# TARGET T0267 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0267.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 966 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.020 0.003 0.001 0.003 0.133 0.840 2 V 0.250 0.127 0.002 0.008 0.087 0.525 3 R 0.308 0.017 0.003 0.012 0.093 0.567 4 I 0.383 0.007 0.022 0.021 0.121 0.447 5 R 0.385 0.023 0.024 0.014 0.149 0.405 6 R 0.348 0.022 0.058 0.013 0.206 0.353 7 A 0.082 0.009 0.010 0.004 0.258 0.638 8 G 0.015 0.006 0.004 0.003 0.218 0.753 9 L 0.006 0.001 0.417 0.106 0.354 0.115 10 E 0.003 0.002 0.433 0.174 0.313 0.074 11 D 0.002 0.003 0.365 0.459 0.110 0.061 12 L 0.001 0.001 0.042 0.887 0.032 0.037 13 P 0.001 0.001 0.016 0.955 0.017 0.011 14 G 0.001 0.001 0.017 0.972 0.006 0.003 15 V 0.001 0.001 0.009 0.981 0.006 0.003 16 A 0.001 0.001 0.005 0.985 0.006 0.003 17 R 0.001 0.001 0.005 0.979 0.009 0.007 18 V 0.002 0.001 0.004 0.964 0.016 0.014 19 L 0.002 0.001 0.005 0.952 0.021 0.019 20 V 0.002 0.001 0.008 0.933 0.031 0.025 21 D 0.001 0.001 0.009 0.926 0.036 0.027 22 T 0.003 0.002 0.013 0.887 0.055 0.040 23 W 0.006 0.004 0.036 0.718 0.124 0.112 24 R 0.005 0.002 0.076 0.686 0.146 0.084 25 A 0.005 0.001 0.070 0.687 0.135 0.101 26 T 0.009 0.004 0.058 0.567 0.184 0.178 27 Y 0.018 0.007 0.076 0.449 0.225 0.226 28 R 0.022 0.006 0.093 0.445 0.250 0.184 29 G 0.024 0.005 0.109 0.422 0.279 0.161 30 V 0.035 0.008 0.079 0.408 0.297 0.173 31 V 0.052 0.013 0.062 0.393 0.255 0.224 32 P 0.048 0.011 0.068 0.390 0.255 0.227 33 E 0.035 0.009 0.123 0.429 0.238 0.165 34 A 0.037 0.007 0.141 0.434 0.233 0.147 35 F 0.030 0.008 0.109 0.503 0.195 0.154 36 L 0.028 0.009 0.082 0.502 0.191 0.188 37 E 0.022 0.006 0.060 0.444 0.220 0.248 38 G 0.021 0.006 0.060 0.460 0.209 0.243 39 L 0.015 0.008 0.050 0.399 0.224 0.305 40 S 0.012 0.007 0.048 0.373 0.220 0.340 41 Y 0.009 0.003 0.057 0.565 0.182 0.185 42 E 0.008 0.003 0.051 0.675 0.143 0.120 43 G 0.006 0.003 0.043 0.677 0.131 0.140 44 Q 0.007 0.003 0.025 0.705 0.084 0.177 45 A 0.003 0.001 0.013 0.906 0.033 0.044 46 E 0.002 0.001 0.010 0.942 0.021 0.024 47 R 0.001 0.001 0.011 0.963 0.013 0.011 48 W 0.001 0.001 0.008 0.968 0.013 0.010 49 A 0.001 0.001 0.015 0.961 0.016 0.007 50 Q 0.001 0.001 0.013 0.940 0.029 0.017 51 R 0.002 0.001 0.017 0.888 0.044 0.050 52 L 0.005 0.006 0.024 0.823 0.078 0.063 53 K 0.008 0.004 0.036 0.714 0.147 0.091 54 T 0.010 0.003 0.031 0.374 0.308 0.275 55 P 0.010 0.006 0.036 0.098 0.419 0.431 56 T 0.014 0.011 0.049 0.049 0.503 0.374 57 W 0.018 0.009 0.057 0.037 0.585 0.293 58 P 0.034 0.007 0.070 0.029 0.552 0.309 59 G 0.146 0.018 0.049 0.015 0.484 0.286 60 R 0.423 0.008 0.017 0.005 0.268 0.280 61 L 0.852 0.002 0.005 0.002 0.053 0.086 62 F 0.967 0.002 0.001 0.001 0.009 0.020 63 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 64 A 0.987 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 65 E 0.984 0.002 0.001 0.001 0.005 0.008 66 S 0.838 0.006 0.001 0.001 0.141 0.014 67 E 0.071 0.002 0.010 0.002 0.904 0.012 68 S 0.013 0.001 0.011 0.001 0.971 0.004 69 G 0.056 0.003 0.017 0.001 0.914 0.010 70 E 0.844 0.004 0.001 0.001 0.082 0.069 71 V 0.985 0.003 0.001 0.001 0.002 0.009 72 V 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 73 G 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 74 F 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 75 A 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 76 A 0.984 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 77 F 0.952 0.003 0.001 0.001 0.010 0.034 78 G 0.895 0.006 0.002 0.001 0.040 0.056 79 P 0.725 0.010 0.008 0.004 0.114 0.139 80 D 0.433 0.018 0.020 0.009 0.253 0.268 81 R 0.188 0.029 0.051 0.026 0.455 0.252 82 A 0.111 0.015 0.058 0.036 0.484 0.296 83 S 0.069 0.014 0.093 0.067 0.545 0.212 84 G 0.049 0.009 0.124 0.083 0.583 0.151 85 F 0.046 0.008 0.122 0.072 0.589 0.163 86 P 0.078 0.018 0.094 0.036 0.621 0.154 87 G 0.121 0.011 0.044 0.014 0.577 0.233 88 Y 0.311 0.011 0.021 0.006 0.324 0.326 89 T 0.801 0.009 0.004 0.002 0.069 0.115 90 A 0.931 0.003 0.001 0.001 0.015 0.049 91 E 0.968 0.002 0.001 0.001 0.006 0.022 92 L 0.963 0.002 0.002 0.003 0.008 0.022 93 W 0.933 0.001 0.004 0.004 0.021 0.037 94 A 0.928 0.002 0.007 0.005 0.027 0.031 95 I 0.917 0.003 0.006 0.004 0.036 0.034 96 Y 0.920 0.010 0.005 0.004 0.030 0.030 97 V 0.690 0.042 0.012 0.010 0.093 0.153 98 L 0.110 0.011 0.009 0.019 0.341 0.510 99 P 0.003 0.001 0.505 0.227 0.239 0.026 100 T 0.002 0.001 0.533 0.195 0.259 0.010 101 W 0.001 0.001 0.511 0.249 0.229 0.008 102 Q 0.003 0.003 0.194 0.399 0.284 0.116 103 R 0.008 0.003 0.030 0.457 0.282 0.219 104 K 0.016 0.003 0.010 0.330 0.214 0.428 105 G 0.020 0.008 0.003 0.099 0.128 0.742 106 L 0.012 0.012 0.009 0.747 0.060 0.159 107 G 0.008 0.002 0.013 0.853 0.024 0.101 108 R 0.001 0.001 0.008 0.979 0.004 0.007 109 A 0.001 0.001 0.008 0.984 0.003 0.004 110 L 0.001 0.001 0.003 0.991 0.002 0.003 111 F 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 112 H 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 113 E 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 114 G 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 115 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 116 R 0.001 0.001 0.001 0.994 0.004 0.002 117 L 0.001 0.001 0.001 0.992 0.005 0.002 118 L 0.001 0.001 0.003 0.986 0.008 0.002 119 Q 0.001 0.001 0.014 0.964 0.017 0.004 120 A 0.001 0.001 0.023 0.911 0.048 0.017 121 E 0.001 0.001 0.028 0.685 0.123 0.163 122 G 0.002 0.001 0.001 0.004 0.085 0.907 123 Y 0.021 0.001 0.001 0.001 0.125 0.851 124 G 0.260 0.003 0.003 0.001 0.131 0.602 125 R 0.949 0.008 0.001 0.001 0.014 0.029 126 M 0.986 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 127 L 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 128 V 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 129 W 0.948 0.002 0.001 0.001 0.014 0.035 130 V 0.793 0.015 0.001 0.002 0.054 0.135 131 L 0.397 0.035 0.004 0.005 0.418 0.141 132 K 0.062 0.008 0.012 0.012 0.705 0.201 133 E 0.010 0.003 0.009 0.014 0.737 0.226 134 N 0.010 0.017 0.016 0.065 0.589 0.303 135 P 0.003 0.003 0.030 0.740 0.139 0.084 136 K 0.002 0.002 0.040 0.891 0.048 0.017 137 G 0.001 0.001 0.020 0.959 0.015 0.004 138 R 0.001 0.001 0.006 0.979 0.011 0.003 139 G 0.001 0.001 0.003 0.985 0.008 0.003 140 F 0.002 0.001 0.003 0.988 0.005 0.001 141 Y 0.003 0.001 0.007 0.978 0.010 0.003 142 E 0.003 0.001 0.013 0.970 0.010 0.004 143 H 0.002 0.001 0.011 0.966 0.011 0.009 144 L 0.004 0.001 0.005 0.883 0.022 0.085 145 G 0.014 0.001 0.001 0.017 0.052 0.916 146 G 0.186 0.007 0.001 0.011 0.071 0.724 147 V 0.612 0.016 0.003 0.012 0.073 0.284 148 L 0.653 0.028 0.006 0.014 0.096 0.204 149 L 0.461 0.007 0.014 0.016 0.168 0.334 150 G 0.308 0.004 0.012 0.013 0.217 0.446 151 E 0.448 0.031 0.013 0.020 0.176 0.312 152 R 0.411 0.025 0.009 0.027 0.146 0.382 153 E 0.435 0.030 0.028 0.066 0.170 0.272 154 I 0.269 0.030 0.050 0.091 0.305 0.255 155 E 0.134 0.015 0.068 0.120 0.426 0.237 156 L 0.078 0.015 0.046 0.121 0.540 0.200 157 G 0.038 0.007 0.030 0.076 0.607 0.241 158 G 0.034 0.008 0.009 0.025 0.567 0.358 159 A 0.100 0.024 0.008 0.029 0.301 0.539 160 K 0.183 0.059 0.008 0.052 0.172 0.527 161 L 0.203 0.021 0.018 0.102 0.210 0.446 162 W 0.260 0.010 0.030 0.085 0.173 0.442 163 E 0.589 0.009 0.057 0.121 0.096 0.127 164 V 0.814 0.003 0.027 0.060 0.044 0.052 165 A 0.874 0.003 0.012 0.052 0.024 0.034 166 Y 0.906 0.003 0.006 0.040 0.019 0.025 167 G 0.852 0.005 0.006 0.053 0.031 0.053 168 F 0.691 0.009 0.013 0.059 0.095 0.133 169 D 0.351 0.017 0.020 0.060 0.364 0.189 170 L 0.089 0.017 0.033 0.057 0.621 0.182 171 G 0.035 0.006 0.018 0.021 0.730 0.189 172 G 0.042 0.014 0.016 0.023 0.646 0.260 173 H 0.079 0.024 0.006 0.022 0.241 0.627 174 K 0.170 0.061 0.008 0.043 0.144 0.574 175 W 0.035 0.014 0.004 0.022 0.062 0.863