PFRMAT RR TARGET T0282 AUTHOR 4204-4258-2837 REMARK From group SAM-TO4-hand under the direction of REMARK Kevin Karplus. REMARK Project by George Shackelford and Kevin Karplus REMARK The value given is an approximation of the probability REMARK as provided by the neural network. REMARK The predictions are limited to a score >= .18 which REMARK is an approximation of the probability. REMARK METHOD The predictor is an artificial neural network METHOD using 280 inputs. METHOD Input includes separation and sequence length, corrected METHOD mutual information between columns (M. Cline) and METHOD an e-value measure of correlation between columns (K Karplus) METHOD NN: /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp6/networks/NN280-240n300.net.28 METHOD Other inputs are from alignments and METHOD secondary predictions from SAM-t2k and SAM-t04 of METHOD University of California, Santa Cruz MODEL 1 MNPNFTTEHTWQGRHDPEDGQAGRRVHHIACPIQVGELANQEPGVALIGF ECDAGVERNKGRTGAKHAPSLIKQALANLAWHHPIPIYDLGNIRCEGDEL EQAQQECAQVIQQALPHARAIVLGGGHEIAWATFQGLAQHFLATGVKQPR IGIINFDAHFDLRTFESELAPVRPSSGTPFNQIHHFCQQQGWDFHYACLG VSRASNTPALFERADKLGVWYVEDKAFSPLSLKDHLTQLQHFIDDCDYLY LTIDLDVFPAASAPGVSAPAARGVSLEALAPYFDRILHYKNKLMIADIAE YNPSFDIDQHTARLAARLCWDIANAMAEQVQS 55 177 0 8 0.71995 196 210 0 8 0.69275 127 267 0 8 0.6817 155 196 0 8 0.6783 155 176 0 8 0.663 126 155 0 8 0.62985 155 198 0 8 0.612 126 196 0 8 0.60945 56 176 0 8 0.60775 180 235 0 8 0.6035 263 311 0 8 0.60095 196 252 0 8 0.59245 126 202 0 8 0.59075 160 180 0 8 0.58395 176 266 0 8 0.5814 183 266 0 8 0.56355 176 206 0 8 0.56355 198 210 0 8 0.55675 160 253 0 8 0.55505 155 219 0 8 0.5525 55 178 0 8 0.54995 56 178 0 8 0.54315 50 198 0 8 0.54315 126 211 0 8 0.5406 126 210 0 8 0.5406 126 268 0 8 0.53805 100 196 0 8 0.5355 156 175 0 8 0.5338 198 219 0 8 0.53125 160 210 0 8 0.53125 156 179 0 8 0.53125 76 155 0 8 0.53125 176 268 0 8 0.5219 56 182 0 8 0.5219 180 214 0 8 0.5168 155 178 0 8 0.5168 127 252 0 8 0.5168 155 179 0 8 0.51425 155 175 0 8 0.5117 104 176 0 8 0.5066 155 299 0 8 0.50405 128 210 0 8 0.50405 128 202 0 8 0.50405 127 201 0 8 0.50405 65 182 0 8 0.50405 155 255 0 8 0.4998 122 162 0 8 0.49215 154 249 0 8 0.4896 133 250 0 8 0.4896 155 180 0 8 0.48705 252 297 0 8 0.4845 202 272 0 8 0.4845 176 202 0 8 0.4845 155 199 0 8 0.4845 56 268 0 8 0.4845 155 286 0 8 0.48195 55 179 0 8 0.48195 158 219 0 8 0.4794 126 176 0 8 0.47685 127 266 0 8 0.4743 178 214 0 8 0.47175 126 267 0 8 0.47175 134 162 0 8 0.46665 122 198 0 8 0.46665 176 267 0 8 0.4641 174 210 0 8 0.4641 155 210 0 8 0.4641 128 176 0 8 0.4641 253 279 0 8 0.46155 130 179 0 8 0.46155 80 317 0 8 0.459 198 252 0 8 0.45645 210 270 0 8 0.4539 179 214 0 8 0.4539 155 183 0 8 0.45135 128 155 0 8 0.4488 126 177 0 8 0.4488 198 253 0 8 0.44625 80 126 0 8 0.44625 162 180 0 8 0.4437 137 160 0 8 0.4437 45 214 0 8 0.44115 198 239 0 8 0.43945 179 219 0 8 0.43945 100 206 0 8 0.43945 100 126 0 8 0.43945 56 267 0 8 0.43945 126 252 0 8 0.4369 210 268 0 8 0.43435 202 259 0 8 0.43435 176 210 0 8 0.43435 163 181 0 8 0.43435 155 252 0 8 0.43435 100 155 0 8 0.43435 255 301 0 8 0.4318 198 255 0 8 0.42925 196 219 0 8 0.42925 176 196 0 8 0.42925 128 196 0 8 0.4267 65 163 0 8 0.4267 160 196 0 8 0.4233 155 214 0 8 0.4233 104 268 0 8 0.4233 65 176 0 8 0.4233 276 302 0 8 0.42075 163 182 0 8 0.42075 133 219 0 8 0.42075 198 279 0 8 0.4182 176 255 0 8 0.4182 198 214 0 8 0.4131 162 255 0 8 0.4131 122 175 0 8 0.4131 183 249 0 8 0.40885 183 196 0 8 0.40885 162 286 0 8 0.40885 162 175 0 8 0.40885 104 128 0 8 0.40885 252 299 0 8 0.4063 196 299 0 8 0.4063 182 267 0 8 0.4063 158 196 0 8 0.4063 155 274 0 8 0.4063 80 210 0 8 0.4063 56 198 0 8 0.4063 158 201 0 8 0.40375 155 276 0 8 0.40375 56 263 0 8 0.40375 176 198 0 8 0.4012 162 183 0 8 0.4012 176 219 0 8 0.39865 153 219 0 8 0.39865 103 178 0 8 0.39865 202 260 0 8 0.3961 175 316 0 8 0.3961 177 268 0 8 0.39355 174 268 0 8 0.391 156 183 0 8 0.38845 155 250 0 8 0.38845 126 258 0 8 0.38845 156 287 0 8 0.3859 155 253 0 8 0.3859 134 196 0 8 0.3859 134 160 0 8 0.3859 126 270 0 8 0.3859 126 154 0 8 0.3859 104 155 0 8 0.3859 219 274 0 8 0.38335 198 276 0 8 0.38335 160 214 0 8 0.38335 156 196 0 8 0.38335 155 239 0 8 0.3808 154 163 0 8 0.3808 126 272 0 8 0.37825 50 155 0 8 0.37825 298 322 0 8 0.3757 219 267 0 8 0.3757 104 206 0 8 0.3757 95 183 0 8 0.3757 65 206 0 8 0.3757 56 179 0 8 0.3757 265 311 0 8 0.37315 214 239 0 8 0.37315 196 274 0 8 0.37315 182 206 0 8 0.37315 126 206 0 8 0.37315 52 210 0 8 0.37315 50 133 0 8 0.37315 183 198 0 8 0.3706 155 296 0 8 0.3706 104 214 0 8 0.3706 80 270 0 8 0.3706 162 315 0 8 0.36805 134 299 0 8 0.36805 50 196 0 8 0.36805 50 176 0 8 0.36805 200 315 0 8 0.3655 198 250 0 8 0.3655 155 201 0 8 0.3655 219 301 0 8 0.36295 219 255 0 8 0.36295 187 219 0 8 0.36295 175 210 0 8 0.36295 126 259 0 8 0.36295 100 214 0 8 0.36295 257 274 0 8 0.3604 198 296 0 8 0.3604 163 179 0 8 0.3604 78 206 0 8 0.3604 50 134 0 8 0.3604 154 239 0 8 0.35785 224 274 0 8 0.3553 162 214 0 8 0.3553 134 183 0 8 0.3553 128 197 0 8 0.3553 52 219 0 8 0.3553 156 178 0 8 0.35275 104 210 0 8 0.35275 72 198 0 8 0.35275 272 324 0 8 0.3502 199 299 0 8 0.3502 199 274 0 8 0.3502 155 224 0 8 0.3502 155 174 0 8 0.3502 134 155 0 8 0.3502 127 176 0 8 0.3502 104 177 0 8 0.3502 65 175 0 8 0.3502 156 299 0 8 0.34765 128 268 0 8 0.34765 52 259 0 8 0.34765 274 293 0 8 0.34595 155 221 0 8 0.34595 162 181 0 8 0.3434 104 270 0 8 0.3434 93 311 0 8 0.3434 93 156 0 8 0.3434 56 312 0 8 0.3434 52 155 0 8 0.3434 257 279 0 8 0.34085 155 302 0 8 0.34085 128 259 0 8 0.34085 255 266 0 8 0.3383 224 252 0 8 0.3383 210 267 0 8 0.3383 198 274 0 8 0.3383 129 297 0 8 0.3383 56 266 0 8 0.3383 250 297 0 8 0.33575 197 232 0 8 0.33575 180 198 0 8 0.33575 175 205 0 8 0.33575 134 322 0 8 0.33575 133 162 0 8 0.33575 93 124 0 8 0.33575 56 219 0 8 0.33575 250 296 0 8 0.3332 100 128 0 8 0.3332 55 180 0 8 0.3332 199 301 0 8 0.33065 196 206 0 8 0.33065 182 268 0 8 0.33065 134 210 0 8 0.33065 210 219 0 8 0.3281 201 316 0 8 0.3281 156 198 0 8 0.3281 155 184 0 8 0.3281 95 266 0 8 0.3281 55 130 0 8 0.3281 163 207 0 8 0.3264 162 316 0 8 0.3264 156 250 0 8 0.3264 130 198 0 8 0.3264 130 155 0 8 0.3264 52 176 0 8 0.3264 52 122 0 8 0.3264 50 183 0 8 0.3264 45 87 0 8 0.3264 163 206 0 8 0.32385 134 176 0 8 0.32385 104 267 0 8 0.32385 104 160 0 8 0.32385 176 260 0 8 0.3213 160 198 0 8 0.3213 131 183 0 8 0.3213 76 183 0 8 0.3213 76 133 0 8 0.3213 66 206 0 8 0.3213 180 196 0 8 0.31875 56 175 0 8 0.31875 163 176 0 8 0.3162 155 182 0 8 0.3162 132 175 0 8 0.3162 93 299 0 8 0.3162 219 266 0 8 0.3145 196 214 0 8 0.3145 160 222 0 8 0.3145 155 295 0 8 0.3145 104 181 0 8 0.3145 104 178 0 8 0.3145 56 296 0 8 0.3145 52 274 0 8 0.3145 180 299 0 8 0.31195 134 198 0 8 0.31195 126 266 0 8 0.31195 103 214 0 8 0.31195 56 103 0 8 0.31195 52 299 0 8 0.31195 174 183 0 8 0.3094 160 183 0 8 0.3094 156 286 0 8 0.3094 155 211 0 8 0.3094 49 151 0 8 0.3094 180 263 0 8 0.30685 179 196 0 8 0.30685 174 214 0 8 0.30685 155 316 0 8 0.30685 122 179 0 8 0.30685 76 198 0 8 0.30685 52 130 0 8 0.30685 235 299 0 8 0.3043 155 320 0 8 0.3043 134 276 0 8 0.3043 131 296 0 8 0.3043 55 175 0 8 0.3043 52 107 0 8 0.3043 163 180 0 8 0.3026 133 155 0 8 0.3026 132 162 0 8 0.3026 100 163 0 8 0.3026 76 302 0 8 0.3026 56 183 0 8 0.3026 44 211 0 8 0.3026 126 198 0 8 0.30005 65 126 0 8 0.30005 56 316 0 8 0.30005 56 181 0 8 0.30005 182 196 0 8 0.2975 175 196 0 8 0.2975 155 270 0 8 0.2975 103 198 0 8 0.2975 52 88 0 8 0.2975 198 301 0 8 0.29495 174 255 0 8 0.29495 130 196 0 8 0.29495 100 198 0 8 0.29495 263 293 0 8 0.29325 199 210 0 8 0.29325 198 266 0 8 0.29325 178 316 0 8 0.29325 175 214 0 8 0.29325 174 267 0 8 0.29325 163 174 0 8 0.29325 162 219 0 8 0.29325 134 202 0 8 0.29325 130 297 0 8 0.29325 128 260 0 8 0.29325 124 311 0 8 0.29325 108 136 0 8 0.29325 95 155 0 8 0.29325 52 252 0 8 0.29325 301 326 0 8 0.2907 206 313 0 8 0.2907 187 224 0 8 0.2907 162 174 0 8 0.2907 155 181 0 8 0.2907 104 154 0 8 0.2907 103 160 0 8 0.2907 56 326 0 8 0.2907 301 311 0 8 0.28815 176 302 0 8 0.28815 100 219 0 8 0.28815 73 92 0 8 0.28815 56 255 0 8 0.28815 54 219 0 8 0.28815 48 161 0 8 0.28815 222 274 0 8 0.28645 210 252 0 8 0.28645 162 274 0 8 0.28645 141 176 0 8 0.28645 128 267 0 8 0.28645 104 175 0 8 0.28645 52 196 0 8 0.28645 52 126 0 8 0.28645 50 210 0 8 0.28645 46 163 0 8 0.28645 250 295 0 8 0.2839 249 311 0 8 0.2839 198 265 0 8 0.2839 182 316 0 8 0.2839 176 270 0 8 0.2839 175 258 0 8 0.2839 162 276 0 8 0.2839 128 198 0 8 0.2839 76 276 0 8 0.2839 50 126 0 8 0.2839 198 224 0 8 0.28135 104 205 0 8 0.28135 103 155 0 8 0.28135 50 197 0 8 0.28135 252 300 0 8 0.27965 181 214 0 8 0.27965 162 198 0 8 0.27965 155 326 0 8 0.27965 52 76 0 8 0.27965 181 316 0 8 0.2771 65 180 0 8 0.2771 162 206 0 8 0.27455 52 267 0 8 0.27455 178 221 0 8 0.27285 126 163 0 8 0.27285 80 182 0 8 0.27285 55 162 0 8 0.27285 187 196 0 8 0.2703 175 198 0 8 0.2703 100 210 0 8 0.2703 152 274 0 8 0.2686 152 214 0 8 0.2686 56 124 0 8 0.2686 266 301 0 8 0.26605 162 326 0 8 0.26605 155 242 0 8 0.26605 155 202 0 8 0.26605 152 239 0 8 0.26605 133 179 0 8 0.26605 128 252 0 8 0.26605 100 176 0 8 0.26605 55 317 0 8 0.26605 54 178 0 8 0.26605 49 311 0 8 0.26605 196 222 0 8 0.2635 174 219 0 8 0.2635 162 250 0 8 0.2635 128 272 0 8 0.2635 78 104 0 8 0.2635 196 267 0 8 0.2618 179 224 0 8 0.2618 160 199 0 8 0.2618 134 259 0 8 0.2618 133 176 0 8 0.2618 52 134 0 8 0.2618 196 224 0 8 0.25925 182 198 0 8 0.25925 174 205 0 8 0.25925 156 214 0 8 0.25925 154 206 0 8 0.25925 100 222 0 8 0.25925 52 198 0 8 0.25925 293 311 0 8 0.25755 196 211 0 8 0.25755 184 196 0 8 0.25755 163 214 0 8 0.25755 163 183 0 8 0.25755 160 176 0 8 0.25755 100 178 0 8 0.25755 95 198 0 8 0.25755 56 265 0 8 0.25755 197 319 0 8 0.255 196 286 0 8 0.255 196 248 0 8 0.255 187 198 0 8 0.255 176 259 0 8 0.255 174 196 0 8 0.255 163 175 0 8 0.255 160 187 0 8 0.255 184 298 0 8 0.2533 175 250 0 8 0.2533 90 214 0 8 0.2533 57 182 0 8 0.2533 56 65 0 8 0.2533 210 299 0 8 0.25075 198 259 0 8 0.25075 182 214 0 8 0.25075 181 196 0 8 0.25075 176 252 0 8 0.25075 162 196 0 8 0.25075 152 162 0 8 0.25075 141 198 0 8 0.25075 135 270 0 8 0.25075 128 274 0 8 0.25075 104 126 0 8 0.25075 65 268 0 8 0.25075 65 160 0 8 0.25075 57 135 0 8 0.25075 56 250 0 8 0.25075 56 180 0 8 0.25075 53 156 0 8 0.25075 178 198 0 8 0.24905 174 316 0 8 0.24905 126 260 0 8 0.24905 78 210 0 8 0.24905 76 130 0 8 0.24905 181 205 0 8 0.2465 179 206 0 8 0.2465 158 210 0 8 0.2465 66 181 0 8 0.2465 50 131 0 8 0.2465 198 326 0 8 0.2448 136 155 0 8 0.2448 128 211 0 8 0.2448 88 154 0 8 0.2448 56 131 0 8 0.2448 184 322 0 8 0.24225 176 299 0 8 0.24225 163 196 0 8 0.24225 56 253 0 8 0.24225 49 321 0 8 0.24225 198 295 0 8 0.24055 197 259 0 8 0.24055 196 297 0 8 0.24055 124 224 0 8 0.24055 103 318 0 8 0.24055 93 287 0 8 0.24055 53 211 0 8 0.24055 197 227 0 8 0.238 179 236 0 8 0.238 162 184 0 8 0.238 160 175 0 8 0.238 73 93 0 8 0.238 56 196 0 8 0.238 46 90 0 8 0.238 162 178 0 8 0.2363 152 279 0 8 0.2363 124 264 0 8 0.2363 52 297 0 8 0.2363 52 103 0 8 0.2363 46 198 0 8 0.2363 46 56 0 8 0.2363 198 316 0 8 0.2346 156 224 0 8 0.2346 107 174 0 8 0.2346 79 181 0 8 0.2346 56 214 0 8 0.2346 56 130 0 8 0.2346 250 302 0 8 0.23205 175 302 0 8 0.23205 151 160 0 8 0.23205 52 260 0 8 0.23205 222 250 0 8 0.23035 214 305 0 8 0.23035 162 210 0 8 0.23035 155 268 0 8 0.23035 154 294 0 8 0.23035 154 211 0 8 0.23035 151 299 0 8 0.23035 72 178 0 8 0.23035 65 178 0 8 0.23035 202 270 0 8 0.2278 201 280 0 8 0.2278 177 206 0 8 0.2278 176 224 0 8 0.2278 175 256 0 8 0.2278 174 206 0 8 0.2278 155 312 0 8 0.2278 132 158 0 8 0.2278 126 317 0 8 0.2278 104 182 0 8 0.2278 78 207 0 8 0.2278 56 162 0 8 0.2278 198 221 0 8 0.2261 196 205 0 8 0.2261 137 246 0 8 0.2261 130 177 0 8 0.2261 76 162 0 8 0.2261 53 62 0 8 0.2261 51 272 0 8 0.2261 255 302 0 8 0.2244 162 302 0 8 0.2244 131 178 0 8 0.2244 128 206 0 8 0.2244 100 158 0 8 0.2244 93 196 0 8 0.2244 90 198 0 8 0.2244 198 267 0 8 0.22185 162 294 0 8 0.22185 128 270 0 8 0.22185 128 224 0 8 0.22185 100 274 0 8 0.22185 93 265 0 8 0.22185 93 182 0 8 0.22185 80 206 0 8 0.22185 56 136 0 8 0.22185 196 259 0 8 0.22015 181 317 0 8 0.22015 155 272 0 8 0.22015 128 271 0 8 0.22015 126 199 0 8 0.22015 79 182 0 8 0.22015 76 301 0 8 0.22015 54 210 0 8 0.22015 52 202 0 8 0.22015 198 268 0 8 0.21845 196 276 0 8 0.21845 175 317 0 8 0.21845 155 206 0 8 0.21845 133 174 0 8 0.21845 132 219 0 8 0.21845 131 196 0 8 0.21845 104 163 0 8 0.21845 100 160 0 8 0.21845 224 316 0 8 0.21675 183 221 0 8 0.21675 180 206 0 8 0.21675 162 305 0 8 0.21675 136 302 0 8 0.21675 134 197 0 8 0.21675 133 302 0 8 0.21675 56 221 0 8 0.21675 50 232 0 8 0.21675 252 267 0 8 0.2142 222 257 0 8 0.2142 177 302 0 8 0.2142 93 297 0 8 0.2142 55 155 0 8 0.2142 45 232 0 8 0.2142 268 299 0 8 0.2125 224 259 0 8 0.2125 163 219 0 8 0.2125 163 205 0 8 0.2125 155 301 0 8 0.2125 131 214 0 8 0.2125 128 297 0 8 0.2125 80 207 0 8 0.2125 62 302 0 8 0.2125 57 313 0 8 0.2125 259 295 0 8 0.2108 196 268 0 8 0.2108 175 252 0 8 0.2108 160 286 0 8 0.2108 126 219 0 8 0.2108 56 174 0 8 0.2108 52 272 0 8 0.2108 210 274 0 8 0.2091 130 175 0 8 0.2091 72 265 0 8 0.2091 54 214 0 8 0.2091 210 239 0 8 0.20655 178 299 0 8 0.20655 155 260 0 8 0.20655 134 163 0 8 0.20655 57 268 0 8 0.20655 56 155 0 8 0.20655 214 302 0 8 0.20485 198 222 0 8 0.20485 133 163 0 8 0.20485 126 182 0 8 0.20485 88 211 0 8 0.20485 214 224 0 8 0.20315 198 217 0 8 0.20315 160 266 0 8 0.20315 155 266 0 8 0.20315 120 181 0 8 0.20315 104 183 0 8 0.20315 55 163 0 8 0.20315 210 253 0 8 0.20145 138 155 0 8 0.20145 132 214 0 8 0.20145 104 322 0 8 0.20145 88 206 0 8 0.20145 80 181 0 8 0.20145 76 174 0 8 0.20145 224 302 0 8 0.19975 184 198 0 8 0.19975 179 210 0 8 0.19975 178 263 0 8 0.19975 155 267 0 8 0.19975 126 224 0 8 0.19975 65 103 0 8 0.19975 52 100 0 8 0.19975 152 198 0 8 0.1972 131 174 0 8 0.1972 127 297 0 8 0.1972 100 252 0 8 0.1972 211 252 0 8 0.1955 198 302 0 8 0.1955 155 305 0 8 0.1955 134 174 0 8 0.1955 126 276 0 8 0.1955 104 179 0 8 0.1955 56 126 0 8 0.1955 54 88 0 8 0.1955 45 163 0 8 0.1955 182 263 0 8 0.1938 181 198 0 8 0.1938 149 230 0 8 0.1938 136 198 0 8 0.1938 130 302 0 8 0.1938 90 176 0 8 0.1938 54 272 0 8 0.1938 52 268 0 8 0.1938 260 294 0 8 0.1921 259 272 0 8 0.1921 178 252 0 8 0.1921 174 279 0 8 0.1921 163 224 0 8 0.1921 132 160 0 8 0.1921 104 158 0 8 0.1921 56 224 0 8 0.1921 52 174 0 8 0.1921 180 210 0 8 0.1904 160 174 0 8 0.1904 56 252 0 8 0.1904 155 294 0 8 0.1887 88 196 0 8 0.1887 54 162 0 8 0.1887 51 259 0 8 0.1887 51 126 0 8 0.1887 224 250 0 8 0.187 211 316 0 8 0.187 176 294 0 8 0.187 174 222 0 8 0.187 163 198 0 8 0.187 126 162 0 8 0.187 93 127 0 8 0.187 65 207 0 8 0.187 272 294 0 8 0.1853 271 317 0 8 0.1853 232 298 0 8 0.1853 178 268 0 8 0.1853 151 198 0 8 0.1853 136 177 0 8 0.1853 134 267 0 8 0.1853 196 271 0 8 0.1836 182 194 0 8 0.1836 178 250 0 8 0.1836 177 317 0 8 0.1836 104 198 0 8 0.1836 56 100 0 8 0.1836 54 267 0 8 0.1836 276 314 0 8 0.1819 196 270 0 8 0.1819 54 196 0 8 0.1819 52 266 0 8 0.1819 50 267 0 8 0.1819 44 118 0 8 0.1819 183 232 0 8 0.1802 182 265 0 8 0.1802 131 155 0 8 0.1802 57 66 0 8 0.1802 END