# TARGET T0276 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0276.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 195 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.997 2 T 0.007 0.027 0.002 0.054 0.003 0.012 0.896 3 K 0.001 0.001 0.013 0.879 0.035 0.018 0.054 4 A 0.001 0.001 0.006 0.955 0.009 0.014 0.015 5 E 0.001 0.001 0.004 0.969 0.005 0.012 0.009 6 L 0.001 0.001 0.001 0.979 0.005 0.009 0.006 7 R 0.001 0.001 0.001 0.986 0.003 0.006 0.004 8 R 0.001 0.001 0.001 0.988 0.003 0.007 0.002 9 R 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.007 0.005 10 A 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.007 0.004 11 R 0.001 0.001 0.001 0.984 0.004 0.008 0.003 12 A 0.001 0.001 0.001 0.973 0.002 0.021 0.003 13 A 0.001 0.001 0.002 0.939 0.004 0.048 0.006 14 W 0.001 0.001 0.013 0.877 0.015 0.070 0.023 15 R 0.001 0.001 0.046 0.668 0.022 0.241 0.022 16 R 0.001 0.002 0.081 0.415 0.022 0.420 0.058 17 L 0.001 0.006 0.045 0.164 0.157 0.105 0.524 18 D 0.002 0.006 0.081 0.191 0.066 0.148 0.506 19 L 0.002 0.005 0.133 0.202 0.101 0.167 0.390 20 K 0.002 0.004 0.098 0.318 0.116 0.157 0.304 21 A 0.004 0.004 0.047 0.408 0.123 0.123 0.292 22 L 0.002 0.002 0.035 0.700 0.063 0.086 0.112 23 S 0.002 0.001 0.013 0.846 0.030 0.037 0.070 24 R 0.002 0.001 0.003 0.926 0.021 0.016 0.031 25 A 0.002 0.001 0.001 0.955 0.008 0.009 0.024 26 V 0.001 0.001 0.001 0.974 0.004 0.009 0.010 27 G 0.001 0.001 0.001 0.979 0.005 0.010 0.004 28 A 0.001 0.001 0.002 0.969 0.005 0.018 0.006 29 A 0.001 0.001 0.003 0.947 0.004 0.040 0.006 30 L 0.001 0.001 0.008 0.887 0.014 0.068 0.022 31 L 0.002 0.001 0.025 0.695 0.025 0.221 0.031 32 P 0.002 0.002 0.032 0.471 0.045 0.376 0.072 33 W 0.004 0.007 0.039 0.300 0.136 0.104 0.410 34 L 0.014 0.005 0.115 0.444 0.078 0.143 0.201 35 R 0.026 0.005 0.202 0.360 0.085 0.161 0.161 36 E 0.046 0.023 0.263 0.264 0.094 0.121 0.189 37 R 0.075 0.007 0.131 0.191 0.128 0.292 0.176 38 G 0.094 0.012 0.095 0.091 0.126 0.400 0.180 39 F 0.141 0.014 0.036 0.017 0.172 0.109 0.510 40 R 0.267 0.004 0.012 0.005 0.245 0.065 0.403 41 H 0.813 0.004 0.004 0.002 0.082 0.011 0.084 42 I 0.953 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.039 43 L 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.011 44 L 0.980 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 45 Y 0.868 0.005 0.001 0.001 0.009 0.001 0.116 46 H 0.525 0.011 0.002 0.001 0.075 0.006 0.381 47 P 0.124 0.013 0.006 0.002 0.176 0.040 0.639 48 L 0.025 0.013 0.047 0.009 0.268 0.192 0.446 49 P 0.011 0.005 0.086 0.014 0.322 0.313 0.249 50 H 0.014 0.007 0.124 0.025 0.295 0.306 0.229 51 E 0.024 0.013 0.152 0.069 0.273 0.152 0.317 52 L 0.042 0.038 0.098 0.118 0.198 0.081 0.425 53 N 0.062 0.114 0.052 0.174 0.077 0.064 0.457 54 L 0.014 0.006 0.048 0.746 0.031 0.033 0.123 55 L 0.003 0.001 0.028 0.927 0.008 0.013 0.020 56 P 0.002 0.001 0.022 0.952 0.004 0.012 0.007 57 L 0.002 0.001 0.013 0.963 0.003 0.014 0.005 58 M 0.001 0.001 0.019 0.947 0.004 0.019 0.007 59 E 0.002 0.001 0.032 0.848 0.008 0.099 0.010 60 A 0.002 0.001 0.045 0.674 0.027 0.233 0.019 61 Y 0.003 0.004 0.055 0.200 0.098 0.578 0.062 62 P 0.007 0.003 0.016 0.013 0.122 0.651 0.188 63 A 0.084 0.004 0.012 0.009 0.328 0.053 0.511 64 R 0.598 0.017 0.004 0.003 0.056 0.009 0.313 65 Y 0.830 0.004 0.001 0.001 0.009 0.003 0.152 66 Y 0.919 0.003 0.001 0.001 0.008 0.002 0.066 67 L 0.875 0.005 0.001 0.001 0.010 0.001 0.107 68 P 0.691 0.003 0.001 0.001 0.023 0.002 0.279 69 K 0.621 0.011 0.002 0.002 0.036 0.006 0.321 70 V 0.476 0.041 0.006 0.004 0.069 0.024 0.379 71 A 0.237 0.016 0.011 0.005 0.139 0.059 0.533 72 G 0.070 0.008 0.058 0.012 0.345 0.199 0.309 73 K 0.047 0.007 0.069 0.011 0.360 0.332 0.174 74 G 0.123 0.008 0.059 0.010 0.231 0.237 0.333 75 L 0.453 0.019 0.012 0.008 0.087 0.032 0.390 76 T 0.755 0.019 0.004 0.006 0.028 0.009 0.180 77 V 0.811 0.016 0.004 0.007 0.014 0.005 0.142 78 H 0.760 0.008 0.004 0.007 0.019 0.007 0.194 79 P 0.704 0.017 0.008 0.010 0.032 0.017 0.212 80 F 0.440 0.012 0.011 0.016 0.040 0.019 0.462 81 G 0.277 0.007 0.014 0.017 0.049 0.026 0.611 82 P 0.287 0.017 0.032 0.046 0.089 0.069 0.461 83 L 0.221 0.025 0.027 0.055 0.122 0.049 0.500 84 A 0.168 0.022 0.032 0.071 0.099 0.057 0.552 85 P 0.119 0.032 0.067 0.121 0.181 0.190 0.289 86 G 0.066 0.012 0.079 0.083 0.234 0.242 0.285 87 P 0.071 0.015 0.103 0.066 0.206 0.247 0.292 88 F 0.094 0.044 0.063 0.052 0.161 0.315 0.272 89 G 0.051 0.013 0.025 0.016 0.109 0.233 0.553 90 L 0.024 0.011 0.004 0.005 0.052 0.015 0.889 91 L 0.067 0.084 0.005 0.007 0.089 0.024 0.724 92 E 0.046 0.025 0.006 0.008 0.241 0.026 0.649 93 P 0.025 0.032 0.006 0.006 0.083 0.025 0.823 94 T 0.025 0.054 0.014 0.010 0.097 0.037 0.763 95 T 0.018 0.023 0.039 0.027 0.201 0.079 0.614 96 P 0.012 0.012 0.057 0.024 0.106 0.101 0.688 97 P 0.013 0.014 0.105 0.031 0.138 0.181 0.519 98 E 0.014 0.014 0.083 0.029 0.176 0.122 0.562 99 D 0.016 0.018 0.112 0.031 0.126 0.115 0.583 100 P 0.032 0.011 0.145 0.038 0.145 0.167 0.461 101 R 0.087 0.030 0.094 0.033 0.234 0.102 0.420 102 V 0.277 0.048 0.046 0.020 0.128 0.071 0.409 103 L 0.297 0.006 0.003 0.004 0.052 0.007 0.631 104 D 0.669 0.001 0.001 0.003 0.179 0.003 0.144 105 L 0.987 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 106 V 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 107 V 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 108 V 0.962 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.032 109 P 0.713 0.002 0.004 0.002 0.043 0.019 0.218 110 G 0.442 0.003 0.032 0.007 0.215 0.064 0.237 111 L 0.573 0.017 0.045 0.012 0.159 0.051 0.143 112 A 0.636 0.020 0.033 0.011 0.098 0.036 0.166 113 F 0.622 0.168 0.006 0.006 0.061 0.016 0.122 114 D 0.137 0.010 0.008 0.002 0.025 0.024 0.795 115 R 0.012 0.001 0.015 0.002 0.047 0.900 0.024 116 E 0.008 0.002 0.013 0.002 0.073 0.889 0.012 117 G 0.060 0.004 0.009 0.002 0.585 0.135 0.206 118 Y 0.216 0.030 0.004 0.002 0.145 0.047 0.557 119 R 0.687 0.176 0.003 0.001 0.019 0.011 0.103 120 L 0.799 0.015 0.003 0.001 0.020 0.018 0.144 121 G 0.742 0.013 0.005 0.001 0.087 0.050 0.103 122 H 0.459 0.025 0.006 0.003 0.182 0.068 0.257 123 G 0.170 0.025 0.008 0.004 0.190 0.103 0.499 124 Q 0.069 0.015 0.012 0.012 0.351 0.247 0.294 125 G 0.048 0.020 0.022 0.066 0.408 0.233 0.202 126 F 0.060 0.034 0.043 0.414 0.097 0.117 0.235 127 Y 0.065 0.021 0.044 0.598 0.057 0.088 0.127 128 D 0.054 0.008 0.040 0.749 0.035 0.036 0.079 129 R 0.036 0.004 0.053 0.797 0.023 0.038 0.048 130 F 0.013 0.003 0.053 0.835 0.013 0.051 0.031 131 L 0.013 0.005 0.107 0.746 0.015 0.080 0.033 132 K 0.011 0.003 0.107 0.644 0.024 0.178 0.033 133 E 0.008 0.003 0.085 0.460 0.056 0.334 0.053 134 V 0.014 0.015 0.023 0.187 0.290 0.111 0.360 135 R 0.015 0.012 0.008 0.028 0.196 0.113 0.628 136 A 0.028 0.005 0.004 0.010 0.244 0.059 0.650 137 A 0.091 0.003 0.006 0.008 0.226 0.067 0.598 138 T 0.729 0.019 0.004 0.007 0.043 0.011 0.188 139 V 0.954 0.005 0.001 0.002 0.004 0.001 0.033 140 G 0.971 0.002 0.001 0.002 0.003 0.001 0.021 141 V 0.963 0.002 0.001 0.003 0.003 0.002 0.025 142 V 0.887 0.003 0.002 0.005 0.016 0.012 0.075 143 P 0.640 0.007 0.017 0.018 0.087 0.046 0.184 144 Q 0.462 0.009 0.054 0.030 0.133 0.061 0.251 145 A 0.410 0.013 0.137 0.066 0.091 0.084 0.199 146 L 0.446 0.019 0.133 0.090 0.087 0.068 0.156 147 L 0.475 0.074 0.076 0.098 0.064 0.049 0.164 148 F 0.294 0.019 0.069 0.102 0.105 0.059 0.352 149 P 0.148 0.007 0.117 0.117 0.136 0.228 0.248 150 A 0.082 0.019 0.113 0.110 0.178 0.238 0.260 151 L 0.066 0.026 0.023 0.032 0.372 0.042 0.439 152 P 0.032 0.013 0.008 0.009 0.119 0.039 0.780 153 R 0.021 0.025 0.038 0.030 0.201 0.079 0.607 154 D 0.008 0.012 0.067 0.029 0.167 0.064 0.653 155 P 0.006 0.003 0.333 0.055 0.101 0.292 0.210 156 W 0.010 0.008 0.301 0.043 0.106 0.387 0.146 157 D 0.025 0.038 0.182 0.032 0.235 0.150 0.338 158 V 0.102 0.055 0.036 0.036 0.265 0.044 0.461 159 P 0.192 0.048 0.020 0.023 0.092 0.042 0.582 160 V 0.229 0.014 0.042 0.080 0.089 0.037 0.510 161 D 0.403 0.004 0.032 0.065 0.276 0.034 0.186 162 H 0.850 0.009 0.016 0.041 0.020 0.018 0.046 163 L 0.903 0.008 0.004 0.018 0.008 0.010 0.049 164 A 0.885 0.016 0.001 0.008 0.019 0.006 0.066 165 T 0.379 0.006 0.002 0.002 0.071 0.013 0.528 166 E 0.049 0.004 0.040 0.014 0.225 0.517 0.151 167 A 0.039 0.004 0.053 0.018 0.268 0.528 0.092 168 G 0.263 0.016 0.078 0.036 0.166 0.141 0.301 169 V 0.643 0.030 0.016 0.025 0.040 0.032 0.215 170 E 0.785 0.032 0.012 0.028 0.023 0.016 0.104 171 A 0.692 0.022 0.012 0.033 0.032 0.024 0.186 172 V 0.373 0.014 0.014 0.026 0.113 0.065 0.395 173 K 0.215 0.014 0.013 0.010 0.258 0.096 0.394 174 R 0.115 0.019 0.021 0.013 0.285 0.090 0.457 175 P 0.068 0.035 0.024 0.011 0.225 0.083 0.554 176 A 0.056 0.016 0.019 0.008 0.303 0.062 0.537 177 P 0.053 0.044 0.014 0.007 0.287 0.066 0.529 178 G 0.035 0.031 0.010 0.005 0.226 0.024 0.668 179 P 0.039 0.034 0.027 0.010 0.202 0.167 0.521 180 G 0.055 0.017 0.037 0.010 0.261 0.280 0.340 181 G 0.115 0.025 0.048 0.023 0.305 0.131 0.353 182 L 0.183 0.048 0.024 0.035 0.123 0.071 0.516 183 L 0.170 0.055 0.010 0.020 0.005 0.054 0.685 184 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999