# TARGET T0273 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0273.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 118 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 2 P 0.506 0.021 0.001 0.004 0.014 0.007 0.447 3 L 0.707 0.033 0.001 0.002 0.019 0.004 0.233 4 V 0.694 0.011 0.002 0.003 0.021 0.009 0.259 5 L 0.534 0.026 0.003 0.006 0.077 0.012 0.342 6 D 0.203 0.008 0.008 0.005 0.151 0.029 0.597 7 L 0.116 0.010 0.029 0.013 0.293 0.122 0.416 8 A 0.179 0.015 0.040 0.018 0.199 0.136 0.413 9 R 0.235 0.019 0.033 0.015 0.148 0.066 0.485 10 P 0.402 0.045 0.011 0.015 0.094 0.040 0.393 11 V 0.188 0.058 0.002 0.006 0.144 0.012 0.589 12 S 0.092 0.028 0.001 0.005 0.048 0.002 0.826 13 E 0.003 0.001 0.015 0.943 0.010 0.014 0.014 14 E 0.002 0.001 0.035 0.923 0.011 0.023 0.006 15 E 0.001 0.001 0.069 0.905 0.004 0.015 0.005 16 L 0.003 0.001 0.031 0.941 0.006 0.013 0.006 17 R 0.010 0.001 0.030 0.850 0.010 0.082 0.017 18 R 0.005 0.004 0.039 0.580 0.016 0.333 0.023 19 L 0.010 0.008 0.034 0.329 0.196 0.124 0.299 20 S 0.008 0.009 0.200 0.257 0.086 0.178 0.259 21 E 0.004 0.004 0.199 0.246 0.087 0.288 0.172 22 L 0.003 0.006 0.087 0.281 0.159 0.212 0.251 23 N 0.006 0.006 0.025 0.064 0.269 0.102 0.527 24 P 0.010 0.004 0.060 0.072 0.156 0.550 0.148 25 G 0.044 0.011 0.113 0.062 0.125 0.466 0.180 26 Y 0.148 0.019 0.175 0.119 0.151 0.079 0.310 27 Q 0.639 0.017 0.048 0.074 0.030 0.022 0.170 28 W 0.677 0.010 0.047 0.095 0.042 0.025 0.104 29 E 0.819 0.017 0.022 0.061 0.015 0.016 0.050 30 R 0.665 0.008 0.031 0.105 0.020 0.083 0.088 31 S 0.478 0.010 0.034 0.057 0.085 0.220 0.117 32 P 0.026 0.001 0.013 0.011 0.073 0.853 0.022 33 E 0.072 0.002 0.009 0.002 0.166 0.657 0.092 34 G 0.755 0.010 0.001 0.001 0.027 0.006 0.200 35 R 0.934 0.009 0.001 0.001 0.004 0.001 0.052 36 L 0.969 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.023 37 W 0.914 0.004 0.001 0.001 0.008 0.002 0.070 38 V 0.730 0.008 0.001 0.001 0.055 0.006 0.199 39 S 0.366 0.022 0.002 0.001 0.090 0.009 0.510 40 P 0.084 0.014 0.006 0.003 0.147 0.045 0.701 41 T 0.022 0.015 0.013 0.005 0.341 0.156 0.449 42 G 0.007 0.007 0.019 0.020 0.483 0.134 0.329 43 G 0.007 0.008 0.046 0.215 0.323 0.135 0.266 44 E 0.007 0.014 0.047 0.604 0.085 0.127 0.117 45 S 0.007 0.007 0.019 0.786 0.039 0.067 0.076 46 G 0.005 0.002 0.007 0.882 0.026 0.036 0.042 47 R 0.004 0.001 0.004 0.947 0.009 0.018 0.016 48 R 0.002 0.001 0.003 0.969 0.004 0.013 0.009 49 S 0.002 0.001 0.001 0.986 0.002 0.006 0.003 50 L 0.002 0.001 0.001 0.987 0.002 0.004 0.003 51 Q 0.002 0.001 0.001 0.990 0.001 0.004 0.002 52 L 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.001 53 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 54 Y 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.006 0.001 55 Q 0.001 0.001 0.002 0.983 0.001 0.013 0.001 56 L 0.001 0.001 0.003 0.971 0.003 0.018 0.003 57 A 0.001 0.001 0.011 0.939 0.005 0.038 0.005 58 R 0.003 0.001 0.022 0.870 0.011 0.081 0.012 59 W 0.005 0.003 0.041 0.793 0.022 0.105 0.031 60 N 0.019 0.011 0.041 0.639 0.076 0.129 0.085 61 E 0.039 0.007 0.060 0.404 0.095 0.210 0.185 62 E 0.043 0.007 0.072 0.255 0.144 0.260 0.219 63 R 0.047 0.009 0.077 0.167 0.145 0.378 0.178 64 G 0.069 0.008 0.057 0.076 0.216 0.344 0.230 65 L 0.276 0.015 0.035 0.043 0.149 0.106 0.376 66 G 0.515 0.011 0.012 0.024 0.098 0.052 0.289 67 V 0.756 0.014 0.009 0.021 0.053 0.019 0.128 68 V 0.819 0.015 0.006 0.017 0.022 0.012 0.110 69 F 0.785 0.015 0.008 0.012 0.037 0.019 0.125 70 D 0.631 0.017 0.011 0.011 0.076 0.030 0.224 71 S 0.358 0.017 0.027 0.015 0.157 0.092 0.334 72 S 0.234 0.011 0.064 0.019 0.187 0.225 0.259 73 T 0.224 0.011 0.098 0.028 0.175 0.295 0.168 74 G 0.318 0.022 0.065 0.033 0.160 0.118 0.284 75 F 0.486 0.047 0.026 0.029 0.086 0.033 0.293 76 K 0.517 0.110 0.015 0.026 0.059 0.024 0.249 77 F 0.357 0.058 0.011 0.019 0.093 0.042 0.421 78 P 0.102 0.014 0.017 0.008 0.188 0.226 0.445 79 D 0.022 0.009 0.025 0.006 0.281 0.503 0.154 80 G 0.027 0.009 0.039 0.006 0.392 0.292 0.235 81 S 0.049 0.023 0.087 0.009 0.292 0.169 0.371 82 I 0.144 0.035 0.038 0.006 0.241 0.074 0.462 83 L 0.235 0.147 0.019 0.005 0.150 0.039 0.405 84 S 0.260 0.043 0.007 0.003 0.116 0.037 0.534 85 P 0.208 0.009 0.002 0.002 0.201 0.019 0.559 86 D 0.327 0.002 0.002 0.001 0.435 0.011 0.221 87 A 0.925 0.015 0.001 0.001 0.005 0.002 0.051 88 A 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 89 F 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 90 V 0.929 0.003 0.001 0.001 0.006 0.002 0.058 91 E 0.522 0.007 0.003 0.003 0.065 0.012 0.388 92 R 0.164 0.007 0.059 0.035 0.240 0.107 0.388 93 G 0.118 0.023 0.110 0.053 0.224 0.147 0.325 94 A 0.116 0.037 0.090 0.093 0.150 0.094 0.420 95 W 0.041 0.022 0.091 0.132 0.128 0.082 0.505 96 E 0.024 0.009 0.101 0.140 0.131 0.253 0.341 97 A 0.013 0.009 0.101 0.158 0.168 0.321 0.230 98 L 0.007 0.010 0.073 0.115 0.250 0.216 0.329 99 S 0.008 0.010 0.045 0.115 0.238 0.166 0.419 100 E 0.005 0.006 0.117 0.388 0.134 0.161 0.189 101 A 0.005 0.008 0.155 0.484 0.095 0.107 0.146 102 E 0.004 0.007 0.160 0.530 0.051 0.088 0.160 103 R 0.004 0.013 0.193 0.541 0.042 0.098 0.110 104 E 0.005 0.004 0.193 0.405 0.048 0.259 0.086 105 G 0.005 0.004 0.132 0.231 0.053 0.488 0.087 106 F 0.010 0.020 0.060 0.088 0.191 0.121 0.509 107 P 0.014 0.032 0.089 0.036 0.143 0.100 0.587 108 P 0.020 0.009 0.077 0.014 0.184 0.258 0.437 109 L 0.027 0.043 0.059 0.015 0.288 0.168 0.400 110 A 0.045 0.055 0.012 0.004 0.227 0.031 0.626 111 P 0.039 0.004 0.009 0.002 0.177 0.043 0.726 112 K 0.228 0.004 0.010 0.002 0.488 0.041 0.227 113 A 0.925 0.017 0.002 0.001 0.006 0.002 0.048 114 V 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 115 F 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 116 E 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 117 V 0.858 0.002 0.001 0.001 0.015 0.001 0.124 118 R 0.541 0.029 0.002 0.001 0.090 0.003 0.334 119 S 0.108 0.034 0.004 0.001 0.063 0.006 0.785 120 A 0.003 0.002 0.064 0.006 0.096 0.781 0.048 121 S 0.001 0.001 0.040 0.006 0.085 0.837 0.031 122 Q 0.001 0.012 0.048 0.015 0.363 0.196 0.365 123 D 0.002 0.009 0.007 0.047 0.393 0.065 0.476 124 P 0.002 0.006 0.042 0.673 0.074 0.105 0.097 125 E 0.003 0.004 0.032 0.774 0.051 0.087 0.049 126 E 0.002 0.003 0.029 0.880 0.015 0.042 0.028 127 L 0.001 0.001 0.008 0.959 0.006 0.010 0.014 128 R 0.001 0.001 0.003 0.976 0.003 0.011 0.006 129 A 0.001 0.001 0.001 0.971 0.003 0.018 0.006 130 K 0.001 0.001 0.001 0.980 0.002 0.014 0.004 131 M 0.001 0.001 0.001 0.992 0.002 0.003 0.003 132 G 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 133 I 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 134 Y 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 135 L 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.009 0.001 136 R 0.001 0.001 0.007 0.883 0.002 0.104 0.003 137 N 0.001 0.001 0.003 0.104 0.009 0.882 0.002 138 G 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.971 0.015 139 V 0.020 0.001 0.001 0.001 0.027 0.002 0.950 140 L 0.434 0.004 0.001 0.001 0.135 0.001 0.425 141 L 0.972 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.020 142 G 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 143 V 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 144 L 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 145 V 0.973 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.023 146 D 0.538 0.002 0.001 0.001 0.013 0.001 0.446 147 P 0.015 0.001 0.045 0.002 0.065 0.852 0.021 148 Y 0.010 0.002 0.050 0.001 0.058 0.871 0.007 149 A 0.183 0.008 0.067 0.002 0.182 0.325 0.233 150 R 0.396 0.006 0.004 0.001 0.105 0.073 0.416 151 A 0.937 0.002 0.001 0.001 0.024 0.002 0.034 152 V 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 153 E 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 154 V 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 155 F 0.949 0.004 0.001 0.001 0.004 0.001 0.042 156 R 0.579 0.007 0.001 0.001 0.023 0.004 0.387 157 P 0.039 0.002 0.017 0.001 0.156 0.693 0.093 158 G 0.012 0.002 0.013 0.001 0.154 0.769 0.048 159 K 0.089 0.011 0.010 0.003 0.355 0.095 0.436 160 P 0.136 0.019 0.008 0.009 0.158 0.037 0.632 161 P 0.458 0.038 0.025 0.019 0.089 0.046 0.326 162 L 0.657 0.023 0.029 0.026 0.044 0.028 0.194 163 R 0.747 0.025 0.026 0.030 0.035 0.020 0.117 164 L 0.572 0.017 0.032 0.061 0.054 0.044 0.220 165 E 0.323 0.014 0.032 0.069 0.140 0.084 0.338 166 G 0.150 0.010 0.032 0.045 0.216 0.098 0.450 167 V 0.102 0.009 0.059 0.038 0.206 0.195 0.392 168 E 0.147 0.016 0.091 0.048 0.204 0.153 0.341 169 R 0.240 0.048 0.077 0.029 0.175 0.087 0.344 170 V 0.265 0.026 0.029 0.022 0.155 0.054 0.449 171 S 0.144 0.038 0.022 0.022 0.162 0.067 0.546 172 L 0.080 0.026 0.124 0.100 0.220 0.068 0.382 173 D 0.041 0.009 0.291 0.073 0.079 0.112 0.395 174 P 0.048 0.005 0.387 0.078 0.051 0.184 0.247 175 E 0.064 0.021 0.250 0.100 0.074 0.300 0.191 176 L 0.051 0.038 0.103 0.020 0.234 0.074 0.479 177 P 0.008 0.002 0.062 0.008 0.125 0.719 0.077 178 G 0.020 0.002 0.034 0.007 0.096 0.781 0.060 179 F 0.429 0.021 0.010 0.013 0.124 0.023 0.381 180 A 0.755 0.015 0.001 0.002 0.009 0.003 0.216 181 L 0.870 0.016 0.001 0.002 0.009 0.001 0.101 182 S 0.814 0.028 0.001 0.002 0.007 0.001 0.148 183 L 0.266 0.005 0.168 0.184 0.048 0.054 0.276 184 P 0.171 0.005 0.293 0.157 0.118 0.087 0.169 185 P 0.173 0.004 0.278 0.186 0.069 0.138 0.151 186 L 0.116 0.021 0.160 0.136 0.006 0.093 0.468 187 W 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.994