(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
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Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0255 AAG06109, Pseudomonas aeruginosa PAO1
    • gi|22219049|pdb|1KLL|A_1:120 Chain A, Molecular Basis Of Mitomycin C Resictance In Streptomyces: Crystal Structures Of The Mrd Protein With And Without A Drug Derivative [Taxonomy]
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 221 .-..A..V..T.Q..DV.....SY..E..GmrwvtV....TP.....P.....DQ.....P....


          50                60                                 70      
          |                 |                                  |      
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   3 .GD.VLTVEF.R.V...M.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.A.F.....R
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   5 .GD.VLTVEF.R.V...M.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.A.F.....R
   6 .GD.VLTVEF.T.V...L.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.E.F.....K
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   8 .GD.VLTVEF.T.V...M.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.E.F.....T
   9 .GD.VLTVEF.T.V...M.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.G.I.....K
  10 .GD.VLTVEF.T.V...M.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.H.F.....K
  11 .GD.VITVEF.T.V...M.GI..PC.VG....L.....N.....G....G....P.A.F.....K
  12 .GS.VLTVEF.T.A...N.GQ..KF.VG....L.....N.....G....G....P.Q.F.....K
  13 .GD.VLMVEF.T.V...A.GV..PC.LG....L.....N.....G....G....P.A.F.....K
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  15 .GD.VLTVQF.T.V...A.GV..SC.IG....L.....N.....G....G....P.T.F.....K
  16 .GA.VMTVSF.E.L...D.GQ..PF.TA....L.....N.....G....G....P.T.F.....K
  17 .GD.VLTVEF.T.V...A.GI..PC.VG....L.....N.....G....G....P.H.F.....K
  18 .GD.VLTVQF.T.V...A.GV..SC.IG....L.....N.....G....G....P.T.F.....K
  19 .GD.VLTVEF.T.V...M.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.E.V.....K
  20 .GD.VLVVEF.T.V...A.GV..AC.IG....L.....N.....G....G....P.T.F.....K
  21 .GD.VLTVEF.T.V...A.GI..PC.LG....L.....N.....G....G....P.H.F.....K
  22 .GT.VLTVGF.T.V...L.GI..PC.IG....L.....N.....G....G....P.Q.F.....P
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  25 .GA.VMTVAF.E.L...D.GQ..AF.VA....L.....N.....G....G....P.V.F.....Q
  26 .GN.VLTVEF.T.V...M.GI..PC.IG....L.....N.....G....G....P.V.F.....T
  27 .GS.VMTVSF.E.L...D.GH..TF.TG....L.....N.....G....G....P.V.F.....K
  28 .GA.VMTVSF.E.L...D.GQ..AF.LA....L.....N.....G....G....P.A.F.....P
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  30 .GN.ELTVEF.T.V...L.GQ..SF.IG....L.....N.....G....G....P.N.F.....T
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  32 .GS.VLVVEF.T.V...A.GQ..PL.VA....L.....N.....G....G....M.K.M.....E
  33 .GS.VMTVQF.E.L...D.GT..PF.TA....L.....N.....G....G....P.A.F.....Q
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  37 .GS.VTVIEF.R.L...G.DQ..NF.TA....L.....E.....A....G....P.L.D.....P
  38 .GT.RM-VEF.E.L...F.GQ..PF.IA....M.....S.....H....P....R.T.E.....T
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  40 .--.-M-AVF.E.L...E.GQ..RF.HA....L.....N.....G....G....P.Q.Y.....R
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  43 .GT.VQRSVF.S.I...A.GQ..DL.MA....M.....D.....S....Gld..H.A.F.....T
  44 .GT.VQRSVF.S.I...A.GQ..DL.MA....M.....D.....S....Gld..H.A.F.....T
  45 .GK.VLNGEF.S.L...N.GL..DF.IC....L.....D.....G....G....P.I.F.....K
  46 .GS.VKIAEF.T.L...S.DQ..SY.MA....I.....E.....A....G....P.L.D.....P
  47 .GK.VLNGEF.S.L...N.GL..DF.IC....L.....D.....G....G....P.I.F.....K
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  49 .--.-MQADF.I.L...N.GQ..KF.FS....Y.....N.....G....G....P.N.F.....Q
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  52 .GT.VIHATF.T.L...N.GQ..EF.MC....I.....D.....Syv..N....H.N.F.....T
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  68 .DL.IMHARL.R.L...D.DQ..LL.MA....S.....D.....S....N....S.Q.C.....P
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  72 .DK.VMHAAF.R.I...G.DT..LV.MA....S.....D.....G....M....A.S.G.....K
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  74 .ER.VLHATL.K.V...G.NT..DL.MI....S.....D.....T....F....P.G.Q.....G
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  82 .ER.LMHSRL.A.K...N.GE..EF.IY....I.....T.....D....A....P.Y.D.....G
  83 .ER.LMHSRL.A.K...N.GE..EF.IY....I.....T.....D....A....P.Y.D.....G
  84 .NL.VLNAAL.E.V...K.GS..TI.MF....S.....D.....I....V....P.G.M.....K
  85 .ER.LMHSRL.A.K...N.GE..EF.IY....I.....T.....D....A....P.Y.D.....G
  86 .DW.IMHAEF.E.V...N.GI..HL.ML....S.....D.....G....V....V.A.K.....E
  87 .ET.V---NF.I.L...A.GL..PF.AA....I.....S.....A....G....P.F.F.....K
  88 .GT.VQHSIF.T.L...N.GQ..VF.MA....I.....Dan...S....G....T.E.L.....P
  89 .GS.VQHSIF.T.L...N.GQ..VF.MA....I.....Dan...S....G....E.E.L.....P
  90 .NK.IMHCEF.K.I...G.DT..TF.FA....S.....D.....G....C....S.S.A.....E
  91 .HR.ILHARL.V.Lp..G.GG..ML.YA....G.....D.....C....P....A.D.Q.....P
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  93 .GT.VQHSIF.T.L...N.GQ..VF.MA....I.....Dan...S....G....T.E.L.....P
  94 .GK.ILRAVI.V.I...K.GQ..EI.MC....M.....D.....S....Fiq..H.D.F.....S
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  96 .DL.TMHSQC.D.I...L.GS..TI.MA....A.....D.....N....F....M.K.V.....D
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 108 .TA.IAHANM.R.I...A.GS..DI.MM....S.....D.....As...A....S.G.R.....A
 109 .TA.IAHANM.R.I...A.GS..DI.MM....S.....D.....As...A....S.G.T.....A
 110 .TA.IAHANV.R.I...A.GS..DI.MM....S.....D.....A....I....P.S.G.....K
 111 .GK.IGHAEL.K.I...G.DS..KI.ML....A.....D.....E....F....P.E.M.....G
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 116 .GG.IGHAEL.R.I...G.DS..AI.MLgsp.C.....D.....Q....G....P.L.S.....N
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 121 .EA.TMHAEF.E.V...L.GV..KV.LC....S.....D.....Sf...G....R.A.D.....K
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 124 .GK.TLTVEL.A.I...S.GF..KI.IL....I.....N.....A....G....E.E.F.....T
 125 .DH.IAHSVL.Q.I...G.NT..KL.MI....A.....E.....DtmkhN....E.R.Y.....N
 126 .DH.IAHSVL.Q.I...G.NT..KL.MIaedtM.....N.....P....N....E.G.Y.....N
 127 .DL.VMNASL.V.M...D.GV..KV.MF....S.....D.....V....P....K.S.M.....P
 128 .DK.VMHAEF.K.V...G.DS..LI.MV....S.....D.....Gr...C....T.G.N.....P
 129 .GR.LMHGAV.R.I...G.DS..TL.ML....M.....D.....A....F....P.E.W.....D
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 131 .ER.ILHARL.A.K...D.EKd.LF.YF....S.....D.....Tv...E....G.E.T.....D
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 133 .DL.IMHARL.R.L...D.DQ..LL.MA....S.....D.....S....N....S.Q.C.....P
 134 .ER.ILHARL.A.K...D.EKd.LF.YF....S.....D.....Tv...E....G.E.T.....D
 135 .ER.ILHARL.T.K...D.DKd.LF.YF....S.....D.....Tl...E....G.E.T.....D
 136 .GK.VLNATF.E.I...K.GA..SF.MI....M.....Dmt...N....N....A.S.P.....D
 137 .GR.VGHAEL.R.I...G.DS..SL.ML....G.....D.....P....C....D.M.E.....G
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 139 .GK.VLNATF.E.I...K.GA..SF.MI....M.....Dmt...N....N....A.S.P.....D
 140 .NT.TVHGGF.T.V...L.GA..NL.FC....S.....D.....Sf...G....K.E.V.....K
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 166 .GK.LIHAAL.R.I...N.GF..TV.ML....N.....D.....D....V....P.Q.M.....C
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 182 .GK.ILHARF.E.G...P.GV..LF.HA....S.....D.....N....D....D.A.E.....P
 183 .FD.TPGTKF.E.L...Y.PL..DL.LV....K.....Di....D....E....S.S.L.....K
 184 .GS.IMNAEV.K.I...G.DS..VI.MV....S.....E.....A....R....C.E.F.....K
 185 .GS.IMNAEV.K.I...G.DS..VI.ML....S.....E.....A....R....C.E.F.....K
 186 .-L.VSSVEL.K.L...G.SS..SF.LV....Snlt..D.....D....D....S.S.A.....P
 187 .E-.---VVF.T.L...Y.GV..RF.HM....L.....D.....E....N....P.E.F.....G
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 195 ..Lta7ehP....N.T...IW...FNIIV..S.....D-...-.....-.....IE.DTHNKALR
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 198 ..Hplqa.P....Q.S...FS...LLLPV..E.....D-...-.....-.....IA.VWWDRAVA
 199 ..Y.....Egi..K.G...CS...ISLNV..D.....SK...A.....E.....AE.RLFNALAE
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 203 ..Ada7aeG....N.GfrgFT...IAYNG..Q.....SK...E.....E.....VD.QVIAKAEK
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 205 ..Paa...G....G.R...LS...LAFRC..D.....SP...A.....E.....VD.TVYGDLVG
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 215 ..K.....N....P.S...IS...FLINC..A.....SE...E.....N.....VQ.HYWDLLSE
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   1 .NG.....GE...E.S.ACGW...C.RDK.WGISWQI.TP.....R.....V.LSEA.IAS.PDR
   2 .NG.....GE...E.S.ACGW...C.RDK.WGISWQI.TP.....R.....V.LSEA.IAS.PDR
   3 .NG.....GE...E.S.ACGW...C.RDK.WGISWQI.TP.....R.....V.LSEA.IAS.PDR
   4 .GGt....PW...-.-.QCGW...L.QDR.FGVSWQI.VP.....D.....V.LGEM.LRD.PDA
   5 .NG.....GE...E.S.ACGW...C.RDK.WGISWQI.TP.....R.....V.LSEA.IAS.PDR
   6 .HG.....GQ...E.S.ACGW...C.KDK.WGLSWQI.TP.....R.....A.LMEA.IND.PDA
   7 .GG.....GE...G.G.PCGW...L.KDR.YGLSWQV.VP.....A.....K.LIGM.IGD.ADP
   8 .NG.....GQ...E.S.VCGW...C.KDK.WGISWQI.TP.....I.....A.LTKA.VTD.PDT
   9 .NG.....GE...E.N.VCGW...C.RDK.WGLSWQI.TP.....R.....V.LTEA.IAH.PDR
  10 .NG.....GQ...E.S.ECGW...C.KDR.WGLSWQI.TP.....R.....A.LTAA.YTD.PDR
  11 .ND.....GE...A.S.VCGW...C.RDK.WGISWQI.TP.....R.....I.LIEA.IGH.PDR
  12 .GG.....GE...D.G.PCGW...L.KDR.FGVSWQV.VP.....R.....R.LEEM.FRD.PDP
  13 .NG.....GQ...E.S.ACGW...C.KDK.WGISWQI.TP.....R.....V.LMEA.MAA.GG-
  14 .DG.....-E...K.Q.GPAW...V.KDR.YGISWQI.VP.....T.....V.LGEL.LSD.PDT
  15 .NG.....GE...E.S.ACGW...C.KDK.WGVSWQI.TP.....R.....V.LMDA.MAA.GG-
  16 .GG.....DEt..A.Q.QCGW...L.KDK.YGVSWQI.IP.....R.....I.LIEL.LNH.PDA
  17 .HG.....GQ...E.S.ACGW...C.KDR.WGLCWQI.TP.....R.....A.LLAA.ITD.PDR
  18 .NG.....GE...E.S.ACGW...C.KDK.WGVSWQI.TP.....R.....V.LMDA.MAA.GG-
  19 .NG.....GQ...E.S.VCGW...C.KDK.WGVSWQI.TP.....I.....A.LTKA.VTD.PDT
  20 .NG.....GQ...E.S.ECGW...C.KDK.WGVSWQI.TP.....R.....T.LMDA.LAA.GG-
  21 .NG.....GQ...E.S.ACGW...C.KDR.WGISWQI.TP.....R.....A.LTAA.ICD.PDR
  22 .NG.....GV...E.S.ACGW...C.KDK.WGLSWQI.TP.....R.....Q.LTDG.MAH.PDP
  23 .NG.....GI...E.S.ACGW...C.KDR.WGFSWQI.TP.....R.....I.LLEL.TTS.SDS
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  28 .GG.....DEr..A.Q.QCGW...L.RDR.FGVSWQV.VP.....V.....Q.MPEL.MA-.GDP
  29 .GG.....-E...E.S.QCGW...L.KDR.FGLSWQI.VP.....D.....R.LFEL.IGD.PDR
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  32 .HG.....GK...E.E.QCGW...L.RDR.WGVAWQV.VP.....K.....V.MFEF.LTS.PDK
  33 .GGd....PR...A.Q.QCGW...L.ADQ.YGLSWQI.VP.....A.....M.VAEW.MT-.GDP
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  36 .NG.....GT...A.D.ACGW...L.RDR.YGVSWQI.VP.....E.....T.LIPM.MSD.RDT
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  39 .NG.....DA...SrQ.QSGW...L.ADK.YGISWQI.VP.....A.....A.FKEM.MCS.GDK
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  44 .QG.....-E...K.Q.KCGW...V.KDK.FGVSWQI.IP.....S.....I.LGDY.LQD.KDP
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  47 .HV.....KE...A.E.QCGW...C.KDK.FGISWQI.IP.....E.....N.LGQL.MAK.GD-
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  49 .GG.....GK...E.S.MCGW...I.QDK.YGMWWQV.TP.....K.....I.LLQL.VSH.KDR
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  53 .DGav9ayPF...S.K.KFGW...L.NDK.YGVSWQL.TL.....A.....E.----.---.---
  54 .DGav9ayPF...S.K.KFGW...L.NDK.YGVSWQL.TL.....A.....E.----.---.---
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  75 .GGev9etFW...S.P.AYGQ...V.KDK.FNIEWQI.TT.....S.....T.TE--.---.---
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 120 .SGr11eqFW...G.G.KMGQ...F.VDE.YGISWMI.HT.....Q.....P.YSKL.---.---
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