# TARGET T0212 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0212.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 53 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 S 0.230 0.034 0.004 0.009 0.003 0.009 0.711 3 A 0.299 0.029 0.008 0.011 0.119 0.025 0.509 4 L 0.282 0.039 0.012 0.011 0.069 0.046 0.540 5 D 0.102 0.007 0.012 0.003 0.176 0.037 0.663 6 N 0.043 0.005 0.013 0.001 0.461 0.345 0.131 7 S 0.146 0.010 0.010 0.001 0.193 0.236 0.405 8 I 0.656 0.007 0.001 0.001 0.056 0.003 0.278 9 R 0.962 0.004 0.001 0.001 0.006 0.001 0.028 10 V 0.979 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 11 E 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.013 12 V 0.958 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.035 13 K 0.854 0.003 0.001 0.001 0.024 0.004 0.115 14 T 0.668 0.005 0.004 0.002 0.082 0.016 0.223 15 E 0.515 0.006 0.013 0.005 0.113 0.054 0.295 16 Y 0.592 0.034 0.009 0.007 0.087 0.034 0.237 17 I 0.508 0.042 0.012 0.014 0.102 0.023 0.299 18 E 0.293 0.025 0.014 0.015 0.117 0.037 0.500 19 Q 0.138 0.022 0.210 0.103 0.170 0.165 0.192 20 Q 0.114 0.014 0.221 0.097 0.161 0.206 0.187 21 S 0.094 0.018 0.080 0.068 0.312 0.118 0.310 22 S 0.042 0.014 0.028 0.029 0.259 0.043 0.584 23 P 0.008 0.003 0.271 0.097 0.093 0.400 0.128 24 E 0.008 0.003 0.374 0.041 0.085 0.409 0.079 25 D 0.015 0.005 0.408 0.015 0.092 0.398 0.067 26 E 0.084 0.003 0.086 0.004 0.214 0.325 0.285 27 K 0.345 0.005 0.010 0.001 0.334 0.019 0.286 28 Y 0.931 0.014 0.001 0.001 0.009 0.001 0.043 29 L 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 30 F 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 31 S 0.961 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.036 32 Y 0.957 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.030 33 T 0.962 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.030 34 I 0.968 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.029 35 T 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 36 I 0.981 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 37 I 0.935 0.003 0.001 0.002 0.007 0.004 0.048 38 N 0.749 0.007 0.004 0.006 0.072 0.025 0.137 39 L 0.176 0.003 0.006 0.006 0.282 0.064 0.462 40 G 0.042 0.004 0.006 0.006 0.530 0.136 0.276 41 E 0.040 0.006 0.018 0.014 0.396 0.227 0.299 42 Q 0.160 0.015 0.026 0.056 0.250 0.056 0.437 43 A 0.437 0.018 0.020 0.117 0.085 0.024 0.300 44 A 0.557 0.010 0.020 0.193 0.028 0.015 0.177 45 K 0.689 0.010 0.018 0.198 0.020 0.014 0.051 46 L 0.741 0.010 0.018 0.131 0.010 0.015 0.074 47 E 0.754 0.005 0.027 0.081 0.023 0.035 0.076 48 T 0.737 0.009 0.037 0.060 0.056 0.031 0.069 49 R 0.745 0.005 0.032 0.033 0.048 0.035 0.101 50 H 0.799 0.002 0.010 0.010 0.044 0.020 0.114 51 W 0.872 0.002 0.006 0.009 0.051 0.009 0.051 52 I 0.959 0.003 0.001 0.005 0.005 0.003 0.024 53 I 0.954 0.005 0.001 0.004 0.005 0.002 0.029 54 T 0.887 0.014 0.001 0.003 0.010 0.004 0.081 55 D 0.266 0.004 0.007 0.004 0.043 0.099 0.578 56 A 0.056 0.004 0.009 0.002 0.194 0.636 0.099 57 N 0.013 0.002 0.010 0.002 0.288 0.647 0.039 58 G 0.041 0.005 0.005 0.002 0.626 0.141 0.179 59 K 0.370 0.046 0.007 0.005 0.052 0.019 0.501 60 T 0.856 0.036 0.003 0.002 0.011 0.005 0.086 61 S 0.924 0.005 0.004 0.005 0.013 0.004 0.045 62 E 0.926 0.008 0.006 0.004 0.010 0.005 0.041 63 V 0.844 0.010 0.005 0.009 0.016 0.009 0.106 64 Q 0.721 0.010 0.011 0.012 0.061 0.024 0.160 65 G 0.494 0.016 0.016 0.023 0.152 0.041 0.258 66 A 0.295 0.016 0.037 0.031 0.168 0.094 0.359 67 G 0.247 0.014 0.073 0.062 0.163 0.136 0.305 68 V 0.221 0.074 0.094 0.088 0.134 0.077 0.311 69 V 0.182 0.035 0.083 0.071 0.159 0.094 0.376 70 G 0.138 0.010 0.048 0.035 0.225 0.144 0.399 71 E 0.159 0.036 0.032 0.019 0.211 0.094 0.449 72 T 0.104 0.016 0.013 0.006 0.182 0.020 0.659 73 P 0.091 0.012 0.011 0.003 0.093 0.042 0.747 74 T 0.180 0.054 0.025 0.003 0.155 0.070 0.512 75 I 0.125 0.145 0.012 0.003 0.236 0.021 0.458 76 P 0.040 0.018 0.010 0.001 0.034 0.017 0.881 77 P 0.005 0.002 0.015 0.001 0.062 0.895 0.021 78 N 0.010 0.003 0.018 0.001 0.103 0.839 0.027 79 T 0.166 0.016 0.006 0.001 0.216 0.021 0.575 80 A 0.672 0.028 0.001 0.001 0.037 0.010 0.252 81 Y 0.934 0.011 0.001 0.001 0.009 0.002 0.044 82 Q 0.946 0.005 0.001 0.001 0.007 0.001 0.040 83 Y 0.905 0.008 0.001 0.001 0.008 0.002 0.076 84 T 0.718 0.009 0.004 0.001 0.041 0.019 0.209 85 S 0.486 0.011 0.012 0.003 0.164 0.124 0.201 86 G 0.398 0.012 0.010 0.002 0.228 0.094 0.257 87 T 0.474 0.023 0.005 0.002 0.157 0.018 0.322 88 V 0.494 0.099 0.003 0.001 0.045 0.013 0.345 89 L 0.242 0.068 0.004 0.001 0.053 0.025 0.607 90 D 0.120 0.039 0.005 0.001 0.379 0.073 0.383 91 T 0.033 0.009 0.002 0.001 0.654 0.016 0.285 92 P 0.078 0.013 0.012 0.002 0.432 0.115 0.348 93 F 0.419 0.024 0.009 0.002 0.139 0.077 0.331 94 G 0.840 0.012 0.004 0.001 0.062 0.020 0.062 95 I 0.935 0.009 0.002 0.001 0.007 0.011 0.036 96 M 0.943 0.007 0.001 0.001 0.007 0.008 0.033 97 Y 0.827 0.003 0.003 0.001 0.046 0.050 0.071 98 G 0.811 0.003 0.003 0.001 0.069 0.039 0.075 99 T 0.937 0.002 0.001 0.001 0.015 0.004 0.041 100 Y 0.975 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.018 101 G 0.980 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.014 102 M 0.967 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.026 103 V 0.956 0.008 0.001 0.001 0.007 0.001 0.028 104 S 0.675 0.009 0.003 0.001 0.012 0.007 0.294 105 E 0.065 0.002 0.018 0.001 0.085 0.791 0.039 106 S 0.009 0.001 0.007 0.001 0.039 0.939 0.006 107 G 0.180 0.003 0.006 0.001 0.357 0.229 0.225 108 E 0.525 0.013 0.001 0.001 0.067 0.009 0.384 109 H 0.908 0.031 0.001 0.001 0.005 0.001 0.054 110 F 0.947 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.047 111 N 0.967 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.026 112 A 0.939 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.054 113 I 0.868 0.004 0.001 0.001 0.014 0.003 0.109 114 I 0.756 0.015 0.001 0.001 0.043 0.002 0.182 115 K 0.299 0.010 0.004 0.001 0.092 0.010 0.584 116 P 0.106 0.003 0.039 0.007 0.221 0.151 0.473 117 F 0.296 0.035 0.038 0.018 0.119 0.096 0.397 118 R 0.348 0.075 0.036 0.022 0.064 0.028 0.428 119 L 0.228 0.021 0.048 0.022 0.090 0.062 0.530 120 A 0.095 0.040 0.047 0.019 0.262 0.079 0.458 121 T 0.024 0.014 0.013 0.007 0.290 0.018 0.633 122 P 0.005 0.004 0.189 0.056 0.136 0.360 0.250 123 G 0.009 0.008 0.283 0.065 0.178 0.320 0.137 124 L 0.017 0.011 0.306 0.072 0.178 0.165 0.251 125 L 0.012 0.019 0.094 0.068 0.006 0.151 0.651 126 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997