# TARGET T0248 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0248.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 10 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.085 0.069 0.051 0.089 0.077 0.088 0.137 0.115 0.125 0.097 0.067 2 I 0.047 0.030 0.020 0.049 0.054 0.067 0.132 0.133 0.168 0.155 0.146 3 N 0.142 0.146 0.075 0.136 0.125 0.103 0.105 0.067 0.052 0.031 0.018 4 K 0.147 0.260 0.068 0.149 0.111 0.091 0.082 0.043 0.027 0.016 0.007 5 P 0.231 0.084 0.043 0.108 0.121 0.119 0.115 0.067 0.054 0.036 0.022 6 N 0.369 0.155 0.088 0.145 0.092 0.060 0.050 0.020 0.012 0.006 0.003 7 Q 0.028 0.081 0.092 0.238 0.196 0.153 0.125 0.048 0.024 0.010 0.005 8 F 0.008 0.007 0.012 0.016 0.017 0.028 0.116 0.179 0.220 0.230 0.166 9 V 0.010 0.013 0.048 0.128 0.187 0.222 0.204 0.090 0.054 0.029 0.015 10 N 0.015 0.042 0.271 0.165 0.122 0.098 0.117 0.068 0.052 0.033 0.017 11 H 0.001 0.011 0.023 0.070 0.088 0.146 0.259 0.163 0.115 0.083 0.043 12 L 0.002 0.004 0.021 0.011 0.015 0.026 0.129 0.160 0.241 0.226 0.165 13 S 0.099 0.077 0.394 0.255 0.107 0.040 0.020 0.005 0.002 0.001 0.001 14 A 0.009 0.039 0.196 0.194 0.175 0.162 0.157 0.042 0.018 0.006 0.002 15 L 0.002 0.003 0.040 0.012 0.010 0.018 0.081 0.122 0.236 0.265 0.211 16 K 0.005 0.006 0.061 0.113 0.159 0.212 0.298 0.091 0.040 0.013 0.004 17 K 0.012 0.032 0.746 0.131 0.052 0.018 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 18 H 0.004 0.012 0.041 0.049 0.082 0.213 0.360 0.133 0.064 0.032 0.010 19 F 0.020 0.022 0.086 0.055 0.047 0.068 0.226 0.178 0.154 0.096 0.048 20 A 0.064 0.108 0.551 0.124 0.074 0.036 0.027 0.009 0.004 0.002 0.001 21 S 0.068 0.235 0.349 0.190 0.084 0.041 0.022 0.006 0.003 0.001 0.001 22 Y 0.011 0.020 0.055 0.043 0.070 0.127 0.268 0.144 0.140 0.081 0.042 23 K 0.455 0.122 0.277 0.090 0.031 0.013 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 24 E 0.028 0.057 0.404 0.273 0.143 0.062 0.026 0.005 0.001 0.001 0.001 25 L 0.005 0.009 0.080 0.020 0.025 0.065 0.203 0.178 0.192 0.149 0.076 26 R 0.009 0.018 0.258 0.218 0.176 0.141 0.126 0.033 0.014 0.004 0.001 27 E 0.019 0.026 0.886 0.051 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 28 A 0.015 0.024 0.209 0.098 0.121 0.192 0.221 0.064 0.031 0.016 0.007 29 F 0.004 0.008 0.073 0.022 0.030 0.067 0.266 0.187 0.174 0.115 0.054 30 N 0.013 0.041 0.505 0.173 0.135 0.071 0.043 0.012 0.005 0.002 0.001 31 D 0.101 0.102 0.695 0.069 0.024 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 32 Y 0.017 0.025 0.064 0.053 0.085 0.120 0.273 0.133 0.121 0.076 0.033 33 H 0.039 0.051 0.078 0.089 0.109 0.140 0.234 0.110 0.082 0.046 0.021 34 K 0.148 0.145 0.337 0.167 0.097 0.051 0.036 0.011 0.005 0.002 0.001 35 H 0.229 0.177 0.213 0.137 0.093 0.064 0.050 0.019 0.009 0.005 0.002 36 N 0.203 0.388 0.074 0.109 0.064 0.053 0.049 0.025 0.017 0.013 0.007 37 G 0.398 0.193 0.049 0.133 0.111 0.066 0.034 0.010 0.005 0.002 0.001 38 D 0.639 0.170 0.076 0.066 0.025 0.012 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 39 E 0.020 0.062 0.094 0.249 0.202 0.163 0.146 0.041 0.016 0.005 0.002 40 L 0.003 0.003 0.007 0.011 0.017 0.044 0.170 0.226 0.235 0.178 0.105 41 T 0.005 0.016 0.090 0.216 0.259 0.237 0.121 0.037 0.014 0.005 0.001 42 T 0.028 0.071 0.487 0.250 0.094 0.044 0.019 0.005 0.002 0.001 0.001 43 F 0.001 0.002 0.010 0.016 0.033 0.079 0.271 0.221 0.183 0.122 0.063 44 F 0.001 0.001 0.016 0.008 0.010 0.022 0.156 0.208 0.235 0.207 0.135 45 L 0.003 0.015 0.303 0.256 0.222 0.123 0.057 0.013 0.005 0.002 0.001 46 H 0.023 0.045 0.563 0.180 0.096 0.054 0.031 0.006 0.002 0.001 0.001 47 Q 0.001 0.001 0.012 0.008 0.010 0.028 0.186 0.207 0.249 0.198 0.101 48 F 0.001 0.001 0.014 0.006 0.012 0.040 0.258 0.218 0.193 0.154 0.105 49 D 0.004 0.014 0.748 0.155 0.052 0.018 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 50 K 0.001 0.010 0.134 0.156 0.245 0.260 0.158 0.026 0.006 0.002 0.001 51 V 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.003 0.039 0.091 0.262 0.327 0.266 52 M 0.001 0.001 0.027 0.057 0.145 0.252 0.383 0.089 0.033 0.011 0.003 53 E 0.004 0.013 0.898 0.065 0.016 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 54 L 0.001 0.003 0.025 0.026 0.076 0.255 0.461 0.104 0.034 0.012 0.003 55 V 0.001 0.001 0.010 0.003 0.004 0.010 0.103 0.167 0.282 0.248 0.172 56 K 0.014 0.061 0.592 0.186 0.098 0.032 0.014 0.003 0.001 0.001 0.001 57 Q 0.069 0.106 0.648 0.127 0.038 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 58 K 0.272 0.093 0.119 0.088 0.091 0.107 0.144 0.050 0.022 0.010 0.005 59 D 0.171 0.390 0.162 0.124 0.059 0.047 0.032 0.007 0.004 0.002 0.001 60 F 0.003 0.012 0.042 0.037 0.071 0.152 0.289 0.159 0.128 0.072 0.036 61 K 0.383 0.156 0.290 0.122 0.032 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 62 T 0.082 0.138 0.338 0.246 0.119 0.051 0.022 0.003 0.001 0.001 0.001 63 A 0.003 0.004 0.028 0.015 0.014 0.039 0.158 0.181 0.231 0.204 0.124 64 Q 0.001 0.002 0.030 0.052 0.137 0.283 0.348 0.094 0.036 0.013 0.004 65 S 0.008 0.022 0.894 0.057 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 66 R 0.001 0.009 0.041 0.120 0.212 0.310 0.218 0.056 0.020 0.010 0.003 67 C 0.001 0.003 0.016 0.003 0.004 0.006 0.048 0.110 0.258 0.298 0.251 68 E 0.011 0.028 0.261 0.227 0.242 0.134 0.073 0.015 0.005 0.001 0.001 69 E 0.029 0.055 0.779 0.097 0.028 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 70 E 0.004 0.008 0.024 0.031 0.056 0.115 0.336 0.194 0.135 0.065 0.032 71 L 0.012 0.004 0.014 0.010 0.012 0.028 0.142 0.166 0.230 0.209 0.174 72 A 0.082 0.136 0.344 0.198 0.118 0.063 0.033 0.012 0.007 0.004 0.002 73 A 0.025 0.065 0.083 0.128 0.137 0.165 0.179 0.106 0.064 0.036 0.012 74 P 0.211 0.096 0.042 0.071 0.082 0.079 0.135 0.108 0.083 0.061 0.032 75 Y 0.047 0.041 0.028 0.076 0.099 0.117 0.219 0.126 0.114 0.079 0.054 76 L 0.022 0.034 0.025 0.053 0.065 0.072 0.145 0.154 0.180 0.157 0.093 77 P 0.106 0.124 0.057 0.145 0.125 0.123 0.131 0.078 0.059 0.032 0.019 78 K 0.387 0.172 0.080 0.116 0.086 0.061 0.052 0.024 0.013 0.005 0.002 79 P 0.425 0.249 0.056 0.126 0.068 0.038 0.022 0.009 0.004 0.002 0.001 80 L 0.007 0.023 0.021 0.046 0.044 0.075 0.168 0.167 0.190 0.156 0.105 81 V 0.015 0.023 0.048 0.128 0.169 0.199 0.227 0.095 0.061 0.024 0.010 82 S 0.131 0.114 0.432 0.215 0.064 0.025 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 83 F 0.001 0.003 0.024 0.051 0.072 0.153 0.321 0.193 0.109 0.054 0.019 84 F 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.009 0.075 0.141 0.238 0.277 0.253 85 Q 0.001 0.004 0.179 0.268 0.248 0.174 0.086 0.023 0.010 0.004 0.001 86 S 0.001 0.009 0.172 0.221 0.252 0.204 0.106 0.025 0.008 0.003 0.001 87 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.044 0.104 0.253 0.321 0.270 88 L 0.001 0.001 0.005 0.012 0.033 0.076 0.328 0.237 0.171 0.097 0.039 89 Q 0.002 0.014 0.590 0.205 0.112 0.046 0.020 0.007 0.003 0.001 0.001 90 L 0.001 0.007 0.031 0.047 0.110 0.261 0.391 0.100 0.035 0.014 0.004 91 V 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.004 0.034 0.102 0.235 0.334 0.284 92 N 0.017 0.078 0.074 0.184 0.226 0.183 0.152 0.051 0.022 0.009 0.005 93 H 0.202 0.149 0.398 0.172 0.052 0.018 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 94 D 0.374 0.163 0.110 0.138 0.084 0.061 0.050 0.012 0.005 0.002 0.001 95 L 0.008 0.010 0.013 0.019 0.022 0.052 0.172 0.177 0.220 0.175 0.131 96 L 0.014 0.038 0.115 0.104 0.125 0.175 0.223 0.099 0.062 0.031 0.013 97 E 0.066 0.073 0.533 0.183 0.073 0.039 0.023 0.006 0.003 0.001 0.001 98 Q 0.099 0.068 0.349 0.159 0.118 0.097 0.072 0.021 0.009 0.004 0.002 99 Q 0.019 0.029 0.084 0.064 0.065 0.116 0.200 0.132 0.130 0.101 0.058 100 N 0.012 0.029 0.149 0.125 0.146 0.171 0.205 0.084 0.048 0.023 0.008 101 A 0.064 0.057 0.770 0.072 0.024 0.008 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 102 A 0.045 0.060 0.416 0.175 0.124 0.090 0.065 0.015 0.007 0.003 0.002 103 L 0.005 0.006 0.028 0.018 0.030 0.060 0.198 0.171 0.216 0.161 0.107 104 A 0.041 0.040 0.263 0.164 0.153 0.147 0.124 0.039 0.019 0.008 0.003 105 S 0.123 0.120 0.609 0.099 0.031 0.011 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 106 L 0.002 0.005 0.010 0.015 0.033 0.079 0.220 0.197 0.190 0.158 0.091 107 P 0.206 0.419 0.097 0.101 0.060 0.043 0.034 0.014 0.011 0.008 0.006 108 A 0.081 0.070 0.082 0.146 0.179 0.186 0.157 0.051 0.030 0.013 0.006 109 A 0.334 0.222 0.123 0.145 0.082 0.043 0.032 0.010 0.006 0.002 0.001 110 K 0.060 0.117 0.122 0.378 0.180 0.087 0.041 0.009 0.004 0.001 0.001 111 I 0.003 0.003 0.006 0.009 0.014 0.027 0.097 0.153 0.233 0.255 0.201 112 I 0.001 0.002 0.010 0.021 0.042 0.109 0.274 0.209 0.164 0.105 0.063 113 E 0.002 0.018 0.171 0.280 0.189 0.134 0.103 0.048 0.032 0.017 0.006 114 L 0.002 0.006 0.023 0.032 0.057 0.146 0.290 0.185 0.128 0.087 0.044 115 V 0.003 0.006 0.015 0.024 0.026 0.033 0.123 0.181 0.246 0.214 0.130 116 L 0.002 0.004 0.010 0.016 0.025 0.044 0.154 0.160 0.214 0.214 0.158 117 Q 0.019 0.069 0.186 0.270 0.212 0.117 0.075 0.029 0.014 0.005 0.002 118 D 0.134 0.168 0.101 0.156 0.126 0.107 0.107 0.051 0.029 0.015 0.006 119 Y 0.062 0.070 0.027 0.090 0.102 0.126 0.183 0.128 0.100 0.070 0.041 120 P 0.410 0.206 0.062 0.120 0.078 0.050 0.039 0.016 0.010 0.006 0.004 121 N 0.272 0.155 0.071 0.146 0.114 0.085 0.072 0.036 0.026 0.015 0.008 122 K 0.058 0.129 0.059 0.166 0.131 0.120 0.139 0.079 0.062 0.036 0.021 123 L 0.013 0.013 0.014 0.047 0.079 0.134 0.207 0.156 0.155 0.109 0.074 124 N 0.043 0.077 0.113 0.203 0.175 0.150 0.133 0.054 0.031 0.015 0.008 125 M 0.001 0.004 0.008 0.030 0.042 0.073 0.188 0.193 0.206 0.160 0.094 126 I 0.001 0.001 0.002 0.005 0.006 0.012 0.056 0.106 0.204 0.290 0.317 127 H 0.005 0.009 0.038 0.106 0.121 0.165 0.201 0.134 0.111 0.072 0.038 128 Y 0.001 0.005 0.036 0.048 0.066 0.101 0.224 0.189 0.172 0.110 0.049 129 L 0.001 0.001 0.003 0.007 0.008 0.015 0.063 0.114 0.213 0.296 0.280 130 L 0.002 0.003 0.006 0.027 0.051 0.095 0.238 0.200 0.214 0.116 0.048 131 P 0.079 0.114 0.184 0.242 0.149 0.103 0.070 0.031 0.019 0.007 0.003 132 K 0.029 0.035 0.033 0.081 0.097 0.159 0.245 0.143 0.095 0.059 0.024 133 T 0.118 0.092 0.062 0.132 0.102 0.096 0.137 0.100 0.078 0.050 0.032 134 K 0.087 0.097 0.096 0.228 0.179 0.131 0.093 0.046 0.025 0.012 0.005 135 A 0.114 0.115 0.142 0.190 0.144 0.119 0.092 0.043 0.025 0.012 0.005 136 F 0.009 0.014 0.017 0.049 0.064 0.094 0.206 0.189 0.173 0.118 0.067 137 V 0.006 0.010 0.009 0.023 0.038 0.063 0.153 0.170 0.210 0.189 0.129 138 K 0.043 0.164 0.099 0.247 0.183 0.111 0.080 0.034 0.023 0.011 0.006 139 P 0.017 0.010 0.010 0.027 0.039 0.066 0.161 0.161 0.215 0.163 0.132 140 H 0.309 0.201 0.091 0.184 0.110 0.053 0.032 0.011 0.005 0.003 0.002 141 L 0.013 0.075 0.038 0.154 0.134 0.153 0.198 0.107 0.070 0.040 0.018 142 L 0.004 0.005 0.011 0.019 0.035 0.068 0.153 0.159 0.214 0.171 0.161 143 Q 0.286 0.142 0.254 0.195 0.071 0.029 0.017 0.004 0.001 0.001 0.001 144 R 0.007 0.043 0.082 0.228 0.216 0.189 0.164 0.044 0.017 0.007 0.003 145 L 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.011 0.059 0.108 0.214 0.269 0.326 146 Q 0.033 0.041 0.137 0.273 0.226 0.152 0.098 0.025 0.010 0.004 0.002 147 F 0.007 0.041 0.348 0.230 0.151 0.115 0.072 0.022 0.010 0.004 0.001 148 V 0.001 0.002 0.010 0.015 0.027 0.065 0.233 0.201 0.190 0.158 0.097 149 L 0.001 0.002 0.007 0.007 0.012 0.029 0.160 0.183 0.231 0.211 0.159 150 T 0.007 0.082 0.316 0.203 0.155 0.091 0.075 0.034 0.020 0.012 0.006 151 D 0.131 0.155 0.195 0.234 0.140 0.081 0.044 0.012 0.005 0.002 0.001 152 S 0.466 0.135 0.125 0.102 0.068 0.041 0.039 0.013 0.007 0.002 0.001 153 E 0.193 0.132 0.169 0.220 0.110 0.078 0.063 0.018 0.010 0.004 0.003 154 L 0.017 0.023 0.061 0.057 0.065 0.104 0.202 0.146 0.143 0.112 0.069 155 L 0.040 0.059 0.251 0.141 0.113 0.136 0.145 0.061 0.033 0.015 0.006 156 E 0.106 0.118 0.418 0.175 0.085 0.050 0.031 0.009 0.005 0.002 0.001 157 L 0.071 0.047 0.121 0.106 0.104 0.117 0.172 0.099 0.080 0.055 0.030 158 K 0.058 0.135 0.149 0.157 0.122 0.119 0.117 0.058 0.046 0.026 0.012 159 R 0.003 0.013 0.035 0.038 0.064 0.120 0.257 0.174 0.152 0.096 0.048 160 F 0.025 0.047 0.146 0.186 0.207 0.168 0.122 0.050 0.030 0.014 0.005 161 S 0.017 0.061 0.112 0.206 0.204 0.164 0.148 0.051 0.024 0.009 0.004 162 F 0.001 0.002 0.008 0.011 0.011 0.014 0.070 0.136 0.268 0.275 0.205 163 F 0.001 0.001 0.010 0.015 0.030 0.073 0.216 0.180 0.195 0.163 0.115 164 Q 0.003 0.014 0.458 0.272 0.140 0.062 0.031 0.011 0.005 0.002 0.001 165 A 0.001 0.001 0.015 0.018 0.046 0.140 0.361 0.199 0.122 0.070 0.027 166 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.006 0.045 0.110 0.247 0.321 0.263 167 N 0.014 0.028 0.094 0.143 0.202 0.193 0.199 0.076 0.034 0.012 0.005 168 Q 0.109 0.156 0.336 0.215 0.099 0.052 0.024 0.006 0.002 0.001 0.001 169 I 0.010 0.022 0.013 0.044 0.068 0.110 0.250 0.202 0.147 0.099 0.035 170 P 0.643 0.179 0.033 0.051 0.027 0.020 0.018 0.010 0.008 0.005 0.004 171 G 0.245 0.117 0.056 0.133 0.124 0.101 0.108 0.051 0.035 0.020 0.011 172 F 0.032 0.017 0.007 0.024 0.030 0.050 0.124 0.154 0.208 0.205 0.150 173 Q 0.088 0.168 0.087 0.251 0.171 0.107 0.072 0.028 0.016 0.008 0.005 174 G 0.309 0.141 0.082 0.129 0.094 0.074 0.066 0.042 0.029 0.018 0.014 175 E 0.175 0.125 0.062 0.159 0.136 0.116 0.117 0.058 0.027 0.017 0.008 176 Q 0.108 0.309 0.091 0.257 0.133 0.061 0.030 0.006 0.003 0.001 0.001 177 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.012 0.052 0.106 0.240 0.273 0.305 178 E 0.186 0.208 0.167 0.302 0.099 0.027 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 179 Y 0.003 0.012 0.015 0.050 0.086 0.129 0.273 0.188 0.145 0.069 0.030 180 F 0.001 0.004 0.005 0.023 0.029 0.066 0.149 0.170 0.197 0.182 0.174 181 N 0.005 0.016 0.017 0.101 0.188 0.216 0.241 0.112 0.069 0.026 0.009 182 S 0.183 0.126 0.269 0.213 0.084 0.051 0.041 0.017 0.010 0.004 0.002 183 K 0.096 0.125 0.108 0.253 0.171 0.118 0.087 0.025 0.012 0.005 0.002 184 L 0.006 0.005 0.005 0.011 0.011 0.023 0.094 0.146 0.225 0.247 0.227 185 K 0.025 0.093 0.139 0.339 0.240 0.111 0.038 0.010 0.004 0.001 0.001 186 Q 0.022 0.040 0.140 0.129 0.118 0.143 0.179 0.103 0.072 0.035 0.017 187 K 0.033 0.079 0.074 0.291 0.238 0.145 0.086 0.033 0.013 0.005 0.002 188 F 0.004 0.004 0.004 0.010 0.018 0.039 0.147 0.204 0.249 0.203 0.118 189 T 0.027 0.074 0.103 0.359 0.255 0.109 0.051 0.014 0.006 0.002 0.001 190 L 0.002 0.004 0.008 0.015 0.025 0.048 0.140 0.173 0.250 0.220 0.115 191 T 0.056 0.164 0.082 0.327 0.195 0.080 0.060 0.020 0.011 0.004 0.002 192 L 0.009 0.005 0.003 0.009 0.014 0.027 0.110 0.177 0.251 0.235 0.162 193 G 0.242 0.333 0.084 0.178 0.089 0.044 0.019 0.006 0.003 0.002 0.001 194 E 0.169 0.223 0.079 0.272 0.139 0.067 0.032 0.011 0.006 0.002 0.001 195 F 0.018 0.010 0.004 0.015 0.026 0.046 0.124 0.152 0.235 0.206 0.165 196 E 0.107 0.295 0.207 0.259 0.093 0.027 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 197 I 0.017 0.015 0.008 0.026 0.035 0.047 0.142 0.181 0.195 0.197 0.137 198 A 0.081 0.086 0.082 0.190 0.170 0.136 0.121 0.054 0.039 0.025 0.018 199 Q 0.071 0.105 0.086 0.181 0.126 0.113 0.140 0.073 0.058 0.032 0.016 200 Q 0.074 0.100 0.066 0.170 0.130 0.134 0.143 0.076 0.056 0.034 0.016 201 P 0.394 0.101 0.073 0.077 0.062 0.056 0.071 0.052 0.050 0.039 0.024 202 D 0.338 0.335 0.073 0.119 0.058 0.031 0.026 0.009 0.007 0.003 0.002 203 A 0.039 0.051 0.027 0.072 0.082 0.123 0.189 0.147 0.134 0.088 0.048 204 K 0.061 0.103 0.089 0.297 0.235 0.128 0.061 0.016 0.008 0.002 0.001 205 A 0.059 0.096 0.221 0.223 0.157 0.122 0.082 0.026 0.011 0.003 0.001 206 Y 0.001 0.003 0.006 0.026 0.040 0.083 0.215 0.241 0.202 0.127 0.056 207 F 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.024 0.138 0.203 0.238 0.216 0.164 208 E 0.006 0.022 0.442 0.318 0.143 0.048 0.016 0.004 0.001 0.001 0.001 209 Q 0.002 0.016 0.109 0.188 0.224 0.240 0.170 0.035 0.011 0.003 0.001 210 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.041 0.104 0.235 0.325 0.289 211 I 0.001 0.001 0.007 0.023 0.075 0.197 0.439 0.160 0.068 0.023 0.007 212 T 0.017 0.035 0.781 0.133 0.025 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 213 Q 0.001 0.002 0.011 0.030 0.077 0.246 0.461 0.116 0.037 0.014 0.004 214 I 0.001 0.001 0.008 0.002 0.001 0.003 0.032 0.096 0.240 0.324 0.293 215 Q 0.001 0.006 0.150 0.207 0.260 0.203 0.122 0.033 0.011 0.004 0.001 216 Q 0.007 0.025 0.704 0.154 0.067 0.030 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 217 L 0.004 0.009 0.029 0.036 0.070 0.158 0.379 0.169 0.092 0.039 0.015 218 F 0.023 0.020 0.049 0.041 0.041 0.066 0.230 0.191 0.173 0.113 0.052 219 L 0.020 0.061 0.204 0.164 0.172 0.118 0.110 0.063 0.041 0.029 0.016 220 K 0.055 0.118 0.192 0.172 0.143 0.107 0.099 0.053 0.036 0.018 0.006 221 E 0.186 0.113 0.059 0.103 0.107 0.102 0.141 0.081 0.062 0.033 0.014 222 P 0.131 0.077 0.051 0.091 0.092 0.100 0.161 0.108 0.097 0.060 0.032 223 V 0.076 0.122 0.059 0.116 0.110 0.103 0.117 0.097 0.092 0.069 0.040 224 N 0.016 0.097 0.053 0.141 0.134 0.153 0.166 0.104 0.074 0.041 0.021 225 A 0.081 0.047 0.061 0.102 0.131 0.159 0.199 0.101 0.073 0.032 0.014 226 E 0.187 0.111 0.147 0.265 0.141 0.074 0.049 0.016 0.007 0.002 0.001 227 F 0.001 0.007 0.030 0.058 0.060 0.082 0.197 0.191 0.177 0.120 0.076 228 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.011 0.076 0.135 0.233 0.276 0.261 229 N 0.001 0.005 0.158 0.199 0.218 0.226 0.136 0.032 0.016 0.006 0.002 230 E 0.001 0.005 0.080 0.161 0.212 0.238 0.217 0.058 0.019 0.007 0.002 231 I 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.004 0.044 0.099 0.221 0.307 0.320 232 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.012 0.123 0.194 0.247 0.259 0.153 233 D 0.001 0.006 0.247 0.241 0.245 0.142 0.070 0.027 0.014 0.006 0.002 234 A 0.002 0.007 0.045 0.045 0.078 0.220 0.388 0.117 0.058 0.029 0.012 235 F 0.001 0.001 0.005 0.007 0.006 0.011 0.083 0.179 0.312 0.273 0.122 236 L 0.001 0.004 0.009 0.013 0.014 0.031 0.133 0.174 0.206 0.229 0.185 237 V 0.002 0.014 0.120 0.141 0.183 0.135 0.147 0.110 0.086 0.045 0.018 238 S 0.030 0.063 0.107 0.122 0.119 0.154 0.197 0.100 0.067 0.029 0.011 239 Y 0.007 0.012 0.014 0.046 0.058 0.074 0.196 0.223 0.219 0.115 0.035 240 F 0.013 0.023 0.011 0.044 0.065 0.097 0.221 0.192 0.176 0.105 0.054 241 P 0.167 0.156 0.097 0.166 0.125 0.086 0.086 0.050 0.039 0.019 0.009 242 L 0.162 0.075 0.032 0.123 0.126 0.114 0.147 0.104 0.069 0.034 0.013 243 H 0.075 0.093 0.016 0.099 0.141 0.134 0.179 0.130 0.083 0.038 0.013 244 P 0.411 0.164 0.042 0.097 0.069 0.058 0.061 0.043 0.031 0.019 0.007 245 P 0.474 0.109 0.026 0.106 0.080 0.067 0.071 0.032 0.021 0.010 0.004 246 V 0.094 0.067 0.021 0.062 0.071 0.084 0.168 0.181 0.138 0.084 0.031 247 P 0.132 0.541 0.077 0.134 0.057 0.029 0.016 0.007 0.004 0.002 0.001 248 L 0.034 0.039 0.035 0.115 0.157 0.215 0.188 0.110 0.063 0.032 0.012 249 A 0.496 0.169 0.075 0.100 0.075 0.044 0.029 0.008 0.004 0.001 0.001 250 Q 0.025 0.068 0.152 0.450 0.188 0.072 0.035 0.007 0.002 0.001 0.001 251 L 0.002 0.005 0.021 0.015 0.016 0.027 0.109 0.159 0.219 0.246 0.182 252 A 0.001 0.001 0.021 0.019 0.038 0.101 0.338 0.212 0.137 0.086 0.047 253 A 0.001 0.011 0.559 0.259 0.111 0.038 0.014 0.003 0.002 0.001 0.001 254 K 0.001 0.008 0.048 0.080 0.146 0.291 0.318 0.075 0.021 0.009 0.003 255 I 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.002 0.025 0.077 0.261 0.354 0.274 256 Y 0.001 0.001 0.014 0.016 0.046 0.128 0.422 0.184 0.101 0.058 0.030 257 E 0.010 0.029 0.711 0.187 0.048 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 258 Y 0.001 0.002 0.015 0.016 0.044 0.131 0.431 0.195 0.099 0.048 0.018 259 V 0.001 0.001 0.007 0.003 0.002 0.003 0.025 0.078 0.222 0.315 0.344 260 S 0.001 0.003 0.040 0.066 0.183 0.269 0.285 0.089 0.042 0.016 0.006 261 Q 0.026 0.044 0.584 0.212 0.078 0.039 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 262 I 0.003 0.006 0.014 0.024 0.053 0.122 0.372 0.203 0.122 0.060 0.021 263 V 0.006 0.005 0.014 0.010 0.007 0.012 0.056 0.110 0.204 0.272 0.304 264 L 0.018 0.058 0.166 0.199 0.208 0.145 0.110 0.046 0.026 0.016 0.008 265 N 0.057 0.087 0.274 0.140 0.100 0.096 0.108 0.058 0.045 0.024 0.011 266 E 0.187 0.123 0.102 0.113 0.123 0.112 0.134 0.052 0.029 0.016 0.009 267 A 0.140 0.118 0.092 0.137 0.091 0.085 0.123 0.073 0.064 0.049 0.029 268 V 0.093 0.067 0.076 0.119 0.127 0.133 0.155 0.079 0.073 0.049 0.028 269 N 0.286 0.181 0.214 0.140 0.070 0.041 0.038 0.014 0.009 0.004 0.003 270 L 0.064 0.063 0.060 0.087 0.103 0.128 0.181 0.110 0.084 0.072 0.047 271 K 0.074 0.137 0.083 0.148 0.133 0.122 0.129 0.067 0.049 0.034 0.024 272 D 0.229 0.225 0.136 0.188 0.121 0.055 0.030 0.008 0.005 0.001 0.001 273 E 0.735 0.106 0.074 0.056 0.018 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 274 L 0.044 0.091 0.095 0.192 0.162 0.147 0.150 0.057 0.037 0.019 0.008 275 I 0.008 0.008 0.013 0.024 0.043 0.086 0.247 0.217 0.183 0.110 0.061 276 K 0.084 0.162 0.319 0.315 0.088 0.024 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 277 L 0.002 0.007 0.033 0.033 0.063 0.151 0.324 0.185 0.117 0.061 0.023 278 I 0.001 0.006 0.013 0.026 0.028 0.039 0.121 0.162 0.214 0.212 0.178 279 V 0.001 0.002 0.004 0.009 0.020 0.052 0.241 0.188 0.197 0.168 0.118 280 H 0.039 0.076 0.380 0.276 0.122 0.053 0.029 0.013 0.008 0.004 0.002 281 T 0.018 0.048 0.048 0.155 0.194 0.191 0.212 0.077 0.034 0.015 0.006 282 L 0.001 0.002 0.006 0.007 0.006 0.007 0.041 0.103 0.252 0.316 0.259 283 Y 0.001 0.005 0.022 0.074 0.173 0.256 0.289 0.092 0.057 0.022 0.010 284 E 0.033 0.058 0.553 0.193 0.079 0.041 0.026 0.009 0.005 0.002 0.001 285 Q 0.006 0.012 0.023 0.061 0.106 0.215 0.342 0.145 0.061 0.024 0.006 286 L 0.011 0.008 0.012 0.011 0.010 0.019 0.087 0.143 0.254 0.261 0.184 287 D 0.066 0.119 0.134 0.199 0.190 0.125 0.091 0.039 0.022 0.010 0.004 288 R 0.140 0.178 0.164 0.177 0.124 0.087 0.070 0.032 0.018 0.008 0.002 289 P 0.260 0.119 0.059 0.103 0.100 0.086 0.119 0.072 0.046 0.027 0.009 290 V 0.148 0.086 0.031 0.076 0.076 0.091 0.162 0.121 0.098 0.072 0.038 291 G 0.291 0.233 0.084 0.132 0.093 0.056 0.046 0.028 0.020 0.012 0.005 292 D 0.540 0.168 0.078 0.097 0.046 0.030 0.020 0.010 0.006 0.003 0.001 293 E 0.522 0.158 0.062 0.089 0.060 0.039 0.034 0.017 0.011 0.006 0.003 294 N 0.345 0.197 0.051 0.112 0.082 0.053 0.053 0.039 0.033 0.022 0.013