# TARGET T0262 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0262.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 33 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 H 0.035 0.005 0.003 0.010 0.136 0.810 2 L 0.108 0.029 0.006 0.023 0.186 0.647 3 T 0.060 0.024 0.006 0.028 0.180 0.701 4 S 0.032 0.035 0.012 0.085 0.230 0.606 5 S 0.012 0.010 0.003 0.043 0.058 0.873 6 L 0.005 0.001 0.047 0.876 0.035 0.036 7 E 0.003 0.001 0.038 0.916 0.030 0.012 8 D 0.003 0.001 0.054 0.906 0.027 0.009 9 A 0.008 0.002 0.035 0.918 0.027 0.010 10 V 0.007 0.001 0.016 0.933 0.028 0.016 11 S 0.014 0.001 0.011 0.909 0.033 0.033 12 T 0.038 0.003 0.010 0.838 0.044 0.067 13 G 0.160 0.015 0.021 0.521 0.124 0.159 14 R 0.317 0.018 0.020 0.231 0.163 0.252 15 R 0.261 0.035 0.026 0.162 0.179 0.337 16 H 0.243 0.019 0.013 0.024 0.385 0.316 17 G 0.052 0.007 0.006 0.006 0.621 0.309 18 N 0.018 0.005 0.004 0.002 0.502 0.470 19 L 0.046 0.018 0.001 0.002 0.376 0.557 20 V 0.063 0.001 0.001 0.001 0.070 0.863 21 A 0.798 0.012 0.001 0.004 0.026 0.159 22 V 0.974 0.004 0.001 0.001 0.005 0.015 23 L 0.981 0.001 0.001 0.001 0.003 0.014 24 L 0.986 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 25 V 0.973 0.005 0.001 0.001 0.003 0.018 26 D 0.846 0.008 0.001 0.008 0.033 0.104 27 V 0.036 0.001 0.060 0.596 0.259 0.048 28 E 0.009 0.001 0.053 0.713 0.204 0.020 29 C 0.007 0.002 0.033 0.838 0.115 0.006 30 L 0.015 0.001 0.021 0.850 0.094 0.019 31 R 0.015 0.002 0.016 0.916 0.037 0.014 32 R 0.022 0.001 0.034 0.845 0.075 0.023 33 R 0.021 0.001 0.024 0.549 0.192 0.213 34 G 0.007 0.001 0.001 0.004 0.141 0.846 35 L 0.095 0.004 0.002 0.002 0.123 0.775 36 K 0.689 0.007 0.003 0.002 0.074 0.225 37 V 0.922 0.005 0.003 0.001 0.026 0.042 38 E 0.970 0.003 0.002 0.001 0.011 0.014 39 R 0.919 0.006 0.004 0.001 0.057 0.012 40 M 0.472 0.005 0.022 0.007 0.458 0.036 41 S 0.051 0.002 0.014 0.004 0.912 0.018 42 K 0.033 0.006 0.026 0.007 0.905 0.024 43 T 0.293 0.011 0.007 0.006 0.431 0.253 44 V 0.875 0.004 0.001 0.002 0.034 0.085 45 Y 0.966 0.004 0.001 0.001 0.005 0.024 46 T 0.967 0.012 0.001 0.002 0.007 0.011 47 V 0.878 0.006 0.014 0.006 0.049 0.047 48 D 0.620 0.003 0.038 0.012 0.181 0.146 49 W 0.221 0.008 0.051 0.031 0.329 0.361 50 V 0.094 0.096 0.005 0.010 0.210 0.584 51 P 0.025 0.005 0.006 0.009 0.226 0.729 52 P 0.008 0.001 0.495 0.198 0.203 0.095 53 E 0.051 0.004 0.485 0.178 0.229 0.053 54 C 0.108 0.009 0.317 0.392 0.133 0.041 55 I 0.392 0.011 0.057 0.253 0.083 0.204 56 A 0.705 0.009 0.022 0.132 0.047 0.086 57 E 0.763 0.004 0.013 0.126 0.034 0.059 58 V 0.765 0.008 0.005 0.070 0.040 0.112 59 R 0.554 0.018 0.006 0.083 0.061 0.277 60 R 0.423 0.005 0.032 0.082 0.093 0.365 61 E 0.225 0.012 0.081 0.109 0.178 0.395 62 S 0.162 0.009 0.117 0.087 0.330 0.294 63 L 0.113 0.007 0.059 0.058 0.419 0.344 64 G 0.069 0.017 0.033 0.039 0.349 0.493 65 R 0.128 0.036 0.024 0.052 0.247 0.513 66 S 0.059 0.018 0.010 0.049 0.117 0.747 67 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.015 0.979