# TARGET T0262 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0262.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 51 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.001 0.993 2 S 0.054 0.018 0.003 0.199 0.009 0.011 0.707 3 K 0.040 0.010 0.009 0.602 0.064 0.029 0.245 4 T 0.036 0.003 0.005 0.821 0.020 0.041 0.074 5 L 0.035 0.002 0.007 0.863 0.016 0.017 0.059 6 A 0.055 0.002 0.020 0.814 0.027 0.020 0.062 7 G 0.058 0.003 0.036 0.801 0.027 0.029 0.046 8 I 0.042 0.005 0.042 0.791 0.030 0.052 0.039 9 L 0.014 0.015 0.024 0.729 0.026 0.139 0.053 10 R 0.013 0.008 0.023 0.406 0.101 0.254 0.195 11 H 0.009 0.008 0.026 0.368 0.163 0.138 0.287 12 H 0.006 0.009 0.014 0.274 0.176 0.049 0.472 13 P 0.001 0.002 0.122 0.622 0.058 0.129 0.067 14 G 0.003 0.003 0.238 0.498 0.061 0.153 0.045 15 R 0.007 0.009 0.299 0.416 0.048 0.162 0.059 16 Y 0.009 0.003 0.122 0.122 0.065 0.602 0.076 17 G 0.016 0.003 0.033 0.015 0.037 0.805 0.091 18 V 0.041 0.015 0.007 0.003 0.095 0.012 0.828 19 R 0.143 0.196 0.007 0.002 0.056 0.008 0.588 20 L 0.165 0.208 0.005 0.003 0.050 0.012 0.558 21 T 0.021 0.010 0.008 0.001 0.065 0.035 0.861 22 R 0.005 0.003 0.008 0.003 0.166 0.777 0.037 23 E 0.010 0.008 0.011 0.011 0.173 0.724 0.063 24 G 0.060 0.007 0.005 0.023 0.598 0.065 0.243 25 W 0.284 0.038 0.001 0.017 0.091 0.036 0.533 26 A 0.560 0.169 0.001 0.010 0.048 0.006 0.206 27 R 0.409 0.087 0.001 0.019 0.035 0.003 0.447 28 V 0.006 0.001 0.011 0.955 0.007 0.006 0.014 29 S 0.001 0.001 0.016 0.970 0.004 0.006 0.003 30 E 0.001 0.001 0.022 0.969 0.001 0.006 0.001 31 V 0.001 0.001 0.009 0.980 0.002 0.006 0.002 32 V 0.001 0.001 0.009 0.945 0.005 0.031 0.007 33 E 0.002 0.001 0.012 0.873 0.011 0.088 0.015 34 G 0.001 0.001 0.011 0.844 0.030 0.075 0.037 35 L 0.004 0.008 0.043 0.706 0.055 0.095 0.089 36 R 0.005 0.008 0.091 0.547 0.046 0.175 0.128 37 K 0.003 0.010 0.109 0.481 0.074 0.219 0.104 38 A 0.002 0.002 0.055 0.249 0.074 0.560 0.058 39 G 0.003 0.005 0.045 0.103 0.062 0.656 0.127 40 W 0.005 0.011 0.050 0.021 0.181 0.074 0.657 41 S 0.027 0.007 0.139 0.046 0.282 0.266 0.234 42 W 0.046 0.012 0.088 0.048 0.141 0.397 0.268 43 V 0.042 0.054 0.006 0.014 0.226 0.021 0.637 44 E 0.060 0.036 0.001 0.011 0.054 0.004 0.835 45 E 0.001 0.001 0.017 0.959 0.005 0.011 0.006 46 W 0.001 0.001 0.020 0.958 0.004 0.013 0.004 47 H 0.001 0.001 0.024 0.957 0.003 0.011 0.004 48 I 0.005 0.001 0.004 0.976 0.004 0.005 0.005 49 V 0.011 0.001 0.003 0.967 0.004 0.008 0.007 50 G 0.012 0.001 0.005 0.953 0.003 0.019 0.007 51 V 0.009 0.002 0.007 0.941 0.007 0.025 0.009 52 A 0.020 0.005 0.011 0.891 0.016 0.042 0.015 53 L 0.018 0.003 0.014 0.716 0.043 0.172 0.035 54 H 0.011 0.004 0.010 0.295 0.217 0.332 0.130 55 D 0.016 0.004 0.007 0.047 0.284 0.164 0.477 56 P 0.026 0.006 0.022 0.022 0.203 0.299 0.421 57 K 0.070 0.022 0.138 0.043 0.231 0.312 0.183 58 G 0.100 0.010 0.109 0.028 0.329 0.139 0.285 59 R 0.415 0.022 0.060 0.015 0.100 0.044 0.344 60 Y 0.834 0.021 0.004 0.005 0.011 0.005 0.120 61 E 0.891 0.012 0.002 0.004 0.007 0.006 0.078 62 L 0.812 0.019 0.002 0.005 0.012 0.007 0.142 63 R 0.418 0.013 0.009 0.011 0.080 0.079 0.390 64 N 0.057 0.003 0.029 0.031 0.267 0.518 0.095 65 G 0.138 0.004 0.038 0.050 0.236 0.375 0.160 66 E 0.754 0.027 0.008 0.026 0.022 0.015 0.148 67 I 0.873 0.021 0.003 0.025 0.010 0.004 0.062 68 R 0.875 0.009 0.006 0.027 0.017 0.010 0.057 69 A 0.725 0.005 0.032 0.055 0.040 0.051 0.091 70 R 0.559 0.007 0.038 0.053 0.119 0.094 0.130 71 Y 0.395 0.010 0.038 0.055 0.127 0.160 0.216 72 G 0.338 0.012 0.022 0.025 0.208 0.133 0.263 73 H 0.400 0.016 0.016 0.016 0.131 0.056 0.365 74 S 0.474 0.030 0.013 0.013 0.090 0.034 0.346 75 I 0.500 0.030 0.013 0.020 0.119 0.040 0.277 76 P 0.541 0.015 0.010 0.012 0.049 0.029 0.343 77 V 0.236 0.016 0.006 0.013 0.028 0.008 0.692 78 N 0.385 0.029 0.012 0.021 0.029 0.020 0.505 79 V 0.252 0.022 0.031 0.030 0.079 0.056 0.529 80 E 0.198 0.021 0.038 0.028 0.146 0.089 0.480 81 P 0.107 0.026 0.021 0.025 0.300 0.030 0.491 82 L 0.063 0.026 0.027 0.017 0.086 0.030 0.750 83 P 0.027 0.010 0.166 0.031 0.105 0.268 0.393 84 G 0.028 0.010 0.133 0.016 0.165 0.313 0.335 85 E 0.031 0.074 0.020 0.010 0.443 0.051 0.371 86 P 0.038 0.026 0.003 0.004 0.187 0.013 0.728 87 P 0.042 0.004 0.033 0.030 0.157 0.068 0.666 88 P 0.194 0.003 0.031 0.036 0.505 0.051 0.181 89 I 0.862 0.024 0.017 0.037 0.015 0.008 0.037 90 L 0.920 0.005 0.004 0.036 0.002 0.005 0.027 91 Y 0.886 0.004 0.003 0.037 0.011 0.014 0.045 92 H 0.626 0.005 0.005 0.044 0.070 0.031 0.220 93 G 0.175 0.005 0.012 0.054 0.278 0.118 0.358 94 T 0.086 0.022 0.038 0.089 0.287 0.117 0.361 95 T 0.051 0.010 0.121 0.189 0.137 0.125 0.368 96 E 0.027 0.006 0.158 0.454 0.074 0.159 0.121 97 E 0.021 0.011 0.087 0.529 0.084 0.166 0.102 98 A 0.009 0.012 0.019 0.684 0.061 0.087 0.129 99 L 0.002 0.002 0.007 0.875 0.024 0.017 0.073 100 P 0.001 0.001 0.004 0.971 0.006 0.010 0.008 101 L 0.001 0.001 0.003 0.981 0.003 0.007 0.004 102 I 0.001 0.001 0.002 0.987 0.002 0.004 0.003 103 M 0.001 0.001 0.002 0.981 0.002 0.011 0.002 104 E 0.001 0.001 0.004 0.916 0.004 0.072 0.003 105 R 0.001 0.001 0.004 0.399 0.012 0.578 0.007 106 G 0.003 0.003 0.005 0.107 0.049 0.718 0.115 107 I 0.017 0.019 0.010 0.043 0.116 0.040 0.755 108 M 0.062 0.023 0.045 0.051 0.176 0.040 0.603 109 R 0.065 0.020 0.169 0.064 0.133 0.189 0.361 110 G 0.055 0.019 0.230 0.042 0.113 0.367 0.173 111 R 0.136 0.009 0.121 0.027 0.205 0.236 0.267 112 R 0.327 0.010 0.029 0.008 0.196 0.073 0.355 113 L 0.522 0.008 0.006 0.003 0.119 0.029 0.313 114 K 0.883 0.007 0.002 0.002 0.023 0.008 0.074 115 V 0.921 0.007 0.001 0.002 0.006 0.003 0.059 116 H 0.917 0.005 0.002 0.002 0.012 0.005 0.057 117 L 0.801 0.012 0.002 0.004 0.019 0.007 0.155 118 T 0.446 0.010 0.004 0.004 0.056 0.028 0.452 119 S 0.136 0.017 0.028 0.032 0.351 0.179 0.257 120 S 0.089 0.018 0.018 0.031 0.355 0.057 0.433 121 L 0.009 0.004 0.221 0.623 0.045 0.059 0.039 122 E 0.013 0.003 0.179 0.668 0.034 0.072 0.033 123 D 0.014 0.002 0.194 0.624 0.033 0.097 0.035 124 A 0.025 0.006 0.084 0.627 0.072 0.096 0.089 125 V 0.021 0.021 0.040 0.437 0.004 0.214 0.264 126 S 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.990