# TARGET T0244 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0244.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 876 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.013 0.002 0.003 0.023 0.105 0.854 2 A 0.093 0.025 0.030 0.115 0.202 0.535 3 I 0.139 0.028 0.046 0.098 0.276 0.413 4 N 0.242 0.020 0.037 0.084 0.266 0.351 5 T 0.239 0.014 0.020 0.087 0.398 0.243 6 K 0.199 0.030 0.024 0.111 0.409 0.228 7 V 0.362 0.028 0.020 0.049 0.318 0.222 8 K 0.629 0.004 0.011 0.029 0.162 0.165 9 K 0.895 0.004 0.002 0.011 0.021 0.066 10 A 0.972 0.004 0.001 0.007 0.003 0.013 11 V 0.964 0.001 0.001 0.016 0.004 0.014 12 I 0.915 0.005 0.002 0.034 0.009 0.035 13 P 0.624 0.010 0.018 0.110 0.080 0.157 14 V 0.221 0.005 0.060 0.172 0.246 0.295 15 A 0.095 0.007 0.050 0.109 0.415 0.324 16 G 0.081 0.020 0.036 0.050 0.511 0.301 17 L 0.112 0.022 0.029 0.062 0.403 0.373 18 G 0.116 0.016 0.067 0.058 0.443 0.300 19 T 0.159 0.022 0.082 0.085 0.392 0.260 20 R 0.124 0.040 0.109 0.107 0.342 0.277 21 M 0.119 0.036 0.075 0.069 0.325 0.376 22 L 0.086 0.012 0.096 0.052 0.366 0.387 23 P 0.090 0.027 0.135 0.065 0.369 0.314 24 A 0.052 0.026 0.148 0.106 0.421 0.246 25 T 0.072 0.050 0.058 0.044 0.637 0.139 26 K 0.049 0.008 0.051 0.058 0.705 0.130 27 A 0.038 0.020 0.055 0.070 0.633 0.185 28 I 0.051 0.024 0.022 0.046 0.546 0.311 29 P 0.049 0.024 0.015 0.034 0.220 0.658 30 K 0.043 0.022 0.146 0.066 0.306 0.417 31 E 0.034 0.019 0.309 0.073 0.293 0.271 32 M 0.028 0.014 0.373 0.079 0.280 0.226 33 L 0.042 0.018 0.209 0.047 0.426 0.258 34 P 0.025 0.017 0.115 0.069 0.495 0.278 35 L 0.016 0.021 0.051 0.036 0.804 0.073 36 V 0.009 0.002 0.008 0.015 0.894 0.073 37 D 0.007 0.002 0.003 0.014 0.809 0.165 38 K 0.073 0.014 0.002 0.060 0.551 0.301 39 P 0.141 0.039 0.003 0.275 0.108 0.434 40 L 0.176 0.036 0.011 0.625 0.030 0.122 41 I 0.068 0.002 0.008 0.890 0.006 0.026 42 Q 0.022 0.001 0.005 0.962 0.003 0.008 43 Y 0.006 0.001 0.004 0.984 0.002 0.004 44 V 0.005 0.001 0.001 0.989 0.002 0.003 45 V 0.004 0.001 0.002 0.986 0.005 0.003 46 N 0.002 0.001 0.001 0.990 0.005 0.002 47 E 0.001 0.001 0.003 0.989 0.005 0.001 48 C 0.001 0.001 0.006 0.985 0.007 0.001 49 I 0.001 0.001 0.026 0.952 0.017 0.004 50 A 0.001 0.001 0.033 0.875 0.069 0.022 51 A 0.002 0.001 0.027 0.538 0.196 0.236 52 G 0.002 0.001 0.001 0.003 0.123 0.869 53 I 0.044 0.001 0.001 0.001 0.208 0.745 54 T 0.373 0.004 0.004 0.001 0.173 0.446 55 E 0.981 0.003 0.001 0.001 0.006 0.010 56 I 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 57 V 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 58 L 0.992 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 59 V 0.957 0.001 0.001 0.001 0.010 0.031 60 T 0.715 0.007 0.002 0.003 0.084 0.189 61 H 0.184 0.012 0.004 0.003 0.431 0.367 62 S 0.021 0.006 0.016 0.013 0.685 0.260 63 S 0.012 0.006 0.021 0.029 0.687 0.246 64 K 0.007 0.003 0.084 0.520 0.337 0.049 65 N 0.007 0.001 0.035 0.807 0.106 0.045 66 S 0.018 0.003 0.045 0.873 0.047 0.014 67 I 0.029 0.003 0.035 0.886 0.028 0.019 68 E 0.044 0.002 0.063 0.850 0.023 0.017 69 N 0.036 0.003 0.078 0.841 0.027 0.014 70 H 0.013 0.001 0.051 0.879 0.029 0.026 71 F 0.012 0.004 0.042 0.855 0.048 0.039 72 D 0.009 0.002 0.043 0.813 0.069 0.063 73 T 0.009 0.002 0.027 0.585 0.152 0.226 74 S 0.008 0.003 0.021 0.371 0.197 0.400 75 F 0.015 0.006 0.045 0.582 0.180 0.171 76 E 0.015 0.005 0.065 0.611 0.197 0.107 77 L 0.013 0.004 0.080 0.644 0.169 0.091 78 E 0.013 0.003 0.067 0.629 0.194 0.094 79 A 0.013 0.004 0.048 0.676 0.160 0.100 80 M 0.015 0.010 0.045 0.680 0.149 0.099 81 L 0.018 0.008 0.053 0.634 0.163 0.124 82 E 0.021 0.005 0.048 0.678 0.156 0.092 83 K 0.011 0.002 0.026 0.758 0.114 0.089 84 R 0.016 0.004 0.015 0.573 0.173 0.219 85 V 0.031 0.010 0.015 0.460 0.179 0.305 86 K 0.055 0.013 0.016 0.518 0.135 0.263 87 R 0.057 0.008 0.028 0.650 0.111 0.145 88 Q 0.053 0.009 0.031 0.672 0.087 0.149 89 L 0.057 0.005 0.030 0.699 0.063 0.145 90 L 0.033 0.002 0.038 0.773 0.062 0.091 91 D 0.038 0.003 0.059 0.787 0.064 0.049 92 E 0.031 0.002 0.049 0.801 0.070 0.047 93 V 0.041 0.003 0.051 0.695 0.121 0.088 94 Q 0.027 0.003 0.055 0.685 0.138 0.092 95 S 0.026 0.006 0.052 0.595 0.191 0.129 96 I 0.022 0.008 0.074 0.442 0.278 0.175 97 C 0.019 0.012 0.096 0.176 0.399 0.297 98 P 0.029 0.009 0.144 0.117 0.525 0.176 99 P 0.033 0.008 0.098 0.085 0.514 0.262 100 H 0.065 0.006 0.018 0.012 0.417 0.483 101 V 0.328 0.009 0.005 0.004 0.220 0.433 102 T 0.656 0.008 0.003 0.003 0.074 0.257 103 I 0.928 0.005 0.001 0.001 0.014 0.051 104 M 0.961 0.001 0.001 0.001 0.009 0.026 105 Q 0.964 0.002 0.001 0.001 0.008 0.025 106 V 0.888 0.003 0.001 0.002 0.030 0.076 107 R 0.709 0.005 0.002 0.005 0.083 0.197 108 Q 0.465 0.009 0.007 0.012 0.172 0.335 109 G 0.379 0.026 0.014 0.017 0.228 0.335 110 L 0.220 0.015 0.027 0.030 0.403 0.305 111 A 0.093 0.011 0.037 0.071 0.457 0.331 112 K 0.043 0.009 0.042 0.166 0.473 0.267 113 G 0.021 0.009 0.039 0.269 0.374 0.288 114 L 0.023 0.010 0.033 0.617 0.143 0.176 115 G 0.008 0.002 0.014 0.905 0.036 0.036 116 H 0.007 0.001 0.010 0.947 0.017 0.017 117 A 0.009 0.001 0.009 0.968 0.006 0.005 118 V 0.030 0.002 0.012 0.944 0.008 0.005 119 L 0.035 0.001 0.015 0.934 0.009 0.007 120 C 0.035 0.002 0.016 0.927 0.011 0.009 121 A 0.021 0.001 0.015 0.933 0.014 0.016 122 H 0.012 0.001 0.053 0.902 0.022 0.011 123 P 0.019 0.002 0.081 0.826 0.050 0.022 124 V 0.020 0.003 0.086 0.739 0.098 0.053 125 V 0.046 0.016 0.059 0.255 0.459 0.164 126 G 0.018 0.004 0.018 0.039 0.703 0.218 127 D 0.018 0.004 0.022 0.011 0.684 0.261 128 E 0.094 0.006 0.004 0.002 0.557 0.336 129 P 0.422 0.002 0.002 0.001 0.128 0.444 130 V 0.980 0.002 0.001 0.001 0.002 0.015 131 A 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 132 V 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 133 I 0.933 0.002 0.001 0.001 0.010 0.053 134 L 0.452 0.006 0.012 0.004 0.160 0.366 135 P 0.093 0.005 0.039 0.009 0.508 0.346 136 D 0.043 0.013 0.067 0.012 0.568 0.298 137 V 0.108 0.052 0.119 0.035 0.461 0.226 138 I 0.144 0.016 0.151 0.060 0.387 0.242 139 L 0.152 0.017 0.171 0.107 0.314 0.240 140 D 0.087 0.018 0.176 0.139 0.352 0.228 141 E 0.076 0.018 0.080 0.110 0.339 0.378 142 Y 0.075 0.013 0.071 0.111 0.385 0.345 143 E 0.049 0.016 0.098 0.151 0.478 0.208 144 S 0.037 0.010 0.116 0.141 0.527 0.169 145 D 0.030 0.012 0.087 0.066 0.539 0.266 146 L 0.027 0.017 0.100 0.089 0.401 0.366 147 S 0.015 0.009 0.031 0.108 0.226 0.610 148 Q 0.015 0.009 0.028 0.357 0.173 0.418 149 D 0.012 0.011 0.006 0.328 0.094 0.550 150 N 0.001 0.001 0.001 0.968 0.008 0.022 151 L 0.001 0.001 0.001 0.982 0.007 0.009 152 A 0.001 0.001 0.001 0.985 0.008 0.005 153 E 0.001 0.001 0.002 0.988 0.007 0.002 154 M 0.001 0.001 0.002 0.982 0.011 0.005 155 I 0.001 0.001 0.003 0.976 0.015 0.005 156 R 0.001 0.001 0.002 0.977 0.014 0.007 157 R 0.001 0.001 0.005 0.955 0.025 0.015 158 F 0.001 0.001 0.021 0.906 0.045 0.025 159 D 0.005 0.002 0.039 0.801 0.112 0.041 160 E 0.007 0.002 0.052 0.605 0.203 0.131 161 T 0.010 0.003 0.017 0.041 0.381 0.548 162 G 0.044 0.008 0.020 0.010 0.412 0.505 163 H 0.188 0.006 0.013 0.004 0.298 0.490 164 S 0.753 0.006 0.006 0.003 0.088 0.145 165 Q 0.965 0.003 0.001 0.001 0.009 0.022 166 I 0.979 0.001 0.001 0.001 0.004 0.016 167 M 0.979 0.001 0.001 0.001 0.004 0.016 168 V 0.951 0.001 0.001 0.001 0.008 0.039 169 E 0.883 0.002 0.001 0.001 0.026 0.087 170 P 0.708 0.007 0.001 0.001 0.052 0.231 171 V 0.341 0.016 0.002 0.002 0.151 0.488 172 A 0.177 0.032 0.005 0.004 0.234 0.547 173 D 0.103 0.023 0.013 0.007 0.427 0.428 174 V 0.051 0.012 0.180 0.015 0.532 0.210 175 T 0.041 0.010 0.228 0.013 0.504 0.204 176 A 0.072 0.008 0.256 0.014 0.493 0.156 177 Y 0.204 0.017 0.073 0.015 0.399 0.293 178 G 0.339 0.022 0.032 0.013 0.293 0.302 179 V 0.809 0.017 0.006 0.006 0.065 0.097 180 V 0.861 0.007 0.003 0.010 0.030 0.089 181 D 0.834 0.014 0.003 0.010 0.037 0.102 182 C 0.645 0.009 0.009 0.017 0.086 0.234 183 K 0.340 0.009 0.025 0.022 0.172 0.432 184 G 0.255 0.027 0.054 0.045 0.245 0.375 185 V 0.254 0.027 0.071 0.093 0.292 0.263 186 E 0.233 0.015 0.089 0.143 0.300 0.221 187 L 0.149 0.009 0.143 0.208 0.381 0.110 188 A 0.090 0.006 0.142 0.152 0.512 0.097 189 P 0.058 0.008 0.112 0.087 0.627 0.108 190 G 0.049 0.010 0.043 0.028 0.714 0.155 191 E 0.120 0.020 0.044 0.012 0.586 0.219 192 S 0.256 0.020 0.028 0.005 0.458 0.234 193 V 0.503 0.006 0.011 0.002 0.239 0.239 194 P 0.868 0.007 0.002 0.001 0.032 0.090 195 M 0.951 0.005 0.001 0.001 0.007 0.036 196 V 0.954 0.001 0.001 0.001 0.008 0.037 197 G 0.979 0.001 0.001 0.001 0.005 0.014 198 V 0.957 0.003 0.001 0.001 0.009 0.030 199 V 0.912 0.008 0.001 0.002 0.021 0.056 200 E 0.738 0.004 0.003 0.002 0.047 0.206 201 K 0.528 0.015 0.002 0.002 0.077 0.376 202 P 0.434 0.080 0.004 0.002 0.126 0.353 203 K 0.194 0.047 0.003 0.004 0.506 0.245 204 A 0.038 0.009 0.062 0.027 0.767 0.097 205 D 0.012 0.006 0.067 0.032 0.809 0.074 206 V 0.020 0.009 0.073 0.031 0.781 0.086 207 A 0.025 0.022 0.019 0.038 0.424 0.472 208 P 0.030 0.064 0.033 0.030 0.493 0.349 209 S 0.042 0.018 0.057 0.035 0.565 0.283 210 N 0.087 0.008 0.061 0.017 0.473 0.353 211 L 0.388 0.034 0.053 0.015 0.315 0.196 212 A 0.721 0.010 0.011 0.010 0.111 0.138 213 I 0.852 0.006 0.002 0.006 0.046 0.089 214 V 0.774 0.004 0.002 0.011 0.054 0.155 215 G 0.858 0.005 0.002 0.012 0.035 0.087 216 R 0.908 0.008 0.004 0.018 0.025 0.037 217 Y 0.867 0.004 0.009 0.020 0.044 0.056 218 V 0.792 0.021 0.012 0.039 0.067 0.069 219 L 0.459 0.030 0.020 0.062 0.132 0.297 220 S 0.060 0.005 0.004 0.041 0.206 0.683 221 A 0.004 0.001 0.110 0.609 0.162 0.114 222 D 0.006 0.003 0.124 0.757 0.095 0.015 223 I 0.002 0.001 0.084 0.884 0.026 0.002 224 W 0.002 0.001 0.057 0.920 0.017 0.004 225 P 0.002 0.001 0.036 0.943 0.015 0.002 226 L 0.003 0.001 0.023 0.953 0.015 0.005 227 L 0.007 0.002 0.023 0.937 0.021 0.010 228 A 0.012 0.002 0.043 0.889 0.033 0.022 229 K 0.025 0.002 0.041 0.752 0.087 0.093 230 T 0.052 0.015 0.032 0.444 0.172 0.285 231 P 0.065 0.019 0.021 0.152 0.309 0.434 232 P 0.043 0.015 0.038 0.124 0.414 0.366 233 G 0.016 0.009 0.036 0.084 0.635 0.219 234 A 0.014 0.007 0.045 0.088 0.686 0.161 235 G 0.023 0.011 0.031 0.069 0.632 0.234 236 D 0.043 0.012 0.029 0.094 0.501 0.322 237 E 0.174 0.024 0.031 0.194 0.243 0.333 238 I 0.313 0.065 0.033 0.213 0.136 0.239 239 Q 0.290 0.042 0.035 0.272 0.104 0.257 240 L 0.091 0.006 0.053 0.581 0.094 0.175 241 T 0.025 0.002 0.039 0.708 0.077 0.149 242 D 0.010 0.001 0.024 0.890 0.027 0.047 243 A 0.004 0.001 0.009 0.963 0.010 0.013 244 I 0.002 0.001 0.007 0.977 0.009 0.005 245 D 0.001 0.001 0.004 0.982 0.009 0.003 246 M 0.001 0.001 0.003 0.986 0.008 0.002 247 L 0.001 0.001 0.005 0.985 0.008 0.002 248 I 0.001 0.001 0.012 0.969 0.014 0.004 249 E 0.001 0.001 0.015 0.925 0.039 0.020 250 K 0.005 0.001 0.018 0.652 0.132 0.192 251 E 0.007 0.001 0.001 0.005 0.115 0.871 252 T 0.165 0.004 0.001 0.001 0.113 0.716 253 V 0.840 0.003 0.001 0.001 0.042 0.115 254 E 0.946 0.002 0.001 0.001 0.016 0.035 255 A 0.980 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 256 Y 0.975 0.001 0.001 0.001 0.008 0.016 257 H 0.937 0.003 0.001 0.001 0.023 0.037 258 M 0.664 0.007 0.003 0.002 0.201 0.122 259 K 0.112 0.004 0.009 0.005 0.711 0.160 260 G 0.069 0.006 0.018 0.010 0.717 0.180 261 K 0.388 0.050 0.017 0.017 0.356 0.172 262 S 0.592 0.040 0.014 0.025 0.167 0.161 263 H 0.582 0.034 0.014 0.023 0.183 0.165 264 D 0.436 0.018 0.015 0.015 0.351 0.165 265 C 0.129 0.010 0.012 0.024 0.490 0.334 266 G 0.075 0.033 0.008 0.028 0.441 0.415 267 N 0.030 0.025 0.005 0.071 0.281 0.588 268 K 0.001 0.001 0.028 0.903 0.046 0.022 269 L 0.001 0.001 0.019 0.934 0.036 0.010 270 G 0.001 0.001 0.015 0.949 0.024 0.010 271 Y 0.001 0.001 0.002 0.993 0.003 0.002 272 M 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 273 Q 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 274 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 275 F 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 276 V 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.002 277 E 0.001 0.001 0.002 0.992 0.003 0.003 278 Y 0.001 0.001 0.003 0.988 0.004 0.003 279 G 0.002 0.001 0.006 0.975 0.009 0.008 280 I 0.003 0.001 0.006 0.950 0.019 0.021 281 R 0.003 0.002 0.007 0.864 0.043 0.080 282 H 0.004 0.004 0.028 0.698 0.124 0.142 283 N 0.002 0.002 0.113 0.574 0.215 0.094 284 T 0.002 0.003 0.126 0.632 0.161 0.077 285 L 0.001 0.004 0.097 0.576 0.186 0.136 286 G 0.002 0.002 0.017 0.285 0.182 0.512 287 T 0.001 0.001 0.031 0.787 0.083 0.097 288 E 0.002 0.003 0.030 0.853 0.065 0.046 289 F 0.002 0.002 0.021 0.933 0.020 0.021 290 K 0.001 0.001 0.007 0.972 0.009 0.010 291 A 0.001 0.001 0.004 0.985 0.005 0.005 292 W 0.001 0.001 0.004 0.992 0.003 0.002 293 L 0.001 0.001 0.002 0.988 0.006 0.003 294 E 0.001 0.001 0.002 0.980 0.012 0.005 295 E 0.001 0.001 0.002 0.928 0.036 0.033 296 E 0.001 0.001 0.003 0.908 0.044 0.045 297 M 0.002 0.006 0.014 0.858 0.059 0.061 298 G 0.006 0.003 0.043 0.472 0.248 0.228 299 I 0.010 0.002 0.070 0.355 0.259 0.304 300 K 0.016 0.009 0.017 0.096 0.241 0.621 301 K 0.009 0.008 0.008 0.060 0.296 0.619