# TARGET T0274 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0274.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 250 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.020 0.025 0.002 0.026 0.158 0.769 2 N 0.008 0.012 0.001 0.063 0.068 0.847 3 L 0.001 0.001 0.007 0.973 0.009 0.011 4 E 0.001 0.001 0.006 0.977 0.012 0.005 5 A 0.001 0.001 0.006 0.986 0.007 0.002 6 K 0.001 0.001 0.002 0.991 0.005 0.002 7 K 0.001 0.001 0.002 0.990 0.007 0.001 8 K 0.001 0.001 0.005 0.969 0.020 0.006 9 V 0.001 0.001 0.006 0.973 0.015 0.006 10 L 0.001 0.001 0.016 0.958 0.019 0.006 11 R 0.001 0.001 0.046 0.884 0.047 0.021 12 S 0.004 0.001 0.086 0.691 0.140 0.078 13 F 0.016 0.005 0.053 0.364 0.301 0.261 14 T 0.017 0.003 0.022 0.025 0.325 0.608 15 Y 0.066 0.007 0.016 0.008 0.358 0.545 16 G 0.289 0.003 0.012 0.004 0.233 0.459 17 L 0.916 0.004 0.002 0.001 0.027 0.050 18 Y 0.982 0.001 0.001 0.001 0.005 0.012 19 V 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 20 L 0.984 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 21 T 0.969 0.001 0.001 0.001 0.011 0.019 22 A 0.921 0.004 0.001 0.001 0.031 0.043 23 K 0.628 0.012 0.004 0.002 0.254 0.099 24 D 0.109 0.009 0.021 0.008 0.774 0.079 25 G 0.016 0.002 0.048 0.012 0.878 0.044 26 D 0.051 0.006 0.053 0.013 0.805 0.073 27 E 0.412 0.034 0.017 0.008 0.336 0.194 28 V 0.650 0.031 0.005 0.003 0.107 0.204 29 A 0.794 0.011 0.002 0.002 0.063 0.127 30 A 0.857 0.005 0.002 0.002 0.049 0.085 31 G 0.890 0.009 0.001 0.002 0.026 0.071 32 T 0.878 0.006 0.002 0.003 0.033 0.079 33 V 0.772 0.005 0.015 0.006 0.078 0.124 34 N 0.635 0.007 0.027 0.007 0.150 0.174 35 W 0.595 0.011 0.037 0.010 0.198 0.149 36 V 0.538 0.016 0.025 0.009 0.200 0.212 37 T 0.527 0.010 0.013 0.009 0.164 0.276 38 Q 0.661 0.026 0.010 0.011 0.114 0.178 39 A 0.589 0.030 0.009 0.014 0.133 0.224 40 S 0.551 0.030 0.009 0.014 0.218 0.178 41 F 0.247 0.018 0.016 0.014 0.349 0.355 42 Q 0.076 0.059 0.004 0.006 0.350 0.505 43 P 0.047 0.002 0.003 0.002 0.219 0.727 44 P 0.286 0.005 0.007 0.004 0.153 0.545 45 L 0.838 0.009 0.004 0.002 0.046 0.101 46 V 0.979 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 47 A 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 48 V 0.979 0.001 0.001 0.001 0.004 0.016 49 G 0.949 0.002 0.001 0.001 0.013 0.034 50 L 0.798 0.007 0.001 0.001 0.059 0.134 51 K 0.257 0.015 0.003 0.004 0.548 0.174 52 R 0.033 0.006 0.036 0.023 0.808 0.093 53 D 0.017 0.003 0.071 0.056 0.782 0.071 54 S 0.035 0.010 0.118 0.171 0.610 0.057 55 H 0.062 0.020 0.040 0.420 0.225 0.234 56 L 0.076 0.033 0.026 0.625 0.095 0.145 57 H 0.022 0.002 0.049 0.818 0.072 0.037 58 A 0.017 0.001 0.041 0.880 0.046 0.015 59 L 0.011 0.002 0.038 0.908 0.034 0.008 60 V 0.011 0.001 0.033 0.917 0.031 0.007 61 E 0.012 0.001 0.033 0.902 0.042 0.011 62 R 0.014 0.002 0.026 0.883 0.055 0.021 63 T 0.023 0.001 0.017 0.558 0.214 0.187 64 G 0.018 0.001 0.002 0.016 0.224 0.740 65 K 0.440 0.005 0.002 0.005 0.136 0.411 66 L 0.919 0.006 0.001 0.002 0.023 0.049 67 A 0.961 0.002 0.001 0.002 0.010 0.025 68 L 0.967 0.002 0.001 0.001 0.007 0.023 69 M 0.901 0.005 0.004 0.002 0.033 0.055 70 T 0.600 0.007 0.010 0.005 0.134 0.243 71 L 0.151 0.008 0.006 0.004 0.273 0.558 72 A 0.021 0.006 0.012 0.019 0.402 0.540 73 H 0.004 0.003 0.075 0.444 0.349 0.125 74 D 0.002 0.003 0.075 0.699 0.175 0.045 75 Q 0.001 0.001 0.014 0.947 0.026 0.012 76 K 0.001 0.001 0.003 0.986 0.007 0.004 77 A 0.001 0.001 0.003 0.986 0.007 0.003 78 I 0.001 0.001 0.004 0.988 0.006 0.001 79 A 0.001 0.001 0.007 0.977 0.012 0.003 80 Q 0.001 0.001 0.008 0.972 0.014 0.006 81 D 0.001 0.001 0.007 0.966 0.014 0.012 82 F 0.001 0.001 0.007 0.933 0.024 0.033 83 F 0.006 0.007 0.020 0.672 0.107 0.188 84 K 0.008 0.011 0.047 0.407 0.303 0.224 85 P 0.013 0.007 0.059 0.278 0.410 0.234 86 T 0.015 0.009 0.045 0.154 0.434 0.344 87 V 0.017 0.013 0.031 0.091 0.434 0.414 88 R 0.017 0.011 0.049 0.124 0.389 0.410 89 E 0.017 0.015 0.068 0.167 0.379 0.355 90 G 0.012 0.010 0.211 0.297 0.336 0.134 91 D 0.018 0.015 0.241 0.287 0.316 0.122 92 R 0.018 0.008 0.258 0.330 0.292 0.094 93 L 0.025 0.017 0.176 0.325 0.378 0.078 94 N 0.025 0.006 0.093 0.300 0.405 0.170 95 G 0.026 0.006 0.022 0.058 0.444 0.444 96 H 0.093 0.013 0.013 0.026 0.321 0.535 97 P 0.272 0.024 0.008 0.015 0.137 0.544 98 F 0.455 0.052 0.024 0.030 0.136 0.303 99 E 0.438 0.049 0.023 0.025 0.212 0.254 100 P 0.269 0.025 0.052 0.039 0.317 0.298 101 S 0.079 0.006 0.122 0.021 0.596 0.176 102 P 0.042 0.006 0.118 0.020 0.646 0.167 103 T 0.036 0.014 0.162 0.020 0.631 0.136 104 F 0.047 0.006 0.038 0.009 0.701 0.199 105 G 0.044 0.009 0.015 0.003 0.463 0.466 106 L 0.247 0.020 0.005 0.003 0.244 0.481 107 P 0.437 0.019 0.013 0.005 0.186 0.339 108 L 0.628 0.046 0.020 0.010 0.109 0.186 109 L 0.591 0.011 0.095 0.019 0.174 0.110 110 T 0.315 0.009 0.132 0.039 0.372 0.133 111 E 0.171 0.004 0.112 0.033 0.532 0.147 112 L 0.409 0.027 0.036 0.026 0.326 0.176 113 P 0.614 0.013 0.015 0.018 0.167 0.173 114 Y 0.805 0.008 0.007 0.007 0.071 0.102 115 W 0.941 0.005 0.002 0.002 0.022 0.028 116 L 0.956 0.003 0.001 0.001 0.013 0.026 117 E 0.973 0.002 0.001 0.001 0.007 0.018 118 A 0.946 0.001 0.001 0.001 0.013 0.037 119 E 0.948 0.001 0.002 0.001 0.017 0.031 120 V 0.943 0.002 0.002 0.002 0.023 0.027 121 R 0.879 0.002 0.003 0.004 0.055 0.057 122 H 0.806 0.005 0.003 0.006 0.086 0.095 123 L 0.688 0.012 0.006 0.009 0.147 0.138 124 Y 0.511 0.018 0.010 0.012 0.259 0.190 125 P 0.319 0.018 0.015 0.014 0.389 0.246 126 G 0.201 0.019 0.023 0.016 0.483 0.258 127 G 0.115 0.013 0.022 0.010 0.623 0.217 128 D 0.151 0.010 0.037 0.006 0.558 0.237 129 H 0.457 0.005 0.014 0.002 0.296 0.226 130 S 0.879 0.003 0.002 0.001 0.043 0.072 131 L 0.986 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 132 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 133 V 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 134 A 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 135 E 0.984 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 136 V 0.975 0.001 0.001 0.001 0.007 0.016 137 V 0.963 0.001 0.001 0.001 0.013 0.022 138 E 0.956 0.003 0.001 0.001 0.015 0.024 139 A 0.939 0.002 0.001 0.001 0.020 0.036 140 G 0.902 0.005 0.002 0.002 0.043 0.046 141 V 0.708 0.020 0.004 0.005 0.103 0.160 142 R 0.291 0.031 0.017 0.010 0.472 0.178 143 R 0.061 0.005 0.063 0.015 0.730 0.127 144 E 0.031 0.004 0.070 0.013 0.783 0.098 145 E 0.064 0.029 0.051 0.009 0.698 0.149 146 K 0.094 0.010 0.021 0.008 0.424 0.443 147 P 0.268 0.011 0.029 0.013 0.245 0.434 148 L 0.778 0.018 0.016 0.011 0.091 0.086 149 V 0.902 0.008 0.007 0.009 0.041 0.033 150 M 0.921 0.006 0.004 0.007 0.036 0.026 151 W 0.814 0.008 0.006 0.012 0.094 0.066 152 D 0.239 0.002 0.012 0.024 0.496 0.228 153 T 0.108 0.005 0.010 0.017 0.584 0.276 154 G 0.350 0.029 0.013 0.017 0.323 0.268 155 W 0.644 0.025 0.012 0.020 0.105 0.193 156 F 0.649 0.017 0.013 0.021 0.081 0.219 157 Y 0.547 0.039 0.017 0.023 0.107 0.267 158 G 0.125 0.013 0.009 0.022 0.113 0.719 159 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.023 0.973