# TARGET T0252 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0252.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15.5979 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.146 0.086 0.045 0.105 0.081 0.083 0.125 0.103 0.101 0.075 0.051 2 L 0.074 0.061 0.039 0.078 0.091 0.106 0.152 0.128 0.120 0.095 0.057 3 D 0.150 0.330 0.101 0.158 0.093 0.059 0.048 0.026 0.019 0.011 0.005 4 A 0.166 0.085 0.044 0.108 0.114 0.122 0.135 0.088 0.071 0.045 0.023 5 N 0.484 0.135 0.085 0.096 0.065 0.043 0.043 0.021 0.015 0.008 0.004 6 K 0.085 0.151 0.159 0.278 0.142 0.081 0.059 0.023 0.013 0.006 0.003 7 L 0.023 0.022 0.042 0.042 0.046 0.086 0.189 0.177 0.170 0.131 0.072 8 Q 0.051 0.053 0.195 0.218 0.170 0.138 0.110 0.037 0.019 0.007 0.002 9 Q 0.047 0.065 0.585 0.167 0.069 0.034 0.022 0.007 0.003 0.001 0.001 10 A 0.006 0.014 0.092 0.064 0.065 0.114 0.225 0.135 0.126 0.102 0.057 11 V 0.004 0.006 0.050 0.029 0.040 0.090 0.262 0.195 0.173 0.106 0.045 12 D 0.014 0.029 0.574 0.203 0.098 0.046 0.023 0.007 0.003 0.001 0.001 13 Q 0.016 0.050 0.409 0.163 0.142 0.110 0.074 0.020 0.010 0.004 0.002 14 A 0.006 0.008 0.051 0.021 0.021 0.039 0.145 0.152 0.236 0.201 0.121 15 Y 0.006 0.008 0.051 0.072 0.118 0.184 0.302 0.130 0.080 0.037 0.012 16 T 0.018 0.049 0.718 0.130 0.051 0.020 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 17 Q 0.017 0.038 0.154 0.121 0.143 0.171 0.203 0.076 0.047 0.022 0.008 18 F 0.016 0.013 0.025 0.032 0.042 0.069 0.185 0.182 0.199 0.149 0.088 19 H 0.073 0.127 0.238 0.200 0.155 0.097 0.066 0.023 0.012 0.006 0.003 20 S 0.089 0.130 0.200 0.200 0.137 0.093 0.079 0.033 0.022 0.011 0.006 21 L 0.025 0.021 0.016 0.040 0.059 0.089 0.197 0.160 0.159 0.125 0.108 22 N 0.449 0.267 0.085 0.094 0.046 0.028 0.017 0.006 0.004 0.002 0.001 23 G 0.346 0.206 0.074 0.169 0.099 0.054 0.032 0.011 0.006 0.003 0.001 24 G 0.175 0.082 0.035 0.084 0.096 0.095 0.131 0.100 0.093 0.063 0.046 25 Q 0.033 0.198 0.113 0.281 0.189 0.104 0.055 0.015 0.007 0.003 0.002 26 N 0.019 0.057 0.029 0.103 0.131 0.146 0.188 0.129 0.102 0.061 0.036 27 A 0.031 0.011 0.009 0.031 0.055 0.084 0.174 0.172 0.181 0.136 0.115 28 D 0.228 0.217 0.132 0.240 0.106 0.041 0.023 0.007 0.004 0.002 0.001 29 Y 0.003 0.015 0.012 0.053 0.071 0.107 0.191 0.170 0.171 0.129 0.078 30 I 0.004 0.005 0.004 0.017 0.031 0.054 0.126 0.161 0.189 0.195 0.213 31 P 0.179 0.114 0.104 0.143 0.106 0.094 0.109 0.055 0.047 0.029 0.021 32 F 0.021 0.040 0.048 0.138 0.167 0.162 0.212 0.100 0.061 0.034 0.017 33 L 0.008 0.007 0.005 0.014 0.017 0.027 0.081 0.120 0.190 0.236 0.294 34 A 0.058 0.068 0.058 0.145 0.155 0.159 0.168 0.078 0.054 0.034 0.024 35 N 0.312 0.223 0.144 0.178 0.070 0.038 0.021 0.007 0.004 0.002 0.001 36 V 0.008 0.010 0.006 0.020 0.035 0.076 0.185 0.179 0.172 0.166 0.143 37 P 0.273 0.337 0.078 0.150 0.069 0.035 0.027 0.011 0.009 0.006 0.005 38 G 0.293 0.119 0.044 0.128 0.127 0.096 0.088 0.041 0.031 0.018 0.014 39 Q 0.173 0.170 0.078 0.214 0.147 0.090 0.069 0.028 0.016 0.009 0.006 40 L 0.002 0.014 0.015 0.095 0.167 0.237 0.245 0.108 0.066 0.032 0.018 41 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.012 0.064 0.145 0.243 0.273 0.252 42 A 0.001 0.002 0.003 0.016 0.027 0.066 0.187 0.192 0.187 0.170 0.148 43 V 0.001 0.001 0.003 0.005 0.005 0.011 0.050 0.117 0.236 0.313 0.258 44 A 0.001 0.001 0.001 0.007 0.013 0.030 0.112 0.175 0.224 0.223 0.212 45 I 0.001 0.002 0.003 0.006 0.007 0.012 0.051 0.111 0.222 0.318 0.269 46 V 0.002 0.005 0.006 0.042 0.082 0.102 0.183 0.192 0.190 0.122 0.073 47 T 0.018 0.055 0.036 0.148 0.151 0.152 0.182 0.119 0.078 0.039 0.021 48 C 0.025 0.030 0.024 0.089 0.142 0.161 0.193 0.136 0.103 0.065 0.034 49 D 0.200 0.281 0.080 0.218 0.106 0.054 0.035 0.013 0.007 0.003 0.002 50 G 0.302 0.110 0.036 0.115 0.098 0.086 0.089 0.058 0.048 0.035 0.024 51 N 0.188 0.254 0.087 0.193 0.120 0.069 0.049 0.019 0.011 0.006 0.004 52 V 0.026 0.058 0.028 0.109 0.122 0.140 0.190 0.121 0.098 0.064 0.044 53 Y 0.007 0.010 0.008 0.038 0.064 0.099 0.165 0.164 0.173 0.146 0.127 54 S 0.098 0.141 0.089 0.193 0.145 0.100 0.104 0.052 0.039 0.023 0.017 55 A 0.070 0.050 0.032 0.103 0.100 0.112 0.172 0.124 0.106 0.083 0.048 56 G 0.289 0.157 0.040 0.134 0.099 0.080 0.068 0.041 0.037 0.029 0.026 57 D 0.083 0.137 0.057 0.140 0.117 0.107 0.128 0.078 0.068 0.048 0.037 58 S 0.211 0.082 0.042 0.100 0.088 0.082 0.119 0.080 0.080 0.064 0.053 59 D 0.371 0.225 0.074 0.153 0.090 0.045 0.026 0.008 0.005 0.002 0.001 60 Y 0.078 0.075 0.046 0.131 0.123 0.127 0.167 0.105 0.075 0.049 0.024 61 R 0.044 0.082 0.071 0.219 0.208 0.183 0.113 0.038 0.023 0.012 0.007 62 F 0.009 0.012 0.019 0.036 0.046 0.073 0.195 0.178 0.186 0.145 0.101 63 A 0.019 0.029 0.035 0.112 0.130 0.121 0.199 0.138 0.105 0.071 0.041 64 L 0.010 0.010 0.011 0.026 0.028 0.043 0.128 0.147 0.211 0.220 0.167 65 E 0.011 0.021 0.043 0.133 0.173 0.176 0.195 0.102 0.076 0.044 0.026 66 S 0.020 0.030 0.039 0.074 0.091 0.113 0.271 0.155 0.112 0.068 0.028 67 I 0.010 0.010 0.017 0.036 0.037 0.045 0.124 0.148 0.231 0.226 0.117 68 S 0.022 0.035 0.066 0.095 0.111 0.122 0.218 0.125 0.110 0.065 0.031 69 K 0.017 0.030 0.071 0.087 0.097 0.125 0.251 0.155 0.098 0.050 0.019 70 V 0.007 0.015 0.070 0.040 0.036 0.047 0.144 0.160 0.219 0.181 0.081 71 C 0.010 0.012 0.055 0.046 0.038 0.045 0.139 0.170 0.194 0.183 0.109 72 T 0.004 0.009 0.082 0.046 0.057 0.082 0.196 0.173 0.174 0.115 0.063 73 L 0.001 0.002 0.033 0.010 0.007 0.009 0.069 0.139 0.262 0.297 0.170 74 A 0.001 0.002 0.038 0.032 0.031 0.056 0.150 0.153 0.200 0.195 0.143 75 L 0.001 0.003 0.079 0.016 0.017 0.033 0.149 0.154 0.217 0.191 0.140 76 A 0.001 0.002 0.022 0.019 0.026 0.042 0.158 0.197 0.232 0.183 0.120 77 L 0.001 0.002 0.013 0.010 0.012 0.019 0.086 0.125 0.259 0.280 0.192 78 E 0.005 0.009 0.043 0.098 0.168 0.186 0.252 0.124 0.076 0.028 0.011 79 D 0.058 0.071 0.116 0.128 0.114 0.147 0.198 0.078 0.056 0.023 0.010 80 V 0.014 0.020 0.019 0.049 0.071 0.106 0.214 0.186 0.148 0.118 0.053 81 G 0.092 0.482 0.043 0.104 0.062 0.054 0.063 0.036 0.027 0.021 0.015 82 P 0.087 0.073 0.030 0.122 0.219 0.191 0.146 0.065 0.038 0.018 0.011 83 Q 0.712 0.166 0.034 0.052 0.020 0.009 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 84 A 0.017 0.060 0.037 0.284 0.257 0.183 0.110 0.030 0.013 0.005 0.003 85 V 0.002 0.001 0.002 0.003 0.004 0.007 0.037 0.101 0.223 0.295 0.327 86 Q 0.003 0.007 0.023 0.102 0.220 0.277 0.229 0.080 0.037 0.014 0.007 87 D 0.048 0.095 0.623 0.174 0.040 0.013 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 88 K 0.003 0.009 0.008 0.052 0.115 0.252 0.358 0.122 0.050 0.021 0.009 89 I 0.003 0.003 0.002 0.004 0.006 0.013 0.072 0.148 0.238 0.248 0.264 90 G 0.213 0.248 0.106 0.165 0.103 0.068 0.050 0.018 0.012 0.008 0.007 91 A 0.192 0.196 0.119 0.177 0.121 0.085 0.055 0.025 0.016 0.009 0.005 92 D 0.226 0.161 0.032 0.117 0.113 0.092 0.096 0.066 0.042 0.030 0.024 93 P 0.131 0.048 0.019 0.059 0.079 0.114 0.162 0.107 0.113 0.081 0.088 94 T 0.219 0.182 0.076 0.129 0.095 0.076 0.090 0.047 0.040 0.027 0.018 95 G 0.381 0.155 0.050 0.135 0.089 0.070 0.053 0.027 0.018 0.012 0.009 96 L 0.154 0.148 0.059 0.129 0.113 0.096 0.106 0.071 0.054 0.041 0.031 97 P 0.073 0.105 0.048 0.121 0.117 0.130 0.164 0.091 0.069 0.051 0.030 98 F 0.032 0.022 0.016 0.049 0.059 0.089 0.162 0.152 0.166 0.140 0.113 99 N 0.043 0.070 0.059 0.131 0.133 0.133 0.168 0.100 0.083 0.051 0.030 100 S 0.037 0.075 0.097 0.226 0.154 0.119 0.121 0.069 0.051 0.031 0.019 101 V 0.010 0.009 0.025 0.028 0.028 0.037 0.090 0.117 0.192 0.242 0.221 102 I 0.008 0.008 0.055 0.066 0.086 0.137 0.260 0.155 0.126 0.068 0.032 103 A 0.007 0.032 0.224 0.286 0.182 0.107 0.085 0.040 0.022 0.011 0.004 104 L 0.005 0.013 0.071 0.045 0.062 0.102 0.206 0.152 0.152 0.122 0.071 105 E 0.030 0.042 0.109 0.129 0.116 0.110 0.167 0.106 0.100 0.059 0.034 106 L 0.015 0.032 0.065 0.071 0.097 0.125 0.216 0.138 0.111 0.078 0.052 107 H 0.190 0.244 0.189 0.180 0.092 0.051 0.032 0.012 0.006 0.003 0.002 108 G 0.665 0.132 0.048 0.058 0.035 0.023 0.022 0.009 0.005 0.003 0.002 109 G 0.720 0.138 0.027 0.054 0.027 0.015 0.010 0.004 0.003 0.002 0.001 110 K 0.062 0.170 0.044 0.169 0.169 0.133 0.121 0.057 0.040 0.023 0.012 111 P 0.077 0.057 0.022 0.081 0.101 0.114 0.152 0.118 0.121 0.085 0.071 112 L 0.040 0.036 0.018 0.082 0.135 0.161 0.226 0.134 0.088 0.048 0.032 113 S 0.030 0.047 0.028 0.101 0.128 0.139 0.182 0.134 0.105 0.066 0.041 114 P 0.012 0.010 0.006 0.031 0.045 0.077 0.167 0.176 0.194 0.161 0.121 115 L 0.018 0.010 0.009 0.022 0.029 0.051 0.138 0.152 0.192 0.196 0.185 116 V 0.005 0.007 0.012 0.031 0.033 0.045 0.151 0.176 0.202 0.192 0.145 117 N 0.005 0.008 0.015 0.031 0.040 0.059 0.144 0.161 0.207 0.186 0.143 118 A 0.011 0.008 0.030 0.028 0.028 0.039 0.118 0.141 0.185 0.211 0.202 119 G 0.008 0.009 0.035 0.040 0.051 0.074 0.189 0.180 0.182 0.141 0.091 120 A 0.004 0.008 0.041 0.022 0.018 0.028 0.102 0.135 0.205 0.234 0.203 121 I 0.005 0.006 0.036 0.020 0.019 0.029 0.083 0.121 0.190 0.237 0.253 122 A 0.004 0.004 0.025 0.013 0.014 0.026 0.101 0.127 0.201 0.229 0.257 123 T 0.003 0.008 0.037 0.024 0.019 0.024 0.081 0.124 0.216 0.243 0.222 124 T 0.003 0.006 0.018 0.022 0.029 0.048 0.134 0.141 0.217 0.199 0.185 125 S 0.054 0.047 0.120 0.115 0.120 0.128 0.172 0.096 0.074 0.045 0.029 126 L 0.025 0.035 0.064 0.087 0.101 0.117 0.219 0.130 0.116 0.069 0.037 127 I 0.010 0.011 0.015 0.024 0.033 0.048 0.123 0.135 0.209 0.212 0.178 128 N 0.123 0.199 0.079 0.159 0.127 0.104 0.104 0.046 0.032 0.019 0.009 129 A 0.320 0.136 0.090 0.135 0.090 0.077 0.076 0.034 0.024 0.012 0.005 130 E 0.514 0.159 0.071 0.094 0.060 0.037 0.035 0.015 0.008 0.004 0.003 131 N 0.194 0.371 0.089 0.138 0.074 0.050 0.039 0.018 0.012 0.008 0.006 132 V 0.058 0.055 0.040 0.077 0.099 0.173 0.210 0.118 0.091 0.054 0.024 133 E 0.531 0.153 0.125 0.106 0.044 0.022 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 134 Q 0.138 0.111 0.407 0.241 0.067 0.022 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 135 R 0.010 0.015 0.090 0.066 0.061 0.118 0.238 0.160 0.124 0.080 0.038 136 W 0.002 0.003 0.081 0.035 0.057 0.142 0.322 0.176 0.109 0.053 0.021 137 Q 0.002 0.012 0.701 0.156 0.074 0.033 0.015 0.004 0.001 0.001 0.001 138 R 0.001 0.013 0.158 0.167 0.212 0.226 0.148 0.046 0.019 0.008 0.002 139 I 0.001 0.001 0.013 0.003 0.004 0.009 0.075 0.129 0.274 0.281 0.213 140 L 0.001 0.003 0.063 0.064 0.113 0.194 0.328 0.122 0.064 0.034 0.013 141 H 0.003 0.024 0.679 0.160 0.082 0.030 0.015 0.004 0.002 0.001 0.001 142 I 0.001 0.004 0.060 0.027 0.037 0.067 0.204 0.169 0.189 0.146 0.095 143 Q 0.002 0.003 0.027 0.019 0.023 0.034 0.153 0.176 0.245 0.202 0.115 144 Q 0.004 0.013 0.285 0.175 0.177 0.156 0.117 0.039 0.021 0.009 0.005 145 Q 0.008 0.032 0.276 0.172 0.164 0.166 0.121 0.035 0.016 0.007 0.004 146 L 0.004 0.007 0.012 0.016 0.026 0.057 0.179 0.180 0.215 0.187 0.116 147 A 0.027 0.037 0.030 0.054 0.064 0.092 0.185 0.148 0.141 0.114 0.107 148 G 0.492 0.180 0.137 0.105 0.052 0.020 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 149 E 0.181 0.141 0.089 0.179 0.140 0.117 0.090 0.033 0.017 0.009 0.004 150 Q 0.171 0.197 0.093 0.202 0.131 0.087 0.062 0.024 0.017 0.010 0.006 151 V 0.008 0.006 0.005 0.012 0.018 0.041 0.115 0.137 0.225 0.217 0.217 152 A 0.115 0.196 0.152 0.209 0.134 0.083 0.064 0.024 0.013 0.007 0.004 153 L 0.008 0.015 0.012 0.027 0.036 0.060 0.138 0.152 0.188 0.186 0.178 154 S 0.072 0.154 0.066 0.186 0.168 0.120 0.109 0.054 0.036 0.020 0.015 155 D 0.537 0.143 0.066 0.121 0.061 0.033 0.022 0.008 0.005 0.002 0.001 156 E 0.131 0.107 0.095 0.188 0.151 0.123 0.116 0.043 0.026 0.013 0.007 157 V 0.010 0.011 0.019 0.030 0.029 0.047 0.127 0.148 0.205 0.201 0.172 158 N 0.021 0.033 0.064 0.136 0.147 0.181 0.211 0.100 0.064 0.030 0.014 159 Q 0.048 0.101 0.333 0.212 0.123 0.084 0.052 0.023 0.013 0.007 0.003 160 S 0.022 0.042 0.050 0.077 0.092 0.107 0.183 0.151 0.131 0.090 0.055 161 E 0.119 0.052 0.068 0.086 0.090 0.098 0.152 0.107 0.106 0.075 0.048 162 Q 0.084 0.081 0.135 0.188 0.169 0.126 0.121 0.047 0.026 0.014 0.008 163 T 0.075 0.121 0.210 0.188 0.139 0.102 0.087 0.036 0.023 0.013 0.007 164 T 0.110 0.073 0.055 0.129 0.122 0.126 0.171 0.092 0.063 0.040 0.019 165 N 0.316 0.151 0.065 0.116 0.106 0.091 0.077 0.033 0.025 0.013 0.007 166 F 0.055 0.048 0.062 0.082 0.093 0.124 0.200 0.128 0.101 0.068 0.039 167 H 0.012 0.029 0.031 0.082 0.129 0.166 0.230 0.123 0.101 0.060 0.036 168 N 0.013 0.018 0.034 0.027 0.025 0.039 0.135 0.153 0.219 0.196 0.143 169 R 0.009 0.016 0.037 0.126 0.177 0.193 0.191 0.109 0.074 0.044 0.024 170 A 0.005 0.007 0.053 0.026 0.022 0.030 0.115 0.153 0.227 0.206 0.157 171 I 0.001 0.001 0.013 0.013 0.012 0.017 0.073 0.135 0.239 0.281 0.216 172 A 0.001 0.001 0.021 0.012 0.014 0.032 0.143 0.135 0.203 0.230 0.210 173 W 0.001 0.001 0.060 0.031 0.039 0.081 0.217 0.167 0.174 0.142 0.087 174 L 0.001 0.001 0.010 0.010 0.014 0.031 0.164 0.201 0.242 0.204 0.123 175 L 0.001 0.001 0.004 0.003 0.003 0.006 0.030 0.079 0.200 0.315 0.359 176 Y 0.001 0.002 0.010 0.030 0.072 0.133 0.280 0.195 0.160 0.082 0.036 177 S 0.008 0.028 0.133 0.130 0.123 0.135 0.194 0.111 0.089 0.036 0.014 178 A 0.030 0.036 0.041 0.109 0.125 0.188 0.252 0.113 0.063 0.032 0.012 179 G 0.402 0.156 0.078 0.125 0.068 0.054 0.055 0.029 0.018 0.010 0.005 180 Y 0.027 0.075 0.042 0.119 0.148 0.150 0.185 0.115 0.074 0.044 0.022 181 L 0.014 0.017 0.009 0.022 0.024 0.030 0.080 0.124 0.203 0.243 0.234 182 Y 0.072 0.130 0.051 0.194 0.190 0.147 0.125 0.046 0.027 0.011 0.007 183 C 0.186 0.102 0.076 0.129 0.110 0.102 0.122 0.072 0.053 0.031 0.018 184 D 0.085 0.210 0.080 0.197 0.156 0.121 0.087 0.029 0.017 0.010 0.007 185 A 0.012 0.011 0.010 0.028 0.035 0.058 0.160 0.174 0.208 0.178 0.125 186 M 0.133 0.138 0.115 0.228 0.201 0.112 0.052 0.012 0.006 0.002 0.001 187 E 0.058 0.090 0.263 0.275 0.136 0.092 0.066 0.013 0.004 0.001 0.001 188 A 0.004 0.004 0.021 0.024 0.029 0.050 0.162 0.166 0.204 0.201 0.136 189 C 0.004 0.003 0.017 0.016 0.019 0.039 0.189 0.192 0.204 0.193 0.124 190 D 0.004 0.029 0.361 0.318 0.174 0.069 0.026 0.010 0.005 0.003 0.001 191 V 0.010 0.026 0.115 0.059 0.087 0.186 0.298 0.103 0.061 0.037 0.017 192 Y 0.008 0.009 0.056 0.046 0.035 0.034 0.128 0.174 0.229 0.184 0.096 193 T 0.021 0.037 0.079 0.076 0.098 0.134 0.287 0.120 0.077 0.048 0.023 194 R 0.027 0.053 0.333 0.241 0.151 0.076 0.053 0.028 0.020 0.012 0.006 195 Q 0.025 0.046 0.122 0.092 0.108 0.132 0.200 0.114 0.093 0.048 0.020 196 C 0.037 0.028 0.065 0.079 0.072 0.096 0.210 0.150 0.131 0.086 0.044 197 S 0.037 0.041 0.108 0.089 0.099 0.103 0.177 0.113 0.102 0.079 0.053 198 T 0.024 0.045 0.102 0.091 0.065 0.069 0.153 0.141 0.144 0.109 0.057 199 L 0.034 0.058 0.093 0.132 0.131 0.150 0.169 0.089 0.075 0.045 0.024 200 L 0.040 0.027 0.076 0.049 0.044 0.052 0.127 0.139 0.170 0.156 0.119 201 N 0.011 0.081 0.080 0.176 0.192 0.168 0.158 0.070 0.039 0.017 0.008 202 T 0.003 0.007 0.018 0.020 0.022 0.030 0.110 0.145 0.248 0.233 0.165 203 I 0.094 0.047 0.066 0.171 0.243 0.207 0.119 0.030 0.015 0.005 0.002 204 E 0.007 0.037 0.114 0.221 0.187 0.166 0.180 0.056 0.021 0.007 0.003 205 L 0.001 0.001 0.005 0.004 0.004 0.007 0.037 0.099 0.235 0.315 0.293 206 A 0.002 0.001 0.007 0.010 0.015 0.037 0.184 0.186 0.202 0.201 0.156 207 T 0.002 0.012 0.294 0.222 0.216 0.126 0.071 0.029 0.016 0.008 0.004 208 L 0.001 0.001 0.008 0.010 0.014 0.037 0.170 0.165 0.204 0.214 0.178 209 G 0.001 0.001 0.003 0.003 0.002 0.003 0.022 0.082 0.218 0.328 0.338 210 A 0.002 0.003 0.033 0.022 0.034 0.093 0.256 0.164 0.153 0.127 0.113 211 T 0.002 0.007 0.132 0.072 0.093 0.124 0.181 0.140 0.111 0.082 0.057 212 L 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.012 0.061 0.103 0.191 0.275 0.344 213 A 0.005 0.004 0.009 0.012 0.014 0.025 0.086 0.128 0.217 0.230 0.271 214 A 0.037 0.036 0.067 0.093 0.096 0.140 0.195 0.119 0.102 0.068 0.047 215 G 0.135 0.083 0.077 0.140 0.123 0.130 0.142 0.072 0.050 0.031 0.016 216 G 0.170 0.090 0.055 0.088 0.061 0.058 0.104 0.082 0.096 0.101 0.095 217 V 0.038 0.049 0.028 0.072 0.082 0.093 0.152 0.120 0.137 0.120 0.109 218 N 0.065 0.129 0.033 0.097 0.103 0.105 0.135 0.099 0.099 0.077 0.058 219 P 0.107 0.045 0.020 0.079 0.090 0.103 0.156 0.118 0.117 0.091 0.074 220 L 0.035 0.025 0.011 0.044 0.085 0.107 0.199 0.145 0.146 0.110 0.093 221 T 0.111 0.374 0.098 0.197 0.096 0.047 0.032 0.017 0.013 0.009 0.005 222 H 0.190 0.078 0.041 0.148 0.168 0.149 0.111 0.052 0.033 0.019 0.012 223 K 0.548 0.164 0.082 0.106 0.050 0.023 0.015 0.005 0.003 0.001 0.001 224 R 0.026 0.060 0.058 0.184 0.182 0.179 0.187 0.071 0.034 0.014 0.006 225 V 0.012 0.027 0.023 0.075 0.103 0.124 0.203 0.149 0.125 0.093 0.066 226 L 0.001 0.003 0.005 0.008 0.017 0.037 0.112 0.134 0.198 0.222 0.264 227 Q 0.049 0.208 0.278 0.273 0.118 0.041 0.023 0.006 0.003 0.001 0.001 228 A 0.307 0.129 0.063 0.174 0.121 0.092 0.071 0.023 0.011 0.006 0.003 229 D 0.599 0.148 0.047 0.087 0.047 0.030 0.022 0.009 0.006 0.003 0.002 230 N 0.043 0.118 0.045 0.137 0.135 0.150 0.173 0.083 0.062 0.034 0.020 231 V 0.016 0.022 0.013 0.038 0.067 0.115 0.198 0.164 0.162 0.120 0.085 232 P 0.330 0.167 0.134 0.157 0.087 0.058 0.040 0.013 0.008 0.004 0.003 233 Y 0.034 0.051 0.058 0.194 0.204 0.174 0.167 0.062 0.033 0.016 0.008 234 I 0.017 0.011 0.014 0.024 0.019 0.027 0.076 0.126 0.212 0.243 0.231 235 L 0.007 0.012 0.032 0.095 0.146 0.210 0.228 0.114 0.083 0.047 0.026 236 A 0.011 0.019 0.197 0.079 0.058 0.070 0.137 0.125 0.133 0.104 0.066 237 E 0.005 0.012 0.029 0.077 0.114 0.169 0.269 0.146 0.094 0.055 0.029 238 M 0.010 0.008 0.020 0.015 0.010 0.014 0.056 0.109 0.205 0.285 0.267 239 M 0.008 0.017 0.038 0.079 0.118 0.140 0.184 0.140 0.123 0.089 0.063 240 M 0.022 0.049 0.129 0.093 0.074 0.090 0.160 0.115 0.122 0.086 0.060 241 E 0.020 0.025 0.032 0.094 0.113 0.125 0.173 0.141 0.125 0.098 0.053 242 G 0.097 0.113 0.062 0.105 0.099 0.096 0.150 0.095 0.086 0.055 0.041 243 L 0.025 0.023 0.025 0.046 0.046 0.055 0.120 0.139 0.187 0.187 0.147 244 Y 0.011 0.019 0.014 0.054 0.085 0.125 0.209 0.148 0.149 0.103 0.082 245 G 0.096 0.103 0.086 0.147 0.120 0.105 0.121 0.083 0.067 0.042 0.030 246 R 0.146 0.118 0.068 0.169 0.141 0.125 0.108 0.051 0.037 0.023 0.013 247 S 0.024 0.046 0.018 0.047 0.043 0.053 0.123 0.136 0.188 0.177 0.146 248 G 0.157 0.096 0.043 0.138 0.139 0.150 0.127 0.062 0.042 0.025 0.020 249 D 0.185 0.168 0.133 0.215 0.124 0.077 0.054 0.020 0.012 0.007 0.005 250 W 0.007 0.014 0.018 0.056 0.068 0.101 0.212 0.186 0.169 0.109 0.061 251 A 0.015 0.007 0.011 0.022 0.025 0.035 0.080 0.114 0.190 0.228 0.272 252 Y 0.004 0.013 0.037 0.090 0.130 0.158 0.207 0.144 0.115 0.064 0.038 253 R 0.007 0.036 0.085 0.159 0.168 0.221 0.176 0.077 0.042 0.020 0.010 254 V 0.004 0.003 0.004 0.009 0.012 0.018 0.073 0.147 0.206 0.273 0.252 255 G 0.105 0.075 0.033 0.124 0.121 0.113 0.165 0.102 0.073 0.046 0.041 256 L 0.007 0.014 0.015 0.031 0.038 0.055 0.114 0.136 0.204 0.204 0.183 257 P 0.042 0.066 0.021 0.107 0.115 0.115 0.154 0.120 0.101 0.080 0.077 258 G 0.042 0.016 0.006 0.021 0.026 0.035 0.091 0.133 0.192 0.205 0.234 259 K 0.090 0.070 0.024 0.096 0.114 0.131 0.155 0.097 0.088 0.065 0.069 260 S 0.058 0.051 0.018 0.074 0.059 0.073 0.108 0.111 0.138 0.144 0.166 261 G 0.103 0.057 0.021 0.070 0.084 0.102 0.147 0.110 0.105 0.102 0.100 262 V 0.041 0.035 0.025 0.061 0.056 0.056 0.124 0.113 0.159 0.165 0.164 263 G 0.011 0.013 0.008 0.041 0.067 0.093 0.163 0.150 0.177 0.152 0.125 264 G 0.005 0.008 0.009 0.040 0.066 0.103 0.197 0.181 0.165 0.125 0.100 265 G 0.002 0.002 0.004 0.009 0.017 0.036 0.131 0.180 0.212 0.209 0.196 266 I 0.001 0.001 0.003 0.004 0.004 0.008 0.039 0.098 0.190 0.289 0.361 267 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.035 0.096 0.198 0.311 0.347 268 A 0.001 0.001 0.003 0.004 0.005 0.013 0.059 0.110 0.210 0.261 0.332 269 V 0.001 0.002 0.003 0.007 0.007 0.012 0.054 0.108 0.216 0.283 0.308 270 V 0.002 0.005 0.004 0.025 0.039 0.061 0.146 0.172 0.225 0.170 0.151 271 P 0.039 0.067 0.044 0.124 0.142 0.154 0.197 0.102 0.073 0.037 0.020 272 G 0.169 0.082 0.052 0.201 0.190 0.115 0.095 0.047 0.029 0.014 0.007 273 V 0.021 0.051 0.029 0.139 0.180 0.176 0.170 0.105 0.070 0.039 0.020 274 M 0.001 0.002 0.003 0.014 0.029 0.058 0.156 0.216 0.230 0.178 0.114 275 G 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.032 0.119 0.184 0.219 0.206 0.220 276 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.039 0.122 0.224 0.320 0.285 277 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.010 0.051 0.129 0.237 0.270 0.294 278 A 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.009 0.040 0.090 0.199 0.307 0.344 279 F 0.001 0.003 0.003 0.018 0.029 0.046 0.135 0.202 0.246 0.192 0.126 280 S 0.003 0.009 0.007 0.030 0.044 0.066 0.140 0.187 0.206 0.171 0.138 281 P 0.051 0.054 0.030 0.108 0.140 0.143 0.159 0.117 0.101 0.063 0.034 282 P 0.075 0.076 0.027 0.150 0.197 0.159 0.159 0.080 0.045 0.021 0.011 283 L 0.020 0.020 0.007 0.033 0.043 0.056 0.110 0.133 0.181 0.192 0.205 284 D 0.027 0.061 0.031 0.132 0.152 0.151 0.167 0.103 0.082 0.052 0.043 285 E 0.462 0.202 0.069 0.115 0.063 0.040 0.026 0.011 0.006 0.003 0.002 286 D 0.339 0.117 0.051 0.124 0.101 0.090 0.085 0.042 0.025 0.016 0.009 287 G 0.317 0.120 0.035 0.116 0.093 0.072 0.079 0.049 0.046 0.038 0.035 288 N 0.020 0.075 0.024 0.092 0.111 0.122 0.161 0.117 0.119 0.088 0.071 289 S 0.035 0.063 0.023 0.072 0.083 0.093 0.139 0.127 0.146 0.116 0.102 290 V 0.225 0.044 0.024 0.076 0.101 0.130 0.145 0.080 0.078 0.053 0.042 291 R 0.019 0.056 0.037 0.138 0.162 0.151 0.188 0.107 0.078 0.044 0.022 292 G 0.003 0.010 0.013 0.023 0.022 0.035 0.088 0.131 0.211 0.228 0.236 293 Q 0.016 0.014 0.045 0.064 0.074 0.110 0.188 0.138 0.144 0.120 0.086 294 K 0.012 0.031 0.129 0.184 0.163 0.163 0.181 0.077 0.036 0.015 0.007 295 M 0.001 0.001 0.010 0.011 0.012 0.020 0.096 0.161 0.221 0.244 0.225 296 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.035 0.071 0.164 0.297 0.427 297 A 0.001 0.003 0.124 0.155 0.194 0.220 0.192 0.059 0.034 0.014 0.005 298 S 0.001 0.004 0.047 0.123 0.202 0.279 0.247 0.064 0.022 0.009 0.003 299 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.035 0.093 0.222 0.322 0.322 300 A 0.001 0.001 0.003 0.006 0.013 0.028 0.159 0.214 0.262 0.194 0.120 301 K 0.009 0.024 0.534 0.255 0.117 0.042 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 302 Q 0.002 0.012 0.037 0.054 0.124 0.262 0.364 0.092 0.037 0.013 0.004 303 L 0.009 0.006 0.007 0.016 0.017 0.032 0.115 0.185 0.253 0.230 0.130 304 G 0.550 0.195 0.057 0.078 0.043 0.031 0.027 0.009 0.005 0.003 0.002 305 Y 0.018 0.038 0.070 0.113 0.111 0.124 0.173 0.144 0.114 0.070 0.025 306 N 0.206 0.320 0.083 0.121 0.091 0.066 0.054 0.027 0.015 0.010 0.007 307 V 0.065 0.064 0.062 0.159 0.144 0.131 0.151 0.084 0.067 0.042 0.029 308 F 0.044 0.027 0.020 0.033 0.047 0.067 0.150 0.149 0.187 0.162 0.113 309 K 0.138 0.225 0.127 0.266 0.134 0.055 0.030 0.013 0.008 0.003 0.002 310 G 0.572 0.150 0.038 0.074 0.051 0.038 0.034 0.018 0.012 0.008 0.004