# TARGET T0211 # Using neural net t2k-5631-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-CB-burial-14-7-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 CB_burial_14_7 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0211.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4 # Pos AA A B C D E F G 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.634 0.229 0.096 0.033 0.008 0.001 0.001 2 R 0.549 0.253 0.109 0.061 0.024 0.005 0.001 3 K 0.283 0.230 0.176 0.157 0.104 0.044 0.006 4 I 0.283 0.150 0.139 0.171 0.146 0.094 0.017 5 D 0.227 0.220 0.193 0.183 0.119 0.047 0.010 6 L 0.240 0.132 0.122 0.144 0.171 0.144 0.047 7 C 0.196 0.130 0.132 0.177 0.179 0.144 0.041 8 L 0.239 0.207 0.156 0.166 0.124 0.087 0.022 9 S 0.201 0.243 0.207 0.190 0.107 0.041 0.012 10 S 0.377 0.266 0.138 0.108 0.070 0.034 0.008 11 E 0.292 0.241 0.165 0.167 0.096 0.035 0.005 12 G 0.223 0.257 0.240 0.181 0.077 0.020 0.002 13 S 0.122 0.219 0.235 0.228 0.149 0.045 0.003 14 E 0.063 0.219 0.272 0.286 0.122 0.035 0.003 15 V 0.005 0.013 0.032 0.107 0.291 0.448 0.104 16 I 0.002 0.003 0.009 0.036 0.120 0.462 0.369 17 L 0.001 0.002 0.005 0.016 0.055 0.335 0.587 18 A 0.004 0.007 0.016 0.047 0.143 0.403 0.381 19 T 0.009 0.031 0.070 0.155 0.254 0.334 0.148 20 S 0.078 0.135 0.161 0.224 0.202 0.141 0.058 21 S 0.234 0.312 0.184 0.119 0.077 0.052 0.021 22 D 0.145 0.167 0.186 0.206 0.160 0.111 0.025 23 E 0.116 0.131 0.165 0.225 0.232 0.114 0.017 24 K 0.234 0.276 0.215 0.151 0.078 0.040 0.007 25 H 0.113 0.155 0.190 0.241 0.188 0.094 0.019 26 P 0.100 0.175 0.189 0.190 0.192 0.117 0.036 27 P 0.068 0.109 0.141 0.218 0.232 0.171 0.062 28 E 0.107 0.172 0.193 0.207 0.163 0.114 0.044 29 N 0.129 0.162 0.147 0.184 0.177 0.148 0.053 30 I 0.084 0.094 0.119 0.181 0.228 0.211 0.084 31 I 0.176 0.108 0.115 0.171 0.193 0.180 0.057 32 D 0.284 0.224 0.189 0.149 0.084 0.052 0.017 33 G 0.294 0.202 0.149 0.139 0.121 0.075 0.019 34 N 0.260 0.266 0.192 0.152 0.082 0.038 0.011 35 P 0.357 0.277 0.167 0.120 0.054 0.020 0.005 36 E 0.383 0.304 0.164 0.093 0.039 0.014 0.004 37 T 0.311 0.224 0.179 0.154 0.090 0.035 0.007 38 F 0.335 0.167 0.135 0.139 0.126 0.081 0.018 39 W 0.333 0.176 0.142 0.156 0.118 0.060 0.015 40 T 0.309 0.189 0.156 0.136 0.107 0.078 0.026 41 T 0.253 0.168 0.121 0.156 0.140 0.114 0.049 42 T 0.210 0.209 0.156 0.160 0.124 0.097 0.044 43 G 0.277 0.182 0.141 0.152 0.131 0.084 0.033 44 M 0.341 0.216 0.142 0.117 0.094 0.067 0.023 45 F 0.239 0.161 0.142 0.173 0.140 0.111 0.035 46 P 0.165 0.168 0.154 0.181 0.154 0.133 0.045 47 Q 0.160 0.173 0.155 0.168 0.175 0.125 0.044 48 E 0.097 0.157 0.177 0.217 0.178 0.125 0.049 49 F 0.029 0.041 0.060 0.143 0.261 0.346 0.119 50 I 0.040 0.080 0.128 0.222 0.243 0.230 0.057 51 I 0.052 0.109 0.132 0.180 0.227 0.238 0.063 52 C 0.028 0.079 0.171 0.302 0.244 0.153 0.023 53 F 0.026 0.047 0.071 0.176 0.381 0.271 0.029 54 H 0.105 0.252 0.277 0.249 0.092 0.023 0.003 55 K 0.224 0.381 0.208 0.127 0.045 0.013 0.001 56 H 0.098 0.219 0.288 0.257 0.113 0.024 0.001 57 V 0.076 0.157 0.168 0.259 0.240 0.096 0.004 58 R 0.149 0.315 0.299 0.177 0.050 0.009 0.001 59 I 0.054 0.081 0.111 0.234 0.312 0.188 0.019 60 E 0.122 0.297 0.256 0.200 0.094 0.028 0.002 61 R 0.077 0.211 0.265 0.244 0.139 0.057 0.006 62 L 0.035 0.066 0.101 0.200 0.286 0.275 0.036 63 V 0.040 0.112 0.168 0.248 0.268 0.148 0.017 64 I 0.057 0.047 0.071 0.135 0.214 0.364 0.111 65 Q 0.084 0.152 0.174 0.259 0.204 0.112 0.015 66 S 0.067 0.104 0.147 0.194 0.241 0.211 0.035 67 Y 0.053 0.075 0.108 0.206 0.243 0.264 0.051 68 F 0.100 0.166 0.199 0.259 0.198 0.071 0.007 69 V 0.047 0.082 0.133 0.229 0.303 0.187 0.018 70 Q 0.131 0.261 0.248 0.207 0.109 0.040 0.004 71 T 0.114 0.211 0.241 0.226 0.135 0.066 0.006 72 L 0.052 0.071 0.115 0.224 0.325 0.201 0.012 73 K 0.120 0.240 0.260 0.222 0.125 0.031 0.002 74 I 0.124 0.138 0.165 0.220 0.217 0.126 0.010 75 E 0.134 0.210 0.248 0.235 0.131 0.040 0.002 76 K 0.218 0.230 0.215 0.208 0.104 0.023 0.001 77 S 0.495 0.288 0.138 0.057 0.018 0.003 0.001 78 T 0.583 0.243 0.104 0.052 0.015 0.003 0.001 79 S 0.649 0.202 0.090 0.047 0.010 0.001 0.001 80 K 0.715 0.219 0.051 0.012 0.002 0.001 0.001 81 E 0.712 0.206 0.057 0.020 0.004 0.001 0.001 82 P 0.435 0.317 0.163 0.069 0.015 0.002 0.001 83 V 0.412 0.278 0.177 0.098 0.031 0.004 0.001 84 D 0.374 0.412 0.152 0.051 0.010 0.001 0.001 85 F 0.091 0.101 0.155 0.310 0.264 0.076 0.003 86 E 0.282 0.345 0.222 0.118 0.029 0.004 0.001 87 Q 0.476 0.345 0.118 0.044 0.014 0.003 0.001 88 W 0.212 0.238 0.234 0.209 0.087 0.018 0.001 89 I 0.123 0.122 0.177 0.278 0.219 0.076 0.004 90 E 0.337 0.367 0.177 0.080 0.029 0.009 0.001 91 K 0.199 0.258 0.222 0.180 0.104 0.034 0.003 92 D 0.186 0.278 0.230 0.177 0.093 0.032 0.003 93 L 0.166 0.175 0.177 0.220 0.181 0.076 0.005 94 V 0.339 0.266 0.179 0.145 0.056 0.013 0.001 95 H 0.351 0.275 0.185 0.112 0.056 0.019 0.002 96 T 0.350 0.228 0.171 0.152 0.075 0.022 0.002 97 E 0.467 0.272 0.143 0.077 0.030 0.010 0.001 98 G 0.317 0.274 0.174 0.138 0.071 0.024 0.002 99 Q 0.118 0.307 0.285 0.193 0.078 0.018 0.001 100 L 0.035 0.067 0.132 0.303 0.335 0.121 0.006 101 Q 0.219 0.402 0.255 0.103 0.018 0.002 0.001 102 N 0.320 0.293 0.190 0.141 0.049 0.006 0.001 103 E 0.382 0.376 0.162 0.063 0.015 0.002 0.001 104 E 0.266 0.376 0.217 0.105 0.030 0.005 0.001 105 I 0.049 0.094 0.174 0.322 0.264 0.093 0.004 106 V 0.124 0.297 0.279 0.196 0.084 0.019 0.001 107 A 0.088 0.116 0.172 0.285 0.251 0.082 0.006 108 H 0.341 0.364 0.180 0.085 0.025 0.005 0.001 109 D 0.452 0.323 0.143 0.061 0.017 0.004 0.001 110 G 0.179 0.228 0.194 0.208 0.140 0.048 0.005 111 S 0.171 0.296 0.250 0.177 0.081 0.023 0.002 112 A 0.067 0.097 0.122 0.211 0.282 0.195 0.027 113 T 0.051 0.121 0.165 0.254 0.238 0.144 0.027 114 Y 0.019 0.062 0.103 0.212 0.248 0.263 0.093 115 L 0.007 0.012 0.025 0.066 0.175 0.411 0.304 116 R 0.007 0.021 0.061 0.146 0.254 0.290 0.220 117 F 0.006 0.013 0.030 0.053 0.116 0.339 0.441 118 I 0.003 0.007 0.018 0.060 0.125 0.307 0.481 119 I 0.004 0.007 0.016 0.036 0.095 0.366 0.476 120 V 0.021 0.034 0.044 0.105 0.221 0.329 0.247 121 S 0.071 0.104 0.133 0.158 0.199 0.218 0.116 122 A 0.072 0.105 0.115 0.196 0.184 0.217 0.110 123 F 0.093 0.134 0.159 0.206 0.206 0.149 0.054 124 D 0.110 0.156 0.144 0.186 0.201 0.148 0.055 125 H 0.064 0.093 0.108 0.181 0.227 0.224 0.103 126 F 0.061 0.080 0.092 0.135 0.182 0.273 0.176 127 A 0.072 0.091 0.112 0.162 0.196 0.236 0.131 128 S 0.063 0.103 0.126 0.173 0.200 0.216 0.119 129 V 0.040 0.069 0.104 0.178 0.239 0.248 0.122 130 H 0.036 0.075 0.111 0.196 0.233 0.241 0.107 131 S 0.069 0.162 0.227 0.255 0.165 0.088 0.034 132 V 0.078 0.084 0.105 0.182 0.252 0.223 0.077 133 S 0.113 0.212 0.227 0.219 0.143 0.068 0.017 134 A 0.081 0.090 0.128 0.244 0.255 0.165 0.036 135 E 0.263 0.302 0.202 0.128 0.067 0.031 0.007 136 G 0.272 0.240 0.200 0.162 0.086 0.035 0.005 137 T 0.246 0.221 0.208 0.178 0.105 0.038 0.005 138 V 0.279 0.205 0.162 0.153 0.123 0.069 0.008 139 V 0.272 0.157 0.176 0.198 0.136 0.055 0.006 140 S 0.428 0.297 0.155 0.082 0.030 0.008 0.001 141 N 0.557 0.263 0.108 0.052 0.016 0.003 0.001 142 L 0.460 0.226 0.143 0.114 0.048 0.008 0.001 143 S 0.732 0.180 0.061 0.022 0.004 0.001 0.001 144 S 0.793 0.150 0.039 0.014 0.004 0.001 0.001