# TARGET T0211 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0211.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.021 0.004 0.002 0.005 0.144 0.824 2 R 0.132 0.024 0.005 0.016 0.064 0.760 3 K 0.376 0.027 0.012 0.021 0.065 0.500 4 I 0.566 0.011 0.021 0.032 0.077 0.293 5 D 0.638 0.020 0.014 0.025 0.080 0.223 6 L 0.503 0.027 0.017 0.035 0.117 0.301 7 C 0.353 0.019 0.048 0.046 0.232 0.302 8 L 0.272 0.021 0.086 0.044 0.349 0.228 9 S 0.159 0.026 0.127 0.039 0.474 0.175 10 S 0.091 0.034 0.088 0.026 0.702 0.058 11 E 0.056 0.008 0.052 0.021 0.790 0.073 12 G 0.055 0.003 0.014 0.006 0.804 0.118 13 S 0.173 0.005 0.008 0.006 0.598 0.210 14 E 0.650 0.012 0.005 0.006 0.133 0.194 15 V 0.964 0.003 0.001 0.002 0.011 0.018 16 I 0.979 0.001 0.001 0.002 0.006 0.012 17 L 0.977 0.003 0.001 0.002 0.005 0.013 18 A 0.892 0.004 0.002 0.005 0.029 0.068 19 T 0.487 0.009 0.008 0.012 0.179 0.305 20 S 0.140 0.013 0.026 0.017 0.429 0.375 21 S 0.093 0.025 0.050 0.027 0.466 0.338 22 D 0.054 0.025 0.112 0.031 0.591 0.187 23 E 0.071 0.021 0.080 0.032 0.620 0.176 24 K 0.050 0.027 0.034 0.025 0.550 0.314 25 H 0.023 0.043 0.012 0.025 0.479 0.419 26 P 0.019 0.007 0.012 0.023 0.288 0.651 27 P 0.065 0.030 0.125 0.160 0.268 0.352 28 E 0.139 0.020 0.154 0.127 0.313 0.247 29 N 0.266 0.034 0.135 0.131 0.203 0.230 30 I 0.281 0.037 0.072 0.100 0.223 0.287 31 I 0.293 0.098 0.051 0.074 0.214 0.270 32 D 0.110 0.042 0.022 0.065 0.404 0.357 33 G 0.035 0.029 0.021 0.084 0.420 0.411 34 N 0.020 0.031 0.015 0.041 0.591 0.303 35 P 0.017 0.005 0.075 0.215 0.598 0.090 36 E 0.029 0.005 0.086 0.290 0.533 0.057 37 T 0.109 0.042 0.102 0.280 0.423 0.044 38 F 0.221 0.037 0.089 0.286 0.299 0.068 39 W 0.256 0.014 0.076 0.262 0.275 0.117 40 T 0.323 0.014 0.076 0.225 0.261 0.102 41 T 0.244 0.009 0.044 0.189 0.294 0.220 42 T 0.226 0.013 0.018 0.065 0.293 0.385 43 G 0.127 0.013 0.007 0.012 0.299 0.542 44 M 0.137 0.034 0.005 0.010 0.285 0.529 45 F 0.199 0.032 0.008 0.006 0.213 0.542 46 P 0.231 0.009 0.036 0.017 0.354 0.352 47 Q 0.316 0.005 0.147 0.047 0.315 0.170 48 E 0.772 0.007 0.038 0.013 0.115 0.055 49 F 0.910 0.002 0.010 0.008 0.033 0.038 50 I 0.951 0.002 0.002 0.005 0.007 0.033 51 I 0.965 0.004 0.002 0.004 0.008 0.018 52 C 0.921 0.002 0.003 0.006 0.025 0.042 53 F 0.756 0.006 0.004 0.011 0.078 0.145 54 H 0.430 0.017 0.011 0.028 0.393 0.122 55 K 0.148 0.006 0.038 0.060 0.638 0.110 56 H 0.258 0.015 0.036 0.049 0.566 0.075 57 V 0.399 0.028 0.034 0.067 0.386 0.086 58 R 0.567 0.009 0.007 0.071 0.091 0.254 59 I 0.514 0.008 0.030 0.306 0.051 0.092 60 E 0.330 0.004 0.020 0.603 0.020 0.024 61 R 0.252 0.001 0.011 0.715 0.009 0.011 62 L 0.259 0.002 0.009 0.699 0.011 0.022 63 V 0.401 0.005 0.006 0.556 0.013 0.019 64 I 0.407 0.002 0.010 0.532 0.023 0.026 65 Q 0.304 0.003 0.014 0.617 0.036 0.026 66 S 0.365 0.008 0.023 0.478 0.073 0.053 67 Y 0.376 0.003 0.026 0.453 0.090 0.051 68 F 0.373 0.006 0.020 0.473 0.079 0.048 69 V 0.322 0.014 0.030 0.488 0.104 0.043 70 Q 0.234 0.003 0.026 0.434 0.185 0.118 71 T 0.304 0.009 0.032 0.352 0.147 0.155 72 L 0.527 0.017 0.016 0.186 0.104 0.149 73 K 0.604 0.013 0.009 0.140 0.057 0.177 74 I 0.563 0.034 0.010 0.100 0.070 0.223 75 E 0.451 0.042 0.013 0.090 0.174 0.229 76 K 0.263 0.007 0.027 0.092 0.329 0.282 77 S 0.121 0.009 0.032 0.066 0.530 0.242 78 T 0.110 0.026 0.036 0.071 0.490 0.266 79 S 0.078 0.024 0.023 0.092 0.387 0.397 80 K 0.029 0.012 0.058 0.168 0.415 0.318 81 E 0.020 0.011 0.034 0.181 0.302 0.452 82 P 0.015 0.007 0.072 0.392 0.225 0.289 83 V 0.014 0.006 0.066 0.500 0.165 0.249 84 D 0.020 0.011 0.063 0.543 0.126 0.237 85 F 0.013 0.004 0.061 0.793 0.060 0.070 86 E 0.013 0.002 0.052 0.829 0.054 0.051 87 Q 0.011 0.002 0.058 0.846 0.048 0.035 88 W 0.019 0.003 0.041 0.843 0.051 0.042 89 I 0.024 0.005 0.026 0.857 0.044 0.044 90 E 0.036 0.003 0.026 0.840 0.047 0.047 91 K 0.033 0.002 0.028 0.827 0.056 0.054 92 D 0.065 0.007 0.027 0.761 0.071 0.069 93 L 0.102 0.007 0.021 0.699 0.090 0.081 94 V 0.175 0.012 0.018 0.498 0.141 0.156 95 H 0.172 0.011 0.021 0.388 0.205 0.202 96 T 0.152 0.016 0.027 0.346 0.285 0.173 97 E 0.125 0.010 0.030 0.268 0.348 0.219 98 G 0.098 0.010 0.046 0.131 0.488 0.227 99 Q 0.195 0.025 0.047 0.088 0.448 0.198 100 L 0.300 0.023 0.057 0.068 0.377 0.174 101 Q 0.308 0.017 0.051 0.063 0.388 0.172 102 N 0.218 0.011 0.061 0.051 0.462 0.196 103 E 0.228 0.008 0.032 0.043 0.377 0.313 104 E 0.536 0.023 0.015 0.022 0.168 0.236 105 I 0.662 0.039 0.006 0.018 0.094 0.180 106 V 0.493 0.032 0.011 0.033 0.172 0.259 107 A 0.330 0.026 0.028 0.041 0.364 0.210 108 H 0.119 0.007 0.036 0.027 0.606 0.204 109 D 0.109 0.013 0.027 0.014 0.665 0.172 110 G 0.165 0.020 0.027 0.007 0.543 0.238 111 S 0.248 0.026 0.026 0.004 0.341 0.354 112 A 0.477 0.012 0.023 0.003 0.226 0.259 113 T 0.802 0.004 0.003 0.001 0.052 0.136 114 Y 0.952 0.003 0.002 0.003 0.015 0.025 115 L 0.956 0.001 0.001 0.003 0.014 0.025 116 R 0.979 0.001 0.001 0.003 0.006 0.010 117 F 0.982 0.001 0.001 0.002 0.003 0.011 118 I 0.975 0.001 0.001 0.004 0.005 0.015 119 I 0.969 0.003 0.001 0.005 0.008 0.014 120 V 0.911 0.006 0.003 0.007 0.027 0.046 121 S 0.718 0.013 0.019 0.013 0.113 0.123 122 A 0.307 0.005 0.167 0.018 0.336 0.166 123 F 0.167 0.007 0.250 0.028 0.440 0.108 124 D 0.168 0.003 0.218 0.023 0.485 0.104 125 H 0.358 0.008 0.057 0.008 0.435 0.135 126 F 0.629 0.007 0.011 0.003 0.223 0.128 127 A 0.853 0.004 0.003 0.001 0.067 0.071 128 S 0.936 0.002 0.001 0.001 0.026 0.035 129 V 0.927 0.002 0.002 0.001 0.024 0.045 130 H 0.911 0.003 0.002 0.001 0.030 0.054 131 S 0.908 0.006 0.002 0.001 0.034 0.049 132 V 0.881 0.010 0.002 0.001 0.033 0.073 133 S 0.831 0.014 0.003 0.002 0.090 0.059 134 A 0.533 0.015 0.027 0.007 0.357 0.061 135 E 0.234 0.004 0.025 0.010 0.641 0.086 136 G 0.324 0.006 0.021 0.014 0.551 0.085 137 T 0.716 0.011 0.004 0.013 0.139 0.117 138 V 0.782 0.035 0.003 0.025 0.051 0.104 139 V 0.697 0.027 0.014 0.047 0.088 0.126 140 S 0.531 0.007 0.040 0.058 0.151 0.213 141 N 0.286 0.011 0.087 0.062 0.235 0.320 142 L 0.139 0.024 0.053 0.065 0.188 0.532 143 S 0.072 0.019 0.023 0.050 0.122 0.715 144 S 0.001 0.001 0.001 0.003 0.021 0.973