# TARGET T0273 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0273.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 118 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.038 0.002 0.003 0.003 0.126 0.828 2 P 0.185 0.024 0.005 0.007 0.080 0.699 3 L 0.370 0.068 0.010 0.013 0.100 0.439 4 V 0.511 0.044 0.016 0.012 0.158 0.259 5 L 0.391 0.022 0.012 0.010 0.244 0.322 6 D 0.182 0.006 0.010 0.008 0.454 0.340 7 L 0.113 0.009 0.020 0.012 0.466 0.379 8 A 0.224 0.039 0.058 0.024 0.365 0.289 9 R 0.224 0.022 0.110 0.026 0.346 0.273 10 P 0.254 0.028 0.086 0.035 0.243 0.354 11 V 0.158 0.065 0.025 0.040 0.187 0.525 12 S 0.038 0.010 0.002 0.035 0.071 0.843 13 E 0.001 0.001 0.020 0.935 0.024 0.020 14 E 0.001 0.001 0.025 0.946 0.023 0.005 15 E 0.001 0.001 0.041 0.939 0.018 0.001 16 L 0.001 0.001 0.028 0.940 0.025 0.005 17 R 0.001 0.001 0.028 0.945 0.021 0.005 18 R 0.001 0.001 0.032 0.897 0.053 0.016 19 L 0.002 0.001 0.029 0.732 0.137 0.100 20 S 0.004 0.011 0.086 0.401 0.332 0.166 21 E 0.013 0.012 0.098 0.218 0.485 0.173 22 L 0.017 0.010 0.069 0.130 0.472 0.301 23 N 0.029 0.016 0.027 0.025 0.713 0.189 24 P 0.024 0.004 0.056 0.023 0.735 0.158 25 G 0.062 0.007 0.066 0.017 0.655 0.193 26 Y 0.177 0.038 0.073 0.017 0.492 0.204 27 Q 0.379 0.018 0.026 0.016 0.130 0.432 28 W 0.777 0.014 0.016 0.011 0.050 0.132 29 E 0.864 0.021 0.006 0.007 0.035 0.066 30 R 0.736 0.021 0.007 0.012 0.181 0.044 31 S 0.276 0.008 0.014 0.017 0.602 0.082 32 P 0.097 0.003 0.006 0.005 0.809 0.080 33 E 0.188 0.007 0.006 0.005 0.703 0.091 34 G 0.695 0.011 0.001 0.004 0.083 0.205 35 R 0.927 0.016 0.001 0.002 0.015 0.040 36 L 0.907 0.004 0.001 0.002 0.018 0.068 37 W 0.856 0.011 0.002 0.003 0.028 0.101 38 V 0.428 0.011 0.007 0.006 0.106 0.442 39 S 0.172 0.014 0.007 0.005 0.170 0.631 40 P 0.076 0.015 0.008 0.005 0.330 0.566 41 T 0.053 0.022 0.011 0.013 0.406 0.495 42 G 0.047 0.021 0.017 0.041 0.408 0.467 43 G 0.047 0.017 0.022 0.167 0.435 0.312 44 E 0.042 0.014 0.020 0.369 0.259 0.296 45 S 0.024 0.014 0.018 0.678 0.132 0.134 46 G 0.012 0.002 0.010 0.866 0.058 0.052 47 R 0.009 0.002 0.010 0.918 0.032 0.029 48 R 0.008 0.003 0.007 0.954 0.014 0.014 49 S 0.006 0.001 0.003 0.981 0.005 0.006 50 L 0.004 0.001 0.001 0.990 0.003 0.003 51 Q 0.003 0.001 0.001 0.991 0.002 0.002 52 L 0.002 0.001 0.001 0.993 0.001 0.002 53 A 0.002 0.001 0.001 0.992 0.002 0.003 54 Y 0.001 0.001 0.002 0.991 0.002 0.004 55 Q 0.001 0.001 0.002 0.991 0.003 0.004 56 L 0.001 0.001 0.001 0.989 0.003 0.005 57 A 0.002 0.001 0.005 0.964 0.011 0.018 58 R 0.002 0.001 0.008 0.939 0.023 0.028 59 W 0.002 0.001 0.012 0.908 0.044 0.033 60 N 0.005 0.003 0.023 0.825 0.092 0.052 61 E 0.006 0.002 0.071 0.618 0.224 0.078 62 E 0.006 0.002 0.130 0.493 0.267 0.102 63 R 0.011 0.003 0.089 0.227 0.446 0.224 64 G 0.026 0.004 0.026 0.041 0.394 0.509 65 L 0.169 0.008 0.012 0.018 0.310 0.483 66 G 0.436 0.008 0.014 0.017 0.209 0.316 67 V 0.852 0.008 0.005 0.008 0.045 0.083 68 V 0.899 0.006 0.005 0.006 0.027 0.058 69 F 0.839 0.007 0.005 0.007 0.045 0.097 70 D 0.678 0.010 0.008 0.007 0.106 0.191 71 S 0.376 0.017 0.014 0.007 0.313 0.273 72 S 0.188 0.006 0.037 0.014 0.517 0.238 73 T 0.350 0.012 0.055 0.019 0.407 0.158 74 G 0.597 0.029 0.024 0.012 0.209 0.129 75 F 0.701 0.020 0.011 0.010 0.123 0.136 76 K 0.722 0.038 0.006 0.007 0.078 0.148 77 F 0.407 0.081 0.010 0.009 0.288 0.204 78 P 0.067 0.020 0.011 0.006 0.807 0.089 79 D 0.017 0.003 0.010 0.003 0.884 0.083 80 G 0.026 0.009 0.010 0.004 0.887 0.065 81 S 0.115 0.049 0.011 0.006 0.592 0.228 82 I 0.400 0.095 0.006 0.007 0.176 0.317 83 L 0.434 0.074 0.007 0.006 0.161 0.318 84 S 0.189 0.015 0.003 0.003 0.144 0.646 85 P 0.280 0.015 0.006 0.006 0.187 0.506 86 D 0.480 0.018 0.010 0.007 0.146 0.338 87 A 0.792 0.006 0.012 0.014 0.065 0.111 88 A 0.914 0.003 0.006 0.008 0.026 0.043 89 F 0.963 0.004 0.002 0.006 0.010 0.016 90 V 0.927 0.006 0.003 0.007 0.020 0.036 91 E 0.666 0.004 0.006 0.015 0.096 0.212 92 R 0.223 0.004 0.051 0.045 0.361 0.316 93 G 0.146 0.020 0.043 0.039 0.412 0.339 94 A 0.104 0.026 0.042 0.053 0.366 0.409 95 W 0.050 0.013 0.038 0.045 0.387 0.467 96 E 0.035 0.011 0.067 0.070 0.405 0.411 97 A 0.030 0.009 0.110 0.162 0.423 0.266 98 L 0.029 0.006 0.062 0.140 0.441 0.321 99 S 0.028 0.015 0.049 0.164 0.391 0.353 100 E 0.026 0.007 0.073 0.370 0.294 0.231 101 A 0.020 0.008 0.088 0.541 0.227 0.116 102 E 0.013 0.005 0.092 0.518 0.238 0.134 103 R 0.013 0.005 0.104 0.464 0.254 0.160 104 E 0.009 0.003 0.095 0.450 0.257 0.185 105 G 0.015 0.006 0.052 0.289 0.289 0.350 106 F 0.024 0.012 0.042 0.194 0.278 0.450 107 P 0.046 0.016 0.043 0.107 0.359 0.430 108 P 0.066 0.016 0.057 0.058 0.349 0.454 109 L 0.046 0.025 0.028 0.027 0.311 0.564 110 A 0.036 0.008 0.027 0.013 0.182 0.733 111 P 0.131 0.021 0.059 0.008 0.172 0.609 112 K 0.252 0.005 0.062 0.005 0.188 0.489 113 A 0.693 0.008 0.017 0.002 0.091 0.189 114 V 0.938 0.008 0.002 0.001 0.015 0.037 115 F 0.945 0.002 0.001 0.001 0.006 0.045 116 E 0.958 0.001 0.001 0.001 0.005 0.036 117 V 0.971 0.003 0.001 0.001 0.003 0.022 118 R 0.900 0.014 0.001 0.001 0.007 0.079 119 S 0.520 0.030 0.001 0.001 0.349 0.100 120 A 0.022 0.002 0.019 0.003 0.868 0.087 121 S 0.004 0.002 0.012 0.002 0.934 0.047 122 Q 0.003 0.010 0.014 0.005 0.904 0.065 123 D 0.007 0.013 0.003 0.019 0.174 0.784 124 P 0.007 0.018 0.047 0.617 0.185 0.125 125 E 0.004 0.002 0.053 0.777 0.107 0.057 126 E 0.002 0.001 0.056 0.875 0.048 0.017 127 L 0.001 0.002 0.023 0.940 0.023 0.012 128 R 0.001 0.001 0.009 0.968 0.015 0.007 129 A 0.001 0.001 0.005 0.975 0.009 0.010 130 K 0.001 0.001 0.002 0.986 0.003 0.009 131 M 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 132 G 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 133 I 0.001 0.001 0.002 0.993 0.004 0.001 134 Y 0.001 0.001 0.003 0.990 0.005 0.001 135 L 0.001 0.001 0.004 0.988 0.006 0.002 136 R 0.001 0.001 0.009 0.972 0.013 0.006 137 N 0.001 0.001 0.010 0.888 0.033 0.068 138 G 0.002 0.001 0.001 0.005 0.076 0.916 139 V 0.027 0.001 0.001 0.001 0.091 0.879 140 L 0.422 0.011 0.001 0.001 0.093 0.473 141 L 0.968 0.003 0.001 0.001 0.007 0.022 142 G 0.992 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 143 V 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 144 L 0.986 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 145 V 0.933 0.004 0.001 0.001 0.018 0.044 146 D 0.594 0.017 0.002 0.001 0.252 0.135 147 P 0.027 0.002 0.079 0.003 0.863 0.027 148 Y 0.027 0.002 0.175 0.005 0.774 0.016 149 A 0.090 0.010 0.104 0.003 0.774 0.019 150 R 0.386 0.003 0.010 0.002 0.359 0.239 151 A 0.940 0.005 0.001 0.001 0.014 0.040 152 V 0.992 0.002 0.001 0.001 0.002 0.004 153 E 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 154 V 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 155 F 0.930 0.009 0.001 0.001 0.012 0.049 156 R 0.461 0.014 0.003 0.002 0.383 0.138 157 P 0.028 0.003 0.015 0.004 0.803 0.147 158 G 0.009 0.003 0.025 0.004 0.860 0.099 159 K 0.023 0.020 0.038 0.008 0.817 0.094 160 P 0.091 0.020 0.026 0.024 0.325 0.514 161 P 0.280 0.042 0.053 0.049 0.244 0.333 162 L 0.430 0.019 0.065 0.060 0.230 0.196 163 R 0.540 0.037 0.045 0.061 0.169 0.149 164 L 0.512 0.029 0.036 0.067 0.201 0.156 165 E 0.412 0.015 0.034 0.070 0.244 0.226 166 G 0.185 0.012 0.031 0.051 0.415 0.306 167 V 0.096 0.011 0.038 0.029 0.467 0.359 168 E 0.140 0.016 0.030 0.027 0.369 0.418 169 R 0.337 0.045 0.023 0.017 0.242 0.336 170 V 0.388 0.029 0.011 0.019 0.193 0.361 171 S 0.343 0.025 0.019 0.026 0.214 0.373 172 L 0.164 0.028 0.077 0.060 0.326 0.345 173 D 0.064 0.006 0.224 0.062 0.392 0.253 174 P 0.106 0.018 0.271 0.067 0.361 0.176 175 E 0.117 0.041 0.119 0.090 0.353 0.281 176 L 0.053 0.022 0.026 0.025 0.820 0.054 177 P 0.012 0.003 0.022 0.016 0.892 0.054 178 G 0.022 0.001 0.013 0.007 0.884 0.073 179 F 0.343 0.007 0.005 0.007 0.539 0.100 180 A 0.825 0.021 0.001 0.006 0.031 0.116 181 L 0.921 0.046 0.001 0.003 0.008 0.022 182 S 0.791 0.009 0.004 0.020 0.058 0.119 183 L 0.186 0.002 0.369 0.182 0.143 0.118 184 P 0.062 0.004 0.584 0.092 0.168 0.091 185 P 0.027 0.003 0.495 0.102 0.205 0.168 186 L 0.022 0.013 0.092 0.084 0.126 0.663 187 W 0.001 0.002 0.002 0.005 0.023 0.967