# TARGET T0214 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0214.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.083 0.003 0.003 0.009 0.164 0.738 2 E 0.450 0.030 0.005 0.022 0.073 0.420 3 W 0.618 0.034 0.008 0.023 0.061 0.256 4 E 0.601 0.014 0.023 0.037 0.092 0.232 5 M 0.350 0.017 0.031 0.046 0.192 0.364 6 G 0.114 0.012 0.031 0.023 0.416 0.404 7 L 0.071 0.021 0.032 0.015 0.496 0.366 8 Q 0.070 0.015 0.025 0.068 0.380 0.443 9 E 0.088 0.017 0.059 0.302 0.316 0.218 10 E 0.068 0.008 0.037 0.482 0.211 0.194 11 F 0.047 0.003 0.041 0.784 0.071 0.055 12 L 0.073 0.003 0.016 0.858 0.030 0.021 13 E 0.040 0.003 0.009 0.926 0.013 0.010 14 L 0.026 0.001 0.010 0.938 0.013 0.012 15 I 0.026 0.001 0.009 0.946 0.010 0.009 16 K 0.022 0.001 0.010 0.949 0.011 0.007 17 L 0.017 0.002 0.013 0.878 0.045 0.046 18 R 0.019 0.003 0.003 0.021 0.264 0.689 19 K 0.043 0.001 0.002 0.003 0.287 0.665 20 K 0.437 0.013 0.001 0.002 0.187 0.361 21 K 0.826 0.010 0.001 0.002 0.042 0.118 22 I 0.962 0.003 0.001 0.001 0.007 0.027 23 E 0.968 0.002 0.001 0.001 0.005 0.024 24 G 0.954 0.001 0.001 0.001 0.007 0.037 25 R 0.901 0.004 0.001 0.001 0.016 0.078 26 L 0.631 0.013 0.001 0.001 0.052 0.302 27 Y 0.157 0.006 0.004 0.007 0.169 0.657 28 D 0.034 0.005 0.212 0.154 0.419 0.176 29 E 0.024 0.005 0.252 0.219 0.422 0.077 30 K 0.019 0.002 0.234 0.253 0.417 0.075 31 R 0.026 0.009 0.176 0.318 0.289 0.182 32 R 0.039 0.016 0.155 0.343 0.254 0.193 33 Q 0.062 0.017 0.148 0.261 0.243 0.269 34 I 0.082 0.038 0.044 0.086 0.298 0.452 35 K 0.048 0.029 0.020 0.035 0.776 0.093 36 P 0.045 0.005 0.017 0.017 0.859 0.057 37 G 0.028 0.001 0.005 0.002 0.916 0.048 38 D 0.365 0.008 0.004 0.001 0.556 0.065 39 V 0.912 0.006 0.001 0.001 0.028 0.054 40 I 0.970 0.007 0.001 0.001 0.008 0.014 41 S 0.963 0.003 0.001 0.001 0.013 0.020 42 F 0.892 0.006 0.002 0.001 0.055 0.044 43 E 0.434 0.011 0.009 0.003 0.398 0.145 44 G 0.081 0.003 0.021 0.008 0.777 0.111 45 G 0.091 0.021 0.024 0.010 0.728 0.126 46 K 0.254 0.021 0.008 0.003 0.345 0.368 47 L 0.699 0.011 0.002 0.002 0.067 0.219 48 K 0.900 0.003 0.001 0.001 0.012 0.084 49 V 0.966 0.002 0.001 0.001 0.004 0.027 50 R 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 51 V 0.985 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 52 K 0.934 0.001 0.001 0.001 0.015 0.050 53 A 0.930 0.002 0.001 0.001 0.021 0.046 54 I 0.929 0.005 0.001 0.002 0.023 0.040 55 R 0.904 0.004 0.002 0.002 0.036 0.051 56 V 0.844 0.004 0.004 0.004 0.043 0.101 57 Y 0.698 0.013 0.005 0.014 0.083 0.186 58 N 0.492 0.013 0.008 0.061 0.153 0.273 59 S 0.323 0.030 0.003 0.074 0.091 0.479 60 F 0.010 0.001 0.008 0.953 0.015 0.013 61 R 0.001 0.001 0.007 0.986 0.005 0.001 62 E 0.001 0.001 0.012 0.977 0.009 0.001 63 M 0.001 0.001 0.007 0.975 0.014 0.002 64 L 0.002 0.001 0.004 0.969 0.015 0.010 65 E 0.005 0.001 0.005 0.952 0.022 0.015 66 K 0.009 0.001 0.004 0.870 0.056 0.061 67 E 0.019 0.006 0.008 0.702 0.111 0.155 68 G 0.018 0.006 0.016 0.234 0.213 0.513 69 L 0.026 0.005 0.177 0.192 0.326 0.273 70 E 0.092 0.013 0.219 0.197 0.263 0.216 71 N 0.135 0.023 0.134 0.173 0.251 0.284 72 V 0.162 0.078 0.019 0.068 0.162 0.511 73 L 0.057 0.044 0.017 0.029 0.711 0.142 74 P 0.011 0.006 0.040 0.019 0.864 0.059 75 G 0.005 0.001 0.017 0.008 0.913 0.056 76 V 0.019 0.017 0.008 0.007 0.843 0.106 77 K 0.044 0.057 0.001 0.006 0.141 0.751 78 S 0.073 0.179 0.003 0.038 0.089 0.618 79 I 0.001 0.001 0.014 0.958 0.017 0.010 80 E 0.001 0.001 0.009 0.981 0.008 0.001 81 E 0.001 0.001 0.009 0.981 0.009 0.001 82 G 0.001 0.001 0.002 0.986 0.007 0.003 83 I 0.002 0.001 0.002 0.981 0.010 0.005 84 Q 0.002 0.001 0.002 0.978 0.013 0.005 85 V 0.002 0.001 0.002 0.968 0.019 0.010 86 Y 0.002 0.001 0.004 0.961 0.018 0.014 87 R 0.003 0.002 0.025 0.876 0.049 0.045 88 R 0.006 0.001 0.036 0.856 0.057 0.044 89 F 0.014 0.002 0.026 0.801 0.071 0.086 90 Y 0.033 0.017 0.004 0.226 0.118 0.602 91 D 0.016 0.010 0.003 0.173 0.142 0.656 92 E 0.001 0.001 0.005 0.962 0.018 0.014 93 E 0.001 0.001 0.004 0.957 0.030 0.007 94 K 0.002 0.001 0.005 0.950 0.036 0.006 95 E 0.006 0.001 0.006 0.924 0.047 0.016 96 K 0.005 0.002 0.009 0.913 0.061 0.011 97 K 0.007 0.002 0.017 0.747 0.192 0.035 98 Y 0.014 0.002 0.007 0.296 0.438 0.243 99 G 0.016 0.004 0.001 0.005 0.348 0.625 100 V 0.342 0.004 0.001 0.001 0.128 0.525 101 V 0.935 0.002 0.001 0.001 0.009 0.054 102 A 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 103 I 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 104 E 0.980 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 105 I 0.920 0.001 0.001 0.001 0.014 0.063 106 E 0.810 0.002 0.004 0.002 0.056 0.125 107 P 0.580 0.014 0.038 0.009 0.118 0.241 108 L 0.379 0.027 0.061 0.017 0.163 0.353 109 E 0.175 0.012 0.035 0.014 0.179 0.585 110 Y 0.003 0.002 0.002 0.002 0.034 0.957