# TARGET T0266 # Using neural net t2k-5631-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-CB-burial-14-7-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 CB_burial_14_7 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0266.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 252 # Pos AA A B C D E F G 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.311 0.384 0.200 0.085 0.017 0.003 0.001 2 L 0.077 0.195 0.310 0.273 0.120 0.023 0.002 3 E 0.453 0.357 0.140 0.036 0.010 0.003 0.001 4 K 0.114 0.409 0.271 0.134 0.058 0.013 0.002 5 V 0.023 0.030 0.058 0.217 0.395 0.257 0.020 6 E 0.031 0.163 0.315 0.349 0.125 0.016 0.001 7 E 0.205 0.586 0.166 0.035 0.007 0.001 0.001 8 W 0.022 0.109 0.305 0.405 0.144 0.014 0.001 9 I 0.038 0.052 0.118 0.413 0.327 0.052 0.001 10 K 0.394 0.495 0.097 0.013 0.001 0.001 0.001 11 A 0.685 0.274 0.035 0.005 0.001 0.001 0.001 12 R 0.126 0.320 0.373 0.154 0.025 0.002 0.001 13 G 0.479 0.402 0.099 0.017 0.003 0.001 0.001 14 L 0.079 0.128 0.221 0.371 0.178 0.022 0.001 15 T 0.261 0.348 0.238 0.112 0.035 0.005 0.001 16 W 0.064 0.124 0.191 0.303 0.252 0.063 0.004 17 R 0.159 0.301 0.260 0.175 0.081 0.023 0.002 18 L 0.109 0.145 0.200 0.263 0.201 0.076 0.006 19 L 0.148 0.219 0.213 0.230 0.141 0.045 0.003 20 I 0.241 0.269 0.227 0.153 0.079 0.029 0.002 21 M 0.184 0.181 0.201 0.250 0.145 0.037 0.002 22 Q 0.447 0.293 0.140 0.076 0.033 0.010 0.001 23 K 0.370 0.203 0.170 0.147 0.080 0.027 0.003 24 P 0.556 0.254 0.102 0.058 0.023 0.006 0.001 25 T 0.369 0.285 0.199 0.101 0.035 0.010 0.001 26 R 0.552 0.264 0.110 0.049 0.018 0.006 0.001 27 T 0.161 0.352 0.240 0.156 0.072 0.017 0.002 28 V 0.062 0.125 0.221 0.297 0.228 0.062 0.004 29 A 0.280 0.438 0.197 0.070 0.013 0.002 0.001 30 E 0.213 0.415 0.249 0.099 0.022 0.003 0.001 31 A 0.051 0.086 0.145 0.292 0.327 0.096 0.003 32 A 0.073 0.133 0.275 0.349 0.142 0.026 0.001 33 A 0.477 0.403 0.095 0.020 0.004 0.001 0.001 34 L 0.270 0.348 0.212 0.116 0.043 0.009 0.001 35 L 0.048 0.093 0.219 0.345 0.219 0.069 0.007 36 G 0.393 0.389 0.148 0.049 0.016 0.004 0.001 37 V 0.099 0.156 0.216 0.304 0.186 0.037 0.003 38 S 0.325 0.315 0.192 0.114 0.045 0.010 0.001 39 E 0.172 0.271 0.231 0.198 0.101 0.025 0.003 40 S 0.137 0.254 0.211 0.209 0.131 0.049 0.009 41 E 0.018 0.099 0.167 0.265 0.291 0.137 0.023 42 I 0.002 0.011 0.037 0.136 0.317 0.384 0.113 43 V 0.001 0.002 0.004 0.017 0.077 0.392 0.507 44 K 0.002 0.008 0.021 0.066 0.127 0.353 0.423 45 T 0.001 0.002 0.006 0.023 0.074 0.357 0.537 46 L 0.001 0.001 0.002 0.012 0.056 0.346 0.583 47 I 0.001 0.001 0.002 0.008 0.053 0.314 0.623 48 V 0.001 0.001 0.003 0.014 0.087 0.461 0.434 49 L 0.001 0.020 0.106 0.307 0.342 0.202 0.021 50 D 0.005 0.041 0.122 0.370 0.381 0.078 0.004 51 N 0.288 0.412 0.213 0.072 0.013 0.002 0.001 52 A 0.527 0.364 0.086 0.021 0.002 0.001 0.001 53 G 0.326 0.516 0.128 0.027 0.003 0.001 0.001 54 G 0.013 0.223 0.431 0.284 0.047 0.003 0.001 55 V 0.001 0.001 0.015 0.137 0.466 0.370 0.010 56 Y 0.001 0.001 0.003 0.024 0.171 0.635 0.167 57 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 0.236 0.747 58 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.099 0.898 59 V 0.001 0.001 0.001 0.004 0.024 0.248 0.724 60 I 0.001 0.001 0.004 0.023 0.124 0.506 0.342 61 P 0.001 0.009 0.038 0.147 0.383 0.352 0.072 62 G 0.012 0.083 0.224 0.297 0.256 0.110 0.019 63 D 0.113 0.343 0.255 0.171 0.088 0.028 0.003 64 K 0.062 0.163 0.235 0.297 0.174 0.064 0.004 65 R 0.205 0.315 0.237 0.139 0.069 0.033 0.002 66 L 0.017 0.056 0.131 0.242 0.316 0.214 0.024 67 N 0.068 0.199 0.248 0.260 0.175 0.046 0.003 68 I 0.045 0.141 0.246 0.283 0.209 0.071 0.006 69 N 0.367 0.445 0.144 0.035 0.007 0.002 0.001 70 S 0.060 0.281 0.361 0.213 0.071 0.012 0.001 71 M 0.005 0.016 0.060 0.250 0.478 0.186 0.005 72 K 0.078 0.289 0.345 0.219 0.059 0.009 0.001 73 E 0.483 0.438 0.065 0.011 0.002 0.001 0.001 74 L 0.076 0.217 0.337 0.271 0.086 0.013 0.001 75 A 0.061 0.093 0.222 0.378 0.210 0.035 0.001 76 G 0.517 0.344 0.098 0.032 0.008 0.001 0.001 77 K 0.485 0.335 0.129 0.041 0.008 0.001 0.001 78 P 0.291 0.366 0.199 0.102 0.034 0.008 0.001 79 V 0.024 0.067 0.162 0.304 0.318 0.118 0.007 80 R 0.088 0.233 0.245 0.255 0.132 0.043 0.002 81 L 0.046 0.108 0.179 0.280 0.260 0.121 0.006 82 A 0.011 0.031 0.091 0.242 0.384 0.223 0.018 83 R 0.176 0.440 0.238 0.113 0.029 0.005 0.001 84 A 0.116 0.298 0.322 0.198 0.056 0.009 0.001 85 N 0.568 0.352 0.066 0.012 0.002 0.001 0.001 86 E 0.067 0.308 0.351 0.202 0.062 0.009 0.001 87 V 0.007 0.019 0.074 0.300 0.466 0.131 0.004 88 V 0.066 0.314 0.348 0.195 0.065 0.011 0.001 89 E 0.267 0.466 0.183 0.062 0.017 0.004 0.001 90 L 0.043 0.109 0.206 0.304 0.248 0.084 0.007 91 T 0.036 0.065 0.150 0.304 0.294 0.133 0.017 92 G 0.257 0.363 0.193 0.102 0.053 0.023 0.008 93 Y 0.150 0.200 0.207 0.187 0.143 0.090 0.023 94 P 0.112 0.188 0.193 0.235 0.157 0.092 0.022 95 V 0.054 0.085 0.114 0.168 0.241 0.228 0.110 96 G 0.058 0.059 0.079 0.155 0.210 0.250 0.189 97 G 0.018 0.030 0.049 0.100 0.167 0.280 0.356 98 V 0.009 0.012 0.021 0.043 0.087 0.265 0.562 99 P 0.007 0.011 0.018 0.043 0.093 0.272 0.556 100 P 0.014 0.024 0.035 0.069 0.130 0.272 0.455 101 V 0.022 0.045 0.068 0.116 0.172 0.299 0.278 102 A 0.052 0.107 0.130 0.198 0.216 0.221 0.076 103 L 0.042 0.095 0.151 0.250 0.270 0.159 0.032 104 P 0.116 0.233 0.235 0.228 0.133 0.049 0.006 105 P 0.118 0.276 0.277 0.216 0.090 0.020 0.002 106 N 0.139 0.423 0.290 0.112 0.029 0.006 0.001 107 I 0.003 0.024 0.074 0.243 0.405 0.236 0.015 108 V 0.003 0.033 0.138 0.300 0.316 0.195 0.015 109 L 0.001 0.002 0.007 0.032 0.140 0.586 0.232 110 V 0.001 0.004 0.015 0.065 0.201 0.492 0.221 111 V 0.001 0.003 0.008 0.033 0.137 0.497 0.322 112 D 0.003 0.024 0.080 0.201 0.299 0.295 0.098 113 R 0.025 0.123 0.161 0.208 0.222 0.190 0.071 114 I 0.015 0.093 0.203 0.298 0.219 0.138 0.033 115 L 0.008 0.024 0.058 0.186 0.389 0.305 0.031 116 L 0.075 0.278 0.261 0.211 0.123 0.046 0.005 117 S 0.204 0.371 0.216 0.139 0.052 0.017 0.002 118 R 0.025 0.110 0.255 0.323 0.225 0.058 0.004 119 K 0.078 0.302 0.295 0.211 0.090 0.023 0.001 120 K 0.016 0.087 0.175 0.288 0.291 0.131 0.013 121 V 0.002 0.005 0.018 0.078 0.230 0.521 0.146 122 Y 0.002 0.007 0.021 0.070 0.196 0.493 0.210 123 G 0.001 0.002 0.005 0.015 0.058 0.366 0.554 124 G 0.012 0.039 0.077 0.165 0.255 0.317 0.135 125 G 0.019 0.048 0.087 0.162 0.256 0.318 0.110 126 G 0.069 0.172 0.195 0.242 0.192 0.106 0.023 127 R 0.110 0.242 0.226 0.217 0.135 0.060 0.010 128 E 0.159 0.286 0.262 0.180 0.082 0.028 0.004 129 N 0.183 0.291 0.237 0.175 0.085 0.027 0.003 130 A 0.046 0.131 0.208 0.270 0.236 0.100 0.009 131 L 0.030 0.139 0.244 0.304 0.197 0.078 0.008 132 L 0.003 0.007 0.019 0.084 0.274 0.511 0.102 133 E 0.010 0.072 0.213 0.316 0.243 0.128 0.018 134 F 0.004 0.015 0.042 0.134 0.336 0.403 0.066 135 S 0.027 0.178 0.254 0.281 0.183 0.070 0.007 136 P 0.031 0.140 0.247 0.313 0.196 0.067 0.006 137 R 0.297 0.488 0.155 0.045 0.011 0.003 0.001 138 E 0.066 0.255 0.325 0.233 0.095 0.023 0.003 139 L 0.011 0.029 0.068 0.212 0.415 0.250 0.015 140 V 0.049 0.225 0.301 0.277 0.122 0.025 0.001 141 E 0.241 0.411 0.217 0.096 0.026 0.008 0.001 142 A 0.038 0.093 0.166 0.280 0.287 0.127 0.008 143 T 0.032 0.064 0.131 0.281 0.329 0.153 0.010 144 G 0.152 0.396 0.303 0.116 0.027 0.006 0.001 145 A 0.088 0.118 0.180 0.272 0.243 0.092 0.007 146 V 0.055 0.170 0.237 0.267 0.188 0.077 0.006 147 V 0.019 0.045 0.104 0.217 0.337 0.257 0.022 148 A 0.046 0.052 0.091 0.185 0.294 0.298 0.034 149 D 0.127 0.255 0.248 0.226 0.107 0.034 0.002 150 V 0.124 0.138 0.199 0.251 0.209 0.074 0.005 151 S 0.290 0.248 0.200 0.161 0.077 0.022 0.001 152 E 0.633 0.248 0.076 0.032 0.009 0.003 0.001