# TARGET T0263 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0263.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 17 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.056 0.003 0.001 0.001 0.144 0.796 2 A 0.325 0.004 0.002 0.001 0.077 0.591 3 T 0.810 0.005 0.001 0.001 0.026 0.158 4 L 0.937 0.003 0.001 0.001 0.010 0.050 5 L 0.973 0.001 0.001 0.001 0.005 0.021 6 Q 0.980 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 7 L 0.963 0.002 0.001 0.001 0.006 0.030 8 H 0.942 0.002 0.001 0.001 0.012 0.043 9 F 0.801 0.009 0.003 0.001 0.051 0.135 10 A 0.487 0.045 0.010 0.002 0.244 0.212 11 F 0.116 0.017 0.014 0.003 0.519 0.331 12 N 0.051 0.010 0.010 0.007 0.463 0.460 13 G 0.038 0.028 0.008 0.017 0.521 0.388 14 P 0.015 0.011 0.012 0.055 0.382 0.525 15 F 0.011 0.009 0.028 0.225 0.346 0.382 16 G 0.005 0.004 0.019 0.407 0.176 0.390 17 D 0.001 0.001 0.009 0.966 0.013 0.011 18 A 0.001 0.001 0.009 0.981 0.007 0.002 19 M 0.001 0.001 0.009 0.979 0.008 0.003 20 A 0.001 0.001 0.006 0.982 0.008 0.003 21 E 0.001 0.001 0.005 0.976 0.012 0.008 22 Q 0.001 0.001 0.005 0.978 0.009 0.008 23 L 0.001 0.001 0.002 0.976 0.008 0.012 24 K 0.001 0.001 0.005 0.972 0.010 0.012 25 P 0.001 0.001 0.007 0.956 0.015 0.021 26 L 0.001 0.001 0.008 0.972 0.008 0.012 27 A 0.001 0.001 0.024 0.934 0.021 0.019 28 E 0.001 0.001 0.049 0.910 0.027 0.013 29 S 0.001 0.001 0.050 0.927 0.015 0.007 30 I 0.001 0.001 0.045 0.927 0.022 0.005 31 N 0.001 0.002 0.052 0.895 0.043 0.008 32 Q 0.002 0.001 0.030 0.792 0.120 0.054 33 E 0.009 0.003 0.042 0.343 0.433 0.169 34 P 0.017 0.008 0.045 0.103 0.538 0.290 35 G 0.050 0.006 0.026 0.016 0.520 0.382 36 F 0.461 0.007 0.014 0.005 0.257 0.256 37 L 0.882 0.010 0.003 0.002 0.034 0.070 38 W 0.956 0.004 0.001 0.001 0.012 0.026 39 K 0.948 0.001 0.001 0.002 0.015 0.033 40 V 0.937 0.003 0.002 0.003 0.015 0.040 41 W 0.932 0.002 0.002 0.002 0.019 0.044 42 T 0.909 0.009 0.002 0.002 0.026 0.053 43 E 0.770 0.055 0.002 0.001 0.059 0.113 44 S 0.177 0.032 0.003 0.002 0.745 0.041 45 E 0.013 0.001 0.014 0.004 0.953 0.014 46 K 0.011 0.002 0.012 0.002 0.959 0.014 47 N 0.040 0.013 0.015 0.002 0.901 0.029 48 H 0.244 0.029 0.008 0.004 0.252 0.464 49 E 0.584 0.151 0.006 0.002 0.087 0.171 50 A 0.630 0.015 0.004 0.001 0.122 0.227 51 G 0.546 0.006 0.002 0.002 0.124 0.320 52 G 0.729 0.007 0.002 0.003 0.073 0.186 53 I 0.943 0.002 0.001 0.002 0.015 0.039 54 Y 0.973 0.002 0.001 0.001 0.006 0.018 55 L 0.970 0.001 0.001 0.001 0.006 0.021 56 F 0.887 0.005 0.002 0.001 0.021 0.083 57 T 0.335 0.020 0.002 0.002 0.082 0.560 58 D 0.074 0.005 0.002 0.013 0.129 0.777 59 E 0.003 0.001 0.046 0.850 0.069 0.032 60 K 0.001 0.001 0.027 0.919 0.044 0.009 61 S 0.001 0.001 0.031 0.942 0.022 0.004 62 A 0.001 0.001 0.005 0.976 0.009 0.009 63 L 0.001 0.001 0.007 0.978 0.010 0.004 64 A 0.001 0.001 0.015 0.961 0.016 0.007 65 Y 0.001 0.001 0.014 0.915 0.039 0.030 66 L 0.001 0.001 0.015 0.944 0.028 0.012 67 E 0.001 0.001 0.011 0.944 0.029 0.015 68 K 0.001 0.001 0.010 0.938 0.025 0.025 69 H 0.004 0.002 0.008 0.957 0.016 0.013 70 T 0.004 0.001 0.007 0.955 0.020 0.013 71 A 0.003 0.001 0.009 0.959 0.016 0.012 72 R 0.004 0.001 0.012 0.941 0.023 0.020 73 L 0.005 0.001 0.016 0.933 0.025 0.020 74 K 0.006 0.001 0.021 0.907 0.038 0.027 75 N 0.009 0.002 0.026 0.802 0.081 0.081 76 L 0.026 0.005 0.037 0.468 0.191 0.272 77 G 0.047 0.011 0.021 0.134 0.253 0.534 78 V 0.085 0.017 0.017 0.073 0.327 0.481 79 E 0.096 0.010 0.018 0.068 0.310 0.499 80 E 0.261 0.009 0.015 0.050 0.264 0.401 81 V 0.544 0.004 0.011 0.060 0.138 0.244 82 V 0.876 0.005 0.005 0.025 0.034 0.055 83 A 0.949 0.002 0.001 0.015 0.012 0.022 84 K 0.926 0.001 0.002 0.029 0.013 0.029 85 V 0.933 0.002 0.001 0.027 0.010 0.027 86 F 0.822 0.002 0.002 0.058 0.036 0.081 87 D 0.778 0.011 0.002 0.050 0.054 0.105 88 V 0.461 0.010 0.007 0.074 0.150 0.298 89 N 0.230 0.010 0.026 0.164 0.237 0.333 90 E 0.281 0.012 0.062 0.225 0.242 0.178 91 P 0.262 0.017 0.060 0.313 0.182 0.166 92 L 0.308 0.009 0.080 0.354 0.147 0.101 93 S 0.273 0.009 0.081 0.308 0.208 0.121 94 Q 0.306 0.008 0.067 0.259 0.247 0.113 95 I 0.245 0.014 0.044 0.217 0.311 0.169 96 N 0.151 0.024 0.043 0.123 0.388 0.270 97 Q 0.216 0.008 0.042 0.079 0.320 0.336 98 A 0.258 0.020 0.029 0.048 0.202 0.443 99 K 0.235 0.043 0.017 0.024 0.150 0.530 100 L 0.095 0.022 0.010 0.020 0.092 0.761 101 A 0.001 0.002 0.001 0.001 0.016 0.979