# TARGET T0276 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0276.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 195 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.016 0.019 0.004 0.060 0.243 0.658 2 T 0.009 0.015 0.004 0.182 0.093 0.697 3 K 0.001 0.001 0.003 0.981 0.007 0.009 4 A 0.001 0.001 0.003 0.982 0.010 0.005 5 E 0.001 0.001 0.003 0.986 0.008 0.002 6 L 0.001 0.001 0.002 0.986 0.007 0.004 7 R 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 8 R 0.001 0.001 0.001 0.993 0.004 0.002 9 R 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.002 10 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 11 R 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.002 12 A 0.001 0.001 0.001 0.980 0.012 0.007 13 A 0.001 0.001 0.002 0.979 0.011 0.008 14 W 0.001 0.001 0.007 0.970 0.014 0.008 15 R 0.001 0.001 0.029 0.902 0.047 0.022 16 R 0.001 0.001 0.030 0.697 0.116 0.156 17 L 0.001 0.001 0.016 0.172 0.203 0.608 18 D 0.001 0.001 0.008 0.043 0.216 0.733 19 L 0.001 0.002 0.079 0.204 0.438 0.277 20 K 0.001 0.002 0.094 0.289 0.439 0.175 21 A 0.003 0.003 0.111 0.453 0.308 0.121 22 L 0.006 0.004 0.048 0.535 0.192 0.215 23 S 0.004 0.003 0.019 0.739 0.084 0.151 24 R 0.001 0.001 0.005 0.961 0.015 0.018 25 A 0.001 0.001 0.007 0.960 0.017 0.014 26 V 0.001 0.001 0.005 0.974 0.012 0.008 27 G 0.001 0.001 0.005 0.979 0.009 0.006 28 A 0.001 0.001 0.005 0.973 0.013 0.009 29 A 0.001 0.001 0.006 0.966 0.013 0.015 30 L 0.001 0.001 0.008 0.947 0.021 0.023 31 L 0.001 0.001 0.017 0.865 0.055 0.061 32 P 0.002 0.001 0.016 0.683 0.118 0.180 33 W 0.002 0.002 0.020 0.442 0.204 0.330 34 L 0.005 0.003 0.068 0.528 0.247 0.149 35 R 0.011 0.005 0.135 0.480 0.275 0.094 36 E 0.023 0.003 0.221 0.398 0.271 0.084 37 R 0.031 0.003 0.165 0.350 0.347 0.105 38 G 0.069 0.005 0.077 0.132 0.396 0.321 39 F 0.150 0.003 0.046 0.054 0.404 0.342 40 R 0.415 0.005 0.026 0.023 0.217 0.315 41 H 0.913 0.003 0.004 0.005 0.028 0.047 42 I 0.967 0.001 0.001 0.004 0.010 0.018 43 L 0.971 0.001 0.001 0.003 0.007 0.017 44 L 0.958 0.002 0.001 0.003 0.010 0.027 45 Y 0.865 0.005 0.001 0.007 0.030 0.091 46 H 0.514 0.011 0.006 0.014 0.161 0.294 47 P 0.176 0.010 0.010 0.009 0.354 0.441 48 L 0.032 0.008 0.030 0.014 0.508 0.407 49 P 0.009 0.007 0.105 0.026 0.648 0.204 50 H 0.009 0.006 0.107 0.047 0.593 0.238 51 E 0.014 0.015 0.093 0.126 0.425 0.327 52 L 0.028 0.017 0.061 0.212 0.349 0.334 53 N 0.021 0.012 0.014 0.140 0.135 0.678 54 L 0.003 0.001 0.009 0.916 0.020 0.050 55 L 0.002 0.001 0.004 0.961 0.018 0.015 56 P 0.001 0.001 0.003 0.984 0.009 0.003 57 L 0.001 0.001 0.003 0.990 0.006 0.001 58 M 0.001 0.001 0.003 0.991 0.005 0.001 59 E 0.001 0.001 0.004 0.988 0.006 0.002 60 A 0.001 0.001 0.003 0.966 0.017 0.014 61 Y 0.002 0.009 0.011 0.520 0.155 0.304 62 P 0.001 0.001 0.002 0.008 0.166 0.823 63 A 0.044 0.002 0.006 0.005 0.244 0.699 64 R 0.704 0.016 0.003 0.002 0.103 0.171 65 Y 0.953 0.004 0.001 0.001 0.013 0.029 66 Y 0.979 0.001 0.001 0.001 0.004 0.016 67 L 0.928 0.002 0.001 0.001 0.010 0.059 68 P 0.763 0.002 0.001 0.002 0.036 0.195 69 K 0.464 0.013 0.005 0.004 0.130 0.384 70 V 0.306 0.037 0.010 0.006 0.214 0.427 71 A 0.121 0.027 0.015 0.007 0.385 0.444 72 G 0.055 0.019 0.035 0.008 0.775 0.109 73 K 0.027 0.002 0.033 0.009 0.818 0.111 74 G 0.103 0.007 0.031 0.007 0.716 0.136 75 L 0.607 0.026 0.008 0.004 0.229 0.126 76 T 0.770 0.006 0.002 0.003 0.048 0.171 77 V 0.930 0.005 0.001 0.002 0.013 0.049 78 H 0.919 0.005 0.001 0.002 0.017 0.056 79 P 0.759 0.005 0.001 0.004 0.040 0.191 80 F 0.352 0.010 0.005 0.006 0.125 0.501 81 G 0.124 0.012 0.009 0.007 0.187 0.661 82 P 0.090 0.006 0.016 0.012 0.245 0.631 83 L 0.115 0.016 0.029 0.025 0.307 0.508 84 A 0.168 0.036 0.029 0.040 0.355 0.372 85 P 0.136 0.024 0.038 0.068 0.404 0.330 86 G 0.089 0.013 0.039 0.054 0.496 0.309 87 P 0.066 0.011 0.079 0.114 0.501 0.229 88 F 0.106 0.022 0.083 0.122 0.374 0.292 89 G 0.141 0.011 0.023 0.030 0.284 0.510 90 L 0.195 0.020 0.010 0.020 0.135 0.620 91 L 0.271 0.052 0.009 0.022 0.091 0.556 92 E 0.263 0.029 0.015 0.027 0.157 0.509 93 P 0.174 0.016 0.019 0.030 0.193 0.568 94 T 0.053 0.014 0.021 0.019 0.301 0.592 95 T 0.038 0.012 0.039 0.034 0.440 0.437 96 P 0.022 0.004 0.029 0.023 0.369 0.554 97 P 0.023 0.021 0.112 0.036 0.490 0.319 98 E 0.025 0.020 0.060 0.022 0.469 0.405 99 D 0.027 0.007 0.068 0.020 0.414 0.464 100 P 0.035 0.011 0.139 0.029 0.460 0.326 101 R 0.035 0.020 0.088 0.026 0.348 0.482 102 V 0.107 0.012 0.086 0.010 0.295 0.490 103 L 0.241 0.003 0.009 0.002 0.232 0.514 104 D 0.502 0.002 0.002 0.001 0.080 0.414 105 L 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 106 V 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 107 V 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 108 V 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 109 P 0.879 0.001 0.001 0.001 0.019 0.100 110 G 0.721 0.002 0.023 0.001 0.108 0.146 111 L 0.749 0.011 0.028 0.001 0.106 0.104 112 A 0.838 0.009 0.021 0.001 0.080 0.051 113 F 0.853 0.040 0.005 0.001 0.058 0.044 114 D 0.396 0.026 0.007 0.003 0.530 0.038 115 R 0.011 0.001 0.018 0.016 0.946 0.009 116 E 0.007 0.001 0.011 0.009 0.964 0.009 117 G 0.072 0.010 0.012 0.006 0.882 0.019 118 Y 0.569 0.027 0.003 0.008 0.189 0.203 119 R 0.838 0.050 0.002 0.004 0.034 0.072 120 L 0.815 0.012 0.006 0.005 0.070 0.092 121 G 0.581 0.010 0.013 0.008 0.235 0.153 122 H 0.312 0.026 0.022 0.024 0.319 0.297 123 G 0.174 0.014 0.026 0.045 0.312 0.429 124 Q 0.258 0.010 0.013 0.076 0.249 0.394 125 G 0.244 0.015 0.010 0.104 0.231 0.396 126 F 0.208 0.031 0.027 0.406 0.151 0.178 127 Y 0.190 0.020 0.061 0.462 0.135 0.132 128 D 0.085 0.004 0.112 0.556 0.137 0.105 129 R 0.042 0.006 0.168 0.642 0.091 0.051 130 F 0.023 0.004 0.181 0.665 0.094 0.034 131 L 0.013 0.001 0.199 0.664 0.100 0.023 132 K 0.020 0.003 0.166 0.642 0.129 0.040 133 E 0.028 0.005 0.110 0.477 0.271 0.109 134 V 0.025 0.007 0.035 0.156 0.406 0.371 135 R 0.024 0.006 0.014 0.021 0.319 0.616 136 A 0.087 0.006 0.011 0.010 0.344 0.542 137 A 0.258 0.004 0.007 0.006 0.203 0.523 138 T 0.885 0.005 0.002 0.002 0.024 0.082 139 V 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 140 G 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 141 V 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 142 V 0.937 0.002 0.001 0.001 0.013 0.046 143 P 0.764 0.003 0.010 0.008 0.095 0.120 144 Q 0.445 0.007 0.057 0.026 0.271 0.194 145 A 0.486 0.020 0.081 0.047 0.233 0.134 146 L 0.559 0.030 0.044 0.057 0.190 0.120 147 L 0.384 0.041 0.033 0.084 0.226 0.232 148 F 0.149 0.039 0.048 0.059 0.559 0.145 149 P 0.050 0.004 0.037 0.051 0.672 0.185 150 A 0.049 0.006 0.044 0.039 0.662 0.200 151 L 0.107 0.059 0.010 0.014 0.477 0.332 152 P 0.126 0.058 0.007 0.007 0.220 0.583 153 R 0.102 0.021 0.019 0.008 0.261 0.588 154 D 0.086 0.025 0.051 0.007 0.380 0.450 155 P 0.073 0.014 0.180 0.011 0.377 0.345 156 W 0.135 0.012 0.089 0.012 0.328 0.424 157 D 0.225 0.038 0.045 0.009 0.251 0.432 158 V 0.311 0.061 0.012 0.007 0.219 0.390 159 P 0.319 0.022 0.028 0.008 0.296 0.326 160 V 0.235 0.006 0.048 0.011 0.397 0.303 161 D 0.363 0.007 0.070 0.012 0.249 0.299 162 H 0.819 0.014 0.014 0.005 0.054 0.095 163 L 0.940 0.004 0.003 0.002 0.017 0.034 164 A 0.950 0.012 0.001 0.001 0.011 0.025 165 T 0.664 0.018 0.004 0.004 0.270 0.039 166 E 0.086 0.003 0.019 0.010 0.836 0.047 167 A 0.035 0.001 0.011 0.004 0.911 0.039 168 G 0.265 0.013 0.010 0.004 0.649 0.059 169 V 0.800 0.023 0.001 0.003 0.044 0.128 170 E 0.931 0.019 0.001 0.002 0.014 0.033 171 A 0.907 0.003 0.001 0.002 0.026 0.061 172 V 0.734 0.012 0.005 0.004 0.098 0.147 173 K 0.299 0.013 0.011 0.007 0.238 0.431 174 R 0.262 0.010 0.015 0.008 0.305 0.400 175 P 0.259 0.036 0.038 0.016 0.289 0.363 176 A 0.157 0.033 0.021 0.014 0.254 0.520 177 P 0.123 0.026 0.033 0.020 0.308 0.488 178 G 0.051 0.014 0.026 0.013 0.449 0.447 179 P 0.039 0.024 0.101 0.023 0.567 0.247 180 G 0.066 0.011 0.100 0.022 0.480 0.321 181 G 0.129 0.015 0.087 0.024 0.390 0.356 182 L 0.186 0.078 0.021 0.019 0.187 0.509 183 L 0.103 0.051 0.012 0.025 0.113 0.695 184 D 0.002 0.003 0.001 0.002 0.018 0.973