PFRMAT RR TARGET T0266 AUTHOR 4204-4258-2837 REMARK From group SAM-TO4-hand under the direction of REMARK Kevin Karplus. REMARK Project by George Shackelford and Kevin Karplus REMARK The value given is an approximation of the probability REMARK as provided by the neural network. REMARK The predictions are limited to a score >= .18 which REMARK is an approximation of the probability. REMARK METHOD The predictor is an artificial neural network METHOD using 280 inputs. METHOD Input includes separation and sequence length, corrected METHOD mutual information between columns (M. Cline) and METHOD an e-value measure of correlation between columns (K Karplus) METHOD NN: NN280-240n300.net.28 METHOD Other inputs are from alignments and METHOD secondary predictions from SAM-t2k and SAM-t04 of METHOD University of California, Santa Cruz MODEL 1 MLEKVEEWIKARGLTWRLLIMQKPTRTVAEAAALLGVSESEIVKTLIVLD NAGGVYAVVIPGDKRLNINSMKELAGKPVRLARANEVVELTGYPVGGVPP VALPPNIVLVVDRILLSRKKVYGGGGRENALLEFSPRELVEATGAVVADV SE 43 59 0 8 0.73865 23 131 0 8 0.7106 61 126 0 8 0.6647 24 62 0 8 0.61965 43 60 0 8 0.59925 21 93 0 8 0.595 56 125 0 8 0.59075 43 58 0 8 0.5797 59 132 0 8 0.5661 60 124 0 8 0.5474 45 57 0 8 0.5338 87 121 0 8 0.53125 47 125 0 8 0.53125 36 126 0 8 0.53125 43 115 0 8 0.52615 98 139 0 8 0.5236 45 87 0 8 0.5219 98 127 0 8 0.51935 91 124 0 8 0.51935 91 125 0 8 0.51425 62 125 0 8 0.51425 59 115 0 8 0.50915 59 97 0 8 0.50915 120 137 0 8 0.50405 91 126 0 8 0.4947 60 99 0 8 0.4896 60 98 0 8 0.4845 59 109 0 8 0.4794 97 126 0 8 0.47685 47 82 0 8 0.47685 97 125 0 8 0.4743 70 149 0 8 0.4743 9 99 0 8 0.47175 59 111 0 8 0.4692 69 128 0 8 0.46665 115 124 0 8 0.459 99 125 0 8 0.45645 99 111 0 8 0.45645 45 99 0 8 0.4539 123 134 0 8 0.45135 87 125 0 8 0.44625 23 62 0 8 0.44625 60 97 0 8 0.4369 48 59 0 8 0.4369 1 149 0 8 0.4369 1 131 0 8 0.4369 43 57 0 8 0.43435 61 124 0 8 0.4318 57 111 0 8 0.4318 57 103 0 8 0.4318 42 124 0 8 0.4318 42 58 0 8 0.4318 22 130 0 8 0.42925 97 115 0 8 0.4267 45 91 0 8 0.4267 34 61 0 8 0.4233 121 139 0 8 0.42075 58 71 0 8 0.42075 121 132 0 8 0.4182 37 115 0 8 0.4182 105 127 0 8 0.41565 43 109 0 8 0.41565 98 124 0 8 0.4131 60 107 0 8 0.4131 43 111 0 8 0.4131 105 128 0 8 0.41055 121 136 0 8 0.40885 62 126 0 8 0.40885 47 124 0 8 0.40885 31 123 0 8 0.40885 120 138 0 8 0.4063 58 98 0 8 0.4063 57 91 0 8 0.4063 91 128 0 8 0.40375 123 132 0 8 0.4012 98 134 0 8 0.4012 23 122 0 8 0.4012 26 62 0 8 0.39865 126 140 0 8 0.3961 97 139 0 8 0.3961 120 133 0 8 0.39355 105 130 0 8 0.39355 56 124 0 8 0.39355 46 71 0 8 0.39355 34 126 0 8 0.39355 97 111 0 8 0.391 48 124 0 8 0.391 45 97 0 8 0.391 123 139 0 8 0.38845 97 121 0 8 0.38845 4 64 0 8 0.38845 130 139 0 8 0.3859 58 75 0 8 0.3859 31 97 0 8 0.3859 23 130 0 8 0.3859 59 99 0 8 0.38335 98 121 0 8 0.3808 60 93 0 8 0.3808 48 57 0 8 0.3808 35 61 0 8 0.37825 58 150 0 8 0.3757 28 150 0 8 0.3757 98 115 0 8 0.37315 57 121 0 8 0.37315 43 124 0 8 0.37315 43 61 0 8 0.37315 42 115 0 8 0.37315 28 57 0 8 0.37315 62 148 0 8 0.3706 97 124 0 8 0.36805 71 124 0 8 0.36805 61 120 0 8 0.36805 49 142 0 8 0.36805 126 136 0 8 0.3655 99 115 0 8 0.3655 57 115 0 8 0.3655 31 121 0 8 0.3655 111 124 0 8 0.36295 98 126 0 8 0.36295 93 125 0 8 0.36295 35 127 0 8 0.36295 115 125 0 8 0.3604 64 73 0 8 0.3604 21 97 0 8 0.3604 99 132 0 8 0.35785 98 132 0 8 0.35785 82 98 0 8 0.35785 43 87 0 8 0.35785 31 122 0 8 0.35785 31 99 0 8 0.35785 87 107 0 8 0.3553 62 130 0 8 0.3553 48 111 0 8 0.3553 28 97 0 8 0.3553 48 81 0 8 0.35275 37 125 0 8 0.35275 126 135 0 8 0.3502 81 93 0 8 0.3502 45 115 0 8 0.3502 13 127 0 8 0.3502 97 134 0 8 0.34765 23 61 0 8 0.34765 123 150 0 8 0.34595 121 131 0 8 0.34595 98 131 0 8 0.34595 98 107 0 8 0.34595 71 123 0 8 0.34595 68 99 0 8 0.34595 42 60 0 8 0.34595 17 133 0 8 0.34595 115 139 0 8 0.3434 47 79 0 8 0.3434 93 124 0 8 0.34085 87 99 0 8 0.34085 57 98 0 8 0.34085 45 58 0 8 0.34085 21 130 0 8 0.34085 87 98 0 8 0.3383 34 131 0 8 0.3383 122 139 0 8 0.33575 87 139 0 8 0.33575 72 135 0 8 0.33575 68 121 0 8 0.33575 56 98 0 8 0.33575 31 124 0 8 0.33575 24 34 0 8 0.33575 2 131 0 8 0.33575 87 131 0 8 0.3332 61 122 0 8 0.3332 57 107 0 8 0.3332 43 125 0 8 0.3332 93 147 0 8 0.33065 47 107 0 8 0.33065 42 125 0 8 0.33065 28 99 0 8 0.33065 99 124 0 8 0.3281 58 121 0 8 0.3281 48 115 0 8 0.3281 43 97 0 8 0.3281 28 93 0 8 0.3281 61 121 0 8 0.3264 57 124 0 8 0.3264 55 124 0 8 0.3264 91 123 0 8 0.32385 75 87 0 8 0.32385 48 75 0 8 0.32385 42 57 0 8 0.32385 3 63 0 8 0.32385 3 62 0 8 0.32385 136 145 0 8 0.3213 61 131 0 8 0.3213 61 87 0 8 0.3213 48 126 0 8 0.3213 9 97 0 8 0.3213 5 87 0 8 0.3213 87 124 0 8 0.31875 61 132 0 8 0.31875 48 82 0 8 0.31875 47 87 0 8 0.31875 45 59 0 8 0.31875 19 48 0 8 0.31875 5 98 0 8 0.31875 107 124 0 8 0.3162 103 115 0 8 0.3162 69 105 0 8 0.3162 62 124 0 8 0.3162 62 120 0 8 0.3162 57 75 0 8 0.3162 23 63 0 8 0.3162 9 123 0 8 0.3162 124 150 0 8 0.3145 101 134 0 8 0.3145 91 107 0 8 0.3145 48 87 0 8 0.3145 42 99 0 8 0.3145 5 31 0 8 0.3145 98 140 0 8 0.31195 97 131 0 8 0.31195 93 132 0 8 0.31195 57 109 0 8 0.31195 35 95 0 8 0.31195 34 130 0 8 0.31195 31 111 0 8 0.31195 126 143 0 8 0.3094 126 139 0 8 0.3094 111 126 0 8 0.3094 87 123 0 8 0.3094 82 99 0 8 0.3094 16 139 0 8 0.3094 9 68 0 8 0.3094 5 150 0 8 0.3094 72 136 0 8 0.30685 9 121 0 8 0.30685 1 62 0 8 0.30685 97 123 0 8 0.3043 70 129 0 8 0.3043 42 93 0 8 0.3043 21 125 0 8 0.3043 87 97 0 8 0.3026 68 128 0 8 0.3026 58 91 0 8 0.3026 1 128 0 8 0.3026 109 134 0 8 0.30005 96 131 0 8 0.30005 93 127 0 8 0.30005 70 150 0 8 0.30005 67 121 0 8 0.30005 46 87 0 8 0.30005 45 103 0 8 0.30005 37 87 0 8 0.30005 6 126 0 8 0.30005 126 145 0 8 0.2975 98 123 0 8 0.2975 24 131 0 8 0.2975 23 124 0 8 0.2975 21 127 0 8 0.2975 16 121 0 8 0.2975 57 139 0 8 0.29495 49 107 0 8 0.29495 45 101 0 8 0.29495 14 42 0 8 0.29495 1 73 0 8 0.29495 87 111 0 8 0.29325 48 103 0 8 0.29325 23 132 0 8 0.29325 16 132 0 8 0.29325 16 123 0 8 0.29325 126 142 0 8 0.2907 122 132 0 8 0.2907 97 132 0 8 0.2907 82 107 0 8 0.2907 46 124 0 8 0.2907 31 98 0 8 0.2907 93 130 0 8 0.28815 68 129 0 8 0.28815 48 123 0 8 0.28815 1 126 0 8 0.28815 1 70 0 8 0.28815 105 129 0 8 0.28645 99 122 0 8 0.28645 93 111 0 8 0.28645 5 123 0 8 0.28645 128 143 0 8 0.2839 93 123 0 8 0.2839 23 135 0 8 0.2839 1 23 0 8 0.2839 123 147 0 8 0.28135 121 145 0 8 0.28135 120 136 0 8 0.28135 71 93 0 8 0.28135 47 123 0 8 0.28135 111 121 0 8 0.27965 93 103 0 8 0.27965 68 130 0 8 0.27965 50 143 0 8 0.27965 32 42 0 8 0.27965 23 128 0 8 0.27965 102 132 0 8 0.2771 59 124 0 8 0.2771 47 98 0 8 0.2771 42 61 0 8 0.2771 35 123 0 8 0.2771 28 56 0 8 0.2771 2 62 0 8 0.2771 101 121 0 8 0.27455 91 103 0 8 0.27455 67 131 0 8 0.27455 31 87 0 8 0.27455 31 43 0 8 0.27455 14 93 0 8 0.27455 5 68 0 8 0.27455 4 62 0 8 0.27455 32 125 0 8 0.27285 31 115 0 8 0.27285 3 129 0 8 0.27285 126 144 0 8 0.2703 120 135 0 8 0.2703 84 95 0 8 0.2703 21 31 0 8 0.2703 124 147 0 8 0.2686 99 109 0 8 0.2686 82 123 0 8 0.2686 59 121 0 8 0.2686 58 99 0 8 0.2686 43 98 0 8 0.2686 43 93 0 8 0.2686 35 109 0 8 0.2686 31 103 0 8 0.2686 122 131 0 8 0.26605 105 126 0 8 0.26605 98 136 0 8 0.26605 2 130 0 8 0.26605 103 132 0 8 0.2635 103 124 0 8 0.2635 99 134 0 8 0.2635 87 115 0 8 0.2635 23 34 0 8 0.2635 19 84 0 8 0.2635 130 140 0 8 0.2618 118 139 0 8 0.2618 57 99 0 8 0.2618 48 139 0 8 0.2618 48 98 0 8 0.2618 28 61 0 8 0.2618 93 131 0 8 0.25925 65 126 0 8 0.25925 59 130 0 8 0.25925 14 99 0 8 0.25925 123 136 0 8 0.25755 121 135 0 8 0.25755 99 131 0 8 0.25755 99 126 0 8 0.25755 98 130 0 8 0.25755 93 121 0 8 0.25755 87 150 0 8 0.25755 58 114 0 8 0.25755 42 62 0 8 0.25755 97 145 0 8 0.255 72 131 0 8 0.255 56 87 0 8 0.255 55 75 0 8 0.255 124 134 0 8 0.2533 115 132 0 8 0.2533 99 147 0 8 0.2533 99 130 0 8 0.2533 21 48 0 8 0.2533 18 82 0 8 0.2533 2 64 0 8 0.2533 97 130 0 8 0.25075 67 99 0 8 0.25075 65 135 0 8 0.25075 35 131 0 8 0.25075 34 62 0 8 0.25075 16 124 0 8 0.25075 87 132 0 8 0.24905 75 121 0 8 0.24905 65 131 0 8 0.24905 48 121 0 8 0.24905 105 131 0 8 0.2465 93 139 0 8 0.2465 61 70 0 8 0.2465 45 107 0 8 0.2465 42 71 0 8 0.2465 9 124 0 8 0.2465 99 150 0 8 0.2448 77 105 0 8 0.2448 62 129 0 8 0.2448 61 134 0 8 0.2448 47 97 0 8 0.2448 31 96 0 8 0.2448 21 131 0 8 0.2448 131 150 0 8 0.24225 125 143 0 8 0.24225 92 130 0 8 0.24225 87 122 0 8 0.24225 68 105 0 8 0.24225 62 147 0 8 0.24225 42 121 0 8 0.24225 23 129 0 8 0.24225 21 115 0 8 0.24225 13 72 0 8 0.24225 104 128 0 8 0.24055 93 126 0 8 0.24055 71 99 0 8 0.24055 68 131 0 8 0.24055 32 45 0 8 0.24055 5 42 0 8 0.24055 111 139 0 8 0.238 58 68 0 8 0.238 48 97 0 8 0.238 44 110 0 8 0.238 28 122 0 8 0.238 21 98 0 8 0.238 1 151 0 8 0.238 87 136 0 8 0.2363 47 99 0 8 0.2363 43 99 0 8 0.2363 28 98 0 8 0.2363 99 121 0 8 0.2346 35 99 0 8 0.2346 107 131 0 8 0.23205 103 134 0 8 0.23205 68 126 0 8 0.23205 45 136 0 8 0.23205 43 123 0 8 0.23205 43 91 0 8 0.23205 28 125 0 8 0.23205 28 123 0 8 0.23205 24 126 0 8 0.23205 79 93 0 8 0.23035 61 129 0 8 0.23035 60 131 0 8 0.23035 60 123 0 8 0.23035 124 139 0 8 0.2278 122 136 0 8 0.2278 87 103 0 8 0.2278 72 126 0 8 0.2278 69 129 0 8 0.2278 61 130 0 8 0.2278 45 93 0 8 0.2278 42 131 0 8 0.2278 19 83 0 8 0.2278 14 128 0 8 0.2278 8 134 0 8 0.2278 109 139 0 8 0.2261 104 131 0 8 0.2261 55 97 0 8 0.2261 40 67 0 8 0.2261 32 97 0 8 0.2261 5 124 0 8 0.2261 5 97 0 8 0.2261 97 140 0 8 0.2244 97 109 0 8 0.2244 61 127 0 8 0.2244 58 130 0 8 0.2244 43 75 0 8 0.2244 24 128 0 8 0.2244 16 93 0 8 0.2244 16 61 0 8 0.2244 4 128 0 8 0.2244 68 139 0 8 0.22185 42 87 0 8 0.22185 35 67 0 8 0.22185 21 128 0 8 0.22185 21 46 0 8 0.22185 4 61 0 8 0.22185 109 124 0 8 0.22015 105 133 0 8 0.22015 101 124 0 8 0.22015 98 109 0 8 0.22015 43 62 0 8 0.22015 5 28 0 8 0.22015 131 140 0 8 0.21845 116 138 0 8 0.21845 116 131 0 8 0.21845 87 126 0 8 0.21845 78 128 0 8 0.21845 67 95 0 8 0.21845 57 97 0 8 0.21845 35 93 0 8 0.21845 21 101 0 8 0.21845 99 139 0 8 0.21675 83 131 0 8 0.21675 61 97 0 8 0.21675 42 97 0 8 0.21675 20 131 0 8 0.21675 90 107 0 8 0.2142 77 126 0 8 0.2142 61 135 0 8 0.2142 48 122 0 8 0.2142 47 147 0 8 0.2142 42 126 0 8 0.2142 9 102 0 8 0.2142 115 131 0 8 0.2125 95 131 0 8 0.2125 87 138 0 8 0.2125 43 107 0 8 0.2125 43 101 0 8 0.2125 23 70 0 8 0.2125 5 115 0 8 0.2125 131 147 0 8 0.2108 103 139 0 8 0.2108 79 99 0 8 0.2108 71 131 0 8 0.2108 45 125 0 8 0.2108 31 95 0 8 0.2108 21 123 0 8 0.2108 21 92 0 8 0.2108 126 138 0 8 0.2091 91 139 0 8 0.2091 42 132 0 8 0.2091 31 139 0 8 0.2091 19 131 0 8 0.2091 5 99 0 8 0.2091 55 99 0 8 0.20655 35 130 0 8 0.20655 26 151 0 8 0.20655 21 45 0 8 0.20655 12 150 0 8 0.20655 91 143 0 8 0.20485 87 147 0 8 0.20485 79 111 0 8 0.20485 37 124 0 8 0.20485 31 93 0 8 0.20485 28 130 0 8 0.20485 21 121 0 8 0.20485 104 145 0 8 0.20315 101 132 0 8 0.20315 91 131 0 8 0.20315 83 128 0 8 0.20315 61 136 0 8 0.20315 49 131 0 8 0.20315 47 95 0 8 0.20315 27 62 0 8 0.20315 23 126 0 8 0.20315 21 99 0 8 0.20315 5 130 0 8 0.20315 97 122 0 8 0.20145 48 93 0 8 0.20145 31 42 0 8 0.20145 21 50 0 8 0.20145 4 23 0 8 0.20145 111 131 0 8 0.19975 97 136 0 8 0.19975 21 139 0 8 0.19975 21 122 0 8 0.19975 5 43 0 8 0.19975 3 128 0 8 0.19975 75 110 0 8 0.1972 70 151 0 8 0.1972 70 120 0 8 0.1972 64 131 0 8 0.1972 61 133 0 8 0.1972 43 121 0 8 0.1972 31 145 0 8 0.1972 5 21 0 8 0.1972 1 140 0 8 0.1972 111 145 0 8 0.1955 99 123 0 8 0.1955 94 126 0 8 0.1955 62 128 0 8 0.1955 45 123 0 8 0.1955 32 124 0 8 0.1955 28 48 0 8 0.1955 16 131 0 8 0.1955 2 23 0 8 0.1955 131 141 0 8 0.1938 122 133 0 8 0.1938 111 147 0 8 0.1938 109 132 0 8 0.1938 103 131 0 8 0.1938 93 107 0 8 0.1938 91 132 0 8 0.1938 82 131 0 8 0.1938 68 87 0 8 0.1938 62 133 0 8 0.1938 58 93 0 8 0.1938 45 126 0 8 0.1938 20 127 0 8 0.1938 1 130 0 8 0.1938 115 136 0 8 0.1921 91 121 0 8 0.1921 68 120 0 8 0.1921 68 93 0 8 0.1921 63 124 0 8 0.1921 58 124 0 8 0.1921 45 132 0 8 0.1921 28 103 0 8 0.1921 25 63 0 8 0.1921 24 61 0 8 0.1921 97 114 0 8 0.1904 94 128 0 8 0.1904 93 143 0 8 0.1904 93 134 0 8 0.1904 61 118 0 8 0.1904 28 111 0 8 0.1904 28 87 0 8 0.1904 21 91 0 8 0.1904 21 84 0 8 0.1904 6 24 0 8 0.1904 136 147 0 8 0.1887 93 133 0 8 0.1887 75 123 0 8 0.1887 68 127 0 8 0.1887 61 128 0 8 0.1887 37 131 0 8 0.1887 21 61 0 8 0.1887 4 151 0 8 0.1887 121 140 0 8 0.187 120 140 0 8 0.187 109 126 0 8 0.187 91 136 0 8 0.187 79 98 0 8 0.187 62 131 0 8 0.187 43 132 0 8 0.187 18 99 0 8 0.187 109 123 0 8 0.1853 72 93 0 8 0.1853 47 131 0 8 0.1853 43 150 0 8 0.1853 18 98 0 8 0.1853 97 118 0 8 0.1836 80 128 0 8 0.1836 68 132 0 8 0.1836 45 131 0 8 0.1836 31 126 0 8 0.1836 103 121 0 8 0.1819 82 124 0 8 0.1819 64 128 0 8 0.1819 43 103 0 8 0.1819 23 149 0 8 0.1819 21 111 0 8 0.1819 9 93 0 8 0.1819 2 99 0 8 0.1819 123 145 0 8 0.1802 97 147 0 8 0.1802 77 128 0 8 0.1802 32 145 0 8 0.1802 28 91 0 8 0.1802 14 139 0 8 0.1802 END