Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 | | | | | 1 MNIFEAIENRHSVRD.FL.E.....RKMPERVKDDIENLLVKFITK.....KLDWKINLSSFPSY 2 MNIFEAIENRHSVRD.FL.E.....RKMPERVKDDIENLLVKFITK.....KLDWKINLSSFPSY 3 ----EIIYKRRSVRK.FE.N.....SELDSDTLKKIQDIIDKAKPLfp6sySVEIVKSKWPIPYF 4 --LIDAINIRTAVRA.YD.D.....EPIDDDTARQLEMALQPINLLg16faEANASGHLTNAANY 5 --LIDAINIRTAVRA.YD.D.....EPIDDDTARQLEMALQPINLLg16faEANASGHLTNAANY 6 MDLIGAIDVRCSRRK.YT.S.....DLIDSNKVIHLENLIEKINKKa17enIRKSYGMFSGVQNY 7 --LYPFIFRRKSTRK.YR.Gpa7elREIEDRL-EKIEPLLEDFDTEfm6erDDVRTRMQRPAPHY 8 ----SAMEKRISRRK.FA.K.....EPITDQEKEKIIALIDEFNAAs17qkLSKSYGLFTNVRSL 9 -EALEVLKKRRSVRK.YI.D.....KPIPKEILEDIIDCARLAPSGn22aeKATYGDFIKNAAAC 10 MSFLELAQKRRSLRS.YL.P.....DPVEQEKLEYVLECARLAPSWk34alLQAPLIVVLCGVPA 11 MELLEGILSRRSVRQ.FT.D.....EPVSPAE--------------.....-------------- 12 ----DFFRTRRSVRK.FI.D.....RPVEEEK--------------.....-------------- 13 MEVLEAIYGRRSVRQ.YT.S.....EPVTREE--------------.....-------------- 14 MGMFDTIQDRRSIRT.YK.S.....ERIPQEK--------------.....-------------- 15 --ILENIYQRRSVRN.YS.D.....KEVSDEIIKEIIRAGTYAPSAv47ylSKPTTRILYGAPVF 16 MDVLEAIKTRRSIRK.YQ.D.....REVPEEL--------------.....-------------- 17 MNTRQLILERRSVRA.YT.D.....QPVPNEM--------------.....-------------- 18 NNTIDTMKNHRSIRQ.YL.D.....KEVPNDLIDEIVKSAQAMPNSi44fyRTYLAGEKTGLKQV 19 NDILEFLIKRRSVRS.FQ.Q.....KPVDLEL--------------.....-------------- 20 MEFFEVLKKRRSIRR.FQ.D.....KPVPREL--------------.....-------------- 21 MDLKEAIYSRHAVRE.FT.S.....QPVDEDV--------------.....-------------- 22 -----EIEERRSIRK.YI.D.....KPVEEEK--------------.....-------------- 23 NDFYSLIEQRQSDRK.FDpD.....RPVPEDV--------------.....-------------- 24 -ELYEAIKTRRSIRK.FK.P.....DPVPREV--------------.....-------------- 25 -KVIDIILNRRSVRE.FN.D.....RPISKEE--------------.....-------------- 26 MNFFDLVNKRESVRG.YL.D.....KEVEKEKIIKIIEAARVAPSAc39paFIVVVGEKRNLTSK 27 --CLKMIYTRRSIRV.YS.D.....RQISDED--------------.....-------------- 28 ------IYRRRSIRK.YQ.K.....KDVPDEL--------------.....-------------- 29 MDLLKLMGDRYSCRR.YS.T.....EDVKEED--------------.....-------------- 30 ---IETILSRRSVRE.YT.D.....EPVSEKD--------------.....-------------- 31 -----AALKRRSIRR.YR.K.....DPVPEGL--------------.....-------------- 32 MKFLELNKKRHATKH.FT.D.....KPVDPKD--------------.....-------------- 33 --VLDNIYQRRSVRN.FS.D.....KDVSDEIIKEIIRAGTYAPTAv47ylSKPATRIFYGAPVL 34 -----AALKRRSIRR.YR.K.....DPVPEGL--------------.....-------------- 35 -DLDQTIKDRHSTRK.FL.S.....QPVPRAL--------------.....-------------- 36 MKFLELNKKRHATKH.FT.D.....KLVDPKD--------------.....-------------- 37 -NILELMNKRHSVRK.YI.D.....EEIDSSVKKIIEEKVCEVNREs17nsKLAKYGKFENVNNF 38 -----IINNRRSIRN.YK.G.....KKVEKEK--------------.....-------------- 39 --MTEAIESRRSIRQ.FV.Q.....EPLNQDD--------------.....-------------- 40 -----AALKRRSIRR.YR.K.....DPVPEGL--------------.....-------------- 41 ---YDLLKSRRSIRK.FQ.N.....KEVEKEK--------------.....-------------- 42 MKFLELNKKRHAIKT.FN.D.....QPVDYED--------------.....-------------- 43 MQYDDVVRGRRSIRG.YK.P.....DPVPREL--------------.....-------------- 44 MDFLQLVLSRQSDRA.YDkG.....RPVEAEKLERILEAARLSPSAc38pvHILIVEESANITSL 45 MKFLELNKKRHAVKH.FN.D.....KPVDFKD--------------.....-------------- 46 MEFFEVVNRRRSVRR.FK.R.....VKIPEDDVKKIMEAGRLAPTDa42dlYRLRELLKYRGREI 47 NDFEDLMKNRRSIRE.YD.Et....VKISQEE--------------.....-------------- 48 NDFEDLMKNRRSIRE.YD.Et....VKISQEE--------------.....-------------- 49 ----EVILGRRSIRG.YL.D.....KPVPGEV--------------.....-------------- 50 NDFEDLMKNRRSIRE.YD.Et....VKISQEE--------------.....-------------- 51 NDFEDLMKNRRSIRE.YD.Et....VKISQEE--------------.....-------------- 52 -----VIKTRRSHRL.YL.D.....KPVEREK--------------.....-------------- 53 MKVLELAKRRKTVRK.FL.P.....NKPPREL--------------.....-------------- 54 MDVYEAIRKRRDIRS.YYkP.....DPIPDEV--------------.....-------------- 55 MDIYEVIKRRRDIRS.YCkS.....DPIPDEV--------------.....-------------- 56 MKVSEALQQRKSVRA.YL.D.....KPVPQEV--------------.....-------------- 57 -QVLETIKNRRSVRK.FK.K.....EQLKDSE--------------.....-------------- 58 MDVIDAVNRRMSVRA.FK.P.....DPVDAGL--------------.....-------------- 59 ----EAIVSRRSVRA.FL.P.....DMIDDDT--------------.....-------------- 60 -SFLELATKRRSIRK.FQ.D.....KDVPDED--------------.....-------------- 61 -DVPSAIAQRRSIKT.FK.A.....DPIAPEL--------------.....-------------- 62 MQVEDAIRSRKSIRR.FR.P.....DPVPRAQ--------------.....-------------- 63 ----TALITRRSIRA.FL.P.....TPVPRAD--------------.....-------------- 64 MELQEAISNRRSVKK.FK.H.....DMVVDDQ--TVYDAIYKATDAp37dkREDHFHAVTNLGGM 65 -DVPSAIVQRRSIKT.FK.T.....DPIAPEL--------------.....-------------- 66 -DVPSAIVQRRSIKT.FK.T.....DPIAPEL--------------.....-------------- 67 MRVLELAKRRKTVRK.FS.K.....DRPPIEL--------------.....-------------- 68 -----AITTRRSIRA.FL.D.....TPVPRET--------------.....-------------- 69 NDFNEILTGRRSIRK.YDsS.....VKISKEE--------------.....-------------- 70 ---DEAITSRRSVRA.FL.P.....DPVDEGT--------------.....-------------- 71 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IYAKAEKHF.....DELVEYGFQG.EQIVLFLTAQGFGTCWMARSPHP.....DVP.....YIIV 3 LAFCGEN--.....--LENIGFIG.QQISLALSAIGIGSYWKMGKPQG.....EIKsk...YPFV 4 LAIVGPANDe....EAKERAGFYA.ERMVLTATLRGLGTLWVAGSWDKa13gqELY.....LGVV 5 LAIVGPANDe....EAKERAGFYA.ERMVLTATLRGLGTLWVAGSWDKa13gqELY.....LGVV 6 IALVGKNDK.....LLREKVGYYG.EKIVLEATTMNLGTCWVGGSFDK.....EACsa7dnEILV 7 IAAFSDG-Y.....VGKVNVGFML.QQMDLRISGMGLGSCWQGIPKPR.....GHVkse..LDFV 8 IVMKGKKELq....DLKEKLGYYG.EELVLAITDLGLGTCWVGGTFDK.....DELmaddgEELV 9 VIVYCEKDN.....KHHLEDGSAAtQNILLAATAYGIGSCWVAGYNRS.....YEK.....EINE 10 ESEVWEGKD.....YMMLDAGLAM.EHLILAAAEQGLGTCWQGLFAED.....KVR.....EILK 11 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 12 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 13 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 14 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 15 ILVFAAPDV.....IDDRDCALAA.ENMMLAARSLGIGSCWIGLAAGL.....GSD.....TEFL 16 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LGGKVKDKH.....FPLIDIGIAA.AHITLAAESEGLGSCILGWFDEK.....EIKq12llLDIA 45 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 46 VANKLALFV.....FAAVDAALAA.ENMALAATALGYGSCFIGAVQNA.....VYDlv9pd---- 47 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 48 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 49 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 50 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 51 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 52 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 53 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 54 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 55 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 56 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 57 ---------.....----------.-----------------------.....---.....---- 58 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ISMPFG.....KPAEPLFRAKNEFVRKSLEE..IS..EGNDHRLEAARLAPSGLNAQDWYFIAES 4 IGHPKNh19thRATKTYEQFTATMSDEGREA..AP..DWFKSGVEAAMKAPSAMNRQPITFSYNP 5 IGHPKNh19thRATKTYEQFTATMSDEGREA..AP..DWFKSGVEAAMKAPSAMNRQPITFSYNP 6 GVITIGn14ifKAIHRKSKKVEEMCETK-GE..VP..EWFKDGMMAVKKAPSAINKQPVRFYFEN 7 ILLAFG.....AAAEPVHREHSEFRRKPLSK..ITdiEGLDDVLEAVRLAPSAVNNQPWYFTGGN 8 CVVLVGr10ekMVRSATHRKVKAMAERIISDqpLP..QWTENGMKAVLLAPSAKNSQKAMFKYEN 9 YLNVPD.....--------------------..--..--NLRMISIISLGYPAEDPQP------- 10 V-----.....--------------------..--..PENVRVLAMTPLGYPAEERKP------- 11 ------.....--------------------..--..--VEDILRAGAWAPSGLNNQPWRFAVVR 12 ------.....--------------------..--..--LMAILEAGRIAPSAHNYQPWHFLVVR 13 ------.....--------------------..--..--VLEIVQAGSWAPSGLNNQPWRFAIVS 14 ------.....--------------------..--..--LEKLLEAARLAPSAANRQNWKFIVVE 15 KEVGVP.....EGYKLIAPLIFGYPAKDNQK..AP..ARNAD----------------------- 16 ------.....--------------------..--..--IDKILDAAMCGPSAVDERPWHFIVVR 17 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DKTLLa13lkTSAAALASHHFQSILENPDFDIFYHAP.ALVVISAPEGPWV--- 22 EEENRkk6eaSHKQKWMLTAPVIIVCVSDIRSRLDEN.LEISLNED-------- 23 DPDTRr44kkIHYANIDLGIAAAHITLAATAEGLGSC.IIGWVNEAKIREILG- 24 GPKKDevar.SYGRIVEFGMPPAGQRSPQQEGFLQW-.---------------- 25 DPETIlk6ecTHYSIIIEGAPLLIAAFLDTENSYNRTkDVQAIGA--------- 26 -----.....---------------------------.---------------- 27 DREMLkk6eaFTFGQMLPNASAAIVVCADPKLSK---.---------------- 28 NEETKkk6eiHPHAQMSAEAPVVILVCGDPT------.---------------- 29 SNEGKarl..MKDFKFDFKAPCYLVCGYNEEEAWKNP.LDNNKDSGEVD----- 30 DENTIkd6qcTHYSTIVLGSKLLIAVYLDNSEMYH--.---------------- 31 DPATKra6eaAFGQAHVEEAPVVLVLYADLEDAL---.---------------- 32 EKNAEla6ayGSNFEQVSSAPVTIALFTDTDLAKRAR.KI-------------- 33 -----.....---------------------------.---------------- 34 DPATKra6eaAFGQAHVEEAPVVLVLYADLEDAL---.---------------- 35 GDRRDrl9nqAKQQPNVSPLPSAFQYYRQELGAQVYG.AMGITRDDKANRQL-- 36 EKNAEla6ayGSNFEQVSSAPVTIALFTDTDLAKRAR.KI-------------- 37 -----.....---------------------------.---------------- 38 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