Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 | | | 1 .....M..W..MP..P..R..PEEVARKLRRLG.FV.ERMA.K....GGHRLY.TH....P.... 2 .....M..Sr.LL..Pv.S..GRDMCKILEMLG.FQ.KVHQ.V....GSHVRY.VH....P.... 3 .....M..G..RL..SgfR..YREIIKRLKAFG.FV.FDRQaA....GSHEIW.YN....P.... 4 .....M..Sr.LL..Pv.S..GRDMCKILEMLG.FQ.KVYQ.V....GSHVRY.VH....P.... 5 .....M..K..SY..-..S..SREIVKIITKDG.WY.EVNC.V....GDHHQY.KH....P.... 6 .....M..-..--..-..K..SGDIIAALQKDG.WY.EVAT.K....GSHVQF.KH....P.... 7 .....M..S..GL..PiiS..GMQAIKAFSKAG.WL.PHRQ.V....GSHVVL.RK....E.... 8 .....M..Sk.IL..Pl.P..AKKVVKALENIG.FE.QIRQ.K....GSHLFL.RH....P.... 9 .....M..S..GL..PviS..GMQAIKAFYKAG.WL.PHRQ.V....GSHVVL.RK....E.... 10 .....M..S..GL..PviS..GMQAIKAFSKAG.WL.PHRQ.V....GSHVVL.RK....E.... 11 .....M..-..--..-..N..SREVIAALEADG.WV.EVAR.R....GSHAQF.KH....P.... 12 .....M..Dk.IV..Pl.P..SKKVIKALESMG.FE.QIRQ.K....GSHLFL.RH....P.... 13 .....M..S..GL..PviS..GMQAIEAFSKAG.WL.PHRQ.V....GSHVVL.RK....E.... 14 sksq.-..G..VR..V..K..SSELIKLLETNG.WK.LMRV.K....GSHHQF.KH....P.... 15 .....M..K..V-..-..-..-REVIKHLEADG.WY.LVAT.K....GSHRQY.KH....Pa... 16 .....M..P..KL..PglT..GKKVINTLEKLG.FQ.VVRQ.R....GSHVQM.EH....D.... 17 .....M..SprLI..Pi.T..GQELVRLLQEEG.FQ.VVWV.R....GSHVRL.RH....P.... 18 .....M..SprLI..Pi.T..GQELVRLLQEEG.FQ.VVWV.R....GSHVRL.RH....P.... 19 .....M..S..YL..PivD..PKTMEKVLLKLG.FQ.RVRQ.K....GSHVFY.RH....S.... 20 .....M..K..V-..-..-..-KEVLKRLKADG.WY.QVRM.R....GSHRIL.AH....P.... 21 slf..M..G..RL..AgfS..YRQIIKILKTFG.FV.FHRQaA....GSHEIW.FN....P.... 22 .....M..P..KL..PtpS..ALEVIKALNSQG.FQ.VISQ.K....GNHIKM.KKka..P.... 23 .....M..-..--..-..Q..SRQLVKELEADG.WV.LDRV.T....GSHHMF.KH....P.... 24 .....M..K..I-..-..-..-REVIKLIENDG.WY.LVRT.R....GSHRQF.KH....P.... 25 .....M..P..MT..P..-..-KQMIKLLKKNG.FY.EVSQ.N....GSHKKF.RD....N.... 26 .....M..K..V-..-..-..-SEVIKRLETDG.WY.LART.K....GSHRQF.KH....P.... 27 .....M..-..--..-..N..SAEIIRQLQADG.WF.EVAR.K....GSHAQF.KH....R.... 28 .....Mi.G..YK..M..T..AKEIEKILKADG.WY.FVTA.K....GSHNQY.KH....Tv... 29 .....M..S..KL..PniS..GKQCIEVLKKIG.FY.QKRR.Q....SSHIIL.RR....D.... 30 .....M..-..--..-..D..GKELIKQLERSG.WT.LRSV.K....GSHHVF.AH....P.... 31 .....M..S..--..-..S..SKQIIKRIEADG.WK.FHHA.T....GSHHHF.TH....P.... 32 .....M..S..NL..P..SvqAKDFIRVIKKLG.FF.LERQ.K....GSHAIY.KN....T.... 33 .....M..-..--..-..D..SKELIKQLERSG.WT.LRGV.K....GSHHVF.TH....P.... 34 .....M..K..SY..-..T..SREVIKILQNDG.WY.EVAV.V....GSHHQF.KH....Si... 35 .....M..S..YS..Pf.S..GRDVVKAMVNSGiYE.WDRT.N....GDHAILvWN....Ppesh 36 .....M..-..--..-..N..STDLIQQPKADG.WY.RVHT.V....GSHHQY.KH....P.... 37 rqe..-..G..ET..V..D..SKTAIKMIEEDG.WY.LDRV.K....GSHHQY.KH....P.... 38 .....M..K..LPrdV..S..GEDVIKALRKLG.YV.PARQ.K....GSHVVL.TG....P.... 39 .....M..K..V-..-..-..-RDAIERVEADG.WY.LDRT.K....DSHQQF.KH....P.... 40 pt...-..S..NLtnI..S..SRKAIKAFRKLG.FE.KDRH.T....GDHFIL.KK....T.... 41 .....MarR..LR..Pv.S..RRELVARLKALG.FS.GPYT.G....GRHQFM.VR....-.... 42 .....M..P..SA..I..S..RRNLIKKFKSLG.YTgPYSG.K....KKHQFM.TK....G.... 43 .....M..-..--..-..K..SKDLIDELLAAG.CE.FVRHgK....GSHQIW.KS....Pi... 44 .....-..-..--..-..-..------MIEEDG.WY.LDRV.K....GSHHQY.KH....P.... 45 .....M..K..SI..-..S..GKKLCKIVEKKG.WT.LKKI.T....GSHHIY.EK....T.... 46 .....M..S..V-..-..K..RKELIKYLEQNG.FY.LLRE.G....GNHSIY.TN....E.... 47 .....M..K..V-..-..-..-KVILKILERDG.WY.VARI.R....GSHRQL.KH....P.... 48 .....M..-..--..-..E..SGELIKRLEDAG.WQ.IRGG.RktnsGSHVTL.CK....P.... 49 .....M..-..--..-..T..ERELKKIAKKQG.FS.KTNFgK....GSHEVW.KH....P.... 50 .....M..-..--..-..K..SADLLKELIAAG.CE.LKRH.Ka...SSHQIW.WS....Pi... 51 .....-..-..--..-..-..------------.--.--MA.K....GGHRLY.TH....P.... 52 .....M..P..RL..-..T..AKEAEKLLLQNG.FV.FSRQ.K....GSHRIY.VK....-.... 53 .....M..P..KL..PrvS..TQKTVKTLEKLG.FV.QIRQ.K....GSHLIL.KKqlksE.... 54 .....M..P..KL..PnvT..GNQLIQVLNKVG.FQ.FVRQ.K....GSHMRL.RH....E.... 55 .....M..P..RL..-..T..AKEAEKLLLQNG.FV.FSRQ.K....GSHRIY.VK....-.... 56 .....M..P..RL..-..T..AKEAEKLLLQNG.FV.FSRQ.K....GSHRIY.VK....-.... 57 dqf..L..K..QP..PevR..SQEVYYLLEAFG.FE.EKKS.K....GSHHSF.RD....S.... 58 .....M..P..RL..-..T..AKEAEKLLLQNG.FV.FSRQ.K....GSHRIY.VK....-.... 59 .....M..-..--..-..K..RRQLLKHLAAHG.VV.LARE.G....ANHSIY.RD....P.... 60 ggksaM..P..M-..-..T..QKEMVKLLTAHG.WI.KTRGgK....GSHIKM.EK....Q.... 61 .....-..-..--..-..-..------ALK---.--.LVKV.K....GSHHKF.KK....-.... 40 50 60 70 | | | | 1 D.G.RI.V....V..V.PFH.S.G..E.LPKG.TFKRILRDAGL....TEEEF...HN.L.... 2 D.G.RK.T....V..V.PVH.G.Ne.D.LGTG.LIKEILKQTRI....SRETY...EE.Lrkk. 3 DkD.KY.T....T..I.PNH.A.G..D.MPEG.TLRAILKQAEI....DPEDF...LK.Tgk.. 4 D.G.RK.T....V..V.PVH.G.Ne.D.LGTG.LIKEILKQSRI....SREMY...EE.Lrkk. 5 TkK.GR.L....T..I.PHP.K.K..D.LPIG.TVRSIFKQAGI....KIL--...--.-.... 6 K.KhGR.V....T..V.PHP.K.R..D.LPIG.TLRSIEKQSGL....KLR--...--.-.... 7 G.S.KV.Tl...T..V.PKH.K.-..E.LKPG.LLRNLIKASGL....TVEEF...EA.Llk.. 8 D.G.RT.T....I..V.PMH.P.T..EkIGSG.MINKIIKDAKI....TRNEW...IE.Linr. 9 G.S.KV.Tl...T..V.PKH.K.-..E.LKPG.LLRNLIKASGL....TIEEF...EV.Llk.. 10 G.S.KV.Tl...T..V.PKH.K.-..E.LKPG.LLRNLIKVSGL....TVEEF...EA.Llk.. 11 TkS.GR.V....T..V.PHP.K.R..D.LPLG.TLRSIERQADL....KLR--...--.-.... 12 D.G.RT.T....I..I.PVH.PtN..K.IGKG.MINKIIKDVKI....TRDEW...IE.Liks. 13 G.S.KI.Tl...T..V.PKH.K.-..E.LKPS.LLRNLIKVSGL....TVEEF...ET.Llk.. 14 DfA.AV.I....T..V.PHP.K.K..D.VKPG.TLRQILKDANL....S----...--.-.... 15 K.P.GR.V....T..I.AGH.S.G..DdLAPG.TLNSILKQAQL....KIED-...--.-.... 16 D.G.RL.V....T..V.PVH.A.G..KtIGRG.WLSKILRDAEL....TREEF...IA.Lle.. 17 D.G.RV.T....T..V.PVH.P.G..EtLRPG.TLLAILKDVGW....SKETY...EQ.Krlg. 18 D.G.RV.T....T..V.PVH.P.G..EtLRPG.TLLAILKDVGW....SKETY...EQ.Krlg. 19 N.G.KY.T....T..I.PFH.A.K..EtCPSH.LIRKIIREAGI....SVEEFkkvLE.N.... 20 DkS.GI.V....V..V.PGKlS.N..D.IPIG.TLSAIWKQAKL....GDEK-...--.-.... 21 EtN.RY.T....T..I.PNH.S.G..D.MPEG.TLRAILKQTAI....EPEDF...LN.Rs... 22 D.K.IL.V....Vi.V.PDH.P.-..E.IPSG.TLKSIIRQAGM....TDDEF...VKlL.... 23 EkS.QT.V....P..V.PHP.K.K..D.LPLG.TVKAIRKLAGL....A----...--.-.... 24 SkS.GL.V....T..I.PGKlS.D..D.IAIG.TLKNILKQAQL....NLDTN...--.-.... 25 N.G.HQ.T....I..V.PMH.N.K..D.LGKG.LEDTILKQAGL....K----...--.-.... 26 DkT.GT.V....T..VsGKP.S.V..D.VPIG.TLKNIWRQAQL....EED--...--.-.... 27 DkQ.GR.V....T..V.PHP.K.R..D.IPIG.TLRSIEKQSGL....KLR--...--.-.... 28 K.S.GK.V....T..V.PNH.K.G..D.IPIG.TVKAILKQAGL....K----...--.-.... 29 N.P.FLqV....V..V.PDH.Q.-..T.LPKG.TLRAIIRDADT....SVEDF...INlL.... 30 DrP.GH.I....S..V.PHP.K.K..D.LGIG.LLNSILKAAGL....K----...--.-.... 31 TkK.GI.V....T..V.QHP.E.K..D.LKKG.TEHSILKQAGL....K----...--.-.... 32 Q.G.NR.V....V..V.PIH.P.Gk.D.LKQG.TLMGMIKDIGL....EKEKF...FD.Llqk. 33 DrP.GH.I....S..V.PHP.K.K..D.LGIG.LLNSILKAAGL....K----...--.-.... 34 K.K.GR.V....T..V.KHP.D.K..D.IPIA.TLKTIEKQSGI....RFK--...--.-.... 35 D.S.PR.R....T..V.PVPlH.D..E.LREG.TLKEIGEQAGMqdfqEFKAW...ID.R.... 36 TkP.GK.V....T..V.PHP.R.K..G.LPTA.TQRSILKQAGL....R----...--.-.... 37 TkK.GT.V....T..I.PHP.R.K..D.LG-H.LEKSIKKQAGL....-----...--.-.... 38 S.G.KI.I....V..I.PLH.K.-..R.IKTG.LLRAIIREVGV....SVKIF...IK.Lled. 39 DkP.GL.V....T..V.PGKfS.D..D.LAPG.TLSSIWRQAQL....-----...--.-.... 40 E.T.ST.I....TfpI.PHP.R.Q..E.LNPL.TLKNILIQTNT....TLEDF...LNnL.... 41 G.S.IR.L....V..L.PNPhR.G..E.IGVD.LLKRILRQAGI....EEEEW...LE.-.... 42 S.Q.KI.R....-..I.PNP.H.GsqD.ISID.LVKEILKQADI....SNEDW...DN.A.... 43 S.G.KK.F....P..V.PHP.K.G..S.LPIG.TVRSIKKDAGI....-----...--.-.... 44 TkK.GT.V....T..I.PHP.R.K..D.LG-H.LEKSIKKQAGL....-----...--.-.... 45 DeN.KI.L....S..I.PVH.R.N..QnLKIG.TLKSIMKIANL....TDNDL...--.-.... 46 -.-.-I.K....T..L.PVK.R.H..RtIDRI.TANEICKQAGL....-LPNF...--.-.... 47 H.KaGL.V....T..VlGKP.S.D..E.LAPG.TLASILKQSSQ....AIRYY...FM.Kylv. 48 GvR.KI.I....T..L.PYP.R.K..D.ISKG.LLRQAQKIAGI....KLS--...--.-.... 49 D.G.RT.V....T..I.PKP.KeK..D.YRPG.TLNNILKVLY-....-----...--.-.... 50 T.G.KT.F....P..V.PHP.K.K..D.LPLG.TVRSIKKMAGI....-----...--.-.... 51 D.G.RI.V....V..V.PFH.I.G..E.LPKG.TFKRILRDAGL....TEEEF...HN.L.... 52 D.K.IR.Q....V..L.PFH.S.G..EiLHPK.IVKEIMENA-L....K----...--.-.... 53 E.G.KI.IevgcV..I.PLQ.R.K..T.LAVG.TLKNILN----....-----...--.-.... 54 D.G.RV.V....T..V.PVH.-.-..-.IAI-.-----------....-----...--.-.... 55 D.K.IR.Q....V..L.PFH.S.G..EiLHPK.IVKEIMENI-L....-----...--.-.... 56 D.K.IR.Q....V..L.PFH.S.G..EiLHPK.IVKEIMENT-L....-----...--.-.... 57 Q.G.KT.I....T..V.PKT.G.G..Q.KVKGvYVQQIVELLNL....--EEW...ID.Edte. 58 D.K.IR.Q....V..L.PFH.F.G..EtLHPK.IVKEIMENI-L....-----...--.-.... 59 R.T.G-.A....T..V.PVP.R.Ha.E.ISDA.LVRRICKEIGI....PPP--...--.-.... 60 G.E.RP.I....T..I.-LH.-.G..E.LNKY.TERGIRKQAGL....-----...--.-.... 61 D.G.KV.V....I..V.PHP.K.K..N.LPIG.TARSIAQQAG-....----W...FK.K....