# TARGET T0251 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0251.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 8 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.345 0.004 0.003 0.012 0.109 0.527 2 V 0.749 0.015 0.002 0.010 0.048 0.175 3 V 0.848 0.013 0.002 0.012 0.050 0.076 4 Y 0.662 0.005 0.003 0.027 0.141 0.162 5 G 0.332 0.006 0.009 0.049 0.289 0.317 6 A 0.370 0.017 0.028 0.099 0.250 0.235 7 D 0.568 0.027 0.025 0.060 0.134 0.186 8 V 0.664 0.024 0.024 0.047 0.139 0.100 9 I 0.622 0.035 0.019 0.047 0.160 0.117 10 C 0.406 0.023 0.038 0.070 0.293 0.170 11 A 0.312 0.009 0.063 0.096 0.388 0.132 12 S 0.255 0.018 0.087 0.153 0.309 0.178 13 C 0.180 0.050 0.064 0.105 0.480 0.121 14 V 0.108 0.008 0.034 0.057 0.548 0.245 15 N 0.042 0.012 0.014 0.018 0.501 0.414 16 A 0.040 0.031 0.008 0.015 0.486 0.420 17 P 0.023 0.015 0.018 0.026 0.378 0.539 18 T 0.034 0.025 0.059 0.065 0.439 0.379 19 S 0.019 0.006 0.181 0.205 0.371 0.218 20 K 0.010 0.008 0.209 0.486 0.181 0.105 21 D 0.006 0.006 0.133 0.690 0.102 0.062 22 I 0.008 0.010 0.048 0.799 0.046 0.089 23 Y 0.001 0.001 0.008 0.978 0.007 0.007 24 D 0.001 0.001 0.004 0.982 0.006 0.007 25 W 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 26 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 27 Q 0.001 0.001 0.001 0.990 0.007 0.002 28 P 0.001 0.001 0.002 0.985 0.010 0.003 29 L 0.001 0.001 0.002 0.978 0.014 0.007 30 L 0.001 0.002 0.005 0.958 0.019 0.016 31 K 0.003 0.001 0.008 0.744 0.094 0.150 32 R 0.009 0.003 0.019 0.558 0.157 0.254 33 K 0.027 0.043 0.019 0.451 0.170 0.290 34 Y 0.026 0.017 0.032 0.166 0.575 0.184 35 P 0.011 0.004 0.022 0.046 0.758 0.160 36 N 0.009 0.003 0.020 0.014 0.797 0.158 37 I 0.088 0.050 0.010 0.004 0.633 0.214 38 S 0.086 0.006 0.001 0.001 0.139 0.767 39 F 0.429 0.007 0.001 0.001 0.072 0.491 40 K 0.777 0.002 0.001 0.001 0.018 0.203 41 Y 0.945 0.005 0.001 0.001 0.003 0.047 42 T 0.959 0.001 0.001 0.001 0.004 0.036 43 Y 0.963 0.001 0.001 0.001 0.004 0.031 44 I 0.941 0.002 0.001 0.001 0.010 0.046 45 D 0.757 0.017 0.001 0.001 0.074 0.150 46 I 0.336 0.021 0.009 0.003 0.265 0.366 47 T 0.092 0.026 0.016 0.005 0.491 0.371 48 K 0.037 0.016 0.019 0.012 0.593 0.322 49 D 0.021 0.009 0.041 0.043 0.510 0.376 50 N 0.016 0.018 0.107 0.133 0.520 0.207 51 D 0.007 0.004 0.141 0.180 0.517 0.152 52 N 0.007 0.011 0.096 0.232 0.481 0.173 53 L 0.006 0.011 0.052 0.305 0.394 0.231 54 T 0.008 0.013 0.028 0.316 0.303 0.332 55 D 0.007 0.009 0.043 0.461 0.234 0.246 56 H 0.006 0.008 0.046 0.629 0.146 0.166 57 D 0.005 0.002 0.017 0.818 0.048 0.110 58 L 0.001 0.001 0.004 0.969 0.009 0.018 59 Q 0.001 0.001 0.003 0.984 0.005 0.007 60 F 0.001 0.001 0.002 0.993 0.002 0.002 61 I 0.001 0.001 0.003 0.993 0.002 0.002 62 E 0.001 0.001 0.005 0.990 0.003 0.002 63 R 0.001 0.001 0.010 0.982 0.005 0.003 64 I 0.001 0.001 0.009 0.973 0.010 0.007 65 E 0.002 0.001 0.023 0.939 0.022 0.013 66 Q 0.007 0.002 0.028 0.758 0.104 0.101 67 D 0.018 0.003 0.083 0.415 0.242 0.240 68 E 0.094 0.016 0.091 0.254 0.311 0.235 69 L 0.209 0.028 0.073 0.126 0.332 0.232 70 F 0.280 0.019 0.037 0.059 0.313 0.292 71 Y 0.248 0.008 0.022 0.035 0.389 0.297 72 P 0.346 0.004 0.021 0.021 0.228 0.380 73 L 0.813 0.011 0.010 0.012 0.071 0.083 74 I 0.936 0.004 0.003 0.005 0.026 0.026 75 T 0.898 0.009 0.002 0.004 0.066 0.021 76 M 0.784 0.018 0.001 0.004 0.144 0.050 77 N 0.075 0.001 0.002 0.009 0.781 0.132 78 D 0.047 0.003 0.015 0.160 0.704 0.072 79 E 0.299 0.026 0.014 0.328 0.283 0.050 80 Y 0.239 0.027 0.026 0.471 0.203 0.035 81 V 0.120 0.008 0.030 0.614 0.174 0.053 82 A 0.063 0.017 0.068 0.609 0.203 0.040 83 D 0.038 0.002 0.022 0.474 0.302 0.161 84 G 0.017 0.006 0.007 0.132 0.191 0.647 85 Y 0.024 0.020 0.009 0.290 0.152 0.505 86 I 0.028 0.006 0.045 0.483 0.211 0.226 87 Q 0.030 0.017 0.067 0.641 0.122 0.123 88 T 0.017 0.002 0.034 0.899 0.034 0.014 89 K 0.006 0.001 0.011 0.950 0.024 0.008 90 Q 0.005 0.001 0.006 0.968 0.015 0.006 91 I 0.006 0.001 0.004 0.972 0.010 0.007 92 T 0.008 0.001 0.003 0.965 0.010 0.013 93 R 0.009 0.001 0.006 0.954 0.012 0.018 94 F 0.006 0.001 0.007 0.956 0.012 0.017 95 I 0.009 0.001 0.006 0.949 0.016 0.019 96 D 0.006 0.001 0.021 0.917 0.032 0.023 97 Q 0.003 0.001 0.024 0.884 0.057 0.032 98 K 0.006 0.001 0.027 0.771 0.099 0.095 99 L 0.012 0.012 0.031 0.614 0.143 0.188 100 V 0.012 0.013 0.018 0.442 0.137 0.378 101 N 0.005 0.004 0.009 0.238 0.090 0.654 102 E 0.001 0.001 0.001 0.009 0.018 0.971