# TARGET T0252 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0252.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 17.5609 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.316 0.104 0.056 0.121 0.083 0.074 0.088 0.058 0.050 0.031 0.019 2 L 0.119 0.075 0.038 0.075 0.087 0.097 0.151 0.126 0.106 0.082 0.043 3 D 0.150 0.430 0.098 0.148 0.073 0.041 0.028 0.015 0.010 0.006 0.003 4 A 0.154 0.076 0.041 0.107 0.132 0.144 0.146 0.087 0.062 0.035 0.016 5 N 0.562 0.142 0.085 0.082 0.049 0.028 0.028 0.011 0.008 0.003 0.002 6 K 0.070 0.157 0.178 0.327 0.153 0.064 0.035 0.011 0.005 0.002 0.001 7 L 0.008 0.013 0.018 0.022 0.028 0.067 0.186 0.203 0.201 0.162 0.092 8 Q 0.019 0.032 0.134 0.225 0.245 0.191 0.111 0.028 0.011 0.003 0.001 9 Q 0.082 0.082 0.686 0.110 0.026 0.009 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 10 A 0.002 0.008 0.049 0.077 0.109 0.199 0.295 0.123 0.075 0.043 0.020 11 V 0.001 0.001 0.015 0.004 0.006 0.016 0.125 0.179 0.258 0.240 0.154 12 D 0.003 0.012 0.448 0.275 0.162 0.068 0.025 0.005 0.002 0.001 0.001 13 Q 0.016 0.036 0.751 0.112 0.052 0.023 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 14 A 0.001 0.002 0.017 0.011 0.019 0.060 0.262 0.199 0.204 0.147 0.078 15 Y 0.001 0.002 0.016 0.017 0.035 0.092 0.348 0.213 0.152 0.088 0.037 16 T 0.013 0.041 0.750 0.129 0.047 0.014 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 17 Q 0.042 0.091 0.357 0.186 0.151 0.098 0.055 0.012 0.005 0.002 0.001 18 F 0.008 0.007 0.014 0.014 0.020 0.038 0.142 0.163 0.231 0.204 0.159 19 H 0.046 0.078 0.093 0.169 0.187 0.171 0.158 0.052 0.027 0.013 0.006 20 S 0.136 0.190 0.334 0.197 0.082 0.034 0.017 0.005 0.003 0.001 0.001 21 L 0.019 0.021 0.027 0.050 0.068 0.104 0.209 0.150 0.141 0.111 0.101 22 N 0.343 0.236 0.079 0.117 0.072 0.054 0.049 0.021 0.015 0.009 0.005 23 G 0.426 0.212 0.060 0.140 0.078 0.043 0.025 0.008 0.004 0.002 0.001 24 G 0.146 0.089 0.045 0.095 0.096 0.095 0.127 0.098 0.091 0.065 0.053 25 Q 0.062 0.247 0.102 0.259 0.161 0.091 0.048 0.015 0.007 0.004 0.002 26 N 0.020 0.057 0.024 0.108 0.147 0.163 0.196 0.119 0.091 0.049 0.026 27 A 0.020 0.009 0.007 0.027 0.050 0.077 0.163 0.173 0.194 0.148 0.132 28 D 0.156 0.193 0.135 0.276 0.135 0.056 0.031 0.010 0.005 0.002 0.002 29 Y 0.001 0.011 0.009 0.047 0.068 0.108 0.203 0.184 0.175 0.125 0.070 30 I 0.002 0.002 0.002 0.008 0.016 0.033 0.092 0.145 0.192 0.227 0.280 31 P 0.109 0.086 0.086 0.147 0.123 0.112 0.135 0.072 0.063 0.039 0.028 32 F 0.012 0.030 0.032 0.117 0.150 0.157 0.231 0.120 0.079 0.047 0.026 33 L 0.004 0.004 0.003 0.009 0.012 0.020 0.068 0.111 0.190 0.251 0.329 34 A 0.039 0.051 0.044 0.133 0.161 0.173 0.192 0.089 0.059 0.034 0.024 35 N 0.315 0.226 0.138 0.184 0.068 0.036 0.020 0.007 0.004 0.002 0.001 36 V 0.009 0.012 0.006 0.025 0.041 0.086 0.195 0.178 0.165 0.155 0.127 37 P 0.278 0.336 0.069 0.144 0.068 0.038 0.031 0.013 0.010 0.007 0.006 38 G 0.210 0.098 0.037 0.122 0.135 0.114 0.116 0.062 0.050 0.031 0.025 39 Q 0.139 0.162 0.073 0.221 0.164 0.101 0.077 0.030 0.017 0.009 0.006 40 L 0.002 0.012 0.013 0.090 0.168 0.239 0.247 0.112 0.067 0.032 0.018 41 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.048 0.128 0.238 0.287 0.284 42 A 0.001 0.001 0.002 0.010 0.018 0.050 0.168 0.192 0.201 0.187 0.170 43 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.008 0.043 0.111 0.233 0.321 0.275 44 A 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.019 0.086 0.157 0.222 0.247 0.257 45 I 0.001 0.001 0.002 0.004 0.005 0.010 0.045 0.107 0.218 0.323 0.283 46 V 0.001 0.003 0.004 0.027 0.058 0.082 0.169 0.199 0.217 0.148 0.093 47 T 0.013 0.044 0.031 0.136 0.147 0.156 0.192 0.130 0.085 0.042 0.022 48 C 0.019 0.026 0.021 0.081 0.134 0.156 0.196 0.144 0.112 0.072 0.039 49 D 0.174 0.262 0.081 0.227 0.119 0.062 0.043 0.016 0.009 0.004 0.002 50 G 0.336 0.127 0.040 0.128 0.103 0.084 0.075 0.042 0.031 0.021 0.013 51 N 0.183 0.237 0.084 0.191 0.124 0.074 0.057 0.023 0.014 0.007 0.005 52 V 0.024 0.048 0.024 0.094 0.111 0.136 0.199 0.133 0.109 0.074 0.049 53 Y 0.007 0.011 0.009 0.043 0.074 0.111 0.177 0.165 0.165 0.132 0.106 54 S 0.088 0.135 0.092 0.193 0.144 0.103 0.108 0.055 0.041 0.025 0.017 55 A 0.064 0.046 0.030 0.095 0.098 0.111 0.174 0.130 0.112 0.089 0.051 56 G 0.269 0.161 0.042 0.131 0.102 0.080 0.072 0.045 0.041 0.031 0.027 57 D 0.096 0.149 0.063 0.145 0.117 0.102 0.119 0.072 0.063 0.043 0.031 58 S 0.248 0.091 0.052 0.113 0.097 0.085 0.112 0.067 0.060 0.043 0.033 59 D 0.418 0.217 0.078 0.142 0.075 0.036 0.021 0.007 0.004 0.002 0.001 60 Y 0.092 0.080 0.053 0.134 0.120 0.129 0.160 0.098 0.069 0.044 0.021 61 R 0.069 0.112 0.097 0.237 0.191 0.150 0.087 0.028 0.016 0.008 0.004 62 F 0.013 0.016 0.027 0.043 0.055 0.085 0.203 0.174 0.171 0.128 0.085 63 A 0.038 0.065 0.067 0.196 0.187 0.131 0.146 0.075 0.049 0.029 0.016 64 L 0.015 0.013 0.014 0.029 0.031 0.043 0.121 0.141 0.207 0.211 0.174 65 E 0.018 0.033 0.058 0.175 0.212 0.186 0.165 0.071 0.045 0.023 0.013 66 S 0.028 0.048 0.050 0.101 0.115 0.129 0.249 0.126 0.084 0.049 0.021 67 I 0.012 0.011 0.019 0.040 0.042 0.052 0.128 0.143 0.217 0.213 0.123 68 S 0.033 0.047 0.068 0.107 0.124 0.129 0.213 0.110 0.091 0.052 0.025 69 K 0.020 0.037 0.072 0.100 0.106 0.128 0.232 0.142 0.092 0.050 0.020 70 V 0.009 0.017 0.066 0.042 0.040 0.051 0.144 0.153 0.208 0.178 0.091 71 C 0.011 0.013 0.052 0.051 0.047 0.057 0.158 0.168 0.182 0.161 0.098 72 T 0.004 0.010 0.078 0.048 0.057 0.078 0.187 0.172 0.178 0.123 0.065 73 L 0.001 0.002 0.031 0.011 0.008 0.012 0.081 0.147 0.257 0.282 0.167 74 A 0.001 0.002 0.041 0.030 0.027 0.049 0.137 0.145 0.197 0.207 0.164 75 L 0.001 0.002 0.062 0.015 0.016 0.028 0.131 0.153 0.220 0.211 0.161 76 A 0.001 0.001 0.018 0.016 0.021 0.036 0.140 0.190 0.238 0.199 0.140 77 L 0.001 0.001 0.012 0.009 0.011 0.018 0.083 0.123 0.260 0.283 0.200 78 E 0.003 0.007 0.036 0.085 0.149 0.181 0.269 0.137 0.088 0.033 0.013 79 D 0.039 0.053 0.084 0.110 0.108 0.152 0.235 0.100 0.075 0.032 0.013 80 V 0.010 0.015 0.015 0.042 0.061 0.094 0.205 0.197 0.166 0.134 0.061 81 G 0.087 0.510 0.045 0.111 0.063 0.052 0.056 0.030 0.021 0.014 0.010 82 P 0.084 0.070 0.026 0.124 0.220 0.196 0.144 0.066 0.039 0.019 0.011 83 Q 0.693 0.176 0.032 0.056 0.023 0.010 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 84 A 0.010 0.043 0.027 0.262 0.265 0.201 0.128 0.037 0.017 0.006 0.004 85 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.031 0.097 0.223 0.303 0.333 86 Q 0.002 0.005 0.017 0.094 0.216 0.283 0.233 0.086 0.040 0.015 0.008 87 D 0.032 0.083 0.629 0.183 0.046 0.017 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 88 K 0.002 0.007 0.006 0.043 0.098 0.236 0.376 0.137 0.059 0.025 0.011 89 I 0.003 0.002 0.001 0.003 0.005 0.012 0.068 0.152 0.243 0.256 0.256 90 G 0.263 0.272 0.096 0.162 0.087 0.052 0.035 0.013 0.009 0.006 0.005 91 A 0.132 0.147 0.090 0.163 0.138 0.121 0.093 0.049 0.033 0.021 0.012 92 D 0.233 0.178 0.032 0.122 0.112 0.087 0.087 0.060 0.038 0.028 0.023 93 P 0.105 0.038 0.016 0.050 0.071 0.107 0.163 0.119 0.130 0.097 0.105 94 T 0.183 0.166 0.071 0.129 0.099 0.082 0.102 0.058 0.051 0.036 0.024 95 G 0.302 0.143 0.052 0.144 0.106 0.089 0.070 0.038 0.025 0.018 0.013 96 L 0.116 0.127 0.056 0.127 0.115 0.103 0.116 0.082 0.064 0.052 0.041 97 P 0.100 0.102 0.049 0.122 0.117 0.120 0.151 0.086 0.068 0.053 0.031 98 F 0.050 0.029 0.017 0.056 0.060 0.085 0.156 0.144 0.156 0.133 0.115 99 N 0.033 0.055 0.041 0.104 0.116 0.121 0.165 0.118 0.115 0.079 0.054 100 S 0.061 0.101 0.094 0.192 0.134 0.107 0.114 0.070 0.058 0.040 0.028 101 V 0.030 0.023 0.033 0.062 0.065 0.079 0.127 0.125 0.157 0.165 0.133 102 I 0.024 0.019 0.053 0.073 0.095 0.132 0.233 0.146 0.125 0.068 0.032 103 A 0.021 0.065 0.174 0.289 0.174 0.107 0.086 0.041 0.024 0.013 0.006 104 L 0.008 0.016 0.052 0.039 0.050 0.075 0.163 0.148 0.176 0.164 0.107 105 E 0.087 0.096 0.140 0.180 0.137 0.105 0.112 0.058 0.044 0.025 0.016 106 L 0.023 0.042 0.062 0.078 0.097 0.119 0.195 0.132 0.113 0.084 0.056 107 H 0.220 0.228 0.129 0.170 0.099 0.061 0.046 0.021 0.013 0.008 0.005 108 G 0.638 0.139 0.047 0.068 0.040 0.025 0.023 0.009 0.006 0.003 0.002 109 G 0.688 0.138 0.030 0.063 0.034 0.020 0.014 0.006 0.004 0.002 0.002 110 K 0.071 0.190 0.049 0.186 0.165 0.125 0.105 0.047 0.032 0.019 0.010 111 P 0.064 0.044 0.018 0.066 0.080 0.091 0.140 0.124 0.147 0.115 0.110 112 L 0.043 0.043 0.023 0.094 0.144 0.160 0.212 0.122 0.082 0.045 0.032 113 S 0.043 0.075 0.046 0.144 0.156 0.147 0.157 0.100 0.070 0.039 0.023 114 P 0.012 0.010 0.006 0.033 0.048 0.081 0.170 0.182 0.192 0.155 0.111 115 L 0.017 0.010 0.010 0.025 0.033 0.056 0.135 0.151 0.188 0.189 0.186 116 V 0.004 0.007 0.011 0.029 0.033 0.046 0.148 0.176 0.204 0.192 0.149 117 N 0.007 0.012 0.017 0.039 0.050 0.073 0.156 0.164 0.198 0.163 0.122 118 A 0.017 0.011 0.026 0.033 0.032 0.043 0.117 0.135 0.174 0.203 0.210 119 G 0.016 0.017 0.033 0.057 0.073 0.093 0.188 0.168 0.160 0.119 0.077 120 A 0.007 0.014 0.037 0.032 0.025 0.034 0.103 0.131 0.197 0.219 0.202 121 I 0.008 0.009 0.033 0.029 0.030 0.041 0.091 0.117 0.180 0.218 0.243 122 A 0.008 0.009 0.028 0.028 0.033 0.057 0.160 0.151 0.187 0.177 0.163 123 T 0.007 0.017 0.045 0.050 0.045 0.052 0.126 0.143 0.192 0.182 0.142 124 T 0.003 0.006 0.013 0.019 0.024 0.039 0.105 0.125 0.211 0.222 0.233 125 S 0.076 0.064 0.117 0.141 0.135 0.131 0.149 0.077 0.055 0.033 0.023 126 L 0.022 0.038 0.056 0.093 0.107 0.126 0.227 0.131 0.106 0.063 0.031 127 I 0.005 0.005 0.007 0.014 0.019 0.029 0.084 0.118 0.214 0.255 0.250 128 N 0.085 0.186 0.078 0.184 0.151 0.113 0.108 0.043 0.030 0.015 0.007 129 A 0.273 0.136 0.086 0.148 0.096 0.083 0.086 0.042 0.029 0.015 0.007 130 E 0.501 0.158 0.066 0.101 0.065 0.040 0.036 0.016 0.009 0.005 0.003 131 N 0.183 0.345 0.070 0.138 0.088 0.062 0.051 0.025 0.018 0.012 0.008 132 V 0.051 0.056 0.027 0.068 0.085 0.140 0.190 0.136 0.122 0.082 0.042 133 E 0.443 0.169 0.103 0.140 0.075 0.040 0.024 0.005 0.002 0.001 0.001 134 Q 0.239 0.136 0.327 0.201 0.060 0.022 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 135 R 0.009 0.015 0.050 0.068 0.068 0.135 0.249 0.162 0.124 0.079 0.039 136 W 0.002 0.002 0.036 0.021 0.037 0.104 0.297 0.216 0.157 0.087 0.041 137 Q 0.004 0.019 0.607 0.202 0.099 0.044 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 138 R 0.001 0.015 0.142 0.174 0.217 0.225 0.147 0.048 0.020 0.009 0.003 139 I 0.001 0.001 0.004 0.001 0.002 0.005 0.043 0.099 0.249 0.305 0.291 140 L 0.001 0.001 0.018 0.025 0.064 0.171 0.390 0.162 0.094 0.052 0.023 141 H 0.003 0.024 0.648 0.187 0.086 0.031 0.014 0.004 0.002 0.001 0.001 142 I 0.001 0.003 0.030 0.026 0.041 0.081 0.240 0.177 0.175 0.134 0.092 143 Q 0.001 0.001 0.008 0.005 0.005 0.007 0.049 0.107 0.248 0.305 0.265 144 Q 0.001 0.004 0.109 0.117 0.180 0.234 0.222 0.069 0.038 0.017 0.008 145 Q 0.004 0.019 0.360 0.179 0.159 0.147 0.090 0.025 0.011 0.005 0.003 146 L 0.001 0.003 0.005 0.010 0.022 0.064 0.232 0.197 0.205 0.163 0.100 147 A 0.006 0.008 0.007 0.016 0.020 0.038 0.128 0.161 0.205 0.201 0.210 148 G 0.451 0.196 0.155 0.115 0.053 0.018 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 149 E 0.171 0.148 0.109 0.192 0.136 0.115 0.080 0.027 0.013 0.006 0.003 150 Q 0.156 0.188 0.082 0.189 0.138 0.097 0.076 0.031 0.022 0.013 0.008 151 V 0.007 0.005 0.003 0.008 0.012 0.031 0.098 0.120 0.219 0.226 0.270 152 A 0.101 0.186 0.150 0.208 0.140 0.089 0.070 0.026 0.015 0.008 0.005 153 L 0.007 0.016 0.012 0.030 0.040 0.071 0.150 0.156 0.183 0.175 0.160 154 S 0.063 0.128 0.056 0.164 0.162 0.128 0.128 0.070 0.049 0.030 0.023 155 D 0.544 0.134 0.062 0.121 0.061 0.034 0.024 0.009 0.006 0.003 0.001 156 E 0.107 0.098 0.088 0.188 0.159 0.130 0.127 0.049 0.031 0.015 0.007 157 V 0.009 0.010 0.016 0.026 0.024 0.039 0.110 0.143 0.210 0.215 0.199 158 N 0.017 0.026 0.052 0.123 0.142 0.182 0.220 0.110 0.074 0.036 0.017 159 Q 0.040 0.093 0.311 0.207 0.128 0.095 0.064 0.030 0.018 0.009 0.005 160 S 0.018 0.036 0.040 0.069 0.083 0.101 0.182 0.162 0.145 0.102 0.061 161 E 0.109 0.046 0.055 0.079 0.086 0.097 0.156 0.116 0.117 0.085 0.055 162 Q 0.081 0.080 0.121 0.185 0.167 0.129 0.127 0.053 0.031 0.017 0.010 163 T 0.067 0.112 0.182 0.186 0.143 0.111 0.099 0.044 0.030 0.017 0.009 164 T 0.115 0.070 0.052 0.121 0.116 0.122 0.169 0.097 0.070 0.046 0.022 165 N 0.306 0.151 0.064 0.119 0.107 0.091 0.080 0.035 0.027 0.014 0.007 166 F 0.048 0.044 0.053 0.075 0.087 0.121 0.200 0.135 0.112 0.078 0.047 167 H 0.012 0.026 0.028 0.078 0.124 0.160 0.232 0.128 0.107 0.065 0.039 168 N 0.017 0.022 0.042 0.034 0.031 0.048 0.147 0.151 0.205 0.176 0.125 169 R 0.009 0.016 0.037 0.123 0.171 0.189 0.196 0.112 0.077 0.046 0.025 170 A 0.005 0.007 0.048 0.023 0.019 0.026 0.105 0.148 0.229 0.219 0.171 171 I 0.001 0.001 0.014 0.013 0.013 0.018 0.078 0.137 0.237 0.276 0.213 172 A 0.001 0.001 0.027 0.015 0.017 0.035 0.141 0.133 0.202 0.225 0.205 173 W 0.001 0.001 0.050 0.028 0.037 0.083 0.224 0.171 0.176 0.143 0.086 174 L 0.001 0.001 0.011 0.010 0.013 0.028 0.149 0.197 0.250 0.213 0.129 175 L 0.001 0.001 0.005 0.004 0.004 0.007 0.034 0.083 0.198 0.308 0.356 176 Y 0.001 0.002 0.013 0.034 0.078 0.137 0.278 0.188 0.156 0.079 0.035 177 S 0.008 0.027 0.123 0.123 0.119 0.136 0.201 0.117 0.094 0.038 0.015 178 A 0.031 0.037 0.042 0.111 0.124 0.181 0.245 0.115 0.065 0.035 0.013 179 G 0.376 0.155 0.078 0.127 0.073 0.059 0.062 0.033 0.021 0.011 0.006 180 Y 0.024 0.070 0.039 0.115 0.145 0.152 0.190 0.118 0.077 0.046 0.024 181 L 0.012 0.014 0.008 0.018 0.021 0.027 0.073 0.118 0.204 0.253 0.252 182 Y 0.076 0.141 0.054 0.202 0.186 0.138 0.117 0.043 0.026 0.010 0.006 183 C 0.183 0.102 0.073 0.131 0.113 0.103 0.122 0.071 0.054 0.031 0.018 184 D 0.097 0.211 0.079 0.188 0.147 0.117 0.088 0.031 0.020 0.012 0.009 185 A 0.011 0.011 0.010 0.030 0.040 0.067 0.179 0.179 0.200 0.163 0.110 186 M 0.142 0.133 0.109 0.218 0.194 0.117 0.059 0.015 0.008 0.003 0.001 187 E 0.054 0.091 0.243 0.277 0.144 0.097 0.071 0.016 0.005 0.002 0.001 188 A 0.005 0.004 0.017 0.023 0.028 0.048 0.154 0.165 0.208 0.206 0.142 189 C 0.004 0.003 0.013 0.016 0.020 0.040 0.174 0.182 0.206 0.204 0.139 190 D 0.006 0.036 0.316 0.316 0.186 0.082 0.033 0.013 0.007 0.003 0.001 191 V 0.010 0.024 0.084 0.057 0.083 0.178 0.299 0.119 0.076 0.048 0.022 192 Y 0.008 0.009 0.034 0.041 0.035 0.036 0.129 0.182 0.235 0.190 0.101 193 T 0.022 0.037 0.061 0.075 0.095 0.131 0.276 0.129 0.090 0.056 0.028 194 R 0.027 0.051 0.251 0.237 0.166 0.093 0.073 0.042 0.031 0.019 0.009 195 Q 0.022 0.040 0.085 0.088 0.105 0.134 0.205 0.130 0.109 0.058 0.024 196 C 0.033 0.024 0.047 0.068 0.067 0.094 0.212 0.165 0.145 0.096 0.049 197 S 0.034 0.033 0.082 0.073 0.082 0.093 0.175 0.126 0.124 0.103 0.074 198 T 0.020 0.037 0.079 0.080 0.058 0.064 0.151 0.149 0.161 0.129 0.071 199 L 0.031 0.052 0.076 0.122 0.124 0.147 0.176 0.101 0.088 0.054 0.030 200 L 0.030 0.021 0.054 0.038 0.035 0.043 0.114 0.139 0.189 0.186 0.151 201 N 0.010 0.075 0.068 0.161 0.184 0.169 0.170 0.083 0.049 0.022 0.010 202 T 0.003 0.007 0.014 0.019 0.022 0.032 0.112 0.147 0.247 0.231 0.167 203 I 0.099 0.044 0.056 0.152 0.232 0.217 0.135 0.036 0.019 0.007 0.003 204 E 0.006 0.032 0.091 0.208 0.182 0.170 0.200 0.069 0.028 0.010 0.005 205 L 0.001 0.001 0.004 0.003 0.004 0.007 0.034 0.093 0.227 0.315 0.312 206 A 0.002 0.001 0.006 0.009 0.013 0.033 0.164 0.176 0.205 0.216 0.175 207 T 0.002 0.010 0.245 0.213 0.227 0.144 0.088 0.036 0.021 0.010 0.005 208 L 0.001 0.001 0.008 0.008 0.012 0.031 0.153 0.158 0.207 0.226 0.197 209 G 0.001 0.001 0.002 0.003 0.002 0.004 0.027 0.091 0.225 0.327 0.319 210 A 0.002 0.003 0.034 0.021 0.030 0.080 0.234 0.164 0.161 0.140 0.130 211 T 0.001 0.006 0.105 0.061 0.081 0.118 0.185 0.154 0.126 0.096 0.067 212 L 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.011 0.059 0.102 0.192 0.276 0.348 213 A 0.004 0.004 0.009 0.012 0.014 0.024 0.081 0.123 0.212 0.231 0.286 214 A 0.036 0.035 0.064 0.095 0.101 0.148 0.204 0.117 0.098 0.061 0.041 215 G 0.150 0.087 0.086 0.147 0.123 0.126 0.131 0.064 0.044 0.027 0.014 216 G 0.148 0.087 0.055 0.090 0.063 0.060 0.108 0.085 0.100 0.105 0.098 217 V 0.027 0.044 0.027 0.071 0.084 0.099 0.160 0.125 0.140 0.120 0.105 218 N 0.046 0.101 0.028 0.086 0.098 0.107 0.146 0.112 0.113 0.090 0.072 219 P 0.065 0.030 0.014 0.060 0.073 0.091 0.156 0.132 0.144 0.122 0.113 220 L 0.027 0.022 0.010 0.043 0.087 0.110 0.200 0.147 0.148 0.110 0.097 221 T 0.108 0.363 0.093 0.202 0.099 0.050 0.036 0.019 0.015 0.010 0.006 222 H 0.186 0.074 0.037 0.142 0.169 0.149 0.117 0.055 0.035 0.022 0.014 223 K 0.479 0.181 0.086 0.130 0.062 0.029 0.020 0.007 0.004 0.002 0.002 224 R 0.017 0.053 0.044 0.181 0.195 0.193 0.193 0.071 0.033 0.015 0.007 225 V 0.004 0.008 0.008 0.028 0.047 0.072 0.169 0.173 0.187 0.168 0.137 226 L 0.001 0.002 0.004 0.008 0.020 0.043 0.127 0.144 0.199 0.211 0.241 227 Q 0.044 0.218 0.262 0.272 0.119 0.044 0.026 0.007 0.004 0.002 0.001 228 A 0.300 0.119 0.056 0.182 0.129 0.097 0.074 0.024 0.011 0.005 0.003 229 D 0.683 0.129 0.038 0.069 0.034 0.019 0.014 0.006 0.004 0.002 0.001 230 N 0.022 0.095 0.036 0.120 0.128 0.163 0.202 0.100 0.074 0.039 0.022 231 V 0.009 0.015 0.010 0.028 0.055 0.110 0.206 0.177 0.172 0.127 0.090 232 P 0.349 0.171 0.158 0.152 0.078 0.047 0.028 0.008 0.005 0.002 0.002 233 Y 0.031 0.053 0.065 0.216 0.213 0.171 0.154 0.053 0.027 0.012 0.006 234 I 0.009 0.007 0.010 0.016 0.013 0.019 0.060 0.110 0.210 0.262 0.284 235 L 0.005 0.006 0.023 0.064 0.118 0.203 0.264 0.135 0.098 0.054 0.029 236 A 0.013 0.027 0.379 0.152 0.099 0.087 0.101 0.059 0.043 0.026 0.013 237 E 0.003 0.009 0.024 0.058 0.096 0.174 0.308 0.154 0.093 0.054 0.027 238 M 0.007 0.005 0.013 0.010 0.006 0.009 0.040 0.096 0.202 0.310 0.302 239 M 0.008 0.018 0.041 0.086 0.134 0.159 0.191 0.133 0.106 0.074 0.050 240 M 0.023 0.057 0.184 0.113 0.085 0.097 0.149 0.096 0.095 0.062 0.039 241 E 0.019 0.026 0.030 0.088 0.112 0.127 0.183 0.144 0.122 0.095 0.054 242 G 0.117 0.118 0.051 0.094 0.087 0.082 0.139 0.099 0.096 0.066 0.052 243 L 0.048 0.044 0.039 0.080 0.083 0.092 0.146 0.127 0.139 0.119 0.082 244 Y 0.017 0.025 0.016 0.060 0.087 0.121 0.201 0.145 0.144 0.103 0.080 245 G 0.107 0.109 0.073 0.146 0.123 0.107 0.119 0.082 0.065 0.040 0.028 246 R 0.193 0.135 0.072 0.167 0.129 0.108 0.089 0.042 0.032 0.021 0.013 247 S 0.030 0.055 0.020 0.053 0.048 0.057 0.125 0.133 0.177 0.166 0.136 248 G 0.124 0.077 0.033 0.117 0.135 0.161 0.151 0.082 0.057 0.035 0.028 249 D 0.173 0.168 0.124 0.221 0.129 0.080 0.057 0.022 0.013 0.008 0.006 250 W 0.007 0.013 0.016 0.053 0.066 0.101 0.210 0.185 0.171 0.113 0.065 251 A 0.014 0.006 0.009 0.018 0.019 0.025 0.063 0.103 0.190 0.247 0.306 252 Y 0.004 0.011 0.027 0.078 0.118 0.149 0.210 0.155 0.129 0.074 0.045 253 R 0.006 0.029 0.078 0.140 0.149 0.209 0.189 0.096 0.059 0.031 0.016 254 V 0.005 0.004 0.005 0.014 0.020 0.032 0.108 0.177 0.207 0.239 0.189 255 G 0.082 0.050 0.023 0.082 0.083 0.090 0.168 0.137 0.120 0.086 0.078 256 L 0.008 0.013 0.013 0.030 0.038 0.056 0.113 0.136 0.203 0.204 0.185 257 P 0.030 0.050 0.016 0.087 0.099 0.110 0.166 0.138 0.120 0.095 0.089 258 G 0.031 0.012 0.005 0.018 0.022 0.031 0.082 0.135 0.199 0.218 0.247 259 K 0.077 0.055 0.020 0.079 0.099 0.124 0.158 0.110 0.107 0.081 0.090 260 S 0.050 0.046 0.018 0.070 0.055 0.072 0.110 0.118 0.146 0.151 0.165 261 G 0.099 0.052 0.021 0.068 0.082 0.105 0.156 0.115 0.106 0.100 0.096 262 V 0.029 0.028 0.023 0.053 0.047 0.047 0.113 0.113 0.165 0.185 0.195 263 G 0.007 0.011 0.007 0.036 0.062 0.085 0.152 0.151 0.185 0.163 0.140 264 G 0.004 0.007 0.008 0.038 0.066 0.103 0.201 0.187 0.168 0.122 0.096 265 G 0.002 0.002 0.003 0.011 0.022 0.048 0.160 0.199 0.206 0.185 0.161 266 I 0.001 0.001 0.002 0.004 0.003 0.007 0.037 0.096 0.190 0.289 0.369 267 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.032 0.090 0.194 0.310 0.363 268 A 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.010 0.047 0.096 0.198 0.270 0.369 269 V 0.001 0.001 0.003 0.006 0.006 0.012 0.052 0.109 0.216 0.285 0.310 270 V 0.002 0.004 0.004 0.021 0.033 0.054 0.137 0.169 0.229 0.179 0.168 271 P 0.035 0.062 0.042 0.122 0.142 0.151 0.198 0.107 0.077 0.040 0.022 272 G 0.159 0.082 0.051 0.209 0.198 0.118 0.093 0.045 0.027 0.012 0.006 273 V 0.018 0.049 0.029 0.141 0.187 0.182 0.170 0.103 0.066 0.036 0.018 274 M 0.001 0.002 0.002 0.011 0.025 0.053 0.150 0.219 0.236 0.183 0.117 275 G 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 0.028 0.111 0.180 0.221 0.212 0.232 276 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.036 0.117 0.221 0.323 0.293 277 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.047 0.123 0.236 0.277 0.302 278 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.008 0.038 0.088 0.197 0.308 0.351 279 F 0.001 0.002 0.002 0.016 0.027 0.043 0.132 0.203 0.250 0.197 0.127 280 S 0.003 0.010 0.007 0.036 0.055 0.080 0.156 0.196 0.194 0.150 0.111 281 P 0.037 0.044 0.025 0.098 0.133 0.142 0.165 0.130 0.114 0.074 0.039 282 P 0.072 0.075 0.026 0.158 0.205 0.157 0.153 0.078 0.044 0.020 0.011 283 L 0.018 0.019 0.007 0.033 0.045 0.060 0.119 0.140 0.181 0.188 0.190 284 D 0.025 0.057 0.028 0.128 0.146 0.147 0.168 0.109 0.087 0.057 0.048 285 E 0.468 0.199 0.065 0.112 0.062 0.040 0.027 0.012 0.007 0.004 0.003 286 D 0.346 0.116 0.052 0.123 0.098 0.086 0.083 0.042 0.026 0.018 0.010 287 G 0.367 0.133 0.037 0.117 0.087 0.063 0.067 0.038 0.035 0.029 0.027 288 N 0.023 0.067 0.022 0.084 0.102 0.117 0.156 0.121 0.129 0.099 0.081 289 S 0.049 0.096 0.030 0.090 0.093 0.095 0.127 0.111 0.123 0.097 0.089 290 V 0.212 0.041 0.020 0.069 0.093 0.122 0.145 0.088 0.089 0.065 0.055 291 R 0.028 0.070 0.037 0.141 0.169 0.150 0.173 0.097 0.073 0.041 0.020 292 G 0.005 0.017 0.015 0.037 0.036 0.053 0.106 0.137 0.200 0.197 0.197 293 Q 0.022 0.017 0.037 0.062 0.077 0.117 0.184 0.134 0.144 0.119 0.086 294 K 0.016 0.034 0.097 0.172 0.161 0.176 0.201 0.081 0.038 0.016 0.008 295 M 0.001 0.001 0.009 0.011 0.012 0.019 0.088 0.158 0.220 0.248 0.233 296 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.035 0.069 0.157 0.289 0.442 297 A 0.001 0.003 0.121 0.166 0.199 0.211 0.180 0.060 0.037 0.015 0.006 298 S 0.001 0.004 0.047 0.125 0.197 0.273 0.248 0.067 0.024 0.010 0.004 299 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.036 0.096 0.223 0.321 0.317 300 A 0.001 0.001 0.004 0.007 0.013 0.029 0.159 0.212 0.260 0.194 0.122 301 K 0.009 0.024 0.537 0.252 0.115 0.043 0.014 0.004 0.001 0.001 0.001 302 Q 0.002 0.012 0.038 0.051 0.118 0.257 0.370 0.095 0.039 0.014 0.005 303 L 0.009 0.005 0.007 0.015 0.015 0.029 0.106 0.176 0.251 0.240 0.146 304 G 0.510 0.200 0.063 0.082 0.047 0.037 0.035 0.012 0.007 0.004 0.003 305 Y 0.023 0.046 0.087 0.130 0.123 0.128 0.164 0.127 0.095 0.056 0.020 306 N 0.243 0.317 0.085 0.118 0.085 0.059 0.046 0.022 0.012 0.008 0.005 307 V 0.086 0.071 0.068 0.164 0.144 0.128 0.143 0.076 0.060 0.036 0.024 308 F 0.059 0.030 0.022 0.034 0.045 0.065 0.143 0.144 0.182 0.163 0.112 309 K 0.141 0.235 0.115 0.248 0.135 0.060 0.034 0.015 0.010 0.004 0.002 310 G 0.497 0.152 0.038 0.078 0.060 0.049 0.048 0.031 0.022 0.016 0.009