# TARGET T0266 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0266.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 252 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.005 0.002 0.005 0.078 0.090 0.821 2 L 0.013 0.010 0.008 0.376 0.068 0.525 3 E 0.012 0.004 0.004 0.468 0.063 0.450 4 K 0.002 0.001 0.003 0.891 0.014 0.089 5 V 0.002 0.001 0.002 0.972 0.007 0.017 6 E 0.002 0.001 0.003 0.973 0.013 0.008 7 E 0.002 0.001 0.002 0.974 0.016 0.005 8 W 0.001 0.001 0.002 0.983 0.011 0.003 9 I 0.001 0.001 0.006 0.972 0.019 0.003 10 K 0.001 0.001 0.008 0.968 0.019 0.005 11 A 0.001 0.001 0.011 0.939 0.036 0.014 12 R 0.001 0.001 0.010 0.825 0.065 0.099 13 G 0.002 0.001 0.001 0.009 0.076 0.912 14 L 0.028 0.003 0.002 0.002 0.117 0.848 15 T 0.211 0.005 0.005 0.003 0.127 0.649 16 W 0.791 0.011 0.007 0.003 0.053 0.135 17 R 0.928 0.002 0.003 0.002 0.016 0.049 18 L 0.943 0.004 0.001 0.002 0.010 0.039 19 L 0.868 0.006 0.003 0.004 0.037 0.083 20 I 0.679 0.012 0.005 0.005 0.080 0.220 21 M 0.277 0.012 0.006 0.006 0.188 0.510 22 Q 0.148 0.032 0.010 0.004 0.429 0.377 23 K 0.051 0.017 0.015 0.005 0.512 0.400 24 P 0.019 0.008 0.024 0.008 0.685 0.255 25 T 0.015 0.009 0.048 0.028 0.727 0.172 26 R 0.014 0.010 0.026 0.047 0.536 0.368 27 T 0.043 0.035 0.010 0.079 0.215 0.618 28 V 0.003 0.001 0.007 0.935 0.028 0.026 29 A 0.002 0.001 0.005 0.961 0.022 0.009 30 E 0.003 0.001 0.005 0.974 0.016 0.002 31 A 0.002 0.001 0.004 0.982 0.011 0.001 32 A 0.001 0.001 0.005 0.980 0.013 0.002 33 A 0.001 0.001 0.011 0.970 0.015 0.003 34 L 0.001 0.001 0.012 0.958 0.020 0.010 35 L 0.001 0.001 0.011 0.828 0.044 0.116 36 G 0.001 0.001 0.001 0.006 0.053 0.939 37 V 0.006 0.003 0.001 0.001 0.079 0.910 38 S 0.027 0.008 0.003 0.003 0.199 0.760 39 E 0.010 0.003 0.546 0.171 0.239 0.032 40 S 0.013 0.001 0.730 0.114 0.130 0.013 41 E 0.024 0.001 0.760 0.098 0.107 0.009 42 I 0.236 0.011 0.270 0.222 0.136 0.125 43 V 0.493 0.012 0.119 0.127 0.110 0.139 44 K 0.731 0.007 0.101 0.060 0.062 0.039 45 T 0.804 0.001 0.047 0.051 0.055 0.043 46 L 0.849 0.002 0.023 0.055 0.035 0.036 47 I 0.963 0.002 0.002 0.016 0.008 0.010 48 V 0.973 0.001 0.001 0.006 0.010 0.009 49 L 0.971 0.002 0.001 0.004 0.012 0.011 50 D 0.899 0.006 0.004 0.005 0.059 0.027 51 N 0.336 0.007 0.020 0.017 0.556 0.064 52 A 0.018 0.002 0.042 0.013 0.897 0.028 53 G 0.027 0.006 0.042 0.010 0.870 0.046 54 G 0.342 0.008 0.007 0.003 0.409 0.231 55 V 0.906 0.003 0.001 0.001 0.017 0.074 56 Y 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 57 A 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 58 V 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 59 V 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 60 I 0.916 0.002 0.001 0.001 0.020 0.060 61 P 0.396 0.007 0.002 0.003 0.223 0.370 62 G 0.040 0.007 0.012 0.006 0.512 0.423 63 D 0.015 0.007 0.174 0.018 0.605 0.182 64 K 0.030 0.008 0.419 0.057 0.386 0.100 65 R 0.085 0.026 0.322 0.069 0.314 0.184 66 L 0.147 0.051 0.070 0.078 0.281 0.373 67 N 0.061 0.016 0.014 0.073 0.125 0.711 68 I 0.001 0.001 0.016 0.958 0.017 0.007 69 N 0.001 0.001 0.007 0.975 0.014 0.003 70 S 0.001 0.001 0.007 0.987 0.006 0.001 71 M 0.001 0.001 0.003 0.990 0.006 0.001 72 K 0.001 0.001 0.004 0.988 0.007 0.001 73 E 0.001 0.001 0.010 0.945 0.038 0.007 74 L 0.001 0.001 0.011 0.899 0.065 0.024 75 A 0.003 0.018 0.013 0.616 0.183 0.167 76 G 0.002 0.002 0.004 0.014 0.290 0.688 77 K 0.030 0.004 0.008 0.004 0.305 0.649 78 P 0.308 0.013 0.011 0.003 0.174 0.491 79 V 0.539 0.021 0.033 0.004 0.135 0.269 80 R 0.678 0.009 0.025 0.003 0.080 0.204 81 L 0.511 0.020 0.033 0.005 0.120 0.310 82 A 0.139 0.014 0.002 0.003 0.122 0.720 83 R 0.027 0.004 0.001 0.007 0.076 0.886 84 A 0.001 0.001 0.014 0.911 0.040 0.034 85 N 0.001 0.001 0.008 0.939 0.043 0.009 86 E 0.001 0.001 0.006 0.966 0.024 0.002 87 V 0.003 0.001 0.002 0.978 0.014 0.003 88 V 0.001 0.001 0.002 0.986 0.008 0.001 89 E 0.001 0.001 0.006 0.977 0.012 0.004 90 L 0.001 0.001 0.003 0.977 0.010 0.010 91 T 0.001 0.001 0.002 0.916 0.014 0.067 92 G 0.002 0.002 0.001 0.027 0.055 0.912 93 Y 0.032 0.015 0.010 0.018 0.161 0.765 94 P 0.180 0.030 0.046 0.020 0.334 0.391 95 V 0.089 0.015 0.123 0.023 0.421 0.330 96 G 0.090 0.013 0.060 0.014 0.436 0.387 97 G 0.140 0.026 0.024 0.008 0.352 0.450 98 V 0.197 0.097 0.013 0.008 0.251 0.434 99 P 0.111 0.042 0.021 0.010 0.484 0.332 100 P 0.068 0.015 0.104 0.046 0.521 0.247 101 V 0.042 0.012 0.160 0.054 0.547 0.185 102 A 0.048 0.020 0.120 0.036 0.578 0.199 103 L 0.054 0.035 0.081 0.048 0.474 0.308 104 P 0.044 0.015 0.143 0.049 0.470 0.279 105 P 0.035 0.009 0.108 0.055 0.484 0.309 106 N 0.049 0.012 0.079 0.047 0.390 0.423 107 I 0.127 0.014 0.033 0.048 0.314 0.465 108 V 0.260 0.008 0.027 0.045 0.163 0.498 109 L 0.811 0.012 0.010 0.027 0.039 0.101 110 V 0.919 0.008 0.004 0.013 0.017 0.039 111 V 0.826 0.011 0.002 0.013 0.021 0.127 112 D 0.227 0.004 0.013 0.072 0.196 0.489 113 R 0.015 0.003 0.177 0.429 0.243 0.132 114 I 0.007 0.002 0.266 0.415 0.251 0.059 115 L 0.008 0.002 0.402 0.276 0.287 0.025 116 L 0.015 0.005 0.196 0.381 0.315 0.088 117 S 0.032 0.020 0.116 0.223 0.422 0.188 118 R 0.026 0.004 0.077 0.043 0.602 0.247 119 K 0.036 0.002 0.073 0.017 0.599 0.274 120 K 0.307 0.012 0.057 0.035 0.406 0.183 121 V 0.826 0.013 0.011 0.020 0.085 0.045 122 Y 0.925 0.004 0.002 0.010 0.027 0.031 123 G 0.887 0.006 0.003 0.008 0.045 0.051 124 G 0.730 0.019 0.007 0.011 0.145 0.087 125 G 0.295 0.011 0.028 0.018 0.459 0.190 126 G 0.134 0.012 0.016 0.006 0.614 0.218 127 R 0.081 0.022 0.027 0.004 0.800 0.066 128 E 0.064 0.013 0.054 0.008 0.779 0.081 129 N 0.086 0.005 0.029 0.006 0.754 0.120 130 A 0.440 0.022 0.010 0.004 0.350 0.175 131 L 0.754 0.035 0.002 0.003 0.046 0.160 132 L 0.903 0.013 0.001 0.002 0.021 0.061 133 E 0.887 0.009 0.002 0.003 0.026 0.073 134 F 0.691 0.025 0.001 0.004 0.049 0.230 135 S 0.294 0.011 0.002 0.012 0.115 0.566 136 P 0.009 0.001 0.087 0.730 0.122 0.051 137 R 0.005 0.001 0.115 0.731 0.133 0.016 138 E 0.004 0.002 0.102 0.769 0.114 0.009 139 L 0.005 0.004 0.043 0.850 0.079 0.019 140 V 0.006 0.003 0.035 0.880 0.062 0.014 141 E 0.007 0.001 0.049 0.818 0.099 0.027 142 A 0.010 0.001 0.044 0.765 0.130 0.050 143 T 0.009 0.006 0.033 0.651 0.138 0.163 144 G 0.038 0.002 0.013 0.061 0.239 0.647 145 A 0.168 0.003 0.011 0.011 0.238 0.569 146 V 0.561 0.022 0.006 0.003 0.092 0.316 147 V 0.848 0.007 0.004 0.002 0.028 0.111 148 A 0.792 0.002 0.005 0.004 0.028 0.169 149 D 0.671 0.006 0.006 0.005 0.031 0.280 150 V 0.572 0.012 0.005 0.005 0.037 0.369 151 S 0.214 0.007 0.002 0.003 0.042 0.732 152 E 0.004 0.002 0.001 0.001 0.022 0.971