# TARGET T0262 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0262.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.007 0.003 0.003 0.025 0.149 0.812 2 P 0.020 0.018 0.012 0.072 0.204 0.673 3 S 0.025 0.013 0.019 0.114 0.276 0.553 4 S 0.036 0.009 0.057 0.253 0.310 0.334 5 S 0.047 0.012 0.067 0.364 0.271 0.239 6 Q 0.071 0.017 0.111 0.354 0.270 0.176 7 Y 0.084 0.022 0.131 0.416 0.200 0.146 8 R 0.113 0.016 0.127 0.303 0.230 0.211 9 R 0.137 0.021 0.096 0.311 0.202 0.233 10 Y 0.119 0.031 0.043 0.263 0.208 0.335 11 Q 0.068 0.043 0.023 0.132 0.253 0.481 12 D 0.040 0.041 0.017 0.034 0.652 0.217 13 P 0.023 0.013 0.031 0.021 0.769 0.143 14 H 0.014 0.012 0.036 0.011 0.799 0.129 15 H 0.028 0.033 0.041 0.005 0.824 0.069 16 P 0.054 0.025 0.041 0.010 0.577 0.293 17 S 0.053 0.046 0.056 0.010 0.514 0.321 18 I 0.082 0.039 0.021 0.008 0.437 0.413 19 P 0.086 0.045 0.012 0.011 0.231 0.615 20 T 0.096 0.043 0.012 0.013 0.300 0.536 21 P 0.105 0.013 0.046 0.064 0.351 0.421 22 T 0.202 0.027 0.076 0.092 0.297 0.306 23 T 0.316 0.028 0.102 0.120 0.243 0.192 24 L 0.291 0.028 0.103 0.152 0.231 0.195 25 F 0.243 0.018 0.067 0.147 0.247 0.278 26 S 0.211 0.016 0.043 0.126 0.266 0.339 27 Q 0.180 0.014 0.029 0.089 0.328 0.361 28 P 0.152 0.014 0.040 0.114 0.321 0.360 29 S 0.239 0.020 0.068 0.144 0.294 0.236 30 L 0.312 0.013 0.107 0.214 0.224 0.131 31 E 0.405 0.013 0.078 0.247 0.142 0.114 32 I 0.381 0.019 0.075 0.282 0.143 0.100 33 L 0.226 0.031 0.048 0.255 0.240 0.200 34 G 0.077 0.005 0.026 0.186 0.317 0.389 35 G 0.028 0.003 0.018 0.128 0.330 0.493 36 G 0.040 0.024 0.036 0.160 0.275 0.466 37 V 0.041 0.016 0.127 0.536 0.163 0.117 38 A 0.019 0.003 0.299 0.504 0.122 0.053 39 E 0.016 0.005 0.251 0.528 0.132 0.069 40 E 0.015 0.004 0.141 0.595 0.130 0.115 41 L 0.026 0.005 0.051 0.479 0.172 0.267 42 P 0.048 0.011 0.084 0.563 0.142 0.153 43 E 0.072 0.017 0.155 0.610 0.094 0.052 44 L 0.115 0.008 0.167 0.614 0.063 0.033 45 A 0.138 0.005 0.150 0.572 0.087 0.048 46 L 0.208 0.015 0.086 0.442 0.119 0.129 47 C 0.233 0.057 0.049 0.271 0.253 0.137 48 C 0.157 0.030 0.027 0.163 0.410 0.212 49 D 0.056 0.005 0.013 0.037 0.629 0.262 50 G 0.091 0.011 0.019 0.036 0.619 0.225 51 T 0.419 0.045 0.012 0.033 0.251 0.241 52 V 0.508 0.067 0.012 0.031 0.149 0.233 53 V 0.374 0.031 0.017 0.030 0.276 0.273 54 E 0.243 0.030 0.028 0.031 0.339 0.329 55 G 0.135 0.015 0.034 0.033 0.449 0.334 56 R 0.189 0.034 0.038 0.020 0.456 0.263 57 S 0.239 0.039 0.036 0.023 0.401 0.263 58 N 0.268 0.034 0.037 0.021 0.398 0.242 59 C 0.336 0.021 0.026 0.026 0.340 0.250 60 R 0.514 0.022 0.018 0.020 0.232 0.194 61 C 0.661 0.018 0.014 0.016 0.130 0.161 62 K 0.698 0.009 0.022 0.019 0.135 0.118 63 A 0.726 0.005 0.036 0.020 0.117 0.095 64 R 0.799 0.006 0.017 0.017 0.086 0.075 65 A 0.878 0.007 0.007 0.010 0.046 0.051 66 V 0.839 0.021 0.004 0.009 0.051 0.077 67 L 0.602 0.040 0.008 0.016 0.198 0.136 68 P 0.209 0.004 0.022 0.025 0.531 0.209 69 G 0.116 0.004 0.030 0.037 0.644 0.168 70 G 0.332 0.015 0.019 0.021 0.446 0.167 71 M 0.724 0.013 0.004 0.020 0.082 0.157 72 R 0.858 0.010 0.004 0.017 0.028 0.082 73 V 0.852 0.013 0.004 0.018 0.025 0.088 74 R 0.803 0.008 0.008 0.027 0.057 0.097 75 L 0.520 0.009 0.020 0.051 0.147 0.252 76 S 0.328 0.012 0.036 0.086 0.261 0.277 77 K 0.248 0.012 0.066 0.106 0.317 0.252 78 T 0.185 0.019 0.049 0.169 0.252 0.326 79 L 0.129 0.015 0.106 0.368 0.272 0.110 80 A 0.077 0.006 0.100 0.478 0.237 0.103 81 G 0.080 0.007 0.107 0.497 0.219 0.091 82 I 0.098 0.011 0.077 0.463 0.198 0.153 83 L 0.102 0.026 0.039 0.407 0.141 0.284 84 R 0.063 0.023 0.019 0.281 0.101 0.513 85 H 0.001 0.002 0.001 0.008 0.016 0.973