# TARGET T0267 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0267.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 966 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.006 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.990 2 V 0.449 0.023 0.002 0.006 0.006 0.006 0.506 3 R 0.608 0.021 0.004 0.008 0.031 0.006 0.322 4 I 0.500 0.017 0.008 0.011 0.035 0.013 0.415 5 R 0.419 0.012 0.010 0.012 0.097 0.018 0.431 6 R 0.295 0.030 0.013 0.012 0.120 0.031 0.499 7 A 0.041 0.014 0.004 0.004 0.185 0.012 0.740 8 G 0.017 0.004 0.001 0.002 0.085 0.005 0.886 9 L 0.001 0.001 0.330 0.371 0.069 0.204 0.024 10 E 0.001 0.002 0.333 0.416 0.080 0.135 0.033 11 D 0.001 0.002 0.155 0.606 0.070 0.037 0.129 12 L 0.001 0.001 0.008 0.966 0.005 0.010 0.011 13 P 0.001 0.001 0.003 0.966 0.003 0.020 0.006 14 G 0.001 0.001 0.003 0.968 0.002 0.022 0.004 15 V 0.001 0.001 0.001 0.985 0.004 0.006 0.004 16 A 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.004 0.002 17 R 0.001 0.001 0.001 0.983 0.002 0.011 0.003 18 V 0.001 0.001 0.001 0.978 0.004 0.010 0.006 19 L 0.001 0.001 0.003 0.974 0.003 0.015 0.004 20 V 0.002 0.001 0.005 0.932 0.005 0.052 0.004 21 D 0.003 0.001 0.007 0.863 0.012 0.096 0.019 22 T 0.006 0.005 0.018 0.770 0.033 0.092 0.076 23 W 0.023 0.017 0.040 0.614 0.068 0.095 0.143 24 R 0.028 0.008 0.063 0.544 0.081 0.144 0.130 25 A 0.019 0.005 0.047 0.508 0.094 0.207 0.119 26 T 0.018 0.007 0.034 0.382 0.144 0.177 0.238 27 Y 0.021 0.008 0.053 0.342 0.138 0.165 0.273 28 R 0.028 0.007 0.103 0.328 0.114 0.241 0.179 29 G 0.035 0.007 0.107 0.302 0.124 0.254 0.172 30 V 0.051 0.016 0.079 0.320 0.137 0.152 0.245 31 V 0.085 0.025 0.051 0.306 0.134 0.108 0.292 32 P 0.071 0.016 0.060 0.273 0.095 0.122 0.364 33 E 0.052 0.015 0.101 0.324 0.102 0.154 0.252 34 A 0.056 0.011 0.120 0.345 0.114 0.154 0.201 35 F 0.055 0.011 0.117 0.315 0.102 0.184 0.216 36 L 0.044 0.015 0.096 0.280 0.130 0.152 0.283 37 E 0.039 0.016 0.073 0.225 0.168 0.122 0.357 38 G 0.029 0.010 0.073 0.257 0.169 0.165 0.297 39 L 0.023 0.012 0.078 0.249 0.135 0.156 0.346 40 S 0.010 0.012 0.074 0.202 0.116 0.091 0.495 41 Y 0.008 0.005 0.069 0.362 0.088 0.096 0.372 42 E 0.005 0.003 0.073 0.562 0.053 0.148 0.156 43 G 0.004 0.006 0.058 0.596 0.068 0.113 0.154 44 Q 0.004 0.006 0.026 0.665 0.054 0.054 0.190 45 A 0.001 0.001 0.010 0.924 0.018 0.020 0.025 46 E 0.002 0.001 0.008 0.944 0.009 0.017 0.018 47 R 0.001 0.001 0.006 0.957 0.006 0.016 0.013 48 W 0.001 0.001 0.004 0.962 0.006 0.015 0.011 49 A 0.001 0.001 0.006 0.951 0.006 0.027 0.008 50 Q 0.002 0.001 0.007 0.908 0.008 0.064 0.011 51 R 0.002 0.002 0.017 0.828 0.018 0.098 0.036 52 L 0.007 0.010 0.043 0.672 0.048 0.144 0.076 53 K 0.009 0.006 0.079 0.446 0.072 0.284 0.105 54 T 0.008 0.005 0.061 0.206 0.181 0.359 0.180 55 P 0.009 0.005 0.049 0.077 0.252 0.270 0.339 56 T 0.014 0.010 0.073 0.028 0.230 0.146 0.499 57 W 0.021 0.010 0.139 0.021 0.238 0.184 0.387 58 P 0.037 0.009 0.143 0.012 0.241 0.311 0.247 59 G 0.131 0.011 0.097 0.006 0.278 0.140 0.337 60 R 0.446 0.019 0.025 0.002 0.105 0.033 0.369 61 L 0.870 0.006 0.004 0.001 0.017 0.006 0.096 62 F 0.964 0.002 0.001 0.001 0.003 0.002 0.028 63 V 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 64 A 0.978 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 65 E 0.959 0.006 0.001 0.001 0.003 0.001 0.031 66 S 0.712 0.005 0.002 0.001 0.014 0.015 0.251 67 E 0.065 0.001 0.011 0.001 0.095 0.796 0.032 68 S 0.005 0.001 0.006 0.001 0.050 0.935 0.003 69 G 0.147 0.001 0.005 0.001 0.377 0.312 0.158 70 E 0.681 0.017 0.001 0.001 0.034 0.003 0.265 71 V 0.925 0.031 0.001 0.001 0.002 0.001 0.042 72 V 0.970 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.025 73 G 0.986 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.008 74 F 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 75 A 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 76 A 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 77 F 0.925 0.003 0.001 0.001 0.007 0.001 0.064 78 G 0.838 0.010 0.001 0.001 0.023 0.004 0.124 79 P 0.678 0.033 0.006 0.003 0.054 0.030 0.197 80 D 0.361 0.025 0.020 0.010 0.160 0.108 0.317 81 R 0.201 0.018 0.040 0.021 0.253 0.169 0.299 82 A 0.099 0.019 0.079 0.049 0.233 0.225 0.296 83 S 0.058 0.012 0.092 0.053 0.272 0.240 0.272 84 G 0.058 0.010 0.094 0.050 0.225 0.282 0.280 85 F 0.069 0.009 0.064 0.048 0.218 0.333 0.259 86 P 0.116 0.015 0.049 0.027 0.262 0.207 0.323 87 G 0.152 0.011 0.052 0.025 0.246 0.153 0.360 88 Y 0.272 0.024 0.039 0.016 0.232 0.086 0.332 89 T 0.634 0.011 0.013 0.006 0.088 0.024 0.225 90 A 0.867 0.009 0.003 0.003 0.015 0.005 0.098 91 E 0.927 0.007 0.002 0.002 0.007 0.002 0.053 92 L 0.945 0.003 0.003 0.002 0.008 0.003 0.036 93 W 0.875 0.004 0.010 0.010 0.026 0.007 0.069 94 A 0.865 0.005 0.012 0.007 0.018 0.008 0.086 95 I 0.905 0.002 0.009 0.008 0.016 0.020 0.040 96 Y 0.947 0.007 0.003 0.003 0.010 0.006 0.024 97 V 0.893 0.027 0.001 0.003 0.017 0.003 0.056 98 L 0.502 0.007 0.001 0.003 0.034 0.007 0.446 99 P 0.005 0.001 0.493 0.291 0.014 0.182 0.013 100 T 0.002 0.001 0.567 0.237 0.045 0.141 0.008 101 W 0.002 0.001 0.702 0.168 0.016 0.097 0.013 102 Q 0.005 0.004 0.273 0.350 0.065 0.240 0.062 103 R 0.008 0.005 0.099 0.136 0.071 0.611 0.070 104 K 0.014 0.003 0.043 0.190 0.342 0.173 0.233 105 G 0.018 0.008 0.026 0.286 0.247 0.095 0.322 106 L 0.014 0.015 0.018 0.623 0.118 0.038 0.174 107 G 0.003 0.001 0.006 0.870 0.023 0.014 0.084 108 R 0.001 0.001 0.002 0.985 0.004 0.005 0.004 109 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 110 L 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 111 F 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 112 H 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.001 113 E 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.006 0.002 114 G 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 115 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 116 R 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.007 0.001 117 L 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.006 0.003 118 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.004 0.003 119 Q 0.001 0.001 0.002 0.979 0.001 0.014 0.003 120 A 0.001 0.001 0.010 0.861 0.007 0.113 0.007 121 E 0.001 0.001 0.004 0.128 0.015 0.851 0.002 122 G 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 0.968 0.014 123 Y 0.036 0.003 0.001 0.001 0.054 0.010 0.896 124 G 0.268 0.005 0.002 0.001 0.285 0.017 0.422 125 R 0.906 0.004 0.002 0.001 0.022 0.004 0.062 126 M 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 127 L 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 128 V 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 129 W 0.886 0.003 0.001 0.001 0.010 0.001 0.099 130 V 0.454 0.017 0.004 0.003 0.070 0.009 0.443 131 L 0.106 0.015 0.013 0.005 0.174 0.037 0.649 132 K 0.028 0.008 0.053 0.022 0.250 0.364 0.275 133 E 0.007 0.009 0.049 0.046 0.263 0.299 0.327 134 N 0.002 0.003 0.011 0.046 0.151 0.021 0.766 135 P 0.002 0.002 0.049 0.677 0.041 0.127 0.102 136 K 0.002 0.003 0.039 0.803 0.013 0.102 0.039 137 G 0.001 0.001 0.015 0.939 0.005 0.016 0.023 138 R 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.002 0.004 139 G 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 140 F 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 141 Y 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 142 E 0.001 0.001 0.003 0.987 0.001 0.009 0.001 143 H 0.001 0.001 0.004 0.945 0.002 0.048 0.001 144 L 0.001 0.001 0.005 0.504 0.014 0.472 0.005 145 G 0.002 0.001 0.002 0.025 0.053 0.863 0.054 146 G 0.068 0.012 0.003 0.011 0.057 0.018 0.831 147 V 0.511 0.027 0.008 0.016 0.040 0.007 0.391 148 L 0.597 0.022 0.021 0.018 0.030 0.011 0.301 149 L 0.528 0.012 0.041 0.028 0.067 0.038 0.285 150 G 0.494 0.005 0.035 0.019 0.121 0.077 0.249 151 E 0.532 0.014 0.032 0.022 0.109 0.047 0.244 152 R 0.604 0.021 0.015 0.023 0.061 0.014 0.263 153 E 0.561 0.018 0.025 0.029 0.064 0.030 0.274 154 I 0.464 0.035 0.037 0.038 0.080 0.071 0.276 155 E 0.188 0.025 0.060 0.038 0.163 0.191 0.336 156 L 0.073 0.009 0.047 0.024 0.237 0.308 0.302 157 G 0.016 0.005 0.031 0.017 0.212 0.591 0.130 158 G 0.016 0.003 0.020 0.010 0.324 0.357 0.271 159 A 0.118 0.018 0.012 0.031 0.202 0.056 0.564 160 K 0.333 0.059 0.017 0.115 0.103 0.050 0.323 161 L 0.362 0.025 0.027 0.204 0.072 0.029 0.281 162 W 0.489 0.020 0.030 0.163 0.044 0.027 0.227 163 E 0.639 0.007 0.029 0.190 0.040 0.019 0.076 164 V 0.785 0.003 0.017 0.137 0.012 0.010 0.036 165 A 0.749 0.003 0.021 0.178 0.009 0.015 0.026 166 Y 0.788 0.003 0.017 0.133 0.010 0.018 0.030 167 G 0.665 0.008 0.032 0.171 0.027 0.028 0.069 168 F 0.599 0.020 0.025 0.158 0.068 0.031 0.099 169 D 0.351 0.019 0.029 0.147 0.102 0.069 0.283 170 L 0.125 0.019 0.021 0.080 0.224 0.179 0.351 171 G 0.031 0.006 0.014 0.022 0.272 0.281 0.373 172 G 0.026 0.006 0.018 0.027 0.461 0.225 0.237 173 H 0.050 0.020 0.015 0.044 0.328 0.105 0.437 174 K 0.071 0.036 0.012 0.037 0.021 0.050 0.773 175 W 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.993