# TARGET T0242 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0242.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 5 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.155 0.011 0.029 0.027 0.458 0.320 2 G 0.230 0.011 0.009 0.008 0.256 0.485 3 K 0.634 0.012 0.004 0.006 0.090 0.256 4 V 0.914 0.004 0.001 0.004 0.022 0.055 5 F 0.946 0.004 0.001 0.004 0.010 0.036 6 L 0.932 0.007 0.002 0.008 0.020 0.031 7 T 0.826 0.007 0.008 0.013 0.061 0.085 8 N 0.520 0.003 0.023 0.024 0.220 0.210 9 A 0.460 0.013 0.042 0.035 0.261 0.189 10 F 0.399 0.080 0.028 0.033 0.190 0.271 11 S 0.167 0.020 0.034 0.054 0.283 0.443 12 I 0.034 0.004 0.415 0.186 0.264 0.097 13 N 0.021 0.007 0.402 0.217 0.288 0.064 14 M 0.011 0.002 0.387 0.278 0.277 0.045 15 L 0.028 0.010 0.239 0.240 0.399 0.085 16 K 0.024 0.007 0.174 0.168 0.513 0.114 17 E 0.024 0.007 0.067 0.071 0.549 0.281 18 F 0.045 0.012 0.017 0.007 0.503 0.416 19 P 0.071 0.004 0.010 0.004 0.309 0.601 20 T 0.608 0.008 0.005 0.004 0.114 0.261 21 T 0.932 0.004 0.001 0.002 0.020 0.042 22 I 0.973 0.003 0.001 0.001 0.004 0.020 23 T 0.961 0.003 0.001 0.002 0.007 0.028 24 I 0.797 0.006 0.033 0.008 0.059 0.098 25 D 0.278 0.002 0.118 0.017 0.278 0.307 26 K 0.181 0.007 0.137 0.023 0.397 0.255 27 L 0.160 0.056 0.036 0.026 0.355 0.366 28 D 0.112 0.017 0.022 0.066 0.357 0.427 29 E 0.022 0.002 0.287 0.454 0.185 0.050 30 E 0.023 0.003 0.250 0.486 0.182 0.055 31 D 0.012 0.001 0.216 0.603 0.138 0.030 32 F 0.026 0.006 0.082 0.547 0.167 0.172 33 C 0.024 0.015 0.089 0.588 0.154 0.130 34 L 0.014 0.005 0.077 0.587 0.129 0.189 35 K 0.010 0.003 0.053 0.354 0.158 0.421 36 L 0.006 0.008 0.067 0.510 0.187 0.222 37 E 0.010 0.003 0.076 0.424 0.238 0.249 38 L 0.016 0.006 0.122 0.359 0.288 0.208 39 R 0.021 0.005 0.119 0.383 0.312 0.159 40 L 0.023 0.008 0.073 0.258 0.484 0.154 41 E 0.019 0.013 0.047 0.224 0.441 0.256 42 D 0.015 0.008 0.022 0.112 0.345 0.498 43 G 0.021 0.002 0.051 0.572 0.216 0.139 44 T 0.057 0.006 0.036 0.683 0.132 0.085 45 L 0.077 0.012 0.036 0.752 0.085 0.038 46 I 0.090 0.008 0.071 0.673 0.107 0.051 47 N 0.086 0.005 0.078 0.646 0.111 0.074 48 A 0.055 0.005 0.069 0.670 0.112 0.088 49 I 0.040 0.012 0.037 0.517 0.141 0.252 50 G 0.024 0.009 0.057 0.422 0.156 0.331 51 H 0.005 0.003 0.037 0.395 0.104 0.455 52 D 0.001 0.001 0.041 0.881 0.036 0.040 53 S 0.001 0.001 0.023 0.956 0.014 0.007 54 T 0.001 0.001 0.010 0.980 0.005 0.004 55 I 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 56 N 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 57 L 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 58 V 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 59 N 0.001 0.001 0.008 0.990 0.002 0.001 60 T 0.001 0.001 0.009 0.983 0.007 0.001 61 L 0.001 0.001 0.009 0.966 0.018 0.006 62 C 0.001 0.009 0.023 0.898 0.045 0.024 63 G 0.011 0.007 0.023 0.388 0.288 0.283 64 T 0.039 0.009 0.042 0.191 0.292 0.427 65 Q 0.141 0.036 0.042 0.104 0.229 0.448 66 L 0.148 0.021 0.120 0.124 0.328 0.259 67 Q 0.104 0.016 0.115 0.131 0.396 0.237 68 K 0.117 0.007 0.079 0.109 0.410 0.277 69 N 0.325 0.009 0.014 0.032 0.260 0.360 70 R 0.545 0.012 0.006 0.020 0.095 0.322 71 V 0.879 0.005 0.004 0.009 0.025 0.079 72 E 0.950 0.003 0.003 0.005 0.010 0.029 73 V 0.946 0.003 0.003 0.004 0.013 0.032 74 K 0.949 0.003 0.003 0.002 0.015 0.029 75 M 0.843 0.011 0.006 0.004 0.061 0.075 76 N 0.303 0.015 0.014 0.011 0.571 0.086 77 E 0.047 0.004 0.042 0.006 0.858 0.043 78 G 0.046 0.006 0.024 0.004 0.885 0.035 79 D 0.153 0.003 0.013 0.004 0.730 0.097 80 E 0.756 0.006 0.001 0.002 0.069 0.166 81 A 0.964 0.010 0.001 0.001 0.007 0.017 82 L 0.983 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 83 I 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 84 I 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 85 M 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 86 I 0.966 0.001 0.001 0.004 0.008 0.020 87 S 0.856 0.005 0.011 0.022 0.042 0.065 88 Q 0.667 0.013 0.041 0.046 0.133 0.099 89 R 0.566 0.014 0.031 0.049 0.182 0.158 90 L 0.321 0.012 0.051 0.153 0.305 0.157 91 E 0.148 0.011 0.062 0.260 0.411 0.108 92 E 0.085 0.009 0.055 0.317 0.405 0.129 93 G 0.049 0.003 0.019 0.056 0.516 0.357 94 K 0.154 0.014 0.020 0.040 0.378 0.394 95 V 0.278 0.095 0.017 0.038 0.209 0.363 96 L 0.216 0.061 0.013 0.036 0.227 0.448 97 S 0.101 0.012 0.005 0.052 0.196 0.633 98 D 0.003 0.001 0.014 0.925 0.039 0.017 99 K 0.001 0.001 0.007 0.979 0.010 0.003 100 E 0.003 0.001 0.009 0.977 0.008 0.002 101 I 0.004 0.001 0.005 0.981 0.006 0.003 102 K 0.006 0.001 0.004 0.980 0.007 0.003 103 D 0.005 0.001 0.004 0.980 0.006 0.003 104 M 0.004 0.001 0.004 0.977 0.009 0.006 105 Y 0.006 0.001 0.007 0.964 0.015 0.006 106 R 0.008 0.001 0.011 0.933 0.034 0.013 107 Q 0.015 0.002 0.016 0.658 0.189 0.120 108 G 0.024 0.002 0.002 0.022 0.293 0.656 109 K 0.142 0.004 0.002 0.003 0.217 0.633 110 I 0.734 0.014 0.001 0.001 0.068 0.184 111 S 0.893 0.004 0.001 0.001 0.024 0.077 112 F 0.956 0.002 0.001 0.001 0.004 0.038 113 Y 0.872 0.001 0.001 0.001 0.012 0.113 114 E 0.675 0.008 0.001 0.001 0.022 0.293 115 V 0.232 0.011 0.001 0.001 0.048 0.707 116 W 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.987