# TARGET T0265 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0265.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 269 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.003 0.001 0.003 0.043 0.005 0.002 0.943 2 M 0.047 0.016 0.013 0.661 0.003 0.029 0.232 3 K 0.040 0.005 0.020 0.626 0.047 0.053 0.210 4 E 0.041 0.004 0.026 0.726 0.051 0.045 0.107 5 K 0.044 0.002 0.021 0.750 0.063 0.036 0.083 6 L 0.043 0.003 0.018 0.791 0.030 0.033 0.082 7 E 0.041 0.004 0.013 0.800 0.037 0.040 0.064 8 S 0.038 0.003 0.008 0.806 0.028 0.052 0.064 9 K 0.020 0.008 0.007 0.806 0.026 0.051 0.082 10 K 0.010 0.003 0.007 0.830 0.027 0.056 0.067 11 D 0.006 0.001 0.012 0.833 0.022 0.074 0.052 12 E 0.006 0.002 0.013 0.842 0.038 0.044 0.056 13 I 0.008 0.002 0.012 0.878 0.024 0.035 0.041 14 R 0.010 0.002 0.019 0.836 0.031 0.067 0.035 15 C 0.010 0.003 0.041 0.752 0.033 0.115 0.046 16 C 0.009 0.009 0.085 0.527 0.080 0.195 0.094 17 Y 0.004 0.003 0.042 0.173 0.115 0.602 0.061 18 K 0.002 0.004 0.014 0.019 0.075 0.690 0.197 19 I 0.002 0.013 0.002 0.007 0.171 0.014 0.791 20 T 0.002 0.006 0.001 0.009 0.059 0.005 0.918 21 D 0.001 0.001 0.046 0.859 0.022 0.062 0.011 22 T 0.001 0.001 0.025 0.920 0.006 0.041 0.007 23 D 0.001 0.001 0.008 0.976 0.003 0.007 0.005 24 V 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.001 0.003 25 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.002 0.002 26 V 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 27 L 0.002 0.001 0.001 0.994 0.001 0.002 0.001 28 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.002 0.001 29 K 0.001 0.001 0.002 0.989 0.001 0.006 0.001 30 M 0.001 0.001 0.007 0.968 0.002 0.018 0.003 31 V 0.004 0.002 0.009 0.885 0.014 0.079 0.008 32 E 0.003 0.001 0.008 0.670 0.020 0.270 0.027 33 I 0.003 0.005 0.007 0.330 0.140 0.249 0.266 34 E 0.004 0.003 0.012 0.030 0.245 0.215 0.492 35 K 0.024 0.004 0.022 0.038 0.458 0.163 0.290 36 P 0.102 0.028 0.019 0.037 0.194 0.106 0.514 37 I 0.182 0.058 0.004 0.014 0.167 0.012 0.563 38 T 0.178 0.085 0.001 0.022 0.048 0.005 0.661 39 S 0.001 0.001 0.014 0.969 0.004 0.008 0.005 40 E 0.001 0.001 0.015 0.967 0.003 0.011 0.003 41 E 0.001 0.001 0.010 0.980 0.002 0.007 0.002 42 L 0.001 0.001 0.002 0.988 0.003 0.004 0.003 43 A 0.001 0.001 0.004 0.981 0.003 0.008 0.004 44 D 0.001 0.001 0.007 0.959 0.002 0.028 0.002 45 I 0.001 0.001 0.011 0.899 0.005 0.082 0.003 46 F 0.002 0.004 0.013 0.458 0.060 0.435 0.029 47 K 0.002 0.004 0.006 0.033 0.081 0.671 0.203 48 L 0.003 0.021 0.002 0.009 0.289 0.018 0.659 49 S 0.003 0.006 0.002 0.006 0.077 0.005 0.901 50 K 0.001 0.001 0.086 0.823 0.036 0.045 0.010 51 T 0.001 0.001 0.046 0.906 0.013 0.029 0.005 52 T 0.001 0.001 0.056 0.910 0.004 0.022 0.007 53 V 0.001 0.001 0.005 0.981 0.002 0.007 0.005 54 E 0.001 0.001 0.002 0.981 0.002 0.010 0.003 55 N 0.001 0.001 0.002 0.983 0.002 0.011 0.002 56 S 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.007 0.001 57 L 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 58 K 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 59 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 60 L 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 61 I 0.001 0.001 0.003 0.982 0.001 0.012 0.002 62 E 0.001 0.001 0.009 0.855 0.005 0.125 0.004 63 L 0.001 0.001 0.003 0.065 0.005 0.926 0.001 64 G 0.001 0.001 0.001 0.003 0.032 0.939 0.023 65 L 0.169 0.005 0.002 0.002 0.062 0.009 0.749 66 V 0.872 0.021 0.001 0.002 0.006 0.001 0.097 67 V 0.924 0.002 0.002 0.003 0.005 0.002 0.062 68 R 0.903 0.004 0.003 0.004 0.010 0.003 0.074 69 T 0.833 0.002 0.003 0.004 0.028 0.005 0.123 70 K 0.693 0.013 0.005 0.006 0.048 0.010 0.225 71 T 0.325 0.014 0.010 0.018 0.071 0.021 0.542 72 E 0.162 0.007 0.095 0.038 0.130 0.214 0.353 73 G 0.040 0.005 0.119 0.033 0.157 0.561 0.087 74 K 0.038 0.006 0.129 0.025 0.199 0.432 0.171 75 K 0.101 0.008 0.056 0.026 0.311 0.186 0.312 76 I 0.290 0.015 0.028 0.021 0.186 0.146 0.314 77 G 0.528 0.014 0.011 0.013 0.090 0.038 0.306 78 R 0.664 0.012 0.005 0.010 0.047 0.011 0.250 79 P 0.776 0.009 0.004 0.012 0.029 0.007 0.162 80 K 0.836 0.008 0.006 0.021 0.019 0.007 0.102 81 Y 0.838 0.011 0.004 0.030 0.012 0.005 0.100 82 Y 0.723 0.010 0.012 0.078 0.021 0.015 0.141 83 Y 0.551 0.013 0.014 0.132 0.065 0.034 0.190 84 S 0.258 0.012 0.044 0.327 0.088 0.103 0.168 85 I 0.058 0.008 0.052 0.320 0.133 0.169 0.259 86 S 0.025 0.006 0.048 0.479 0.104 0.150 0.187 87 S 0.011 0.003 0.054 0.694 0.069 0.084 0.085 88 N 0.010 0.006 0.053 0.791 0.032 0.059 0.050 89 I 0.003 0.002 0.045 0.857 0.013 0.045 0.035 90 L 0.001 0.001 0.013 0.937 0.012 0.020 0.016 91 E 0.001 0.001 0.011 0.948 0.007 0.025 0.008 92 K 0.001 0.001 0.009 0.943 0.005 0.034 0.008 93 I 0.001 0.001 0.004 0.957 0.005 0.022 0.010 94 R 0.001 0.001 0.003 0.979 0.003 0.012 0.002 95 N 0.001 0.001 0.002 0.981 0.004 0.011 0.002 96 D 0.001 0.001 0.002 0.983 0.002 0.010 0.003 97 L 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.007 0.002 98 L 0.001 0.001 0.001 0.983 0.002 0.013 0.002 99 N 0.001 0.001 0.001 0.976 0.002 0.019 0.002 100 C 0.001 0.001 0.001 0.975 0.002 0.017 0.004 101 A 0.001 0.001 0.001 0.982 0.003 0.010 0.003 102 K 0.001 0.001 0.003 0.974 0.003 0.016 0.004 103 R 0.001 0.001 0.004 0.970 0.003 0.018 0.005 104 M 0.001 0.001 0.005 0.966 0.005 0.015 0.007 105 E 0.001 0.001 0.032 0.919 0.005 0.036 0.007 106 L 0.001 0.001 0.028 0.864 0.007 0.092 0.007 107 A 0.001 0.001 0.026 0.814 0.013 0.128 0.017 108 A 0.005 0.011 0.016 0.475 0.129 0.224 0.141 109 T 0.006 0.005 0.019 0.103 0.084 0.212 0.571