# TARGET T0215 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0215.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 3 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.029 0.007 0.007 0.015 0.182 0.759 2 G 0.071 0.030 0.013 0.021 0.216 0.649 3 T 0.117 0.038 0.028 0.038 0.291 0.487 4 S 0.132 0.022 0.059 0.058 0.343 0.386 5 H 0.171 0.029 0.080 0.075 0.358 0.287 6 H 0.198 0.033 0.073 0.076 0.352 0.268 7 H 0.215 0.033 0.050 0.067 0.374 0.260 8 H 0.205 0.035 0.037 0.053 0.412 0.258 9 H 0.159 0.035 0.037 0.046 0.430 0.293 10 H 0.108 0.032 0.046 0.044 0.493 0.278 11 S 0.085 0.019 0.050 0.071 0.528 0.246 12 S 0.090 0.017 0.050 0.073 0.519 0.250 13 G 0.098 0.016 0.032 0.069 0.459 0.325 14 R 0.196 0.025 0.037 0.080 0.337 0.324 15 E 0.305 0.029 0.039 0.129 0.243 0.255 16 N 0.342 0.020 0.041 0.165 0.216 0.217 17 L 0.401 0.018 0.043 0.210 0.166 0.162 18 Y 0.457 0.019 0.030 0.223 0.116 0.155 19 F 0.384 0.011 0.031 0.374 0.099 0.101 20 Q 0.250 0.007 0.034 0.400 0.196 0.115 21 G 0.152 0.011 0.071 0.322 0.281 0.163 22 H 0.130 0.015 0.098 0.292 0.339 0.125 23 M 0.083 0.018 0.145 0.295 0.353 0.106 24 R 0.044 0.011 0.079 0.214 0.430 0.222 25 N 0.029 0.014 0.031 0.108 0.467 0.351 26 L 0.015 0.006 0.108 0.395 0.330 0.146 27 S 0.011 0.005 0.136 0.425 0.305 0.118 28 D 0.019 0.007 0.189 0.470 0.217 0.098 29 R 0.037 0.006 0.089 0.575 0.174 0.119 30 A 0.040 0.005 0.065 0.517 0.205 0.169 31 K 0.038 0.010 0.068 0.611 0.148 0.124 32 F 0.042 0.012 0.079 0.704 0.099 0.064 33 E 0.041 0.003 0.129 0.700 0.089 0.037 34 S 0.045 0.004 0.161 0.628 0.107 0.055 35 M 0.060 0.009 0.096 0.574 0.165 0.095 36 I 0.059 0.039 0.064 0.414 0.211 0.213 37 N 0.034 0.014 0.017 0.085 0.293 0.557 38 S 0.017 0.030 0.051 0.061 0.526 0.314 39 P 0.019 0.027 0.041 0.053 0.504 0.356 40 S 0.021 0.023 0.045 0.047 0.596 0.268 41 K 0.022 0.007 0.046 0.432 0.378 0.114 42 S 0.046 0.004 0.053 0.589 0.251 0.056 43 V 0.128 0.025 0.055 0.547 0.204 0.041 44 F 0.160 0.018 0.046 0.594 0.139 0.042 45 V 0.113 0.017 0.053 0.548 0.228 0.040 46 R 0.055 0.005 0.043 0.498 0.290 0.109 47 N 0.012 0.004 0.010 0.357 0.286 0.332 48 L 0.001 0.002 0.021 0.746 0.107 0.123 49 N 0.001 0.001 0.026 0.844 0.051 0.078 50 E 0.001 0.001 0.026 0.964 0.007 0.002 51 L 0.001 0.001 0.014 0.970 0.009 0.005 52 E 0.001 0.001 0.007 0.975 0.012 0.005 53 A 0.001 0.001 0.006 0.975 0.013 0.005 54 L 0.001 0.001 0.004 0.979 0.011 0.004 55 A 0.001 0.001 0.007 0.973 0.015 0.004 56 V 0.001 0.001 0.009 0.961 0.019 0.009 57 R 0.001 0.001 0.010 0.934 0.033 0.021 58 L 0.001 0.001 0.004 0.889 0.036 0.070 59 G 0.001 0.001 0.004 0.321 0.147 0.525 60 K 0.003 0.003 0.017 0.512 0.187 0.277 61 S 0.022 0.009 0.029 0.629 0.142 0.170 62 Y 0.023 0.004 0.032 0.836 0.054 0.053 63 R 0.041 0.003 0.039 0.839 0.034 0.044 64 I 0.031 0.004 0.035 0.877 0.027 0.026 65 Q 0.030 0.004 0.027 0.873 0.030 0.036 66 L 0.019 0.001 0.057 0.868 0.031 0.024 67 D 0.025 0.002 0.082 0.809 0.055 0.027 68 Q 0.026 0.002 0.112 0.736 0.076 0.047 69 A 0.085 0.006 0.055 0.578 0.130 0.146 70 K 0.133 0.005 0.045 0.418 0.143 0.255 71 E 0.199 0.009 0.030 0.448 0.117 0.198 72 K 0.349 0.009 0.022 0.307 0.097 0.215 73 W 0.419 0.010 0.013 0.144 0.083 0.331 74 K 0.328 0.036 0.014 0.107 0.090 0.425 75 V 0.090 0.016 0.009 0.056 0.058 0.772 76 K 0.001 0.001 0.001 0.003 0.021 0.973