# TARGET T0263 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0263.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 17 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 A 0.246 0.007 0.001 0.002 0.015 0.004 0.725 3 T 0.808 0.010 0.001 0.001 0.034 0.002 0.145 4 L 0.970 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.025 5 L 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 6 Q 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 7 L 0.960 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.034 8 H 0.865 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 0.112 9 F 0.541 0.051 0.002 0.002 0.039 0.004 0.362 10 A 0.410 0.050 0.007 0.003 0.073 0.024 0.432 11 F 0.202 0.026 0.023 0.007 0.154 0.195 0.393 12 N 0.044 0.027 0.019 0.007 0.437 0.215 0.252 13 G 0.013 0.015 0.015 0.015 0.531 0.065 0.346 14 P 0.010 0.025 0.025 0.020 0.214 0.198 0.510 15 F 0.006 0.024 0.025 0.046 0.309 0.230 0.360 16 G 0.004 0.006 0.013 0.183 0.230 0.050 0.514 17 D 0.001 0.001 0.020 0.942 0.009 0.023 0.006 18 A 0.001 0.001 0.016 0.958 0.004 0.018 0.004 19 M 0.001 0.001 0.014 0.970 0.001 0.012 0.003 20 A 0.001 0.001 0.003 0.987 0.002 0.006 0.002 21 E 0.001 0.001 0.003 0.979 0.002 0.014 0.002 22 Q 0.001 0.001 0.007 0.962 0.002 0.027 0.002 23 L 0.001 0.001 0.010 0.947 0.003 0.033 0.006 24 K 0.001 0.001 0.024 0.932 0.006 0.034 0.004 25 P 0.001 0.001 0.017 0.920 0.007 0.050 0.005 26 L 0.001 0.001 0.022 0.878 0.012 0.064 0.022 27 A 0.001 0.004 0.048 0.813 0.018 0.061 0.055 28 E 0.001 0.001 0.099 0.755 0.012 0.120 0.013 29 S 0.001 0.001 0.098 0.753 0.013 0.122 0.013 30 I 0.003 0.004 0.096 0.706 0.034 0.112 0.046 31 N 0.011 0.004 0.048 0.584 0.051 0.251 0.051 32 Q 0.017 0.007 0.065 0.407 0.104 0.298 0.101 33 E 0.016 0.006 0.027 0.035 0.367 0.074 0.475 34 P 0.007 0.004 0.052 0.013 0.106 0.729 0.090 35 G 0.029 0.007 0.040 0.005 0.108 0.710 0.101 36 F 0.337 0.023 0.053 0.012 0.062 0.046 0.467 37 L 0.756 0.013 0.017 0.008 0.020 0.023 0.164 38 W 0.803 0.005 0.019 0.006 0.027 0.013 0.128 39 K 0.910 0.004 0.006 0.002 0.014 0.005 0.059 40 V 0.925 0.002 0.002 0.001 0.012 0.003 0.055 41 W 0.949 0.004 0.001 0.001 0.006 0.001 0.038 42 T 0.905 0.003 0.001 0.001 0.012 0.002 0.076 43 E 0.804 0.019 0.001 0.002 0.044 0.006 0.125 44 S 0.326 0.022 0.002 0.001 0.035 0.008 0.607 45 E 0.015 0.002 0.050 0.009 0.092 0.771 0.061 46 K 0.004 0.001 0.026 0.006 0.081 0.866 0.016 47 N 0.039 0.007 0.066 0.009 0.375 0.295 0.210 48 H 0.124 0.020 0.013 0.008 0.350 0.086 0.398 49 E 0.418 0.107 0.021 0.013 0.089 0.091 0.261 50 A 0.584 0.023 0.011 0.005 0.074 0.069 0.235 51 G 0.595 0.008 0.009 0.005 0.123 0.095 0.164 52 G 0.727 0.013 0.013 0.009 0.086 0.027 0.126 53 I 0.857 0.008 0.005 0.010 0.014 0.006 0.099 54 Y 0.940 0.006 0.004 0.007 0.007 0.005 0.032 55 L 0.916 0.007 0.004 0.015 0.008 0.008 0.041 56 F 0.816 0.011 0.004 0.019 0.024 0.016 0.110 57 T 0.527 0.024 0.008 0.037 0.154 0.032 0.218 58 D 0.195 0.020 0.005 0.074 0.264 0.028 0.415 59 E 0.004 0.001 0.030 0.908 0.018 0.025 0.015 60 K 0.001 0.001 0.037 0.920 0.012 0.027 0.004 61 S 0.001 0.001 0.047 0.917 0.003 0.029 0.003 62 A 0.001 0.001 0.029 0.946 0.004 0.017 0.004 63 L 0.001 0.001 0.018 0.950 0.005 0.023 0.004 64 A 0.001 0.001 0.016 0.901 0.006 0.069 0.007 65 Y 0.001 0.001 0.013 0.913 0.009 0.051 0.014 66 L 0.001 0.002 0.007 0.927 0.013 0.022 0.028 67 E 0.001 0.001 0.006 0.942 0.007 0.035 0.008 68 K 0.001 0.001 0.005 0.955 0.005 0.027 0.007 69 H 0.001 0.001 0.003 0.976 0.003 0.013 0.005 70 T 0.001 0.001 0.002 0.983 0.002 0.009 0.002 71 A 0.001 0.001 0.003 0.980 0.002 0.011 0.003 72 R 0.001 0.001 0.003 0.977 0.003 0.014 0.003 73 L 0.001 0.001 0.006 0.967 0.004 0.017 0.005 74 K 0.001 0.001 0.024 0.914 0.006 0.049 0.006 75 N 0.002 0.001 0.043 0.727 0.016 0.202 0.010 76 L 0.004 0.002 0.050 0.368 0.066 0.460 0.049 77 G 0.011 0.016 0.033 0.073 0.111 0.575 0.181 78 V 0.057 0.014 0.020 0.021 0.194 0.088 0.607 79 E 0.146 0.011 0.023 0.012 0.290 0.056 0.462 80 E 0.391 0.008 0.011 0.006 0.110 0.029 0.443 81 V 0.683 0.005 0.002 0.003 0.028 0.004 0.276 82 V 0.933 0.002 0.001 0.001 0.018 0.001 0.045 83 A 0.964 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.030 84 K 0.964 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.030 85 V 0.946 0.002 0.001 0.002 0.007 0.002 0.041 86 F 0.871 0.004 0.003 0.003 0.014 0.004 0.100 87 D 0.711 0.005 0.006 0.006 0.040 0.012 0.219 88 V 0.519 0.009 0.020 0.017 0.105 0.059 0.270 89 N 0.374 0.015 0.021 0.021 0.110 0.060 0.400 90 E 0.267 0.014 0.036 0.035 0.157 0.043 0.449 91 P 0.391 0.043 0.034 0.065 0.083 0.046 0.338 92 L 0.339 0.025 0.064 0.075 0.100 0.078 0.320 93 S 0.299 0.027 0.082 0.087 0.125 0.102 0.279 94 Q 0.266 0.025 0.110 0.099 0.150 0.144 0.206 95 I 0.141 0.010 0.141 0.112 0.147 0.138 0.311 96 N 0.112 0.014 0.058 0.090 0.206 0.196 0.325 97 Q 0.103 0.006 0.041 0.060 0.244 0.256 0.291 98 A 0.120 0.012 0.021 0.048 0.282 0.064 0.452 99 K 0.142 0.055 0.015 0.040 0.140 0.037 0.571 100 L 0.079 0.046 0.006 0.022 0.004 0.032 0.811 101 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999