# TARGET T0214 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0214.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 E 0.361 0.021 0.003 0.061 0.007 0.014 0.534 3 W 0.633 0.037 0.008 0.040 0.037 0.018 0.228 4 E 0.645 0.013 0.018 0.048 0.026 0.025 0.226 5 M 0.483 0.009 0.052 0.079 0.091 0.085 0.199 6 G 0.284 0.006 0.063 0.065 0.165 0.144 0.274 7 L 0.241 0.014 0.040 0.082 0.169 0.084 0.370 8 Q 0.281 0.012 0.015 0.144 0.097 0.052 0.399 9 E 0.079 0.015 0.034 0.440 0.094 0.064 0.275 10 E 0.038 0.011 0.034 0.714 0.049 0.058 0.097 11 F 0.033 0.006 0.037 0.785 0.026 0.047 0.067 12 L 0.047 0.002 0.022 0.858 0.016 0.021 0.035 13 E 0.072 0.001 0.012 0.871 0.008 0.013 0.022 14 L 0.071 0.002 0.016 0.859 0.014 0.019 0.020 15 I 0.066 0.002 0.013 0.859 0.016 0.027 0.018 16 K 0.034 0.003 0.020 0.815 0.021 0.074 0.033 17 L 0.009 0.001 0.013 0.227 0.094 0.633 0.023 18 R 0.006 0.001 0.003 0.010 0.068 0.862 0.049 19 K 0.099 0.005 0.002 0.002 0.134 0.030 0.728 20 K 0.504 0.012 0.001 0.002 0.099 0.004 0.378 21 K 0.884 0.005 0.002 0.002 0.011 0.002 0.095 22 I 0.951 0.002 0.004 0.002 0.005 0.002 0.034 23 E 0.964 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.027 24 G 0.899 0.003 0.003 0.003 0.007 0.002 0.083 25 R 0.789 0.011 0.003 0.005 0.022 0.007 0.164 26 L 0.457 0.018 0.014 0.009 0.058 0.043 0.401 27 Y 0.115 0.013 0.013 0.015 0.151 0.036 0.656 28 D 0.047 0.011 0.127 0.210 0.220 0.100 0.286 29 E 0.026 0.008 0.221 0.330 0.151 0.135 0.130 30 K 0.019 0.009 0.286 0.355 0.102 0.108 0.121 31 R 0.021 0.006 0.446 0.304 0.038 0.080 0.106 32 R 0.048 0.001 0.316 0.232 0.034 0.295 0.074 33 Q 0.048 0.011 0.252 0.124 0.033 0.421 0.112 34 I 0.022 0.011 0.011 0.013 0.189 0.016 0.738 35 K 0.026 0.006 0.015 0.003 0.061 0.015 0.874 36 P 0.011 0.004 0.049 0.005 0.098 0.802 0.031 37 G 0.009 0.001 0.034 0.001 0.033 0.905 0.018 38 D 0.300 0.008 0.007 0.001 0.060 0.016 0.608 39 V 0.905 0.014 0.001 0.001 0.011 0.003 0.066 40 I 0.975 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 41 S 0.977 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.018 42 F 0.951 0.005 0.001 0.001 0.004 0.002 0.038 43 E 0.632 0.006 0.003 0.001 0.059 0.158 0.141 44 G 0.043 0.001 0.014 0.001 0.274 0.618 0.048 45 G 0.080 0.004 0.022 0.002 0.330 0.454 0.108 46 K 0.486 0.012 0.009 0.001 0.100 0.108 0.284 47 L 0.848 0.011 0.001 0.001 0.025 0.002 0.113 48 K 0.949 0.003 0.001 0.001 0.005 0.001 0.042 49 V 0.957 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.038 50 R 0.981 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.014 51 V 0.933 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.059 52 K 0.946 0.002 0.003 0.001 0.012 0.003 0.034 53 A 0.937 0.004 0.003 0.002 0.007 0.002 0.046 54 I 0.883 0.003 0.005 0.006 0.023 0.012 0.067 55 R 0.898 0.007 0.003 0.008 0.019 0.010 0.055 56 V 0.781 0.013 0.007 0.012 0.043 0.020 0.124 57 Y 0.545 0.012 0.010 0.033 0.095 0.056 0.249 58 N 0.352 0.030 0.014 0.052 0.260 0.067 0.224 59 S 0.235 0.042 0.005 0.110 0.143 0.040 0.425 60 F 0.008 0.001 0.025 0.893 0.019 0.026 0.027 61 R 0.001 0.001 0.021 0.957 0.006 0.010 0.005 62 E 0.001 0.001 0.032 0.946 0.003 0.014 0.004 63 M 0.001 0.001 0.019 0.952 0.002 0.021 0.004 64 L 0.005 0.003 0.017 0.896 0.007 0.060 0.013 65 E 0.008 0.002 0.028 0.775 0.015 0.153 0.019 66 K 0.011 0.004 0.027 0.759 0.055 0.095 0.050 67 E 0.022 0.007 0.053 0.599 0.101 0.088 0.130 68 G 0.022 0.009 0.088 0.290 0.082 0.231 0.277 69 L 0.012 0.007 0.261 0.387 0.051 0.153 0.129 70 E 0.032 0.003 0.290 0.344 0.095 0.140 0.095 71 N 0.037 0.007 0.272 0.362 0.082 0.135 0.104 72 V 0.047 0.049 0.064 0.251 0.236 0.101 0.252 73 L 0.018 0.014 0.021 0.042 0.145 0.080 0.681 74 P 0.010 0.006 0.025 0.034 0.203 0.390 0.331 75 G 0.010 0.008 0.024 0.034 0.295 0.434 0.195 76 V 0.016 0.009 0.010 0.036 0.516 0.076 0.336 77 K 0.042 0.041 0.008 0.083 0.253 0.030 0.542 78 S 0.040 0.091 0.010 0.244 0.060 0.018 0.536 79 I 0.001 0.001 0.010 0.957 0.007 0.011 0.012 80 E 0.001 0.001 0.004 0.979 0.003 0.010 0.003 81 E 0.001 0.001 0.004 0.983 0.002 0.009 0.002 82 G 0.001 0.001 0.002 0.983 0.001 0.011 0.002 83 I 0.001 0.001 0.001 0.984 0.003 0.008 0.003 84 Q 0.002 0.001 0.003 0.982 0.002 0.008 0.002 85 V 0.001 0.001 0.004 0.981 0.003 0.008 0.003 86 Y 0.002 0.001 0.010 0.968 0.002 0.013 0.004 87 R 0.003 0.001 0.030 0.882 0.007 0.072 0.005 88 R 0.004 0.001 0.024 0.745 0.011 0.208 0.008 89 F 0.009 0.004 0.019 0.480 0.129 0.271 0.088 90 Y 0.028 0.068 0.004 0.139 0.266 0.096 0.400 91 D 0.004 0.004 0.001 0.039 0.069 0.008 0.874 92 E 0.001 0.001 0.029 0.922 0.007 0.028 0.014 93 E 0.001 0.001 0.042 0.920 0.005 0.028 0.005 94 K 0.001 0.001 0.054 0.910 0.006 0.022 0.006 95 E 0.005 0.001 0.029 0.917 0.011 0.024 0.013 96 K 0.011 0.004 0.066 0.796 0.015 0.082 0.025 97 K 0.013 0.003 0.067 0.539 0.044 0.304 0.030 98 Y 0.011 0.003 0.023 0.233 0.068 0.626 0.036 99 G 0.050 0.009 0.009 0.034 0.211 0.406 0.282 100 V 0.180 0.008 0.002 0.004 0.069 0.013 0.723 101 V 0.522 0.005 0.004 0.003 0.154 0.013 0.299 102 A 0.885 0.005 0.003 0.002 0.013 0.003 0.089 103 I 0.967 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.028 104 E 0.965 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.031 105 I 0.928 0.003 0.001 0.002 0.004 0.001 0.063 106 E 0.871 0.003 0.001 0.004 0.013 0.002 0.106 107 P 0.683 0.007 0.004 0.011 0.032 0.016 0.248 108 L 0.286 0.012 0.010 0.018 0.114 0.089 0.470 109 E 0.128 0.013 0.007 0.012 0.016 0.094 0.730 110 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999