# TARGET T0262 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0262.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 33 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 H 0.044 0.034 0.106 0.033 0.161 0.207 0.416 2 L 0.071 0.030 0.072 0.061 0.131 0.151 0.485 3 T 0.060 0.039 0.029 0.075 0.142 0.183 0.473 4 S 0.035 0.046 0.022 0.280 0.213 0.135 0.269 5 S 0.027 0.019 0.005 0.289 0.197 0.083 0.380 6 L 0.001 0.001 0.005 0.978 0.003 0.009 0.004 7 E 0.001 0.001 0.006 0.986 0.002 0.005 0.002 8 D 0.001 0.001 0.006 0.987 0.001 0.004 0.001 9 A 0.002 0.001 0.007 0.984 0.001 0.004 0.002 10 V 0.002 0.001 0.005 0.976 0.002 0.012 0.002 11 S 0.003 0.001 0.005 0.939 0.004 0.045 0.004 12 T 0.011 0.001 0.010 0.708 0.020 0.218 0.031 13 G 0.042 0.018 0.021 0.293 0.120 0.257 0.248 14 R 0.094 0.020 0.054 0.154 0.140 0.112 0.426 15 R 0.111 0.043 0.063 0.117 0.217 0.162 0.286 16 H 0.069 0.037 0.076 0.073 0.125 0.313 0.307 17 G 0.038 0.015 0.031 0.021 0.208 0.351 0.335 18 N 0.038 0.022 0.017 0.009 0.409 0.255 0.251 19 L 0.052 0.009 0.003 0.002 0.601 0.055 0.278 20 V 0.091 0.005 0.003 0.001 0.161 0.033 0.706 21 A 0.781 0.004 0.001 0.001 0.054 0.006 0.153 22 V 0.985 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 23 L 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 24 L 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 25 V 0.944 0.005 0.001 0.003 0.004 0.001 0.043 26 D 0.463 0.005 0.001 0.014 0.038 0.005 0.474 27 V 0.029 0.003 0.034 0.646 0.047 0.087 0.153 28 E 0.006 0.001 0.036 0.852 0.048 0.042 0.016 29 C 0.004 0.001 0.025 0.937 0.009 0.017 0.007 30 L 0.004 0.001 0.015 0.959 0.006 0.008 0.007 31 R 0.006 0.004 0.017 0.927 0.006 0.031 0.010 32 R 0.008 0.001 0.017 0.836 0.015 0.109 0.014 33 R 0.001 0.001 0.006 0.189 0.019 0.782 0.003 34 G 0.004 0.001 0.002 0.004 0.039 0.895 0.055 35 L 0.064 0.001 0.001 0.001 0.030 0.004 0.899 36 K 0.695 0.016 0.001 0.001 0.038 0.002 0.248 37 V 0.935 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.056 38 E 0.977 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 39 R 0.965 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.029 40 M 0.833 0.001 0.005 0.002 0.022 0.071 0.066 41 S 0.198 0.002 0.019 0.002 0.190 0.534 0.055 42 K 0.006 0.001 0.006 0.001 0.155 0.821 0.011 43 T 0.083 0.001 0.008 0.001 0.167 0.644 0.096 44 V 0.943 0.008 0.001 0.001 0.002 0.001 0.046 45 Y 0.986 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 46 T 0.978 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 47 V 0.927 0.003 0.003 0.001 0.011 0.003 0.053 48 D 0.753 0.002 0.008 0.002 0.058 0.011 0.165 49 W 0.482 0.009 0.009 0.004 0.115 0.020 0.362 50 V 0.242 0.061 0.003 0.005 0.155 0.011 0.522 51 P 0.078 0.007 0.004 0.011 0.155 0.014 0.731 52 P 0.007 0.001 0.196 0.433 0.098 0.202 0.062 53 E 0.010 0.003 0.239 0.521 0.047 0.146 0.033 54 C 0.023 0.005 0.298 0.544 0.025 0.059 0.047 55 I 0.098 0.010 0.130 0.598 0.027 0.049 0.088 56 A 0.178 0.003 0.090 0.513 0.042 0.102 0.072 57 E 0.245 0.012 0.075 0.481 0.035 0.095 0.057 58 V 0.226 0.020 0.028 0.460 0.057 0.050 0.160 59 R 0.203 0.022 0.021 0.325 0.094 0.073 0.262 60 R 0.096 0.020 0.034 0.426 0.089 0.076 0.259 61 E 0.028 0.006 0.092 0.355 0.122 0.123 0.275 62 S 0.027 0.006 0.114 0.292 0.109 0.252 0.199 63 L 0.026 0.010 0.088 0.194 0.132 0.233 0.317 64 G 0.022 0.007 0.059 0.115 0.193 0.339 0.265 65 R 0.034 0.007 0.041 0.089 0.340 0.169 0.320 66 S 0.041 0.037 0.033 0.103 0.036 0.099 0.651 67 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.995