# TARGET T0257 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0257.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 56 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.029 0.004 0.005 0.017 0.222 0.724 2 A 0.123 0.019 0.016 0.018 0.228 0.597 3 V 0.305 0.025 0.013 0.009 0.234 0.414 4 D 0.522 0.004 0.016 0.009 0.172 0.277 5 M 0.702 0.009 0.008 0.011 0.084 0.187 6 F 0.878 0.024 0.003 0.006 0.032 0.057 7 I 0.871 0.009 0.003 0.007 0.050 0.061 8 K 0.784 0.011 0.004 0.008 0.087 0.106 9 I 0.482 0.019 0.015 0.011 0.319 0.153 10 G 0.136 0.013 0.023 0.016 0.536 0.276 11 D 0.037 0.009 0.011 0.007 0.605 0.331 12 V 0.090 0.124 0.020 0.010 0.528 0.228 13 K 0.127 0.029 0.014 0.015 0.367 0.449 14 G 0.092 0.015 0.041 0.042 0.445 0.364 15 E 0.116 0.022 0.064 0.087 0.448 0.263 16 S 0.130 0.033 0.081 0.133 0.349 0.274 17 K 0.188 0.039 0.125 0.140 0.309 0.198 18 D 0.123 0.015 0.195 0.136 0.366 0.165 19 K 0.101 0.014 0.179 0.130 0.433 0.142 20 T 0.084 0.023 0.158 0.121 0.448 0.166 21 H 0.108 0.053 0.049 0.027 0.664 0.100 22 A 0.071 0.004 0.042 0.016 0.759 0.108 23 E 0.142 0.004 0.031 0.009 0.633 0.182 24 E 0.713 0.008 0.005 0.003 0.193 0.078 25 I 0.899 0.005 0.001 0.001 0.025 0.070 26 D 0.972 0.003 0.001 0.001 0.007 0.017 27 V 0.969 0.001 0.001 0.001 0.008 0.020 28 L 0.950 0.002 0.001 0.001 0.014 0.032 29 A 0.915 0.004 0.003 0.003 0.032 0.044 30 W 0.826 0.008 0.009 0.006 0.077 0.074 31 S 0.632 0.008 0.023 0.014 0.223 0.101 32 W 0.321 0.012 0.081 0.035 0.408 0.143 33 G 0.297 0.013 0.032 0.022 0.430 0.206 34 M 0.445 0.011 0.020 0.028 0.266 0.230 35 S 0.559 0.022 0.012 0.021 0.157 0.228 36 Q 0.552 0.045 0.012 0.024 0.142 0.225 37 S 0.374 0.029 0.015 0.028 0.213 0.342 38 G 0.242 0.034 0.017 0.021 0.267 0.419 39 S 0.128 0.050 0.021 0.015 0.511 0.274 40 M 0.113 0.048 0.037 0.016 0.530 0.256 41 H 0.070 0.024 0.050 0.018 0.616 0.223 42 M 0.073 0.059 0.049 0.015 0.587 0.217 43 G 0.059 0.049 0.026 0.018 0.583 0.265 44 G 0.035 0.028 0.030 0.017 0.615 0.274 45 G 0.032 0.029 0.022 0.013 0.540 0.362 46 G 0.080 0.067 0.038 0.011 0.509 0.294 47 G 0.154 0.040 0.035 0.008 0.476 0.286 48 A 0.172 0.028 0.035 0.009 0.504 0.253 49 G 0.189 0.019 0.017 0.007 0.436 0.333 50 K 0.408 0.023 0.012 0.006 0.243 0.308 51 V 0.597 0.025 0.008 0.007 0.143 0.220 52 N 0.671 0.028 0.006 0.008 0.119 0.169 53 V 0.621 0.019 0.009 0.007 0.173 0.170 54 Q 0.504 0.006 0.011 0.008 0.268 0.203 55 D 0.689 0.006 0.006 0.004 0.146 0.149 56 L 0.874 0.009 0.001 0.002 0.034 0.080 57 S 0.931 0.006 0.001 0.001 0.013 0.049 58 F 0.899 0.003 0.001 0.003 0.013 0.081 59 T 0.822 0.005 0.002 0.005 0.031 0.135 60 K 0.603 0.008 0.006 0.014 0.061 0.308 61 Y 0.380 0.020 0.013 0.024 0.154 0.409 62 I 0.204 0.025 0.016 0.026 0.296 0.434 63 D 0.047 0.018 0.021 0.032 0.671 0.211 64 K 0.017 0.013 0.038 0.141 0.639 0.153 65 S 0.014 0.018 0.025 0.210 0.565 0.168 66 T 0.016 0.010 0.006 0.312 0.291 0.364 67 P 0.001 0.001 0.003 0.962 0.014 0.020 68 N 0.001 0.001 0.003 0.979 0.011 0.005 69 L 0.001 0.001 0.003 0.987 0.007 0.002 70 M 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.001 71 M 0.001 0.001 0.003 0.990 0.006 0.001 72 A 0.001 0.001 0.003 0.984 0.008 0.003 73 C 0.001 0.001 0.003 0.979 0.011 0.007 74 S 0.003 0.002 0.009 0.932 0.039 0.016 75 S 0.005 0.002 0.013 0.710 0.133 0.138 76 G 0.005 0.001 0.014 0.038 0.440 0.502 77 K 0.047 0.009 0.020 0.011 0.492 0.421 78 H 0.130 0.052 0.022 0.008 0.468 0.320 79 Y 0.057 0.010 0.067 0.010 0.791 0.065 80 P 0.031 0.001 0.068 0.009 0.789 0.102 81 Q 0.332 0.006 0.046 0.005 0.494 0.117 82 A 0.873 0.002 0.002 0.001 0.060 0.063 83 K 0.969 0.001 0.001 0.001 0.004 0.026 84 L 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 85 T 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 86 I 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 87 R 0.983 0.001 0.001 0.001 0.005 0.012 88 K 0.967 0.002 0.001 0.001 0.011 0.020 89 A 0.807 0.009 0.002 0.001 0.098 0.084 90 G 0.234 0.009 0.004 0.001 0.619 0.132 91 G 0.026 0.001 0.009 0.002 0.902 0.060 92 E 0.034 0.004 0.009 0.002 0.882 0.070 93 N 0.403 0.020 0.005 0.001 0.411 0.159 94 Q 0.594 0.016 0.001 0.001 0.069 0.320 95 V 0.806 0.008 0.001 0.001 0.025 0.160 96 E 0.890 0.002 0.001 0.001 0.017 0.091 97 Y 0.961 0.001 0.001 0.001 0.008 0.030 98 L 0.973 0.001 0.001 0.001 0.004 0.021 99 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 100 I 0.989 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 101 T 0.978 0.002 0.001 0.001 0.008 0.011 102 L 0.873 0.005 0.005 0.001 0.095 0.022 103 K 0.327 0.002 0.013 0.001 0.580 0.077 104 E 0.369 0.004 0.006 0.001 0.527 0.092 105 V 0.884 0.004 0.001 0.001 0.066 0.045 106 L 0.975 0.001 0.001 0.001 0.006 0.018 107 V 0.989 0.002 0.001 0.001 0.002 0.007 108 S 0.963 0.001 0.001 0.001 0.010 0.025 109 S 0.939 0.001 0.001 0.001 0.016 0.042 110 V 0.914 0.006 0.001 0.001 0.020 0.059 111 S 0.828 0.008 0.002 0.003 0.066 0.093 112 T 0.637 0.013 0.014 0.008 0.146 0.182 113 G 0.454 0.033 0.023 0.010 0.245 0.236 114 G 0.293 0.026 0.030 0.011 0.400 0.240 115 S 0.135 0.029 0.026 0.011 0.506 0.293 116 G 0.041 0.030 0.033 0.012 0.708 0.177 117 G 0.020 0.008 0.054 0.013 0.828 0.078 118 E 0.023 0.004 0.034 0.009 0.831 0.099 119 D 0.079 0.018 0.018 0.009 0.685 0.191 120 R 0.317 0.018 0.003 0.003 0.262 0.397 121 L 0.635 0.030 0.002 0.002 0.085 0.246 122 T 0.804 0.009 0.002 0.001 0.047 0.136 123 E 0.918 0.001 0.001 0.001 0.015 0.063 124 N 0.967 0.001 0.001 0.001 0.005 0.026 125 V 0.985 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 126 T 0.992 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 127 L 0.982 0.001 0.001 0.001 0.004 0.013 128 N 0.964 0.001 0.001 0.001 0.013 0.022 129 F 0.886 0.002 0.012 0.001 0.057 0.043 130 A 0.839 0.003 0.012 0.002 0.096 0.049 131 Q 0.898 0.005 0.004 0.001 0.057 0.035 132 V 0.906 0.001 0.001 0.001 0.034 0.056 133 Q 0.959 0.002 0.001 0.001 0.012 0.026 134 V 0.984 0.002 0.001 0.001 0.004 0.010 135 D 0.968 0.001 0.001 0.001 0.007 0.022 136 Y 0.941 0.003 0.001 0.001 0.009 0.044 137 Q 0.826 0.009 0.001 0.002 0.057 0.105 138 P 0.653 0.017 0.002 0.002 0.116 0.210 139 Q 0.286 0.023 0.003 0.003 0.260 0.426 140 K 0.152 0.089 0.005 0.003 0.502 0.249 141 A 0.071 0.029 0.011 0.008 0.644 0.237 142 D 0.036 0.018 0.019 0.009 0.728 0.190 143 G 0.030 0.030 0.023 0.010 0.724 0.183 144 A 0.042 0.060 0.033 0.015 0.607 0.243 145 K 0.070 0.046 0.071 0.017 0.567 0.229 146 D 0.060 0.019 0.060 0.009 0.627 0.225 147 G 0.142 0.026 0.027 0.003 0.550 0.251 148 G 0.277 0.026 0.009 0.002 0.316 0.370 149 P 0.497 0.025 0.006 0.001 0.175 0.297 150 V 0.687 0.010 0.003 0.001 0.101 0.197 151 K 0.832 0.008 0.002 0.001 0.051 0.106 152 Y 0.843 0.005 0.002 0.002 0.048 0.100 153 G 0.876 0.006 0.002 0.002 0.045 0.069 154 W 0.856 0.013 0.002 0.002 0.039 0.088 155 N 0.725 0.012 0.005 0.007 0.090 0.161 156 I 0.264 0.008 0.210 0.121 0.278 0.120 157 R 0.127 0.007 0.276 0.156 0.350 0.085 158 Q 0.156 0.010 0.243 0.207 0.303 0.081 159 N 0.223 0.014 0.060 0.144 0.266 0.295 160 V 0.320 0.047 0.028 0.135 0.141 0.329 161 Q 0.248 0.029 0.017 0.114 0.098 0.494 162 A 0.008 0.003 0.003 0.024 0.036 0.926