# TARGET T0266 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0266.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 252 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 0.001 0.990 2 L 0.016 0.019 0.003 0.281 0.006 0.031 0.643 3 E 0.005 0.004 0.002 0.332 0.039 0.010 0.608 4 K 0.007 0.011 0.003 0.818 0.006 0.029 0.126 5 V 0.002 0.001 0.003 0.937 0.008 0.019 0.029 6 E 0.002 0.001 0.002 0.974 0.005 0.004 0.012 7 E 0.003 0.001 0.002 0.981 0.005 0.002 0.006 8 W 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.002 0.003 9 I 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.004 0.002 10 K 0.001 0.001 0.003 0.981 0.001 0.014 0.001 11 A 0.001 0.001 0.008 0.902 0.004 0.083 0.003 12 R 0.001 0.001 0.008 0.325 0.022 0.638 0.005 13 G 0.001 0.001 0.002 0.005 0.018 0.929 0.045 14 L 0.007 0.003 0.001 0.001 0.055 0.005 0.931 15 T 0.161 0.004 0.001 0.001 0.284 0.010 0.541 16 W 0.842 0.012 0.001 0.001 0.019 0.003 0.123 17 R 0.967 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.027 18 L 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 19 L 0.947 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.048 20 I 0.776 0.007 0.001 0.001 0.032 0.003 0.181 21 M 0.361 0.016 0.002 0.002 0.094 0.008 0.517 22 Q 0.103 0.019 0.004 0.002 0.144 0.021 0.707 23 K 0.026 0.018 0.024 0.010 0.357 0.166 0.400 24 P 0.013 0.010 0.024 0.010 0.253 0.130 0.560 25 T 0.008 0.004 0.135 0.136 0.223 0.333 0.160 26 R 0.010 0.014 0.075 0.223 0.263 0.248 0.166 27 T 0.011 0.052 0.026 0.372 0.182 0.064 0.292 28 V 0.001 0.001 0.008 0.969 0.005 0.008 0.008 29 A 0.001 0.001 0.004 0.980 0.002 0.009 0.005 30 E 0.001 0.001 0.003 0.988 0.002 0.005 0.002 31 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.003 0.002 0.002 32 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.002 33 A 0.001 0.001 0.002 0.985 0.001 0.012 0.001 34 L 0.001 0.001 0.004 0.910 0.002 0.083 0.001 35 L 0.001 0.001 0.004 0.283 0.015 0.693 0.005 36 G 0.001 0.001 0.004 0.017 0.049 0.859 0.071 37 V 0.002 0.012 0.001 0.003 0.278 0.010 0.694 38 S 0.006 0.008 0.001 0.002 0.046 0.004 0.934 39 E 0.001 0.001 0.446 0.386 0.024 0.121 0.021 40 S 0.003 0.001 0.554 0.264 0.034 0.122 0.023 41 E 0.016 0.002 0.601 0.202 0.048 0.082 0.050 42 I 0.248 0.035 0.120 0.303 0.052 0.058 0.184 43 V 0.496 0.009 0.042 0.089 0.059 0.040 0.267 44 K 0.666 0.003 0.037 0.033 0.147 0.025 0.090 45 T 0.887 0.004 0.017 0.012 0.017 0.015 0.049 46 L 0.894 0.003 0.009 0.010 0.015 0.033 0.036 47 I 0.959 0.001 0.001 0.004 0.008 0.004 0.023 48 V 0.866 0.004 0.001 0.004 0.012 0.003 0.111 49 L 0.782 0.014 0.002 0.004 0.013 0.006 0.179 50 D 0.431 0.019 0.012 0.005 0.048 0.167 0.319 51 N 0.026 0.003 0.017 0.001 0.101 0.814 0.038 52 A 0.005 0.002 0.011 0.001 0.168 0.803 0.011 53 G 0.017 0.002 0.005 0.001 0.416 0.448 0.112 54 G 0.298 0.006 0.001 0.001 0.214 0.012 0.470 55 V 0.803 0.021 0.001 0.001 0.019 0.001 0.156 56 Y 0.971 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 57 A 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 58 V 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 59 V 0.947 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.047 60 I 0.816 0.016 0.001 0.001 0.012 0.001 0.153 61 P 0.528 0.010 0.006 0.003 0.106 0.043 0.304 62 G 0.069 0.006 0.068 0.027 0.259 0.379 0.191 63 D 0.035 0.005 0.165 0.047 0.291 0.304 0.154 64 K 0.103 0.007 0.182 0.108 0.241 0.199 0.160 65 R 0.320 0.044 0.064 0.123 0.132 0.111 0.208 66 L 0.393 0.081 0.012 0.054 0.115 0.030 0.314 67 N 0.187 0.026 0.003 0.069 0.074 0.018 0.624 68 I 0.001 0.001 0.011 0.972 0.006 0.006 0.004 69 N 0.001 0.001 0.013 0.978 0.003 0.004 0.001 70 S 0.001 0.001 0.011 0.981 0.001 0.005 0.001 71 M 0.001 0.001 0.007 0.984 0.001 0.005 0.003 72 K 0.001 0.001 0.016 0.953 0.003 0.025 0.003 73 E 0.001 0.001 0.021 0.883 0.005 0.086 0.005 74 L 0.001 0.001 0.022 0.824 0.019 0.117 0.017 75 A 0.004 0.012 0.023 0.344 0.100 0.411 0.106 76 G 0.005 0.003 0.015 0.031 0.124 0.507 0.315 77 K 0.020 0.010 0.014 0.024 0.311 0.050 0.571 78 P 0.097 0.025 0.021 0.017 0.136 0.040 0.663 79 V 0.259 0.023 0.042 0.017 0.104 0.051 0.503 80 R 0.487 0.011 0.030 0.014 0.115 0.033 0.309 81 L 0.535 0.035 0.014 0.011 0.084 0.023 0.298 82 A 0.275 0.046 0.002 0.006 0.135 0.009 0.527 83 R 0.078 0.025 0.001 0.012 0.110 0.005 0.770 84 A 0.001 0.001 0.020 0.957 0.006 0.012 0.004 85 N 0.001 0.001 0.027 0.955 0.004 0.012 0.003 86 E 0.001 0.001 0.021 0.968 0.002 0.007 0.002 87 V 0.001 0.001 0.003 0.988 0.002 0.003 0.003 88 V 0.001 0.001 0.006 0.973 0.003 0.012 0.004 89 E 0.001 0.001 0.007 0.953 0.003 0.033 0.003 90 L 0.001 0.001 0.005 0.946 0.004 0.040 0.004 91 T 0.002 0.004 0.007 0.633 0.042 0.283 0.028 92 G 0.004 0.003 0.004 0.049 0.134 0.569 0.237 93 Y 0.014 0.016 0.004 0.013 0.240 0.030 0.682 94 P 0.054 0.026 0.013 0.009 0.171 0.039 0.687 95 V 0.101 0.055 0.062 0.018 0.134 0.268 0.361 96 G 0.093 0.013 0.042 0.013 0.249 0.281 0.309 97 G 0.191 0.037 0.033 0.018 0.200 0.079 0.441 98 V 0.205 0.087 0.018 0.021 0.130 0.038 0.500 99 P 0.095 0.036 0.023 0.019 0.193 0.048 0.586 100 P 0.087 0.036 0.063 0.028 0.171 0.165 0.451 101 V 0.068 0.057 0.090 0.035 0.152 0.220 0.378 102 A 0.070 0.030 0.079 0.037 0.199 0.172 0.413 103 L 0.052 0.062 0.071 0.034 0.111 0.087 0.583 104 P 0.037 0.033 0.067 0.025 0.157 0.123 0.558 105 P 0.038 0.044 0.055 0.035 0.240 0.330 0.258 106 N 0.035 0.020 0.023 0.010 0.153 0.328 0.432 107 I 0.054 0.004 0.001 0.004 0.210 0.006 0.721 108 V 0.492 0.006 0.001 0.005 0.210 0.007 0.279 109 L 0.922 0.032 0.001 0.002 0.003 0.002 0.039 110 V 0.943 0.003 0.001 0.002 0.004 0.002 0.046 111 V 0.885 0.008 0.001 0.003 0.022 0.002 0.079 112 D 0.387 0.007 0.004 0.020 0.051 0.007 0.524 113 R 0.031 0.003 0.220 0.207 0.134 0.213 0.192 114 I 0.015 0.003 0.244 0.233 0.146 0.252 0.105 115 L 0.011 0.010 0.526 0.210 0.037 0.134 0.072 116 L 0.039 0.006 0.234 0.218 0.116 0.256 0.129 117 S 0.063 0.018 0.137 0.120 0.094 0.409 0.160 118 R 0.070 0.012 0.039 0.018 0.294 0.061 0.507 119 K 0.099 0.002 0.046 0.027 0.305 0.175 0.345 120 K 0.565 0.010 0.032 0.030 0.122 0.100 0.141 121 V 0.866 0.011 0.006 0.019 0.010 0.009 0.078 122 Y 0.938 0.004 0.002 0.010 0.006 0.004 0.037 123 G 0.928 0.005 0.002 0.009 0.008 0.003 0.046 124 G 0.675 0.007 0.006 0.011 0.035 0.032 0.234 125 G 0.161 0.007 0.025 0.020 0.173 0.414 0.201 126 G 0.052 0.010 0.026 0.006 0.323 0.404 0.180 127 R 0.086 0.021 0.055 0.006 0.258 0.106 0.468 128 E 0.038 0.011 0.071 0.005 0.157 0.636 0.081 129 N 0.059 0.007 0.059 0.004 0.182 0.595 0.094 130 A 0.374 0.012 0.015 0.005 0.102 0.029 0.463 131 L 0.779 0.022 0.002 0.003 0.023 0.008 0.164 132 L 0.935 0.004 0.001 0.002 0.012 0.004 0.041 133 E 0.943 0.004 0.001 0.002 0.006 0.003 0.042 134 F 0.867 0.016 0.001 0.002 0.012 0.002 0.102 135 S 0.398 0.010 0.001 0.003 0.024 0.004 0.561 136 P 0.003 0.001 0.158 0.718 0.020 0.083 0.017 137 R 0.001 0.001 0.292 0.612 0.026 0.061 0.007 138 E 0.001 0.001 0.372 0.568 0.009 0.043 0.008 139 L 0.001 0.003 0.084 0.867 0.006 0.026 0.013 140 V 0.002 0.002 0.060 0.833 0.016 0.070 0.017 141 E 0.004 0.001 0.061 0.759 0.017 0.139 0.019 142 A 0.004 0.002 0.049 0.707 0.047 0.149 0.042 143 T 0.017 0.015 0.041 0.406 0.145 0.267 0.109 144 G 0.016 0.003 0.029 0.104 0.107 0.448 0.293 145 A 0.024 0.005 0.018 0.065 0.099 0.039 0.749 146 V 0.149 0.012 0.053 0.155 0.127 0.050 0.454 147 V 0.333 0.029 0.066 0.248 0.056 0.069 0.199 148 A 0.401 0.010 0.064 0.229 0.030 0.038 0.228 149 D 0.592 0.007 0.046 0.116 0.043 0.041 0.155 150 V 0.550 0.011 0.034 0.078 0.060 0.050 0.216 151 S 0.404 0.028 0.020 0.053 0.015 0.042 0.437 152 E 0.006 0.001 0.001 0.005 0.002 0.001 0.984