# TARGET T0231 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0231.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 142 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.018 0.007 0.006 0.010 0.013 0.010 0.936 2 S 0.116 0.049 0.037 0.047 0.025 0.083 0.643 3 D 0.105 0.020 0.071 0.048 0.300 0.162 0.294 4 S 0.109 0.010 0.108 0.043 0.225 0.263 0.242 5 L 0.197 0.019 0.050 0.027 0.211 0.141 0.355 6 V 0.281 0.009 0.032 0.022 0.218 0.070 0.369 7 V 0.488 0.030 0.026 0.012 0.107 0.081 0.256 8 C 0.502 0.011 0.008 0.011 0.066 0.015 0.386 9 E 0.411 0.065 0.006 0.004 0.039 0.008 0.467 10 V 0.120 0.076 0.003 0.006 0.080 0.006 0.709 11 D 0.017 0.002 0.001 0.005 0.044 0.003 0.928 12 P 0.001 0.001 0.027 0.912 0.015 0.039 0.007 13 E 0.001 0.001 0.018 0.951 0.006 0.021 0.004 14 L 0.001 0.001 0.011 0.975 0.002 0.009 0.003 15 K 0.001 0.001 0.002 0.989 0.003 0.003 0.003 16 E 0.001 0.001 0.001 0.986 0.001 0.008 0.002 17 T 0.001 0.001 0.001 0.981 0.001 0.014 0.002 18 L 0.001 0.001 0.002 0.976 0.004 0.012 0.004 19 R 0.001 0.001 0.008 0.941 0.004 0.042 0.004 20 K 0.001 0.001 0.009 0.798 0.006 0.181 0.004 21 F 0.007 0.003 0.015 0.712 0.031 0.174 0.058 22 R 0.054 0.018 0.022 0.493 0.075 0.167 0.171 23 F 0.199 0.021 0.037 0.259 0.086 0.078 0.319 24 R 0.174 0.010 0.063 0.262 0.096 0.132 0.262 25 K 0.076 0.007 0.080 0.183 0.126 0.378 0.149 26 E 0.037 0.002 0.070 0.046 0.192 0.485 0.167 27 T 0.075 0.009 0.063 0.020 0.308 0.335 0.190 28 N 0.292 0.009 0.024 0.006 0.151 0.170 0.348 29 N 0.563 0.007 0.002 0.001 0.051 0.009 0.367 30 A 0.798 0.003 0.001 0.001 0.070 0.003 0.125 31 A 0.979 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 32 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 33 I 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 34 M 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 35 K 0.978 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.019 36 V 0.925 0.005 0.001 0.001 0.009 0.001 0.060 37 D 0.574 0.012 0.001 0.001 0.020 0.005 0.387 38 K 0.063 0.002 0.045 0.002 0.111 0.739 0.038 39 D 0.023 0.002 0.045 0.001 0.111 0.800 0.018 40 R 0.249 0.005 0.045 0.003 0.221 0.220 0.257 41 Q 0.640 0.007 0.003 0.001 0.059 0.021 0.269 42 M 0.926 0.007 0.001 0.001 0.011 0.002 0.052 43 V 0.965 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.028 44 V 0.960 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.032 45 L 0.917 0.004 0.002 0.001 0.006 0.002 0.068 46 E 0.824 0.008 0.004 0.002 0.023 0.008 0.130 47 D 0.642 0.012 0.009 0.005 0.073 0.028 0.229 48 E 0.291 0.017 0.020 0.009 0.180 0.064 0.418 49 L 0.110 0.013 0.021 0.006 0.193 0.073 0.584 50 Q 0.084 0.011 0.032 0.009 0.255 0.165 0.443 51 N 0.060 0.015 0.022 0.012 0.210 0.167 0.514 52 I 0.042 0.045 0.009 0.010 0.304 0.038 0.551 53 S 0.043 0.081 0.005 0.023 0.140 0.016 0.693 54 P 0.002 0.001 0.131 0.780 0.015 0.045 0.025 55 E 0.002 0.001 0.160 0.755 0.011 0.057 0.014 56 E 0.001 0.002 0.188 0.733 0.011 0.059 0.007 57 L 0.002 0.003 0.105 0.807 0.023 0.045 0.015 58 K 0.003 0.003 0.251 0.642 0.007 0.071 0.024 59 L 0.006 0.001 0.267 0.457 0.010 0.230 0.029 60 E 0.005 0.005 0.218 0.350 0.023 0.345 0.054 61 L 0.009 0.023 0.015 0.026 0.436 0.033 0.458 62 P 0.010 0.018 0.063 0.007 0.047 0.057 0.797 63 E 0.004 0.003 0.119 0.006 0.082 0.725 0.062 64 R 0.006 0.002 0.126 0.003 0.114 0.712 0.037 65 Q 0.112 0.012 0.008 0.002 0.380 0.018 0.469 66 P 0.233 0.005 0.001 0.001 0.085 0.004 0.673 67 R 0.851 0.002 0.001 0.001 0.073 0.001 0.072 68 F 0.989 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 69 V 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 70 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 71 Y 0.965 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.030 72 S 0.813 0.002 0.001 0.001 0.023 0.002 0.159 73 Y 0.547 0.006 0.006 0.001 0.102 0.043 0.294 74 K 0.393 0.031 0.015 0.003 0.188 0.078 0.292 75 Y 0.468 0.021 0.015 0.005 0.189 0.065 0.237 76 V 0.475 0.069 0.008 0.009 0.108 0.042 0.290 77 H 0.237 0.034 0.016 0.012 0.106 0.073 0.523 78 D 0.063 0.010 0.038 0.018 0.155 0.551 0.165 79 D 0.020 0.004 0.051 0.018 0.168 0.681 0.058 80 G 0.054 0.014 0.054 0.023 0.329 0.311 0.214 81 R 0.107 0.034 0.036 0.018 0.145 0.140 0.520 82 V 0.181 0.116 0.053 0.025 0.138 0.139 0.348 83 S 0.133 0.040 0.047 0.018 0.223 0.186 0.353 84 Y 0.077 0.005 0.003 0.002 0.410 0.013 0.490 85 P 0.182 0.002 0.002 0.001 0.350 0.015 0.448 86 L 0.926 0.007 0.001 0.001 0.006 0.001 0.060 87 C 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 88 F 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 89 I 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 90 F 0.920 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.071 91 S 0.756 0.009 0.001 0.001 0.038 0.002 0.192 92 S 0.214 0.029 0.004 0.001 0.070 0.009 0.673 93 P 0.038 0.008 0.092 0.006 0.219 0.330 0.306 94 V 0.004 0.004 0.077 0.007 0.141 0.712 0.056 95 G 0.006 0.006 0.071 0.011 0.273 0.520 0.114 96 C 0.012 0.012 0.009 0.023 0.477 0.033 0.434 97 K 0.067 0.047 0.005 0.034 0.084 0.044 0.720 98 P 0.069 0.026 0.047 0.458 0.043 0.060 0.297 99 E 0.076 0.012 0.052 0.590 0.052 0.044 0.173 100 Q 0.053 0.003 0.061 0.780 0.021 0.038 0.042 101 Q 0.078 0.004 0.042 0.771 0.026 0.041 0.038 102 M 0.190 0.012 0.029 0.663 0.021 0.033 0.052 103 M 0.151 0.003 0.034 0.683 0.037 0.033 0.058 104 Y 0.195 0.003 0.020 0.675 0.040 0.035 0.032 105 A 0.093 0.003 0.024 0.785 0.015 0.045 0.035 106 G 0.066 0.011 0.026 0.718 0.033 0.089 0.057 107 S 0.037 0.007 0.014 0.700 0.052 0.064 0.125 108 K 0.007 0.002 0.008 0.866 0.023 0.026 0.068 109 N 0.002 0.001 0.006 0.956 0.007 0.019 0.011 110 R 0.001 0.001 0.005 0.954 0.005 0.026 0.008 111 L 0.002 0.001 0.005 0.955 0.009 0.016 0.013 112 V 0.002 0.001 0.009 0.956 0.008 0.014 0.010 113 Q 0.004 0.001 0.013 0.889 0.009 0.077 0.009 114 T 0.003 0.001 0.028 0.701 0.024 0.223 0.020 115 A 0.008 0.008 0.025 0.244 0.123 0.484 0.107 116 E 0.016 0.002 0.010 0.016 0.138 0.507 0.311 117 L 0.102 0.012 0.014 0.011 0.175 0.043 0.643 118 T 0.421 0.014 0.007 0.005 0.077 0.012 0.465 119 K 0.768 0.006 0.005 0.003 0.037 0.005 0.176 120 V 0.956 0.004 0.001 0.001 0.011 0.001 0.026 121 F 0.963 0.005 0.001 0.001 0.003 0.001 0.027 122 E 0.916 0.006 0.001 0.001 0.007 0.002 0.069 123 I 0.561 0.019 0.001 0.001 0.030 0.007 0.380 124 R 0.069 0.014 0.001 0.001 0.445 0.026 0.443 125 T 0.014 0.008 0.002 0.004 0.674 0.016 0.283 126 T 0.001 0.002 0.441 0.277 0.067 0.151 0.061 127 D 0.001 0.001 0.459 0.250 0.046 0.209 0.035 128 D 0.003 0.007 0.470 0.295 0.037 0.140 0.047 129 L 0.013 0.040 0.075 0.443 0.119 0.093 0.217 130 T 0.018 0.013 0.020 0.455 0.073 0.092 0.330 131 E 0.002 0.001 0.010 0.935 0.017 0.021 0.013 132 T 0.002 0.001 0.007 0.959 0.007 0.016 0.009 133 W 0.002 0.001 0.005 0.956 0.004 0.026 0.007 134 L 0.005 0.001 0.003 0.950 0.008 0.015 0.018 135 K 0.007 0.001 0.010 0.942 0.008 0.020 0.013 136 E 0.006 0.001 0.013 0.915 0.009 0.048 0.009 137 K 0.008 0.002 0.013 0.860 0.019 0.079 0.019 138 L 0.054 0.008 0.018 0.556 0.063 0.204 0.097 139 A 0.103 0.005 0.016 0.205 0.137 0.338 0.197 140 F 0.183 0.020 0.014 0.153 0.194 0.134 0.301 141 F 0.145 0.030 0.010 0.060 0.005 0.055 0.694 142 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999