.016 0.058 0.067 0.391 104 K 0.103 0.137 0.013 0.013 0.014 0.109 0.095 0.517 105 L 0.043 0.131 0.009 0.009 0.008 0.122 0.111 0.567 106 N 0.179 0.236 0.010 0.006 0.010 0.061 0.137 0.361 107 D 0.123 0.158 0.016 0.022 0.024 0.085 0.087 0.486 108 S 0.094 0.047 0.034 0.028 0.038 0.111 0.076 0.572 109 I 0.099 0.013 0.022 0.028 0.041 0.134 0.057 0.605 110 G 0.075 0.007 0.013 0.017 0.032 0.110 0.049 0.697 111 R 0.044 0.006 0.009 0.013 0.021 0.102 0.031 0.774 112 D 0.032 0.007 0.013 0.017 0.035 0.116 0.033 0.746