# TARGET T0239
# Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    6 (1 EBGHTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0239.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 1
#
Pos	AA	E	B	G	H	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.022	0.002	0.003	0.009	0.094	0.870
2	K	0.142	0.012	0.027	0.040	0.177	0.602
3	K	0.380	0.019	0.038	0.048	0.165	0.350
4	H	0.627	0.008	0.033	0.048	0.107	0.175
5	I	0.817	0.009	0.007	0.027	0.048	0.092
6	I	0.833	0.011	0.005	0.029	0.035	0.087
7	I	0.710	0.012	0.017	0.043	0.081	0.137
8	K	0.565	0.006	0.023	0.054	0.145	0.206
9	T	0.353	0.013	0.024	0.051	0.214	0.345
10	I	0.198	0.019	0.008	0.035	0.246	0.495
11	P	0.098	0.008	0.017	0.070	0.295	0.513
12	K	0.076	0.010	0.055	0.183	0.324	0.352
13	K	0.057	0.010	0.107	0.348	0.273	0.205
14	E	0.082	0.008	0.122	0.393	0.226	0.169
15	E	0.129	0.007	0.089	0.383	0.181	0.211
16	I	0.184	0.026	0.072	0.355	0.146	0.218
17	I	0.218	0.021	0.056	0.314	0.134	0.256
18	S	0.273	0.012	0.067	0.302	0.159	0.187
19	R	0.179	0.006	0.114	0.335	0.205	0.160
20	D	0.194	0.013	0.113	0.238	0.267	0.176
21	L	0.246	0.015	0.127	0.186	0.295	0.130
22	C	0.241	0.006	0.093	0.142	0.332	0.185
23	D	0.350	0.008	0.085	0.113	0.264	0.180
24	C	0.581	0.010	0.042	0.103	0.143	0.120
25	I	0.701	0.012	0.022	0.089	0.084	0.091
26	Y	0.791	0.007	0.012	0.048	0.069	0.073
27	Y	0.757	0.008	0.013	0.033	0.103	0.086
28	Y	0.565	0.014	0.013	0.028	0.251	0.130
29	D	0.217	0.006	0.027	0.033	0.566	0.151
30	N	0.128	0.005	0.043	0.033	0.651	0.139
31	S	0.371	0.012	0.035	0.025	0.416	0.141
32	V	0.727	0.016	0.013	0.021	0.121	0.103
33	I	0.806	0.013	0.004	0.015	0.053	0.109
34	C	0.749	0.017	0.004	0.013	0.082	0.136
35	K	0.565	0.010	0.005	0.011	0.159	0.249
36	P	0.287	0.018	0.006	0.012	0.230	0.447
37	I	0.108	0.037	0.004	0.015	0.268	0.568
38	G	0.059	0.010	0.006	0.011	0.263	0.651
39	P	0.097	0.015	0.075	0.043	0.408	0.362
40	S	0.132	0.007	0.115	0.087	0.372	0.287
41	K	0.382	0.014	0.101	0.116	0.211	0.176
42	V	0.508	0.017	0.033	0.125	0.122	0.195
43	Y	0.592	0.019	0.019	0.121	0.075	0.174
44	V	0.615	0.012	0.019	0.127	0.074	0.153
45	S	0.519	0.008	0.030	0.134	0.122	0.186
46	T	0.314	0.014	0.044	0.142	0.204	0.283
47	S	0.230	0.011	0.038	0.170	0.217	0.334
48	L	0.094	0.005	0.133	0.379	0.260	0.129
49	E	0.041	0.006	0.127	0.465	0.241	0.121
50	N	0.029	0.005	0.083	0.578	0.176	0.130
51	L	0.012	0.002	0.049	0.819	0.075	0.043
52	E	0.009	0.001	0.043	0.848	0.065	0.033
53	K	0.008	0.002	0.047	0.866	0.050	0.028
54	C	0.013	0.002	0.034	0.849	0.058	0.045
55	L	0.014	0.002	0.037	0.825	0.069	0.054
56	Q	0.020	0.003	0.022	0.809	0.060	0.086
57	L	0.021	0.002	0.020	0.838	0.046	0.073
58	H	0.028	0.003	0.023	0.824	0.050	0.071
59	Y	0.025	0.003	0.028	0.837	0.045	0.061
60	F	0.017	0.002	0.026	0.878	0.036	0.041
61	K	0.013	0.001	0.028	0.888	0.041	0.029
62	K	0.015	0.002	0.030	0.859	0.051	0.042
63	L	0.015	0.002	0.017	0.878	0.041	0.047
64	V	0.020	0.003	0.025	0.853	0.056	0.044
65	K	0.020	0.002	0.023	0.802	0.073	0.079
66	N	0.042	0.002	0.021	0.680	0.087	0.168
67	I	0.088	0.004	0.019	0.697	0.074	0.117
68	E	0.153	0.010	0.020	0.635	0.064	0.118
69	I	0.140	0.006	0.026	0.666	0.054	0.108
70	F	0.131	0.006	0.044	0.629	0.079	0.110
71	D	0.126	0.004	0.066	0.588	0.109	0.107
72	E	0.114	0.004	0.071	0.554	0.134	0.121
73	V	0.111	0.015	0.058	0.469	0.183	0.164
74	H	0.102	0.016	0.077	0.332	0.281	0.192
75	N	0.078	0.011	0.049	0.192	0.375	0.295
76	S	0.042	0.018	0.041	0.111	0.374	0.414
77	K	0.032	0.025	0.045	0.046	0.506	0.345
78	P	0.023	0.008	0.072	0.041	0.587	0.270
79	N	0.030	0.015	0.105	0.043	0.566	0.240
80	C	0.079	0.028	0.077	0.041	0.552	0.223
81	D	0.171	0.008	0.045	0.023	0.407	0.346
82	K	0.531	0.013	0.034	0.027	0.202	0.193
83	C	0.783	0.008	0.013	0.019	0.077	0.100
84	L	0.915	0.005	0.005	0.014	0.025	0.037
85	I	0.948	0.002	0.003	0.011	0.016	0.020
86	V	0.942	0.002	0.002	0.012	0.017	0.025
87	E	0.926	0.003	0.002	0.012	0.028	0.029
88	I	0.733	0.006	0.009	0.022	0.148	0.082
89	G	0.348	0.005	0.012	0.019	0.426	0.190
90	G	0.443	0.005	0.011	0.012	0.318	0.211
91	V	0.837	0.006	0.004	0.011	0.066	0.076
92	Y	0.923	0.004	0.002	0.011	0.019	0.042
93	F	0.938	0.004	0.002	0.013	0.014	0.029
94	V	0.921	0.003	0.004	0.014	0.021	0.036
95	R	0.816	0.003	0.009	0.016	0.046	0.112
96	R	0.670	0.012	0.009	0.017	0.070	0.223
97	V	0.315	0.028	0.006	0.015	0.063	0.573
98	N	0.003	0.002	0.001	0.001	0.018	0.977