# TARGET T0237 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0237.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 8 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 F 0.002 0.001 0.001 0.002 0.004 0.003 0.987 2 G 0.128 0.086 0.016 0.035 0.015 0.052 0.669 3 L 0.224 0.046 0.017 0.029 0.211 0.060 0.414 4 W 0.250 0.055 0.034 0.056 0.104 0.103 0.397 5 V 0.186 0.064 0.019 0.031 0.158 0.100 0.443 6 D 0.123 0.040 0.010 0.011 0.325 0.093 0.398 7 G 0.067 0.028 0.010 0.023 0.505 0.090 0.278 8 N 0.063 0.035 0.026 0.086 0.244 0.094 0.453 9 C 0.029 0.019 0.240 0.372 0.070 0.103 0.168 10 E 0.043 0.011 0.251 0.392 0.070 0.155 0.077 11 E 0.042 0.012 0.231 0.372 0.081 0.167 0.094 12 I 0.067 0.054 0.057 0.353 0.157 0.069 0.243 13 P 0.070 0.014 0.038 0.178 0.123 0.097 0.479 14 Y 0.088 0.009 0.097 0.148 0.137 0.263 0.258 15 V 0.192 0.020 0.160 0.232 0.097 0.114 0.186 16 K 0.274 0.024 0.133 0.245 0.082 0.057 0.185 17 E 0.327 0.017 0.089 0.254 0.064 0.045 0.203 18 V 0.240 0.022 0.096 0.235 0.109 0.100 0.198 19 E 0.177 0.015 0.060 0.198 0.117 0.131 0.302 20 A 0.071 0.012 0.071 0.155 0.135 0.257 0.300 21 E 0.043 0.011 0.035 0.087 0.284 0.352 0.188 22 D 0.063 0.017 0.017 0.060 0.231 0.079 0.533 23 L 0.017 0.006 0.125 0.633 0.062 0.082 0.076 24 R 0.035 0.007 0.100 0.652 0.036 0.127 0.044 25 E 0.066 0.011 0.113 0.578 0.040 0.130 0.062 26 C 0.123 0.010 0.084 0.475 0.056 0.091 0.159 27 N 0.216 0.003 0.043 0.317 0.129 0.076 0.215 28 R 0.408 0.002 0.037 0.316 0.102 0.079 0.057 29 I 0.653 0.023 0.016 0.220 0.007 0.030 0.050 30 V 0.759 0.005 0.009 0.137 0.010 0.024 0.056 31 F 0.737 0.008 0.014 0.062 0.032 0.021 0.125 32 G 0.382 0.009 0.020 0.041 0.115 0.032 0.400 33 A 0.131 0.008 0.018 0.014 0.268 0.039 0.523 34 S 0.083 0.071 0.009 0.008 0.208 0.016 0.604 35 A 0.012 0.004 0.443 0.125 0.098 0.180 0.138 36 S 0.007 0.001 0.406 0.112 0.092 0.305 0.077 37 D 0.003 0.008 0.373 0.110 0.148 0.240 0.118 38 Q 0.009 0.019 0.059 0.223 0.350 0.100 0.239 39 P 0.013 0.006 0.039 0.323 0.081 0.121 0.417 40 T 0.028 0.013 0.048 0.475 0.087 0.114 0.235 41 Q 0.047 0.011 0.068 0.616 0.041 0.055 0.163 42 Y 0.028 0.007 0.095 0.683 0.045 0.038 0.102 43 E 0.027 0.004 0.077 0.731 0.038 0.052 0.070 44 E 0.018 0.003 0.092 0.657 0.041 0.125 0.064 45 E 0.007 0.003 0.035 0.735 0.029 0.140 0.052 46 M 0.002 0.002 0.017 0.809 0.047 0.059 0.063 47 T 0.002 0.002 0.013 0.839 0.032 0.074 0.040 48 D 0.001 0.001 0.011 0.840 0.030 0.067 0.050 49 Y 0.001 0.001 0.006 0.944 0.011 0.021 0.016 50 Q 0.003 0.001 0.005 0.945 0.013 0.023 0.010 51 K 0.005 0.001 0.008 0.938 0.009 0.025 0.014 52 I 0.003 0.001 0.009 0.941 0.008 0.018 0.019 53 Q 0.006 0.002 0.012 0.934 0.009 0.022 0.017 54 Q 0.004 0.001 0.012 0.881 0.009 0.082 0.012 55 G 0.003 0.001 0.013 0.832 0.011 0.119 0.020 56 F 0.010 0.009 0.017 0.803 0.030 0.041 0.089 57 R 0.014 0.004 0.023 0.848 0.026 0.032 0.052 58 Q 0.008 0.002 0.029 0.777 0.037 0.108 0.038 59 N 0.007 0.004 0.024 0.594 0.095 0.204 0.072 60 N 0.007 0.007 0.019 0.351 0.094 0.187 0.336 61 R 0.001 0.001 0.063 0.794 0.026 0.091 0.025 62 E 0.002 0.001 0.076 0.783 0.019 0.105 0.014 63 M 0.004 0.002 0.078 0.807 0.024 0.061 0.025 64 I 0.008 0.004 0.065 0.835 0.010 0.045 0.033 65 K 0.019 0.002 0.130 0.723 0.022 0.085 0.019 66 S 0.029 0.001 0.180 0.652 0.021 0.101 0.015 67 A 0.034 0.006 0.132 0.645 0.027 0.124 0.033 68 F 0.127 0.020 0.052 0.447 0.070 0.194 0.089 69 L 0.193 0.009 0.032 0.166 0.176 0.133 0.291 70 P 0.255 0.029 0.040 0.119 0.107 0.104 0.346 71 V 0.313 0.023 0.058 0.085 0.103 0.088 0.331 72 G 0.339 0.013 0.071 0.068 0.189 0.119 0.200 73 A 0.495 0.017 0.053 0.033 0.109 0.066 0.228 74 F 0.586 0.032 0.027 0.023 0.087 0.056 0.189 75 N 0.441 0.035 0.022 0.022 0.078 0.079 0.324 76 S 0.164 0.010 0.048 0.026 0.191 0.339 0.223 77 D 0.108 0.009 0.036 0.012 0.247 0.450 0.138 78 N 0.211 0.014 0.039 0.007 0.211 0.192 0.326 79 F 0.552 0.042 0.013 0.004 0.117 0.052 0.220 80 K 0.634 0.048 0.010 0.005 0.060 0.042 0.201 81 S 0.554 0.032 0.012 0.004 0.083 0.054 0.261 82 K 0.340 0.019 0.013 0.005 0.153 0.133 0.337 83 G 0.337 0.021 0.019 0.006 0.224 0.178 0.216 84 R 0.422 0.031 0.013 0.006 0.147 0.075 0.305 85 G 0.434 0.036 0.015 0.005 0.125 0.066 0.319 86 F 0.357 0.028 0.021 0.008 0.139 0.047 0.401 87 N 0.358 0.104 0.040 0.012 0.125 0.057 0.305 88 W 0.287 0.022 0.105 0.026 0.123 0.116 0.320 89 A 0.313 0.021 0.117 0.024 0.141 0.152 0.232 90 N 0.332 0.039 0.085 0.032 0.122 0.091 0.298 91 F 0.252 0.031 0.030 0.039 0.220 0.057 0.370 92 D 0.158 0.023 0.043 0.040 0.086 0.069 0.581 93 S 0.031 0.006 0.129 0.070 0.091 0.609 0.064 94 V 0.023 0.005 0.147 0.037 0.095 0.654 0.039 95 K 0.037 0.004 0.081 0.025 0.222 0.523 0.109 96 K 0.069 0.015 0.019 0.011 0.225 0.392 0.270 97 K 0.422 0.019 0.010 0.007 0.070 0.040 0.431 98 C 0.802 0.027 0.007 0.005 0.013 0.013 0.133 99 Y 0.877 0.004 0.004 0.007 0.014 0.005 0.089 100 I 0.904 0.007 0.006 0.009 0.012 0.012 0.050 101 F 0.815 0.014 0.004 0.010 0.020 0.022 0.115 102 N 0.429 0.009 0.005 0.008 0.086 0.071 0.392 103 T 0.111 0.018 0.005 0.012 0.365 0.063 0.425 104 K 0.045 0.012 0.004 0.003 0.413 0.024 0.499 105 P 0.022 0.005 0.056 0.024 0.287 0.397 0.209 106 T 0.049 0.016 0.090 0.023 0.407 0.278 0.137 107 C 0.379 0.050 0.080 0.034 0.082 0.054 0.320 108 L 0.657 0.010 0.028 0.030 0.024 0.082 0.169 109 I 0.729 0.019 0.010 0.014 0.043 0.088 0.096 110 N 0.451 0.047 0.011 0.021 0.083 0.121 0.266 111 D 0.071 0.006 0.006 0.005 0.112 0.045 0.755 112 K 0.011 0.002 0.021 0.011 0.098 0.832 0.025 113 N 0.024 0.002 0.019 0.008 0.088 0.827 0.032 114 F 0.423 0.023 0.012 0.027 0.123 0.043 0.350 115 I 0.776 0.057 0.004 0.026 0.020 0.015 0.102 116 A 0.822 0.011 0.008 0.025 0.024 0.017 0.093 117 T 0.749 0.011 0.024 0.050 0.035 0.019 0.112 118 T 0.673 0.011 0.025 0.054 0.041 0.020 0.176 119 A 0.525 0.012 0.059 0.063 0.051 0.087 0.203 120 L 0.342 0.024 0.039 0.085 0.148 0.178 0.183 121 S 0.111 0.008 0.033 0.047 0.254 0.112 0.435 122 H 0.042 0.010 0.052 0.054 0.217 0.073 0.552 123 P 0.056 0.016 0.095 0.064 0.155 0.227 0.388 124 Q 0.018 0.015 0.073 0.043 0.009 0.207 0.635 125 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997