# TARGET T0275 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0275.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 806 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 2 F 0.193 0.055 0.015 0.025 0.006 0.031 0.675 3 K 0.314 0.015 0.032 0.023 0.110 0.080 0.426 4 T 0.464 0.006 0.029 0.019 0.101 0.066 0.315 5 I 0.789 0.007 0.008 0.010 0.035 0.019 0.132 6 L 0.904 0.004 0.003 0.006 0.013 0.005 0.064 7 L 0.886 0.012 0.003 0.005 0.015 0.002 0.076 8 A 0.731 0.008 0.004 0.004 0.023 0.006 0.224 9 Y 0.414 0.044 0.011 0.004 0.098 0.047 0.382 10 D 0.146 0.041 0.012 0.005 0.309 0.085 0.402 11 G 0.013 0.006 0.021 0.009 0.432 0.074 0.445 12 S 0.004 0.005 0.008 0.024 0.303 0.016 0.640 13 E 0.001 0.001 0.177 0.718 0.023 0.075 0.007 14 H 0.001 0.001 0.094 0.832 0.017 0.047 0.010 15 A 0.001 0.001 0.029 0.935 0.007 0.016 0.013 16 R 0.001 0.001 0.003 0.981 0.003 0.008 0.004 17 R 0.001 0.001 0.001 0.979 0.003 0.012 0.004 18 A 0.001 0.001 0.001 0.979 0.002 0.014 0.004 19 A 0.001 0.001 0.001 0.989 0.004 0.005 0.003 20 E 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.005 0.002 21 V 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.009 0.001 22 A 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.007 0.003 23 K 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.007 0.002 24 A 0.001 0.001 0.001 0.973 0.003 0.019 0.003 25 E 0.001 0.001 0.002 0.966 0.002 0.022 0.007 26 A 0.001 0.001 0.003 0.954 0.007 0.023 0.011 27 E 0.002 0.002 0.015 0.885 0.008 0.073 0.015 28 A 0.003 0.002 0.034 0.685 0.034 0.200 0.041 29 H 0.001 0.002 0.014 0.130 0.049 0.793 0.012 30 G 0.001 0.001 0.002 0.002 0.031 0.924 0.039 31 A 0.038 0.002 0.001 0.001 0.107 0.004 0.849 32 R 0.512 0.003 0.001 0.001 0.123 0.001 0.359 33 L 0.971 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 34 I 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 35 V 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 36 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 37 H 0.967 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.030 38 A 0.752 0.002 0.001 0.001 0.020 0.002 0.224 39 Y 0.487 0.018 0.002 0.002 0.106 0.011 0.374 40 E 0.268 0.024 0.007 0.007 0.150 0.034 0.510 41 P 0.069 0.023 0.038 0.030 0.220 0.115 0.504 42 V 0.044 0.015 0.090 0.067 0.268 0.198 0.317 43 P 0.027 0.009 0.158 0.099 0.181 0.240 0.284 44 D 0.025 0.012 0.152 0.129 0.169 0.213 0.300 45 Y 0.023 0.012 0.110 0.147 0.193 0.170 0.345 46 L 0.021 0.012 0.095 0.186 0.143 0.165 0.378 47 G 0.014 0.008 0.080 0.196 0.102 0.122 0.479 48 E 0.014 0.008 0.076 0.265 0.096 0.143 0.398 49 P 0.015 0.009 0.081 0.336 0.102 0.166 0.292 50 F 0.010 0.009 0.058 0.394 0.112 0.095 0.322 51 F 0.005 0.004 0.041 0.589 0.067 0.064 0.230 52 E 0.003 0.002 0.031 0.787 0.044 0.062 0.072 53 E 0.003 0.002 0.019 0.838 0.032 0.053 0.053 54 A 0.002 0.002 0.012 0.870 0.025 0.036 0.053 55 L 0.001 0.001 0.004 0.917 0.017 0.023 0.036 56 R 0.001 0.001 0.003 0.930 0.015 0.026 0.024 57 R 0.001 0.001 0.002 0.937 0.012 0.026 0.021 58 R 0.001 0.001 0.002 0.934 0.009 0.028 0.026 59 L 0.001 0.001 0.001 0.951 0.010 0.025 0.013 60 E 0.001 0.001 0.001 0.950 0.010 0.026 0.013 61 R 0.001 0.001 0.001 0.960 0.007 0.017 0.016 62 A 0.001 0.001 0.001 0.965 0.006 0.012 0.015 63 E 0.001 0.001 0.001 0.976 0.007 0.011 0.005 64 G 0.001 0.001 0.001 0.976 0.004 0.015 0.005 65 V 0.001 0.001 0.001 0.977 0.002 0.014 0.006 66 L 0.001 0.001 0.001 0.976 0.005 0.010 0.007 67 E 0.001 0.001 0.001 0.973 0.005 0.015 0.005 68 E 0.001 0.001 0.002 0.960 0.005 0.023 0.008 69 A 0.001 0.001 0.004 0.947 0.006 0.026 0.016 70 R 0.002 0.001 0.010 0.891 0.016 0.063 0.017 71 A 0.005 0.001 0.026 0.716 0.020 0.208 0.024 72 L 0.006 0.004 0.035 0.463 0.108 0.264 0.120 73 T 0.002 0.003 0.019 0.132 0.118 0.664 0.062 74 G 0.004 0.001 0.008 0.007 0.067 0.773 0.139 75 V 0.041 0.006 0.001 0.002 0.056 0.005 0.889 76 P 0.437 0.021 0.001 0.001 0.026 0.005 0.509 77 K 0.759 0.009 0.002 0.001 0.019 0.005 0.204 78 E 0.903 0.003 0.003 0.001 0.020 0.004 0.065 79 D 0.935 0.003 0.002 0.001 0.007 0.001 0.052 80 A 0.930 0.001 0.002 0.002 0.010 0.002 0.053 81 L 0.931 0.005 0.001 0.003 0.010 0.002 0.048 82 L 0.878 0.007 0.003 0.006 0.013 0.005 0.087 83 L 0.687 0.015 0.007 0.012 0.051 0.043 0.185 84 E 0.208 0.008 0.010 0.015 0.246 0.228 0.286 85 G 0.031 0.006 0.003 0.005 0.604 0.104 0.247 86 V 0.033 0.029 0.003 0.024 0.332 0.019 0.559 87 P 0.003 0.002 0.038 0.785 0.040 0.045 0.086 88 A 0.001 0.001 0.015 0.956 0.005 0.017 0.007 89 E 0.001 0.001 0.008 0.979 0.003 0.007 0.003 90 A 0.001 0.001 0.003 0.988 0.001 0.005 0.003 91 I 0.001 0.001 0.002 0.987 0.001 0.008 0.002 92 L 0.001 0.001 0.002 0.984 0.002 0.010 0.002 93 Q 0.001 0.001 0.002 0.977 0.003 0.015 0.003 94 A 0.001 0.001 0.002 0.976 0.002 0.015 0.004 95 A 0.001 0.001 0.004 0.971 0.004 0.015 0.007 96 R 0.001 0.001 0.014 0.948 0.002 0.031 0.004 97 A 0.001 0.001 0.023 0.872 0.008 0.088 0.008 98 E 0.001 0.002 0.029 0.576 0.052 0.322 0.018 99 K 0.004 0.005 0.009 0.049 0.063 0.732 0.139 100 A 0.016 0.001 0.001 0.001 0.058 0.005 0.920 101 D 0.135 0.001 0.001 0.001 0.756 0.002 0.106 102 L 0.985 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 103 I 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 104 V 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 105 M 0.949 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.045 106 G 0.466 0.004 0.002 0.001 0.111 0.008 0.407 107 T 0.126 0.007 0.022 0.006 0.313 0.082 0.444 108 R 0.033 0.031 0.054 0.010 0.315 0.247 0.310 109 G 0.035 0.021 0.051 0.016 0.335 0.222 0.319 110 L 0.018 0.015 0.086 0.040 0.319 0.205 0.318 111 G 0.028 0.019 0.083 0.082 0.358 0.233 0.197 112 A 0.037 0.014 0.146 0.267 0.137 0.232 0.167 113 L 0.065 0.019 0.173 0.398 0.077 0.117 0.150 114 G 0.050 0.012 0.252 0.466 0.047 0.094 0.080 115 S 0.105 0.006 0.187 0.413 0.068 0.106 0.114 116 L 0.183 0.019 0.141 0.326 0.070 0.162 0.099 117 F 0.347 0.068 0.039 0.192 0.066 0.154 0.134 118 L 0.279 0.019 0.017 0.092 0.101 0.209 0.283 119 G 0.099 0.008 0.005 0.046 0.392 0.067 0.383 120 S 0.042 0.022 0.016 0.430 0.175 0.035 0.280 121 Q 0.001 0.001 0.020 0.965 0.004 0.007 0.003 122 S 0.001 0.001 0.011 0.978 0.001 0.007 0.002 123 Q 0.001 0.001 0.008 0.983 0.001 0.005 0.002 124 R 0.001 0.001 0.005 0.986 0.001 0.005 0.002 125 V 0.001 0.001 0.007 0.974 0.002 0.012 0.004 126 V 0.002 0.002 0.025 0.919 0.006 0.039 0.006 127 A 0.005 0.002 0.032 0.662 0.022 0.267 0.011 128 E 0.004 0.007 0.027 0.339 0.035 0.550 0.039 129 A 0.005 0.021 0.007 0.061 0.275 0.115 0.517 130 P 0.003 0.013 0.003 0.005 0.374 0.125 0.475 131 C 0.007 0.002 0.002 0.003 0.613 0.021 0.353 132 P 0.063 0.006 0.002 0.003 0.190 0.020 0.717 133 V 0.817 0.010 0.002 0.003 0.049 0.006 0.114 134 L 0.973 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.020 135 L 0.964 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.030 136 V 0.822 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.164 137 R 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994