(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
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Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0270 1vdh, Thermus thermophilus
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  16 qssEPTVT...Q..QA..A.E..TL...DG.W.Y..TFHDFR.RIDWA.RL.....KQVD..A..
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  44 ...-----...-..--..-.-..--...--.-.-..------.-----.--.....----..-..
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   1 E..AREDAWEELKGLVREWRE..LEEA.GQG.SYGIYQVVGHK..A..D..LLFLNL.RPGLD.P
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  16 S..VRTKMVQEFQAFLGELAQ..VEDQ.KEG.SHALYTIIGQK..A..D..LVLMVL.RPTME.E
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  32 Q..EKQNINSSIIS--EIDEN..IKNG.NLI.NVKYYKSMRYD..S..D..IIFWAS.SNEPL.N
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  16 ...VRD.....RLYPIL.....PK.SK..HICFYPMSKSRRDGDNWYTLSMEKRKELMYR...HG
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  21 ...IPA.....FLAGEE.....PG.-A..YICVYPFVRSY----DWYLLPDQERRHMLAE...HG
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  23 ...FES.....KLTPEI.....PD.DT..YVSFYPMSKRRQPEQNWYDLPIEERAEMMDV...HG
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  31 ...GLE.....ILPGQ-.....--.GK..YLFIYPFIKTRA----WYDLTPHARQGMMDE...HI
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  36 ...LSS.....FL--KI.....PP.LK..YFVAYPMKKSPE----WYLLPFEERRDIMAE...HI
  37 ...INK.....VLSLE-.....P-.LR..YFVAYPMKKDVE----WYLLPFEEREKIMKE...HI
  38 ...LED.....SLKLK-.....P-.LD..YFVAYPMSKDPE----WYLLPFDERKEIMRE...HI
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  40 ...LED.....TLKTD-.....PK.-K..YFVVYPMSKDRE----WYLINYEERKKILAG...HI
  41 ...LED.....SL--RL.....PP.LR..YFVAYPMSKTP----DWYLLDFDTRKEIMHE...HI
  42 ...SSA.....SYTGDA.....PR.--..YAIMIPVKKDAA----WWNRSDEERLKEMEV...HT
  43 ...VPA.....FISGE-.....PP.KD..WLTIYPFVRTPE----WYLIPDEERKDMLAE...HG
  44 ...ARS.....KTAEEVve6knSK.FR..FLVAYPMKKSPT----WYLEPEEVRRRAMGE...HI
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  46 ...LRE.....R-QPALar...PE.AR..CAALIPIKKSAR----WWELAQDERRAIFEEtshHT
  47 ...LVA.....VQAG-L.....GR.LEatSAALIPIRKSQA----WWELTQEERRRIFEDrshHI


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  15 ETG..RKYQG..K..VMQVISGAQGLDD.WEWGVDLF.SED.PVQ..FKKIVYEM.RFDEVSARY
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