# TARGET T0243 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0243.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 2 K 0.080 0.040 0.004 0.082 0.003 0.019 0.773 3 I 0.067 0.014 0.026 0.298 0.083 0.057 0.454 4 R 0.079 0.011 0.068 0.370 0.071 0.085 0.317 5 K 0.075 0.005 0.121 0.439 0.088 0.112 0.162 6 Y 0.142 0.007 0.094 0.456 0.061 0.111 0.129 7 M 0.312 0.012 0.041 0.365 0.055 0.067 0.147 8 R 0.444 0.009 0.022 0.295 0.046 0.049 0.134 9 I 0.419 0.011 0.016 0.332 0.051 0.030 0.140 10 N 0.410 0.009 0.019 0.327 0.058 0.043 0.134 11 Y 0.420 0.007 0.021 0.412 0.037 0.031 0.073 12 Y 0.620 0.003 0.012 0.268 0.023 0.020 0.054 13 I 0.789 0.002 0.009 0.148 0.013 0.010 0.029 14 I 0.902 0.002 0.005 0.057 0.007 0.006 0.020 15 L 0.853 0.003 0.010 0.072 0.016 0.009 0.036 16 K 0.851 0.001 0.011 0.072 0.018 0.008 0.039 17 V 0.881 0.003 0.008 0.051 0.012 0.007 0.038 18 L 0.890 0.004 0.005 0.052 0.010 0.007 0.032 19 V 0.871 0.006 0.004 0.048 0.012 0.014 0.045 20 I 0.663 0.015 0.006 0.071 0.060 0.056 0.129 21 N 0.226 0.009 0.009 0.069 0.188 0.239 0.261 22 G 0.028 0.003 0.050 0.163 0.222 0.409 0.125 23 S 0.040 0.009 0.076 0.310 0.194 0.188 0.183 24 R 0.053 0.012 0.097 0.449 0.108 0.134 0.148 25 L 0.041 0.010 0.078 0.546 0.072 0.104 0.149 26 E 0.031 0.007 0.067 0.494 0.062 0.139 0.200 27 K 0.026 0.003 0.074 0.619 0.062 0.102 0.115 28 K 0.037 0.005 0.062 0.627 0.068 0.084 0.118 29 R 0.040 0.009 0.044 0.660 0.056 0.075 0.118 30 L 0.044 0.010 0.028 0.632 0.048 0.060 0.179 31 R 0.027 0.004 0.025 0.730 0.035 0.057 0.122 32 S 0.016 0.002 0.033 0.819 0.021 0.052 0.057 33 E 0.014 0.002 0.042 0.799 0.027 0.067 0.049 34 I 0.026 0.006 0.050 0.758 0.030 0.076 0.054 35 L 0.046 0.004 0.058 0.680 0.041 0.090 0.081 36 K 0.064 0.004 0.060 0.592 0.047 0.170 0.064 37 R 0.084 0.005 0.048 0.472 0.092 0.165 0.135 38 F 0.135 0.018 0.034 0.280 0.170 0.089 0.273 39 D 0.244 0.017 0.019 0.093 0.116 0.058 0.453 40 I 0.330 0.027 0.024 0.113 0.084 0.056 0.366 41 D 0.340 0.026 0.022 0.088 0.062 0.072 0.389 42 I 0.170 0.016 0.068 0.156 0.119 0.197 0.273 43 S 0.101 0.011 0.073 0.148 0.181 0.226 0.261 44 D 0.028 0.004 0.075 0.159 0.192 0.471 0.071 45 G 0.038 0.004 0.049 0.147 0.169 0.471 0.122 46 V 0.243 0.050 0.034 0.212 0.080 0.073 0.308 47 L 0.346 0.065 0.029 0.304 0.030 0.038 0.187 48 Y 0.200 0.011 0.041 0.493 0.043 0.035 0.178 49 P 0.115 0.007 0.098 0.590 0.033 0.058 0.099 50 L 0.072 0.008 0.095 0.599 0.058 0.079 0.089 51 I 0.065 0.008 0.121 0.594 0.036 0.071 0.105 52 D 0.038 0.002 0.156 0.614 0.035 0.099 0.056 53 S 0.044 0.004 0.148 0.562 0.054 0.122 0.067 54 L 0.037 0.012 0.099 0.594 0.072 0.093 0.094 55 I 0.036 0.010 0.044 0.615 0.070 0.081 0.143 56 D 0.030 0.005 0.036 0.562 0.062 0.116 0.189 57 D 0.018 0.003 0.054 0.622 0.063 0.145 0.095 58 K 0.034 0.006 0.059 0.618 0.056 0.131 0.095 59 I 0.066 0.013 0.049 0.577 0.076 0.095 0.124 60 L 0.107 0.013 0.056 0.452 0.074 0.114 0.184 61 R 0.115 0.011 0.074 0.375 0.073 0.136 0.215 62 E 0.105 0.010 0.124 0.315 0.076 0.142 0.227 63 E 0.123 0.011 0.126 0.204 0.112 0.176 0.249 64 E 0.134 0.036 0.088 0.131 0.173 0.155 0.282 65 A 0.058 0.015 0.039 0.047 0.188 0.068 0.584 66 P 0.032 0.009 0.042 0.039 0.164 0.425 0.288 67 D 0.023 0.004 0.030 0.019 0.181 0.648 0.095 68 G 0.107 0.010 0.018 0.016 0.393 0.175 0.281 69 K 0.273 0.020 0.009 0.012 0.105 0.041 0.540 70 V 0.768 0.034 0.005 0.008 0.029 0.014 0.141 71 L 0.864 0.013 0.005 0.010 0.014 0.009 0.086 72 F 0.862 0.008 0.005 0.012 0.020 0.010 0.084 73 L 0.739 0.016 0.007 0.022 0.035 0.016 0.164 74 T 0.437 0.016 0.013 0.042 0.084 0.036 0.372 75 E 0.153 0.011 0.057 0.208 0.154 0.160 0.256 76 K 0.041 0.008 0.071 0.204 0.174 0.335 0.168 77 G 0.025 0.008 0.058 0.271 0.141 0.297 0.199 78 M 0.022 0.009 0.044 0.454 0.140 0.089 0.242 79 K 0.026 0.011 0.062 0.606 0.068 0.099 0.128 80 E 0.011 0.004 0.052 0.669 0.052 0.103 0.109 81 F 0.007 0.003 0.035 0.802 0.041 0.052 0.060 82 E 0.006 0.001 0.031 0.857 0.025 0.050 0.030 83 E 0.004 0.002 0.034 0.849 0.015 0.067 0.029 84 L 0.001 0.001 0.022 0.900 0.012 0.036 0.027 85 H 0.002 0.001 0.018 0.920 0.011 0.033 0.015 86 E 0.004 0.001 0.023 0.885 0.010 0.057 0.020 87 F 0.002 0.001 0.028 0.876 0.014 0.051 0.027 88 F 0.010 0.003 0.033 0.813 0.026 0.067 0.049 89 K 0.022 0.001 0.064 0.697 0.040 0.136 0.040 90 K 0.034 0.002 0.054 0.652 0.060 0.127 0.071 91 I 0.046 0.010 0.035 0.502 0.119 0.114 0.174 92 V 0.056 0.029 0.018 0.203 0.005 0.176 0.513 93 C 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.997